logo

Genes within 1Mb (chr6:136992330:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 8.14e-01 0.0249 0.106 0.118 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 4.78e-01 0.0334 0.047 0.118 B L1
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.125 0.118 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 2.04e-01 0.0846 0.0664 0.118 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0801 0.0927 0.118 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0517 0.105 0.118 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 1.14e-01 -0.111 0.0702 0.118 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 1.97e-01 0.0689 0.0533 0.118 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 4.08e-01 0.0941 0.114 0.118 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 3.23e-01 0.0708 0.0714 0.118 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 3.98e-01 0.0461 0.0544 0.118 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0247 0.0901 0.118 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0717 0.0805 0.118 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 7.28e-01 0.019 0.0546 0.118 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.86e-01 -0.178 0.134 0.118 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 6.79e-01 0.0281 0.0678 0.118 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 6.55e-01 0.0321 0.0717 0.118 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 2.61e-01 -0.112 0.0994 0.118 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 2.21e-01 -0.119 0.0969 0.119 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0206 0.0875 0.119 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 4.94e-02 0.268 0.136 0.119 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0209 0.104 0.119 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 4.00e-01 0.0948 0.112 0.119 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0674 0.108 0.119 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 8.83e-01 0.0157 0.106 0.119 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 3.70e-01 0.126 0.14 0.119 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0908 0.0812 0.118 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 9.52e-01 0.0042 0.0696 0.118 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0192 0.137 0.118 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0757 0.0689 0.118 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0785 0.121 0.118 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0214 0.0806 0.118 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 2.44e-02 -0.192 0.0846 0.118 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 8.95e-02 -0.165 0.097 0.118 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0737 0.0931 0.116 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0271 0.0495 0.116 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 3.40e-02 0.304 0.142 0.116 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 8.85e-01 0.0113 0.0776 0.116 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 8.33e-02 0.192 0.11 0.116 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 5.58e-01 0.0644 0.11 0.116 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 9.35e-01 0.00694 0.0852 0.118 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0808 0.0712 0.118 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0491 0.139 0.118 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 7.51e-02 -0.0941 0.0526 0.118 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 741995 sc-eQTL 3.03e-01 0.0827 0.0801 0.118 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 3.98e-01 0.0865 0.102 0.118 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 8.20e-01 -0.024 0.105 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 1.24e-01 0.218 0.141 0.11 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 6.56e-01 0.0515 0.115 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 4.25e-01 -0.112 0.14 0.11 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 2.57e-01 -0.159 0.14 0.11 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 3.53e-01 0.146 0.157 0.11 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 7.03e-01 0.0469 0.123 0.11 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 2.31e-01 -0.149 0.125 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 7.55e-01 0.0222 0.0711 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.39e-01 -0.193 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0263 0.0935 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 6.54e-01 0.0508 0.113 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 4.53e-02 0.265 0.131 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 3.57e-01 -0.123 0.133 0.119 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 9.36e-01 0.00634 0.0794 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.32e-02 -0.333 0.133 0.119 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 1.86e-01 -0.116 0.0871 0.119 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.43e-01 0.0726 0.119 0.119 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 3.27e-01 0.128 0.13 0.119 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 8.87e-01 0.0156 0.11 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0222 0.0627 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.13e-01 0.229 0.144 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 7.93e-01 0.0193 0.0735 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 9.44e-01 0.00727 0.103 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 2.30e-01 -0.138 0.115 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00887 0.134 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0367 0.0777 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 9.05e-01 0.0175 0.147 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 8.80e-01 0.0161 0.107 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0677 0.114 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 9.04e-01 0.0167 0.138 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 2.76e-01 -0.133 0.122 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 1.50e-01 0.156 0.108 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.29e-01 -0.206 0.135 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0568 0.0802 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.47e-01 0.0772 0.128 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 7.25e-01 -0.044 0.125 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0123 0.0671 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 2.49e-01 0.0621 0.0537 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 9.11e-01 0.0142 0.127 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 7.41e-01 0.0243 0.0733 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 3.79e-01 0.0474 0.0538 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 6.57e-01 0.0422 0.0949 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0267 0.0933 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 3.68e-01 0.053 0.0588 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.56e-01 0.194 0.136 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 1.55e-01 0.0956 0.0669 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000143 0.0766 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 9.22e-02 -0.158 0.0936 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 2.65e-01 -0.117 0.105 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0303 0.0747 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 5.32e-01 0.0851 0.136 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0392 0.07 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 8.65e-01 0.0184 0.108 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0931 0.112 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 3.41e-02 -0.205 0.0959 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 1.27e-01 0.0984 0.0643 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0434 0.133 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 7.32e-01 0.0279 0.0815 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.58e-01 0.0674 0.115 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 2.06e-02 -0.264 0.113 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 5.85e-01 0.0518 0.0949 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0313 0.0663 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 2.39e-02 -0.309 0.136 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 2.74e-01 0.0812 0.0741 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 6.57e-01 0.0391 0.088 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 6.53e-01 0.0494 0.11 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 6.50e-01 -0.056 0.123 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 6.53e-01 0.0418 0.0926 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.90e-01 -0.185 0.141 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 4.37e-01 -0.052 0.0668 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.98e-02 0.224 0.118 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 7.42e-02 -0.218 0.121 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 4.02e-01 -0.106 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 9.84e-01 0.00236 0.119 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 4.56e-01 0.108 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00315 0.093 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0599 0.144 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 2.42e-01 -0.161 0.137 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0213 0.0984 0.119 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0507 0.0817 0.119 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0454 0.133 0.119 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0424 0.0661 0.119 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 741995 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0396 0.11 0.119 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.62e-02 0.22 0.114 0.119 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0821 0.122 0.119 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0124 0.11 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 2.28e-01 -0.098 0.0811 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 8.23e-01 0.0321 0.144 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0673 0.082 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.44e-02 0.24 0.124 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 3.61e-01 0.12 0.131 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0661 0.0855 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 9.68e-01 0.00228 0.0559 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 5.00e-01 0.0995 0.147 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0397 0.0805 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 1.41e-01 0.171 0.115 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 5.89e-01 0.0652 0.121 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0509 0.11 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0761 0.0931 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 3.82e-01 0.122 0.14 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 8.12e-01 0.0208 0.0873 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 1.17e-01 0.217 0.138 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 2.56e-02 0.312 0.139 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0604 0.0899 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 9.73e-01 0.00228 0.0672 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 5.77e-02 0.267 0.14 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 9.57e-01 0.00439 0.0804 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 9.93e-02 0.182 0.11 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0219 0.121 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 4.70e-01 -0.115 0.159 0.115 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 2.41e-02 0.306 0.134 0.115 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 2.80e-01 -0.176 0.162 0.115 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 1.97e-01 -0.159 0.123 0.115 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 4.40e-01 -0.109 0.14 0.115 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 8.02e-01 0.0373 0.148 0.115 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0556 0.108 0.117 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 1.76e-01 -0.151 0.111 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 5.04e-01 0.0875 0.131 0.117 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 6.78e-01 0.0273 0.0656 0.117 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 741995 sc-eQTL 3.77e-01 0.0804 0.0907 0.117 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0742 0.127 0.117 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 5.72e-01 0.072 0.127 0.117 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 4.22e-02 -0.253 0.124 0.118 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0515 0.0807 0.118 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 7.64e-01 0.0397 0.132 0.118 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0432 0.0795 0.118 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 1.08e-01 -0.138 0.0856 0.118 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0578 0.121 0.118 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 8.58e-02 -0.188 0.109 0.12 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 1.52e-01 -0.159 0.11 0.12 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 4.90e-01 0.0984 0.142 0.12 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0919 0.108 0.12 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 8.98e-01 0.0162 0.127 0.12 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 1.20e-01 0.173 0.111 0.12 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 8.68e-01 0.0235 0.141 0.12 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 4.59e-01 0.108 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0894 0.0762 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0202 0.082 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 8.83e-01 0.0203 0.138 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 1.26e-01 -0.126 0.0819 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 4.34e-01 0.0927 0.118 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0409 0.0856 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 1.41e-01 -0.129 0.0875 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0148 0.11 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0655 0.0879 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0594 0.0903 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0813 0.141 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0525 0.0781 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 1.10e-02 -0.332 0.13 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 7.77e-01 0.0301 0.106 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 8.85e-02 -0.191 0.111 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 2.94e-01 -0.115 0.109 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 7.87e-01 0.0324 0.12 0.136 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 6.40e-01 0.0495 0.106 0.136 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0385 0.152 0.136 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 6.64e-02 -0.135 0.073 0.136 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 741995 sc-eQTL 8.19e-02 -0.202 0.115 0.136 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 2.99e-01 -0.162 0.156 0.136 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0717 0.134 0.136 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0314 0.0919 0.118 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 2.32e-01 -0.145 0.121 0.118 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 2.47e-01 0.144 0.123 0.118 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 1.22e-01 -0.123 0.0789 0.118 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 6.88e-01 0.049 0.122 0.118 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 4.23e-01 0.104 0.129 0.118 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0677 0.118 0.118 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 1.99e-01 -0.175 0.136 0.118 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0958 0.112 0.12 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 7.16e-01 0.0319 0.0875 0.12 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0777 0.139 0.12 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 5.42e-01 0.0608 0.0996 0.12 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 5.14e-01 0.0804 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0104 0.13 0.12 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 3.90e-01 0.107 0.124 0.12 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 1.53e-01 -0.188 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 9.32e-01 0.011 0.128 0.119 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 1.24e-01 0.148 0.0956 0.119 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 2.04e-02 0.326 0.139 0.119 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 9.14e-01 0.0128 0.119 0.119 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0494 0.0986 0.119 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 1.47e-01 -0.229 0.157 0.119 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 7.33e-01 0.0412 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00177 0.146 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 2.72e-01 -0.123 0.111 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 4.63e-01 0.046 0.0625 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.22e-02 -0.319 0.126 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0474 0.0786 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 4.72e-01 0.075 0.104 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 3.79e-02 0.275 0.132 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 8.94e-01 0.0154 0.116 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00731 0.0531 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 1.19e-01 0.219 0.14 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 3.66e-01 0.0598 0.066 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0612 0.0969 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 2.81e-01 -0.127 0.117 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0674 0.0769 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0186 0.0717 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0732 0.138 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0568 0.0712 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 2.66e-01 -0.137 0.123 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00904 0.0835 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 7.04e-02 -0.154 0.0848 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0875 0.0992 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0584 0.0897 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0563 0.081 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 8.97e-01 0.0176 0.135 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0916 0.0836 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 441511 sc-eQTL 5.22e-01 0.0839 0.131 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 9.22e-01 0.0105 0.108 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 9.45e-01 0.00772 0.112 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 208285 sc-eQTL 6.35e-02 -0.236 0.127 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -227119 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0569 0.0881 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 702479 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0152 0.0512 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 169766 sc-eQTL 3.17e-02 0.318 0.147 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -874884 sc-eQTL 8.63e-01 0.0138 0.0804 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 199853 sc-eQTL 1.22e-01 0.168 0.108 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -875903 sc-eQTL 3.90e-01 0.0967 0.112 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118503 \N -874884 2.69e-07 1.25e-07 3.71e-08 1.83e-07 9.01e-08 1e-07 1.44e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.6e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.37e-08 4.17e-08 1.21e-07 5.39e-08 4.16e-08 1.21e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.42e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.06e-07 9.61e-08 1.08e-07 1.1e-07 9.64e-08 3.68e-08 4.02e-08 8.34e-08 6.67e-08 3.49e-08 5.29e-08 8.93e-08 6.86e-08 3.86e-08 5.13e-08 1.33e-07 5.27e-08 1.26e-08 4.92e-08 1.86e-08 1.21e-07 1.91e-09 5.01e-08