logo

Genes within 1Mb (chr6:137080021:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0792 0.0833 0.231 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0047 0.0372 0.231 B L1
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 7.54e-01 0.031 0.0988 0.231 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0755 0.0524 0.231 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 7.90e-03 -0.194 0.0722 0.231 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 9.46e-01 0.00564 0.0829 0.231 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 4.12e-01 -0.046 0.056 0.231 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 7.02e-01 0.0162 0.0424 0.231 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0713 0.0901 0.231 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0628 0.0566 0.231 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0407 0.0432 0.231 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 1.24e-01 -0.11 0.0711 0.231 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 8.09e-01 0.0156 0.0644 0.231 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 2.58e-01 0.0493 0.0434 0.231 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 1.75e-01 -0.145 0.107 0.231 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0727 0.054 0.231 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 2.53e-01 0.0655 0.0571 0.231 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.39e-01 0.0162 0.0796 0.231 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00724 0.0772 0.236 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 4.86e-01 0.0484 0.0694 0.236 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0648 0.109 0.236 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0281 0.0825 0.236 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 7.15e-01 0.0327 0.0893 0.236 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 4.69e-01 0.062 0.0855 0.236 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 7.06e-01 0.0318 0.0841 0.236 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0568 0.112 0.236 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 5.03e-02 -0.127 0.0645 0.231 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 3.63e-01 0.0506 0.0555 0.231 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 2.13e-01 -0.136 0.109 0.231 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 7.26e-01 0.0194 0.0552 0.231 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 1.43e-02 -0.235 0.0953 0.231 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0227 0.0644 0.231 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 1.45e-01 0.0996 0.0681 0.231 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00541 0.078 0.231 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0577 0.0727 0.232 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 1.98e-01 0.0497 0.0385 0.232 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0775 0.112 0.232 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0666 0.0604 0.232 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 3.77e-01 0.0767 0.0866 0.232 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 6.07e-02 -0.161 0.0851 0.232 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00386 0.0673 0.231 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0344 0.0564 0.231 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 3.02e-01 0.113 0.109 0.231 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0252 0.0419 0.231 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 829686 sc-eQTL 5.29e-01 -0.04 0.0634 0.231 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 7.66e-01 0.0241 0.0809 0.231 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0256 0.0831 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0992 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 6.38e-01 0.0429 0.091 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 3.82e-01 0.0965 0.11 0.235 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 8.49e-01 0.0211 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 2.03e-01 -0.158 0.123 0.235 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 6.44e-01 0.0448 0.0967 0.235 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0334 0.0987 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 2.59e-01 0.0635 0.056 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 8.63e-02 0.177 0.103 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0359 0.0739 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0614 0.0892 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 9.42e-01 0.00768 0.105 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0897 0.107 0.233 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0025 0.0635 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 8.92e-01 0.0146 0.108 0.233 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0619 0.0698 0.233 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 2.43e-01 0.111 0.0952 0.233 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0169 0.104 0.233 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0998 0.0838 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 9.84e-01 0.000945 0.048 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 8.79e-01 0.0169 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0771 0.056 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0695 0.0789 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00477 0.0881 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0581 0.102 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 6.49e-01 -0.027 0.0594 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 5.43e-01 0.0682 0.112 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0826 0.0814 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 1.86e-03 -0.268 0.0849 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 2.40e-01 -0.124 0.105 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 7.24e-01 0.0339 0.0959 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0538 0.0851 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.106 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0206 0.0629 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0952 0.1 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0227 0.0979 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0209 0.0533 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 5.09e-01 0.0283 0.0428 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0987 0.101 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0783 0.0581 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 9.05e-01 0.00513 0.0428 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 3.20e-02 -0.161 0.0747 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0693 0.0738 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 5.00e-01 0.0315 0.0466 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 7.17e-01 0.0395 0.109 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0701 0.0531 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 5.96e-02 -0.114 0.0602 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0403 0.0746 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0748 0.084 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0161 0.0597 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0597 0.109 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 3.46e-01 0.0527 0.0558 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 4.81e-02 -0.17 0.0855 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0835 0.0895 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 7.33e-01 0.0263 0.077 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 5.08e-01 0.034 0.0513 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 2.24e-01 0.129 0.106 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 4.05e-01 -0.054 0.0647 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 1.15e-01 0.144 0.091 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.62e-01 0.0159 0.0912 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0195 0.0763 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 1.80e-01 0.0713 0.0531 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.11 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 5.03e-01 -0.04 0.0596 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 6.81e-01 0.0291 0.0707 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 6.67e-01 -0.038 0.0882 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0158 0.101 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 9.03e-01 0.00928 0.0758 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 1.67e-02 -0.276 0.114 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0158 0.0547 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 9.83e-01 0.00206 0.0978 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 5.59e-01 0.0587 0.1 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0894 0.0989 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 1.50e-01 -0.135 0.093 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 4.03e-01 0.0953 0.114 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0737 0.0729 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00613 0.113 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0914 0.108 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0403 0.0773 0.232 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 7.98e-01 0.0165 0.0643 0.232 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0232 0.105 0.232 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0329 0.052 0.232 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 829686 sc-eQTL 3.26e-01 0.0852 0.0865 0.232 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 4.53e-01 0.0681 0.0906 0.232 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 4.21e-01 0.0775 0.0961 0.232 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0118 0.0852 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 8.51e-01 0.0118 0.0628 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0166 0.0634 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 9.33e-01 0.00815 0.0965 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 9.88e-01 0.00154 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 9.66e-01 0.00286 0.0673 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 3.60e-01 0.0403 0.0439 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00202 0.116 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0441 0.0633 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 6.18e-01 0.0456 0.0911 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 1.73e-01 -0.129 0.0945 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 7.04e-02 -0.156 0.0858 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 4.42e-01 0.0564 0.0732 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 3.87e-01 0.0952 0.11 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 2.19e-02 -0.156 0.0677 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 6.58e-02 0.2 0.108 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.40e-02 -0.191 0.11 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0779 0.0704 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 2.21e-01 0.0644 0.0525 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 2.16e-01 -0.137 0.11 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0488 0.0629 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 5.38e-01 0.0534 0.0865 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 1.83e-01 -0.126 0.0946 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0885 0.144 0.207 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 4.76e-02 -0.246 0.123 0.207 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0487 0.148 0.207 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00543 0.112 0.207 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 1.93e-01 -0.166 0.127 0.207 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 1.02e-01 0.22 0.133 0.207 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 2.11e-01 0.108 0.0857 0.233 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 7.95e-01 0.0233 0.0892 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 2.05e-01 0.132 0.104 0.233 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 2.02e-01 0.0668 0.0522 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 829686 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00776 0.0727 0.233 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00303 0.102 0.233 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0283 0.102 0.233 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 2.99e-01 -0.105 0.1 0.231 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00898 0.065 0.231 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 6.48e-01 0.0486 0.106 0.231 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0364 0.064 0.231 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 3.00e-01 0.0719 0.0692 0.231 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 9.07e-01 0.0114 0.0976 0.231 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 8.91e-01 0.0115 0.0835 0.239 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 6.06e-02 0.157 0.0834 0.239 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 5.85e-01 0.059 0.108 0.239 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 9.88e-01 0.00129 0.0824 0.239 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 1.93e-01 0.125 0.0958 0.239 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 8.20e-01 0.0193 0.0847 0.239 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 3.18e-01 0.107 0.107 0.239 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0805 0.11 0.239 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0272 0.0605 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 4.56e-01 0.0484 0.0648 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0666 0.109 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 4.27e-01 0.0518 0.0651 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 4.42e-02 -0.188 0.0929 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0173 0.0678 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 1.43e-01 0.102 0.0692 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 7.76e-01 0.0248 0.0871 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 3.25e-02 -0.149 0.0693 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 4.79e-01 0.051 0.0718 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 1.36e-01 -0.167 0.112 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00528 0.0622 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0664 0.105 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 7.78e-01 0.0239 0.0846 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.51e-01 0.0168 0.0893 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00304 0.0872 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 1.64e-01 0.141 0.101 0.221 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 1.00e+00 3.54e-05 0.0893 0.221 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 1.83e-01 -0.171 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 6.65e-01 0.0271 0.0623 0.221 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 829686 sc-eQTL 4.96e-02 0.192 0.0971 0.221 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 2.91e-01 0.139 0.131 0.221 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.79e-02 -0.192 0.112 0.221 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0382 0.0751 0.233 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 2.29e-01 0.119 0.0989 0.233 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0989 0.101 0.233 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 5.09e-01 0.0429 0.0648 0.233 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 7.18e-01 0.036 0.0996 0.233 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 2.99e-01 0.11 0.105 0.233 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 7.99e-01 0.0247 0.0967 0.233 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 2.87e-01 0.119 0.111 0.233 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 2.11e-02 -0.203 0.0874 0.233 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0788 0.0686 0.233 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 4.00e-01 0.0924 0.11 0.233 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 5.42e-01 0.0478 0.0783 0.233 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0671 0.0968 0.233 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0692 0.102 0.233 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 5.18e-01 0.0634 0.0979 0.233 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0886 0.103 0.233 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0741 0.0983 0.24 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 3.78e-01 0.0652 0.0737 0.24 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0418 0.108 0.24 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0222 0.0913 0.24 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0794 0.0755 0.24 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 1.04e-01 0.197 0.12 0.24 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0537 0.0926 0.24 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 5.45e-01 0.0676 0.112 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0492 0.0873 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 5.07e-01 0.0326 0.049 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 1.80e-01 0.135 0.1 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 8.52e-02 -0.106 0.0612 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 7.32e-01 -0.028 0.0815 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 8.35e-01 0.0217 0.104 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 2.40e-01 -0.104 0.0881 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0257 0.0406 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 9.57e-01 0.0058 0.108 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0759 0.0503 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 9.77e-03 -0.19 0.073 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0557 0.09 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0878 0.0607 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 2.37e-01 0.0671 0.0566 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 1.72e-01 -0.149 0.109 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 8.21e-01 0.0128 0.0564 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 1.17e-02 -0.245 0.0964 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0392 0.066 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 1.68e-01 0.093 0.0673 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 9.04e-01 0.00952 0.0786 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 7.23e-02 -0.132 0.0731 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 6.55e-01 0.0297 0.0665 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 7.65e-01 0.0332 0.111 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 9.12e-01 0.0076 0.0688 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 529202 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0398 0.107 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 4.88e-01 0.0612 0.0881 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 5.15e-01 0.0601 0.0921 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 295976 sc-eQTL 7.73e-01 0.0302 0.105 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0569 0.0688 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 790170 sc-eQTL 6.02e-02 0.0749 0.0397 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257457 sc-eQTL 3.33e-01 -0.112 0.116 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787193 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0774 0.0626 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287544 sc-eQTL 3.70e-01 0.076 0.0847 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788212 sc-eQTL 3.23e-02 -0.187 0.0869 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 pQTL 0.000265 -0.0687 0.0188 0.0 0.0 0.209
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 eQTL 9.41e-06 -0.0734 0.0165 0.0 0.0 0.205

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -139428 4.11e-06 4.67e-06 7.66e-07 2.56e-06 1.12e-06 1.09e-06 2.95e-06 9.98e-07 3.49e-06 1.94e-06 4.32e-06 3.22e-06 6.78e-06 2.04e-06 1.18e-06 2.68e-06 2.06e-06 2.89e-06 1.3e-06 9.53e-07 2.49e-06 4.26e-06 3.34e-06 1.69e-06 5.12e-06 1.38e-06 2.35e-06 1.78e-06 4.28e-06 3.53e-06 2.01e-06 4.91e-07 7.75e-07 1.88e-06 2.1e-06 9.61e-07 9.05e-07 4.75e-07 1.3e-06 3.41e-07 4.36e-07 5.18e-06 3.76e-07 1.49e-07 4.19e-07 4.12e-07 7.28e-07 5.21e-07 3.35e-07