logo

Genes within 1Mb (chr6:137057743:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 9.66e-01 0.0034 0.0801 0.235 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00525 0.0357 0.235 B L1
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0191 0.0948 0.235 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0418 0.0505 0.235 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 4.97e-03 -0.196 0.0691 0.235 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 4.62e-01 0.0585 0.0794 0.235 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0218 0.0539 0.235 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 7.02e-01 0.0156 0.0408 0.235 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 6.60e-02 -0.159 0.0861 0.235 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0416 0.0545 0.235 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0478 0.0415 0.235 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0657 0.0686 0.235 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0187 0.0618 0.235 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 5.09e-01 0.0277 0.0418 0.235 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 1.26e-01 -0.157 0.103 0.235 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0565 0.0519 0.235 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 3.92e-01 0.047 0.0549 0.235 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 7.07e-01 0.0287 0.0764 0.235 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.79e-01 0.021 0.0747 0.239 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 4.58e-01 0.05 0.0672 0.239 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0592 0.105 0.239 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0389 0.0798 0.239 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 8.71e-01 0.0141 0.0865 0.239 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.98e-01 0.000243 0.0829 0.239 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 6.50e-01 0.037 0.0814 0.239 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0903 0.108 0.239 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 6.27e-02 -0.117 0.0624 0.235 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 1.92e-01 0.0701 0.0535 0.235 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 1.95e-01 -0.137 0.105 0.235 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 7.69e-01 0.0157 0.0533 0.235 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 2.34e-02 -0.21 0.0922 0.235 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0214 0.0622 0.235 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 7.23e-02 0.118 0.0656 0.235 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0183 0.0754 0.235 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0697 0.0689 0.236 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 2.71e-01 0.0404 0.0366 0.236 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0417 0.107 0.236 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0212 0.0575 0.236 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00343 0.0823 0.236 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 1.94e-01 -0.106 0.0811 0.236 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 5.48e-01 0.0389 0.0646 0.235 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0105 0.0542 0.235 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 4.86e-01 0.0735 0.105 0.235 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 8.52e-01 -0.00752 0.0402 0.235 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 807408 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0255 0.0609 0.235 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0079 0.0776 0.235 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 8.48e-01 0.0153 0.0798 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0761 0.107 0.237 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0224 0.0872 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.60e-01 0.0616 0.106 0.237 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.60e-01 0.0785 0.106 0.237 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 2.13e-01 -0.148 0.118 0.237 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 6.36e-01 0.0439 0.0926 0.237 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0177 0.0951 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 1.15e-01 0.0851 0.0538 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 1.70e-01 0.136 0.0991 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 9.12e-01 0.00787 0.0712 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0594 0.0859 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 8.08e-01 0.0246 0.101 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 3.53e-01 -0.096 0.103 0.235 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 5.41e-01 0.0376 0.0613 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0057 0.104 0.235 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0198 0.0676 0.235 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 1.30e-01 0.14 0.0918 0.235 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0267 0.101 0.235 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0075 0.0809 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 5.73e-01 -0.026 0.0462 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0686 0.107 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0379 0.0541 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0903 0.0758 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 5.50e-01 0.0507 0.0847 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 8.87e-01 0.0141 0.0989 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 9.04e-01 0.00692 0.0573 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.98e-01 0.0571 0.108 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 2.98e-01 -0.082 0.0786 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 7.09e-03 -0.224 0.0824 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0542 0.102 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.25e-01 0.0329 0.0936 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0453 0.083 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 4.78e-01 0.0737 0.104 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0204 0.0614 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 1.60e-01 -0.137 0.0975 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0593 0.0955 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00806 0.0513 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 6.02e-01 0.0215 0.0412 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 6.93e-02 -0.176 0.0962 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0647 0.0559 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00328 0.0412 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 8.74e-02 -0.124 0.0722 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 2.37e-01 -0.084 0.0707 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 6.81e-01 0.0184 0.0448 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0207 0.104 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0382 0.0511 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 4.88e-02 -0.114 0.0577 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0105 0.0717 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0838 0.0808 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 5.44e-01 0.0349 0.0574 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0116 0.105 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 1.27e-01 0.0821 0.0535 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 6.50e-02 -0.153 0.0825 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0281 0.0863 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.75e-01 0.0212 0.0742 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 4.38e-01 0.0384 0.0494 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.08e-01 0.0676 0.102 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0462 0.0624 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 1.28e-01 0.134 0.0876 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00688 0.0878 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0137 0.0734 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 6.06e-01 0.0264 0.0512 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0606 0.106 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 5.54e-01 -0.034 0.0574 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0281 0.068 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0563 0.0848 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 2.26e-01 -0.118 0.0973 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 9.44e-01 0.00513 0.0733 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 2.14e-02 -0.256 0.111 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 8.22e-01 0.0119 0.0529 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0159 0.0945 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 8.89e-01 0.0136 0.0968 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0829 0.0938 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 2.48e-01 -0.102 0.0884 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 3.39e-01 0.103 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0505 0.0692 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0993 0.107 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00589 0.103 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0184 0.0743 0.236 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 6.46e-01 0.0284 0.0617 0.236 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0236 0.101 0.236 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0134 0.05 0.236 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 807408 sc-eQTL 2.65e-01 0.0927 0.083 0.236 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 7.57e-01 0.027 0.0871 0.236 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 3.45e-01 0.0874 0.0922 0.236 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0604 0.082 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000525 0.0606 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 3.39e-01 0.102 0.107 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 5.38e-01 0.0377 0.0611 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0656 0.0929 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 8.24e-01 0.0217 0.0975 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 9.05e-01 0.00761 0.0639 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 7.50e-01 0.0133 0.0418 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0134 0.11 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00852 0.0602 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.80e-01 0.00214 0.0867 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 2.30e-01 -0.108 0.0899 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.51e-02 -0.148 0.0825 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 4.93e-01 0.0483 0.0704 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 1.59e-01 0.149 0.105 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0812 0.0657 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 3.54e-01 0.0972 0.105 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 1.68e-01 -0.147 0.106 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0797 0.0672 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 6.49e-02 0.0926 0.0499 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 1.71e-01 -0.145 0.105 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00698 0.0602 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0414 0.0827 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 5.16e-01 -0.059 0.0906 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0903 0.143 0.207 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 1.80e-02 -0.289 0.12 0.207 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00553 0.147 0.207 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0247 0.111 0.207 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0856 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 4.34e-02 0.268 0.131 0.207 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 9.26e-02 0.141 0.0836 0.237 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 8.32e-01 0.0185 0.0873 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 3.66e-01 0.0924 0.102 0.237 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 6.45e-01 0.0236 0.0513 0.237 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 807408 sc-eQTL 8.05e-01 0.0175 0.0711 0.237 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.76e-01 0.00303 0.0993 0.237 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0482 0.0995 0.237 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0637 0.0972 0.235 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 4.26e-01 0.0501 0.0628 0.235 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 7.63e-01 0.031 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 9.38e-01 0.00484 0.0619 0.235 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.64e-02 0.111 0.0666 0.235 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 6.90e-01 0.0377 0.0943 0.235 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.03e-01 0.0309 0.0811 0.241 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 8.65e-02 0.14 0.0811 0.241 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.90e-01 0.0565 0.105 0.241 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0119 0.0799 0.241 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 2.71e-01 0.103 0.0931 0.241 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0508 0.0822 0.241 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 6.50e-01 0.0473 0.104 0.241 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0961 0.107 0.241 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0198 0.0584 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 2.60e-01 0.0705 0.0624 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0475 0.105 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.47e-01 0.0479 0.0628 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 1.22e-01 -0.14 0.09 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0197 0.0654 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 1.03e-01 0.109 0.0667 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 8.30e-01 0.018 0.084 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 5.20e-02 -0.131 0.0668 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 5.27e-01 0.0438 0.0692 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 2.21e-01 -0.132 0.108 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 9.00e-01 0.00754 0.0599 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0578 0.101 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.22e-01 0.00798 0.0814 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 7.06e-01 0.0325 0.086 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0517 0.0838 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 1.50e-01 0.139 0.0961 0.233 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 7.84e-01 0.0235 0.0852 0.233 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 3.23e-01 -0.121 0.122 0.233 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 4.58e-01 0.0443 0.0594 0.233 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 807408 sc-eQTL 8.90e-02 0.159 0.093 0.233 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 2.96e-01 0.132 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.107 0.233 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0555 0.0724 0.238 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 2.77e-01 0.104 0.0955 0.238 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 1.83e-01 -0.13 0.0973 0.238 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 8.24e-01 0.0139 0.0626 0.238 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 8.14e-01 0.0227 0.0962 0.238 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 3.51e-01 0.095 0.102 0.238 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 7.87e-01 0.0253 0.0933 0.238 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 4.30e-01 0.085 0.107 0.238 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 6.18e-02 -0.16 0.0852 0.238 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0618 0.0666 0.238 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 5.80e-01 -0.059 0.106 0.238 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 9.34e-01 0.00631 0.0761 0.238 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0363 0.094 0.238 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0582 0.0988 0.238 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 6.09e-01 0.0487 0.0951 0.238 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 9.99e-01 7.35e-05 0.1 0.238 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0465 0.0945 0.251 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 7.10e-01 0.0264 0.0709 0.251 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0823 0.104 0.251 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0567 0.0876 0.251 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 1.23e-01 -0.112 0.0722 0.251 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 3.35e-01 0.112 0.116 0.251 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0406 0.089 0.251 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0213 0.107 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0288 0.084 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 3.65e-01 0.0427 0.0471 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 3.05e-01 0.099 0.0964 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0531 0.0591 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00747 0.0784 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 5.16e-01 0.0652 0.1 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00105 0.0854 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0226 0.0392 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0522 0.104 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0557 0.0487 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 7.26e-03 -0.191 0.0704 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 8.64e-01 0.0149 0.087 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0724 0.0586 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 1.42e-01 0.0802 0.0545 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 3.14e-01 -0.106 0.105 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 9.16e-01 0.00578 0.0544 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 3.20e-02 -0.202 0.0934 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0413 0.0637 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 1.24e-01 0.1 0.0649 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0146 0.0759 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 9.62e-02 -0.117 0.0702 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 4.28e-01 0.0506 0.0638 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0819 0.106 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0042 0.066 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 506924 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0659 0.103 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 5.40e-01 0.052 0.0846 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 5.37e-01 0.0547 0.0884 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 273698 sc-eQTL 5.92e-01 0.0539 0.1 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0511 0.0653 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 767892 sc-eQTL 9.25e-02 0.0637 0.0377 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 235179 sc-eQTL 3.90e-01 -0.095 0.11 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -809471 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0277 0.0596 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 265266 sc-eQTL 9.96e-01 0.000369 0.0805 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -810490 sc-eQTL 1.49e-01 -0.12 0.083 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 pQTL 8.98e-05 -0.0714 0.0182 0.0 0.0 0.223
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 eQTL 3.5e-06 -0.0739 0.0158 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -161706 3.17e-06 2.61e-06 4.62e-07 1.71e-06 6.64e-07 7.53e-07 2.11e-06 8.06e-07 2.27e-06 1.18e-06 2.51e-06 1.45e-06 3.55e-06 1.38e-06 9.13e-07 1.98e-06 1.41e-06 2.2e-06 1.38e-06 1.5e-06 1.37e-06 3.15e-06 2.72e-06 1.4e-06 3.8e-06 1.13e-06 1.5e-06 1.79e-06 2.71e-06 2.28e-06 1.84e-06 3.78e-07 6.11e-07 1.33e-06 1.27e-06 1.01e-06 7.36e-07 4.58e-07 1.33e-06 3.98e-07 2.08e-07 3.49e-06 5.88e-07 1.9e-07 3.27e-07 3.48e-07 8.5e-07 2.22e-07 1.59e-07