logo

Genes within 1Mb (chr6:137080065:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.05e-01 0.14 0.136 0.068 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.60e-01 0.0107 0.0608 0.068 B L1
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 4.19e-01 0.131 0.161 0.068 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 5.27e-01 0.0546 0.086 0.068 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 2.76e-01 -0.131 0.12 0.068 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 3.70e-01 0.122 0.135 0.068 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0455 0.0898 0.068 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0515 0.0679 0.068 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0991 0.145 0.068 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 6.54e-01 0.0409 0.091 0.068 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0379 0.0693 0.068 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 1.53e-01 0.164 0.114 0.068 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 9.33e-01 0.00861 0.102 0.068 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0483 0.0687 0.068 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 7.56e-02 0.301 0.168 0.068 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 3.29e-01 0.0835 0.0854 0.068 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0901 0.068 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 1.05e-01 0.203 0.125 0.068 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0845 0.127 0.07 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0231 0.114 0.07 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 4.36e-01 0.14 0.179 0.07 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 4.49e-01 0.103 0.136 0.07 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0264 0.147 0.07 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 2.61e-01 -0.159 0.141 0.07 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 3.89e-01 -0.119 0.138 0.07 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0499 0.184 0.07 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0836 0.104 0.068 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0961 0.0887 0.068 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 4.45e-01 -0.134 0.175 0.068 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 4.72e-01 0.0635 0.0882 0.068 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0525 0.154 0.068 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0285 0.103 0.068 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 7.88e-01 0.0295 0.109 0.068 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 4.67e-02 -0.247 0.124 0.068 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.54e-01 0.106 0.114 0.069 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 9.33e-01 0.00509 0.0605 0.069 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 1.44e-01 0.257 0.175 0.069 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 9.53e-01 0.00557 0.0948 0.069 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0342 0.136 0.069 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 1.36e-01 0.2 0.134 0.069 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 5.56e-01 0.064 0.109 0.068 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0222 0.0911 0.068 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0812 0.177 0.068 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 1.52e-01 0.0969 0.0673 0.068 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 829730 sc-eQTL 3.13e-01 -0.103 0.102 0.068 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 8.31e-01 -0.028 0.131 0.068 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 2.43e-01 0.157 0.134 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 4.12e-01 0.158 0.192 0.064 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0756 0.156 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 3.91e-01 -0.162 0.189 0.064 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 8.17e-02 0.329 0.188 0.064 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 9.68e-01 0.00861 0.212 0.064 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 6.24e-01 0.0814 0.166 0.064 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 8.42e-01 -0.032 0.16 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 3.98e-01 0.0769 0.0908 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.02e-01 0.0206 0.167 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 3.59e-01 0.11 0.119 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 2.33e-01 -0.173 0.144 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 5.26e-01 -0.108 0.17 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 5.94e-01 0.0985 0.184 0.067 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00446 0.11 0.067 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.28e-01 0.0167 0.186 0.067 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 3.29e-01 0.118 0.12 0.067 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 9.11e-01 0.0184 0.165 0.067 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 9.68e-01 0.00724 0.179 0.067 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 4.35e-01 0.107 0.137 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0678 0.0782 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 8.94e-01 0.0242 0.181 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 5.48e-01 0.0551 0.0917 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00871 0.129 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0144 0.144 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 4.11e-02 0.34 0.165 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 3.41e-01 0.0923 0.0966 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 5.20e-01 0.118 0.182 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 6.23e-02 -0.247 0.132 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0902 0.141 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 8.42e-02 0.296 0.171 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 1.91e-01 0.198 0.151 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 5.28e-01 0.085 0.135 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0689 0.168 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 2.44e-01 0.116 0.0992 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 4.25e-01 -0.127 0.159 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 4.80e-01 0.11 0.155 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 6.67e-01 0.0368 0.0855 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0535 0.0686 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0686 0.162 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 6.74e-01 0.0394 0.0935 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0903 0.0684 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 1.37e-01 0.18 0.121 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.93e-01 -0.102 0.119 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0373 0.0753 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 4.77e-01 -0.125 0.175 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0422 0.0859 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 6.73e-01 0.0414 0.0979 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 7.02e-01 0.0462 0.12 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.53e-01 -0.132 0.142 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0201 0.101 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0658 0.184 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 4.04e-01 0.0791 0.0945 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 1.34e-01 0.219 0.145 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 4.71e-01 0.11 0.152 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 9.71e-02 0.204 0.122 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0166 0.0821 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 2.33e-01 0.202 0.169 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 9.55e-01 0.00583 0.104 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 1.27e-02 -0.362 0.144 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 2.64e-01 0.163 0.145 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 4.53e-02 -0.244 0.121 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0586 0.0852 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0131 0.177 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 2.31e-01 0.114 0.0952 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0825 0.113 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 3.84e-01 0.123 0.141 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 1.30e-02 -0.409 0.163 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 7.63e-01 0.0377 0.124 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.94e-01 0.00151 0.19 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0181 0.0899 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 7.89e-02 0.281 0.159 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0838 0.164 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 2.69e-01 0.17 0.154 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 1.96e-02 0.337 0.143 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0661 0.177 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 5.35e-01 0.0704 0.113 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 3.90e-01 0.151 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 8.86e-01 0.0241 0.168 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 1.12e-01 0.195 0.122 0.069 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0575 0.102 0.069 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.44e-01 0.0117 0.167 0.069 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 1.88e-01 0.109 0.0824 0.069 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 829730 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0886 0.138 0.069 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0396 0.144 0.069 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 2.59e-01 0.173 0.153 0.069 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 4.63e-01 0.101 0.137 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 7.78e-01 0.0285 0.101 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 6.50e-01 0.0812 0.179 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 4.65e-01 0.0747 0.102 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 1.74e-01 -0.211 0.155 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 1.81e-01 0.218 0.162 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.39e-01 0.101 0.105 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.02e-01 0.0173 0.0689 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 2.15e-01 0.225 0.181 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0157 0.0993 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 8.75e-01 0.0224 0.143 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 3.12e-01 0.15 0.148 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 8.47e-01 0.0262 0.135 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 2.70e-01 -0.126 0.114 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0263 0.172 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 1.09e-01 0.172 0.107 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 5.56e-01 -0.101 0.17 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 3.33e-01 0.168 0.173 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.73e-01 0.098 0.11 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0161 0.0821 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.59e-01 0.00896 0.173 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 7.63e-01 0.0297 0.0982 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 3.63e-01 -0.123 0.135 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 8.38e-02 0.255 0.147 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 6.89e-01 0.0955 0.238 0.059 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 2.72e-01 -0.226 0.204 0.059 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 7.21e-01 0.0873 0.244 0.059 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 5.69e-02 0.35 0.182 0.059 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 5.66e-01 -0.121 0.21 0.059 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 7.91e-02 0.388 0.219 0.059 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0929 0.142 0.067 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 4.27e-01 0.117 0.147 0.067 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 5.42e-01 -0.106 0.173 0.067 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 9.32e-01 0.0074 0.0867 0.067 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 829730 sc-eQTL 9.81e-01 0.0028 0.12 0.067 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 4.84e-01 0.118 0.168 0.067 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 6.48e-01 -0.077 0.168 0.067 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 2.26e-01 0.196 0.162 0.068 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0558 0.105 0.068 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.69e-01 0.00677 0.172 0.068 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0219 0.103 0.068 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 7.09e-02 0.202 0.111 0.068 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 1.13e-01 0.249 0.157 0.068 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.52e-01 -0.134 0.143 0.071 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0605 0.145 0.071 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 2.06e-01 0.235 0.185 0.071 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 8.44e-01 -0.028 0.142 0.071 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 8.35e-01 0.0346 0.166 0.071 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 1.43e-01 -0.213 0.145 0.071 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 9.01e-01 0.0231 0.185 0.071 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0209 0.19 0.071 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 2.45e-01 -0.113 0.0973 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0946 0.105 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 4.70e-01 -0.127 0.175 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 7.21e-01 0.0376 0.105 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0202 0.151 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 8.17e-01 0.0253 0.109 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 3.72e-01 -0.1 0.112 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 7.93e-03 -0.371 0.138 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0212 0.112 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 2.33e-01 -0.138 0.115 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 2.86e-01 -0.192 0.18 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 8.41e-01 0.0201 0.0997 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00657 0.168 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 6.01e-02 -0.254 0.134 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 4.39e-01 0.111 0.143 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0894 0.14 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0783 0.161 0.076 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0483 0.142 0.076 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 3.35e-01 0.197 0.203 0.076 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 3.14e-01 0.0998 0.0987 0.076 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 829730 sc-eQTL 4.68e-01 -0.114 0.156 0.076 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 2.48e-01 0.242 0.208 0.076 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 5.87e-01 0.0975 0.179 0.076 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 1.01e-02 -0.312 0.12 0.071 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 9.54e-01 0.0094 0.161 0.071 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0494 0.165 0.071 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 3.59e-02 -0.22 0.104 0.071 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 7.47e-01 0.0523 0.162 0.071 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 5.56e-01 0.101 0.171 0.071 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 6.95e-01 0.0617 0.157 0.071 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 3.31e-01 -0.176 0.181 0.071 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0292 0.144 0.068 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 2.27e-01 0.135 0.112 0.068 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 1.51e-01 0.256 0.178 0.068 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 4.33e-01 -0.1 0.128 0.068 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 4.51e-01 -0.119 0.158 0.068 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 4.41e-01 -0.128 0.166 0.068 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0157 0.16 0.068 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0515 0.168 0.068 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 2.19e-01 0.219 0.177 0.062 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 1.52e-01 -0.191 0.133 0.062 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 5.41e-01 -0.12 0.196 0.062 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 8.52e-01 -0.031 0.165 0.062 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 8.21e-02 -0.238 0.136 0.062 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0928 0.219 0.062 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0987 0.168 0.062 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 4.14e-01 0.165 0.202 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 5.90e-01 0.0773 0.143 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 1.69e-01 0.11 0.0801 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0164 0.165 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 1.71e-01 0.138 0.101 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 3.02e-01 -0.138 0.133 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 6.15e-01 0.086 0.171 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 1.52e-01 0.207 0.144 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00781 0.0665 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 5.13e-01 0.115 0.176 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0267 0.0828 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0216 0.121 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 4.45e-01 0.113 0.147 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0784 0.0979 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 2.14e-01 -0.113 0.0909 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 2.76e-01 -0.192 0.175 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 5.33e-01 0.0565 0.0906 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 7.95e-01 -0.041 0.157 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0788 0.106 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0341 0.109 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 1.41e-02 -0.308 0.125 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 3.04e-02 -0.253 0.116 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 4.92e-01 0.073 0.106 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 7.32e-01 0.0608 0.177 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0327 0.11 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 529246 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0216 0.171 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00775 0.141 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 4.25e-01 0.117 0.147 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 296020 sc-eQTL 2.89e-01 -0.177 0.166 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 sc-eQTL 2.03e-01 0.137 0.107 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790214 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0101 0.0625 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257501 sc-eQTL 1.64e-01 0.253 0.181 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787149 sc-eQTL 9.39e-01 0.00756 0.0981 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287588 sc-eQTL 8.80e-01 -0.02 0.133 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788168 sc-eQTL 1.59e-01 0.193 0.137 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -139384 eQTL 0.0176 -0.0568 0.0239 0.0 0.0 0.08
ENSG00000182747 SLC35D3 157764 eQTL 0.00145 -0.175 0.0549 0.0 0.0 0.08

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina