logo

Genes within 1Mb (chr6:137079788:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0712 0.0832 0.229 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0142 0.0371 0.229 B L1
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 7.23e-01 0.035 0.0987 0.229 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0753 0.0524 0.229 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 9.03e-03 -0.19 0.0721 0.229 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 8.91e-01 0.0114 0.0828 0.229 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0375 0.0559 0.229 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 7.97e-01 0.0109 0.0423 0.229 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0811 0.0899 0.229 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0789 0.0564 0.229 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0396 0.0431 0.229 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 1.15e-01 -0.112 0.0709 0.229 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 7.37e-01 0.0216 0.0642 0.229 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 3.25e-01 0.0428 0.0434 0.229 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.08e-01 -0.135 0.107 0.229 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0818 0.0538 0.229 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 2.42e-01 0.0668 0.057 0.229 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.18e-01 0.0287 0.0794 0.229 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 8.35e-01 0.0162 0.0773 0.234 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 4.34e-01 0.0545 0.0695 0.234 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0527 0.109 0.234 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0233 0.0826 0.234 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 6.92e-01 0.0355 0.0895 0.234 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 4.99e-01 0.0581 0.0857 0.234 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.35e-01 0.0286 0.0842 0.234 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0726 0.112 0.234 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 6.97e-02 -0.118 0.0647 0.229 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 4.35e-01 0.0435 0.0557 0.229 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 1.66e-01 -0.152 0.109 0.229 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 6.84e-01 0.0226 0.0553 0.229 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 1.32e-02 -0.239 0.0954 0.229 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 7.10e-01 -0.024 0.0645 0.229 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 1.26e-01 0.105 0.0682 0.229 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00763 0.0782 0.229 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0645 0.0724 0.23 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 2.79e-01 0.0417 0.0384 0.23 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0579 0.112 0.23 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0677 0.0602 0.23 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 4.07e-01 0.0718 0.0864 0.23 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 8.28e-02 -0.148 0.085 0.23 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00222 0.0673 0.229 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0406 0.0564 0.229 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 3.90e-01 0.0944 0.11 0.229 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0279 0.0419 0.229 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 829453 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0388 0.0634 0.229 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 7.06e-01 0.0305 0.0809 0.229 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.28e-01 -0.029 0.0831 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 2.78e-01 -0.121 0.111 0.232 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 6.48e-01 0.0414 0.0907 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.96e-01 0.115 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 8.26e-01 0.0243 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 2.20e-01 -0.151 0.123 0.232 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 5.95e-01 0.0513 0.0963 0.232 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0272 0.0987 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 2.84e-01 0.0602 0.056 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 8.11e-02 0.18 0.103 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0407 0.0738 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0654 0.0892 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 9.89e-01 0.00151 0.105 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0913 0.107 0.231 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 8.26e-01 -0.014 0.0635 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 9.00e-01 0.0135 0.108 0.231 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0675 0.0697 0.231 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 1.89e-01 0.125 0.0951 0.231 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0152 0.104 0.231 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0992 0.0838 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00627 0.0481 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 8.73e-01 0.0178 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.50e-01 -0.081 0.056 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0806 0.0789 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 9.72e-01 0.00308 0.0882 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0357 0.102 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0394 0.0593 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 5.01e-01 0.0753 0.112 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 3.03e-01 -0.084 0.0813 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 2.72e-03 -0.258 0.0849 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 2.49e-01 -0.122 0.105 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 7.24e-01 0.0339 0.0959 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0632 0.085 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.69e-01 0.118 0.106 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0318 0.0629 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 2.80e-01 -0.108 0.1 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0369 0.0979 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 8.08e-01 -0.013 0.0533 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 5.95e-01 0.0227 0.0428 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.44e-01 -0.117 0.1 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0909 0.0579 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 8.32e-01 0.00908 0.0428 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 2.86e-02 -0.164 0.0746 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0611 0.0736 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 6.04e-01 0.0242 0.0465 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 6.20e-01 0.0537 0.108 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0751 0.0529 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 5.06e-02 -0.118 0.06 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0381 0.0744 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0767 0.0839 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0139 0.0596 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0473 0.108 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 3.79e-01 0.0492 0.0558 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 4.70e-02 -0.171 0.0855 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0857 0.0894 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 7.12e-01 0.0285 0.0771 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 6.39e-01 0.0241 0.0514 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.41e-01 0.124 0.106 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0636 0.0647 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 9.93e-02 0.151 0.0909 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.77e-01 0.0258 0.0912 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 9.90e-01 0.00095 0.0763 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 2.51e-01 0.0611 0.0531 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0819 0.11 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 3.23e-01 -0.059 0.0595 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 7.80e-01 0.0197 0.0707 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0301 0.0882 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00763 0.101 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 9.83e-01 0.00162 0.0759 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 1.24e-02 -0.288 0.114 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0131 0.0548 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 9.83e-01 0.00206 0.0978 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 5.26e-01 0.0636 0.1 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0976 0.0986 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 1.27e-01 -0.142 0.0928 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 3.02e-01 0.117 0.114 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0868 0.0727 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0278 0.113 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0812 0.108 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0358 0.0775 0.229 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 9.62e-01 0.00309 0.0645 0.229 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0308 0.105 0.229 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0462 0.0521 0.229 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 829453 sc-eQTL 3.05e-01 0.0892 0.0867 0.229 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 3.51e-01 0.0848 0.0907 0.229 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 4.54e-01 0.0724 0.0964 0.229 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0198 0.085 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 6.67e-01 0.0271 0.0627 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 9.63e-01 0.00515 0.111 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0272 0.0633 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 9.53e-01 0.00564 0.0963 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 9.57e-01 0.00549 0.101 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 9.56e-01 0.00372 0.0671 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 5.17e-01 0.0284 0.0438 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 9.50e-01 0.0072 0.116 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0463 0.0631 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 5.97e-01 0.0481 0.0909 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 2.14e-01 -0.118 0.0943 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 5.50e-02 -0.165 0.0856 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 4.70e-01 0.0529 0.0731 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.98e-01 0.114 0.109 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.10e-02 -0.173 0.0674 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 8.26e-02 0.188 0.108 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 9.16e-02 -0.186 0.11 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0789 0.0703 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 2.99e-01 0.0546 0.0525 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.17e-01 -0.137 0.11 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0486 0.0629 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 6.07e-01 0.0445 0.0865 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 1.81e-01 -0.127 0.0945 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0821 0.144 0.204 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 3.40e-02 -0.262 0.122 0.204 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0484 0.148 0.204 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00502 0.112 0.204 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 2.00e-01 -0.163 0.127 0.204 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 1.11e-01 0.214 0.133 0.204 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 1.95e-01 0.111 0.0857 0.23 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 8.43e-01 0.0177 0.0893 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 2.38e-01 0.123 0.104 0.23 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 2.16e-01 0.0648 0.0523 0.23 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 829453 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00415 0.0727 0.23 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00592 0.102 0.23 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0324 0.102 0.23 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0854 0.101 0.229 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 9.53e-01 0.00383 0.0651 0.229 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 5.27e-01 0.0673 0.106 0.229 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0366 0.064 0.229 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 2.90e-01 0.0734 0.0692 0.229 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 9.85e-01 0.00185 0.0977 0.229 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 7.33e-01 0.0285 0.0836 0.237 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 6.09e-02 0.157 0.0834 0.237 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 5.31e-01 0.0678 0.108 0.237 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 9.93e-01 0.000684 0.0824 0.237 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 1.75e-01 0.131 0.0958 0.237 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 9.28e-01 0.00772 0.0848 0.237 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 3.87e-01 0.0928 0.107 0.237 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0975 0.11 0.237 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0199 0.0605 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 4.87e-01 0.0451 0.0649 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0595 0.109 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 3.64e-01 0.0592 0.0651 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 3.76e-02 -0.194 0.0929 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0175 0.0678 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 1.22e-01 0.108 0.0692 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 7.58e-01 0.0269 0.0871 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 4.22e-02 -0.142 0.0693 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 4.71e-01 0.0518 0.0718 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 9.90e-02 -0.185 0.112 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000753 0.0622 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0677 0.105 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 8.35e-01 0.0176 0.0846 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 9.08e-01 0.0103 0.0893 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00814 0.0872 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 1.64e-01 0.141 0.101 0.221 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 1.00e+00 3.54e-05 0.0893 0.221 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 1.83e-01 -0.171 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 6.65e-01 0.0271 0.0623 0.221 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 829453 sc-eQTL 4.96e-02 0.192 0.0971 0.221 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 2.91e-01 0.139 0.131 0.221 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 8.79e-02 -0.192 0.112 0.221 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0375 0.075 0.231 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 2.26e-01 0.12 0.0988 0.231 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 4.35e-01 -0.079 0.101 0.231 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 4.81e-01 0.0457 0.0647 0.231 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 7.19e-01 0.0359 0.0995 0.231 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 3.15e-01 0.106 0.105 0.231 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 7.51e-01 0.0307 0.0966 0.231 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 3.64e-01 0.101 0.111 0.231 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 4.74e-02 -0.175 0.0876 0.231 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0833 0.0684 0.231 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 6.37e-01 0.0518 0.109 0.231 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 5.45e-01 0.0474 0.0782 0.231 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0541 0.0966 0.231 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0707 0.102 0.231 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 4.39e-01 0.0758 0.0977 0.231 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0881 0.103 0.231 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0741 0.0983 0.24 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 3.78e-01 0.0652 0.0737 0.24 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0418 0.108 0.24 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0222 0.0913 0.24 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0794 0.0755 0.24 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 1.04e-01 0.197 0.12 0.24 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0537 0.0926 0.24 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 5.45e-01 0.0676 0.112 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0467 0.0872 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 5.79e-01 0.0272 0.0489 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 1.64e-01 0.14 0.0999 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 7.94e-02 -0.108 0.0611 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0243 0.0815 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 8.37e-01 0.0215 0.104 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0931 0.0881 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0344 0.0405 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 9.30e-01 0.00946 0.108 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0762 0.0503 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 1.02e-02 -0.189 0.073 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0469 0.09 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0807 0.0608 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 2.55e-01 0.0646 0.0566 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 1.49e-01 -0.158 0.109 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 7.55e-01 0.0176 0.0564 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 1.05e-02 -0.249 0.0965 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0411 0.0661 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 1.54e-01 0.0963 0.0673 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 9.36e-01 0.00636 0.0787 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 8.44e-02 -0.127 0.073 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 6.36e-01 0.0315 0.0664 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 7.98e-01 0.0284 0.111 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 8.92e-01 0.00936 0.0687 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 528969 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0305 0.107 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 5.24e-01 0.0563 0.0881 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 4.07e-01 0.0764 0.092 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 295743 sc-eQTL 8.71e-01 0.017 0.105 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0601 0.0686 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 789937 sc-eQTL 9.19e-02 0.0671 0.0396 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 257224 sc-eQTL 4.03e-01 -0.097 0.116 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -787426 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0784 0.0624 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 287311 sc-eQTL 3.97e-01 0.0716 0.0844 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -788445 sc-eQTL 4.33e-02 -0.176 0.0868 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 pQTL 0.000567 -0.0651 0.0188 0.0 0.0 0.205
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 eQTL 0.000187 -0.0619 0.0165 0.0 0.0 0.202

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -139661 4.02e-06 3.85e-06 6.52e-07 2.04e-06 1.12e-06 1.03e-06 2.62e-06 8.92e-07 3.25e-06 1.63e-06 3.5e-06 2.85e-06 6.4e-06 1.33e-06 1.06e-06 2.54e-06 1.8e-06 2.33e-06 1.43e-06 9.52e-07 1.9e-06 3.73e-06 3.53e-06 1.71e-06 4.83e-06 1.31e-06 1.84e-06 1.48e-06 3.81e-06 3.38e-06 1.93e-06 5.42e-07 8.14e-07 1.77e-06 1.98e-06 9.43e-07 9.24e-07 4.74e-07 1.04e-06 3.45e-07 4.41e-07 5.01e-06 3.81e-07 1.84e-07 3.99e-07 3.52e-07 7.44e-07 3.18e-07 2.69e-07