Genes within 1Mb (chr6:137016118:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.96e-01 0.0496 0.127 0.079 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.05e-01 0.0214 0.0565 0.079 B L1
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 6.75e-02 0.274 0.149 0.079 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0475 0.08 0.079 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0191 0.112 0.079 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 3.61e-01 -0.115 0.126 0.079 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.52e-01 0.0383 0.0847 0.079 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0779 0.0639 0.079 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 3.17e-01 -0.137 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 7.97e-01 0.0221 0.0859 0.079 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 1.72e-01 0.0892 0.0651 0.079 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 8.18e-02 0.188 0.107 0.079 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0182 0.0964 0.079 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0794 0.065 0.079 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 5.06e-03 0.447 0.158 0.079 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 6.08e-01 0.0416 0.0811 0.079 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0442 0.0857 0.079 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 6.71e-02 0.218 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 4.45e-02 -0.247 0.122 0.077 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.61e-01 0.0338 0.111 0.077 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 6.29e-02 0.323 0.173 0.077 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 2.46e-01 0.153 0.132 0.077 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 5.37e-01 0.0884 0.143 0.077 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 3.03e-01 -0.141 0.137 0.077 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0613 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 5.25e-03 0.495 0.176 0.077 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 9.93e-01 0.000858 0.0985 0.079 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 1.32e-01 -0.127 0.0837 0.079 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 3.51e-01 0.154 0.165 0.079 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 2.39e-01 0.0984 0.0833 0.079 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0496 0.146 0.079 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 2.93e-01 -0.103 0.0972 0.079 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 5.49e-01 -0.062 0.103 0.079 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 4.38e-01 0.0916 0.118 0.079 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 5.26e-01 0.069 0.109 0.079 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 9.76e-01 0.00177 0.0578 0.079 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 1.83e-01 0.224 0.167 0.079 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 2.38e-01 0.107 0.0903 0.079 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 8.84e-01 0.019 0.13 0.079 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 7.16e-03 0.343 0.126 0.079 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 9.32e-01 0.00863 0.101 0.079 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0508 0.0843 0.079 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 8.59e-01 0.0291 0.164 0.079 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 7.18e-01 0.0227 0.0626 0.079 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 765783 sc-eQTL 5.78e-02 -0.179 0.094 0.079 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0186 0.121 0.079 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0842 0.124 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0778 0.163 0.084 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.65e-01 0.0396 0.132 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 7.17e-01 0.0581 0.16 0.084 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 4.53e-02 0.321 0.159 0.084 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0405 0.18 0.084 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 3.89e-01 -0.121 0.14 0.084 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 3.93e-01 -0.127 0.149 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.29e-01 0.0294 0.0847 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 4.41e-01 0.12 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0588 0.111 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00939 0.135 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 6.94e-01 0.0623 0.158 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 3.76e-01 0.146 0.164 0.078 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0504 0.0975 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 2.72e-02 -0.365 0.164 0.078 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.57e-01 0.0991 0.107 0.078 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 9.20e-01 0.0148 0.147 0.078 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 3.76e-01 0.142 0.16 0.078 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 4.60e-01 0.0952 0.129 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0343 0.0736 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 1.93e-01 0.221 0.169 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 2.23e-01 -0.105 0.086 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 1.42e-01 0.178 0.121 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 2.16e-01 -0.167 0.135 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 9.75e-01 0.00499 0.158 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 8.31e-02 0.159 0.0911 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 7.45e-01 0.0565 0.173 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.76e-01 -0.112 0.126 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 9.59e-01 0.00692 0.134 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 6.27e-01 0.0792 0.163 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 8.22e-01 0.034 0.151 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0888 0.134 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 9.92e-01 0.0017 0.167 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 5.24e-01 0.0631 0.0988 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 1.94e-01 -0.205 0.157 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0331 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.14e-01 0.0405 0.0803 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0631 0.0643 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0802 0.152 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 4.98e-01 0.0596 0.0877 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0245 0.0644 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 1.20e-01 0.177 0.113 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 7.20e-01 0.0408 0.114 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0798 0.0715 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 4.72e-01 -0.12 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0933 0.0816 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 6.88e-02 0.169 0.0926 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 7.08e-01 -0.043 0.115 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00299 0.127 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 1.90e-01 -0.118 0.0899 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 6.72e-02 -0.3 0.163 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0557 0.0845 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 2.51e-02 0.291 0.129 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 2.27e-02 0.307 0.134 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 2.16e-01 0.143 0.115 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0618 0.0768 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 2.96e-01 0.166 0.158 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 6.38e-01 0.0457 0.0971 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 2.98e-02 -0.297 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 9.72e-02 0.226 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.36e-02 -0.21 0.113 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0997 0.0791 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 5.96e-01 0.0875 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 8.69e-01 0.0147 0.0889 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 5.04e-01 0.0705 0.105 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 5.74e-01 0.0739 0.131 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 1.07e-01 -0.26 0.161 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 3.75e-01 0.108 0.121 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 2.86e-01 0.198 0.185 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0511 0.0876 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 3.83e-01 0.137 0.156 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 8.97e-03 0.416 0.158 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 9.11e-01 0.0166 0.148 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 6.52e-01 0.0632 0.14 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 3.03e-01 -0.176 0.17 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.61e-01 0.0999 0.109 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 4.39e-01 0.131 0.169 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 2.33e-01 0.194 0.162 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 3.95e-01 0.0997 0.117 0.08 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.43e-02 -0.173 0.0967 0.08 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 1.46e-01 0.231 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 6.70e-01 0.0337 0.0789 0.08 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 765783 sc-eQTL 3.91e-01 -0.113 0.131 0.08 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 2.57e-01 -0.156 0.137 0.08 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0413 0.146 0.08 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.24e-01 0.0663 0.135 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.26e-01 -0.035 0.0996 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 1.25e-01 0.269 0.175 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.72e-01 0.0899 0.1 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0587 0.153 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 2.72e-02 0.352 0.158 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0526 0.1 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 8.65e-01 0.0111 0.0656 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 5.59e-01 0.101 0.173 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.20e-01 0.094 0.0944 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000215 0.136 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 3.70e-02 0.294 0.14 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 3.84e-01 0.115 0.132 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 5.62e-01 -0.065 0.112 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 4.64e-01 -0.123 0.168 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 2.89e-01 0.111 0.104 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 5.17e-01 0.108 0.166 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 2.62e-01 0.189 0.168 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 2.70e-01 0.117 0.106 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0428 0.0793 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 5.22e-01 0.107 0.167 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.27e-01 0.0929 0.0946 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 5.87e-01 0.0708 0.13 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 6.59e-02 0.262 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 1.35e-01 0.311 0.206 0.07 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.22e-01 0.0641 0.18 0.07 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0173 0.214 0.07 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 4.68e-03 0.451 0.156 0.07 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 2.52e-01 -0.211 0.183 0.07 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0727 0.194 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 3.68e-01 -0.12 0.133 0.078 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 3.27e-01 0.136 0.138 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 3.27e-01 0.159 0.162 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 1.43e-01 0.119 0.081 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 765783 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0539 0.113 0.078 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 1.18e-01 0.246 0.157 0.078 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 2.61e-01 0.178 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 5.29e-01 0.0962 0.152 0.079 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0721 0.0984 0.079 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 7.44e-01 0.0526 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0965 0.079 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 1.60e-02 0.252 0.104 0.079 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 1.30e-01 0.224 0.147 0.079 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 2.42e-01 -0.165 0.141 0.076 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 8.01e-01 0.0359 0.142 0.076 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 3.67e-01 0.165 0.182 0.076 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.28e-01 0.136 0.139 0.076 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 3.17e-01 0.163 0.162 0.076 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 2.19e-01 -0.176 0.143 0.076 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0755 0.181 0.076 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 1.40e-01 0.275 0.185 0.076 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0499 0.0913 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0926 0.0978 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 1.99e-01 0.211 0.164 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 1.83e-01 0.131 0.098 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 7.22e-01 0.0505 0.142 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0253 0.102 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 3.40e-01 -0.1 0.105 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 7.31e-01 0.0453 0.131 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 9.29e-01 0.00934 0.105 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 3.49e-01 -0.101 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0256 0.169 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 2.63e-01 0.105 0.0933 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 4.13e-01 -0.129 0.157 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 5.11e-02 -0.247 0.126 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 7.71e-01 0.0391 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 1.23e-01 0.202 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 3.59e-01 -0.138 0.15 0.085 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 5.85e-02 -0.25 0.131 0.085 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 8.47e-01 0.0368 0.191 0.085 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 1.85e-01 -0.123 0.0921 0.085 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 765783 sc-eQTL 9.21e-01 0.0145 0.146 0.085 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 9.06e-01 0.0232 0.196 0.085 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 4.33e-02 -0.337 0.165 0.085 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 1.72e-01 -0.154 0.113 0.082 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 8.26e-02 0.259 0.148 0.082 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 8.79e-01 0.0233 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0957 0.0974 0.082 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 5.95e-01 0.0798 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 4.62e-01 -0.117 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 1.85e-01 -0.193 0.145 0.082 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 8.05e-01 0.0416 0.168 0.082 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0893 0.143 0.077 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 3.07e-01 0.114 0.111 0.077 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 5.39e-03 0.49 0.174 0.077 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 7.32e-01 0.0436 0.127 0.077 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 7.74e-01 -0.045 0.157 0.077 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0166 0.165 0.077 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 5.50e-01 0.095 0.159 0.077 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 2.58e-02 -0.371 0.165 0.077 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 4.85e-01 -0.118 0.169 0.068 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 8.29e-01 0.0275 0.127 0.068 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 4.76e-01 -0.133 0.186 0.068 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0229 0.157 0.068 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0997 0.13 0.068 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 4.93e-01 0.143 0.208 0.068 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 9.44e-01 0.0112 0.16 0.068 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 1.04e-01 0.312 0.191 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0783 0.132 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 3.73e-01 0.0661 0.074 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0546 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 4.02e-01 0.0781 0.0929 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 6.91e-01 -0.049 0.123 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 8.32e-01 0.0334 0.157 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 5.17e-01 0.0883 0.136 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 7.82e-01 0.0173 0.0626 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 1.38e-01 0.246 0.165 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0742 0.0779 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.114 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 4.06e-01 -0.115 0.139 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 7.19e-01 -0.033 0.0917 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 1.27e-01 -0.13 0.0849 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 4.35e-01 0.128 0.164 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 8.97e-02 0.144 0.0842 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0511 0.147 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 1.95e-01 -0.129 0.099 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0499 0.102 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 3.62e-01 0.108 0.118 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 1.89e-01 -0.147 0.111 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 1.77e-01 0.136 0.101 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 1.80e-01 0.226 0.168 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 4.82e-01 0.0736 0.104 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 465299 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00264 0.163 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0605 0.134 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0344 0.14 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 232073 sc-eQTL 1.16e-01 -0.25 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -203331 sc-eQTL 6.44e-01 0.0476 0.103 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 726267 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00819 0.0598 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 193554 sc-eQTL 4.74e-01 0.125 0.174 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -851096 sc-eQTL 3.14e-01 0.0947 0.0937 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 223641 sc-eQTL 5.93e-01 0.068 0.127 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -852115 sc-eQTL 3.84e-02 0.271 0.13 0.08 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000016402 IL20RA -29062 pQTL 0.00627 0.162 0.0593 0.00289 0.0 0.0683
ENSG00000182747 SLC35D3 93817 eQTL 0.414 0.0496 0.0607 0.0477 0.00686 0.0672


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina