logo

Genes within 1Mb (chr6:137059114:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00768 0.0802 0.237 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00505 0.0357 0.237 B L1
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0281 0.0949 0.237 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0489 0.0505 0.237 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 4.85e-03 -0.197 0.0692 0.237 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 4.23e-01 0.0639 0.0795 0.237 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0346 0.0539 0.237 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 6.01e-01 0.0213 0.0408 0.237 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 6.58e-02 -0.159 0.0862 0.237 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0424 0.0546 0.237 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0486 0.0415 0.237 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0582 0.0687 0.237 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0224 0.0619 0.237 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.40e-01 0.0324 0.0418 0.237 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 8.88e-02 -0.175 0.103 0.237 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0551 0.052 0.237 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 3.85e-01 0.0479 0.055 0.237 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.92e-01 0.041 0.0765 0.237 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.28e-01 0.026 0.0748 0.241 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 5.55e-01 0.0398 0.0673 0.241 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 6.42e-01 -0.049 0.105 0.241 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0385 0.08 0.241 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 9.01e-01 0.0107 0.0866 0.241 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.64e-01 0.00376 0.083 0.241 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 6.83e-01 0.0333 0.0815 0.241 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0856 0.108 0.241 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.49e-02 -0.112 0.0624 0.237 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 1.66e-01 0.0744 0.0535 0.237 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 1.84e-01 -0.14 0.105 0.237 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 7.04e-01 0.0203 0.0533 0.237 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 3.19e-02 -0.199 0.0923 0.237 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0171 0.0622 0.237 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.45e-02 0.127 0.0655 0.237 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0197 0.0754 0.237 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0755 0.0689 0.238 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 2.22e-01 0.0448 0.0366 0.238 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0437 0.107 0.238 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0232 0.0575 0.238 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.52e-01 0.00501 0.0824 0.238 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 1.75e-01 -0.11 0.0811 0.238 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 5.47e-01 0.039 0.0646 0.237 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00337 0.0542 0.237 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 5.14e-01 0.0688 0.105 0.237 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.39e-01 -0.00816 0.0402 0.237 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 808779 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0415 0.0609 0.237 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.72e-01 0.00271 0.0777 0.237 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.70e-01 0.0131 0.0798 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 3.26e-01 -0.106 0.107 0.24 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00456 0.0874 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 6.26e-01 0.0516 0.106 0.24 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 4.41e-01 0.0819 0.106 0.24 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 2.66e-01 -0.132 0.119 0.24 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 6.88e-01 0.0373 0.0928 0.24 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0183 0.0952 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 1.37e-01 0.0805 0.0539 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 1.69e-01 0.137 0.0992 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.94e-01 0.0095 0.0712 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0564 0.086 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.23e-01 0.0226 0.101 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0906 0.103 0.237 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 6.18e-01 0.0306 0.0614 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0014 0.104 0.237 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0234 0.0676 0.237 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 1.40e-01 0.136 0.0919 0.237 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0162 0.101 0.237 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0209 0.0809 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0199 0.0462 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0765 0.107 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0434 0.0541 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 1.86e-01 -0.1 0.0758 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 4.99e-01 0.0574 0.0848 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 9.17e-01 0.0103 0.0989 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 8.22e-01 0.0129 0.0574 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 7.13e-01 0.0398 0.108 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0832 0.0786 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.44e-03 -0.216 0.0825 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0441 0.102 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 8.10e-01 0.0225 0.0935 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0456 0.0829 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.70e-01 0.075 0.104 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0217 0.0613 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 2.16e-01 -0.121 0.0975 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0521 0.0954 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0195 0.0514 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.84e-01 0.0289 0.0412 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 7.93e-02 -0.17 0.0964 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0668 0.056 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00313 0.0413 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 9.36e-02 -0.122 0.0723 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0884 0.0708 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 5.70e-01 0.0255 0.0448 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0436 0.104 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0375 0.0511 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 2.99e-02 -0.126 0.0576 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 9.96e-01 0.000323 0.0717 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0858 0.0809 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 6.72e-01 0.0244 0.0575 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0097 0.105 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 1.37e-01 0.0799 0.0536 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 5.60e-02 -0.159 0.0825 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00696 0.0864 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 8.63e-01 0.0128 0.0742 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.75e-01 0.0354 0.0494 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.41e-01 0.0788 0.102 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0445 0.0624 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 1.00e-01 0.145 0.0876 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 9.34e-01 0.00729 0.0878 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0144 0.0735 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 5.30e-01 0.0322 0.0513 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0736 0.106 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0302 0.0575 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0281 0.0681 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0849 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 2.85e-01 -0.105 0.0975 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 8.86e-01 0.0106 0.0734 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 1.77e-02 -0.265 0.111 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.76e-01 0.00827 0.053 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0173 0.0946 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.48e-01 0.0186 0.097 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0731 0.094 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0997 0.0885 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.12e-01 0.0889 0.108 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0613 0.0693 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0953 0.107 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0239 0.103 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0204 0.0744 0.238 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 5.66e-01 0.0355 0.0617 0.238 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0207 0.101 0.238 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0132 0.05 0.238 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 808779 sc-eQTL 2.91e-01 0.088 0.0831 0.238 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 7.00e-01 0.0336 0.0871 0.238 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 3.36e-01 0.089 0.0923 0.238 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0704 0.082 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 9.98e-01 0.000186 0.0606 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 3.28e-01 0.105 0.107 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 5.64e-01 0.0353 0.0611 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0651 0.0929 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.53e-01 0.0181 0.0975 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 9.05e-01 0.00767 0.064 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 6.60e-01 0.0184 0.0418 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0113 0.11 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00522 0.0603 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.10e-01 0.00981 0.0868 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 2.54e-01 -0.103 0.09 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 5.96e-02 -0.156 0.0824 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.01e-01 0.0592 0.0703 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 1.67e-01 0.146 0.105 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 2.31e-01 -0.079 0.0657 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 3.20e-01 0.104 0.105 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 1.51e-01 -0.152 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 2.12e-01 -0.084 0.0671 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 6.07e-02 0.0941 0.0499 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 1.45e-01 -0.154 0.105 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.70e-01 -0.00985 0.0602 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0333 0.0826 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0698 0.0905 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0903 0.143 0.207 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 1.80e-02 -0.289 0.12 0.207 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00553 0.147 0.207 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0247 0.111 0.207 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0856 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 4.34e-02 0.268 0.131 0.207 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 9.07e-02 0.142 0.0836 0.239 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 7.14e-01 0.032 0.0873 0.239 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.33e-01 0.0802 0.102 0.239 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 5.66e-01 0.0295 0.0513 0.239 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 808779 sc-eQTL 9.60e-01 0.00353 0.0711 0.239 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.14e-01 0.0107 0.0994 0.239 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.14e-01 -0.065 0.0995 0.239 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0687 0.0973 0.237 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.75e-01 0.0449 0.0628 0.237 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 7.12e-01 0.0381 0.103 0.237 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.42e-01 0.0124 0.0619 0.237 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 7.58e-02 0.119 0.0666 0.237 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 6.98e-01 0.0367 0.0944 0.237 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 6.55e-01 0.0363 0.0811 0.244 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 9.84e-02 0.135 0.0812 0.244 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.59e-01 0.0778 0.105 0.244 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0112 0.08 0.244 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 2.76e-01 0.102 0.0932 0.244 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0545 0.0822 0.244 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 6.16e-01 0.0523 0.104 0.244 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0946 0.107 0.244 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.72e-01 -0.017 0.0585 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 2.27e-01 0.0757 0.0625 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0592 0.105 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 4.03e-01 0.0527 0.0628 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 1.54e-01 -0.129 0.0902 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0161 0.0654 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.06e-02 0.117 0.0667 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 8.30e-01 0.0181 0.0841 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 6.77e-02 -0.123 0.0669 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.49e-01 0.0525 0.0692 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 2.42e-01 -0.127 0.108 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.13e-01 0.0142 0.0599 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0449 0.101 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.27e-01 0.00743 0.0814 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.96e-01 0.0456 0.086 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0606 0.0839 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 1.50e-01 0.139 0.0961 0.233 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 7.84e-01 0.0235 0.0852 0.233 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 3.23e-01 -0.121 0.122 0.233 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 4.58e-01 0.0443 0.0594 0.233 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 808779 sc-eQTL 8.90e-02 0.159 0.093 0.233 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 2.96e-01 0.132 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.107 0.233 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0473 0.0724 0.24 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 2.27e-01 0.115 0.0953 0.24 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 1.71e-01 -0.134 0.0972 0.24 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.02e-01 0.0157 0.0625 0.24 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 9.25e-01 0.00901 0.0961 0.24 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 3.17e-01 0.102 0.102 0.24 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 7.95e-01 0.0242 0.0932 0.24 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 3.42e-01 0.102 0.107 0.24 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 6.19e-02 -0.16 0.0853 0.24 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0623 0.0667 0.24 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0555 0.107 0.24 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 9.79e-01 0.00203 0.0761 0.24 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0334 0.0941 0.24 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0561 0.0989 0.24 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 6.07e-01 0.0491 0.0952 0.24 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00462 0.1 0.24 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0449 0.0947 0.254 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 8.09e-01 0.0172 0.071 0.254 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0845 0.104 0.254 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0563 0.0877 0.254 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 9.82e-02 -0.12 0.0722 0.254 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 2.86e-01 0.124 0.116 0.254 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0492 0.089 0.254 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00643 0.107 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0306 0.0841 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.21e-01 0.038 0.0472 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 2.95e-01 0.101 0.0965 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0565 0.0592 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00542 0.0786 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.04e-01 0.0671 0.1 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0135 0.0854 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0173 0.0392 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0698 0.104 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0617 0.0487 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 6.03e-03 -0.195 0.0704 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 7.82e-01 0.0242 0.0871 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0671 0.0587 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 1.17e-01 0.0859 0.0545 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 2.93e-01 -0.111 0.105 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.17e-01 0.0126 0.0545 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 4.30e-02 -0.191 0.0936 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0392 0.0638 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 8.98e-02 0.111 0.0649 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0164 0.076 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 1.04e-01 -0.115 0.0702 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 4.12e-01 0.0524 0.0638 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0778 0.107 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00939 0.066 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 508295 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0687 0.103 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 5.15e-01 0.0552 0.0846 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 5.52e-01 0.0527 0.0884 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 275069 sc-eQTL 5.89e-01 0.0544 0.1 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0542 0.0654 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 769263 sc-eQTL 7.06e-02 0.0685 0.0377 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 236550 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0986 0.11 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -808100 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0287 0.0596 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 266637 sc-eQTL 9.28e-01 0.00725 0.0806 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -809119 sc-eQTL 1.37e-01 -0.124 0.083 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 pQTL 8.54e-05 -0.0716 0.0182 0.0 0.0 0.223
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 eQTL 3.48e-06 -0.0739 0.0158 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -160335 4.68e-06 5.16e-06 6.38e-07 3.42e-06 8.92e-07 1.39e-06 4.87e-06 9.99e-07 5.1e-06 2.53e-06 5.59e-06 3.33e-06 7.43e-06 2.29e-06 1.21e-06 3.87e-06 1.8e-06 3.43e-06 1.55e-06 1.15e-06 2.63e-06 4.86e-06 3.54e-06 1.38e-06 7.21e-06 1.37e-06 2.43e-06 1.64e-06 4.53e-06 4.17e-06 2.83e-06 5.08e-07 5.55e-07 1.86e-06 2.07e-06 9.03e-07 9.88e-07 5.11e-07 9.45e-07 4e-07 2.54e-07 7e-06 3.82e-07 1.56e-07 3.65e-07 1.19e-06 9.5e-07 5.21e-07 5.73e-07