logo

Genes within 1Mb (chr6:136977636:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 9.51e-01 0.00487 0.079 0.244 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 8.03e-01 0.00878 0.0352 0.244 B L1
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.94e-01 0.0369 0.0935 0.244 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0211 0.0499 0.244 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0913 0.0692 0.244 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 9.23e-02 -0.132 0.078 0.244 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0373 0.0528 0.244 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 4.09e-01 -0.033 0.04 0.244 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 5.35e-01 0.0529 0.0851 0.244 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 8.85e-02 0.0911 0.0532 0.244 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0515 0.0407 0.244 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.05e-01 -0.109 0.067 0.244 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0498 0.0599 0.244 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0392 0.0405 0.244 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 8.30e-02 0.173 0.0993 0.244 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 1.34e-01 0.0755 0.0502 0.244 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 3.01e-02 -0.115 0.0528 0.244 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 4.00e-03 -0.212 0.0727 0.244 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 8.78e-01 -0.011 0.072 0.252 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 2.55e-01 0.0737 0.0646 0.252 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0673 0.101 0.252 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0766 0.252 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0873 0.0831 0.252 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.70e-01 -0.088 0.0796 0.252 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 6.33e-01 0.0375 0.0784 0.252 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.252 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0528 0.0607 0.244 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 4.62e-01 0.0383 0.052 0.244 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00176 0.102 0.244 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 7.58e-01 0.0159 0.0516 0.244 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 7.58e-01 0.0278 0.0903 0.244 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0416 0.0602 0.244 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.08e-01 -0.103 0.0636 0.244 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 9.92e-01 0.000736 0.073 0.244 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0597 0.0684 0.245 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0374 0.0363 0.245 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.105 0.245 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.78e-01 0.0618 0.0569 0.245 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.03e-01 -0.104 0.0814 0.245 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0886 0.0806 0.245 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00787 0.0629 0.244 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0685 0.0525 0.244 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 9.12e-01 0.0113 0.103 0.244 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 1.82e-01 0.0522 0.039 0.244 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 727301 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0677 0.0591 0.244 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 4.19e-02 -0.153 0.0749 0.244 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 8.44e-02 -0.134 0.0772 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 3.34e-01 0.105 0.109 0.24 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0645 0.0882 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.27e-01 0.052 0.107 0.24 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.93e-03 0.307 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0334 0.12 0.24 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.74e-03 0.29 0.0912 0.24 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0639 0.0944 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0105 0.0537 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 8.36e-01 0.0205 0.0988 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.20e-01 0.0703 0.0705 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0929 0.0852 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.1 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 9.81e-01 0.00242 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 4.62e-01 0.0443 0.0601 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.52e-02 -0.188 0.102 0.244 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.26e-01 0.0651 0.0661 0.244 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 9.30e-02 0.152 0.0899 0.244 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0983 0.244 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 4.43e-01 0.0613 0.0797 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 6.06e-01 0.0235 0.0456 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.105 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0497 0.0533 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 7.95e-01 0.0195 0.0751 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.10e-01 -0.134 0.0832 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0533 0.0987 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 7.53e-01 0.0181 0.0573 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0114 0.0787 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 1.50e-03 -0.263 0.0818 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0792 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 3.82e-02 -0.187 0.0895 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0296 0.0803 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.78e-01 0.0418 0.1 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 1.53e-01 0.0848 0.059 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 7.70e-01 0.0277 0.0947 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 3.64e-02 -0.192 0.0913 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 8.92e-01 0.00687 0.0505 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0252 0.0405 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.54e-01 0.0428 0.0953 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.03e-01 0.0569 0.0551 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0144 0.0405 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0784 0.0713 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0456 0.0697 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 5.06e-02 -0.0858 0.0436 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 8.36e-02 0.177 0.102 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.35e-01 0.0485 0.0502 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0368 0.0572 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.84e-02 -0.165 0.0695 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0238 0.0802 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0428 0.0568 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 8.26e-02 -0.179 0.103 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 6.63e-02 0.0976 0.0529 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0583 0.0822 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0686 0.0853 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 7.16e-01 -0.026 0.0715 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 7.02e-02 -0.0861 0.0473 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.14e-01 0.0497 0.0983 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.07e-02 0.129 0.0595 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 1.12e-01 -0.135 0.0844 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 2.33e-01 -0.101 0.0843 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 6.67e-01 0.0309 0.0717 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0245 0.05 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 3.51e-01 0.0968 0.104 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.87e-01 0.0596 0.0559 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.07e-02 -0.153 0.0656 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 3.19e-03 -0.242 0.0812 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0305 0.0944 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0962 0.0705 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 2.44e-01 -0.126 0.108 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.27e-01 0.0618 0.051 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 1.89e-01 -0.12 0.0909 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.05e-01 -0.151 0.093 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 1.83e-01 -0.123 0.0918 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 1.98e-01 -0.112 0.0867 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 2.79e-01 0.115 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 1.02e-01 0.111 0.0676 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.32e-01 -0.126 0.105 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.84e-01 -0.134 0.1 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0723 0.0728 0.242 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 7.62e-01 0.0184 0.0606 0.242 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 9.27e-01 0.00909 0.0989 0.242 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.95e-01 0.0417 0.049 0.242 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 727301 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0754 0.0816 0.242 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0914 0.0853 0.242 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 2.27e-02 -0.206 0.0896 0.242 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0778 0.0799 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 9.82e-01 0.00135 0.0591 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 5.21e-01 -0.067 0.104 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 1.48e-01 0.0862 0.0593 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 4.88e-01 -0.063 0.0906 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.27e-01 -0.145 0.0945 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0295 0.0624 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0185 0.0408 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 5.28e-01 0.068 0.107 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.36e-01 0.0697 0.0586 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 6.31e-02 -0.157 0.084 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 6.88e-01 0.0354 0.0881 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0886 0.081 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0494 0.0687 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.32e-02 0.191 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 4.10e-01 0.0531 0.0643 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 8.02e-02 -0.179 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 8.29e-02 -0.18 0.103 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0829 0.066 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0268 0.0494 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 3.28e-01 0.102 0.104 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 4.48e-01 0.0449 0.0591 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0161 0.0813 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 2.31e-01 -0.107 0.0889 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 6.38e-02 0.234 0.125 0.244 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0171 0.11 0.244 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 5.32e-01 0.0817 0.13 0.244 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.68e-01 0.109 0.0982 0.244 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0263 0.112 0.244 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0433 0.119 0.244 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0382 0.0825 0.243 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 1.41e-01 -0.126 0.0852 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 4.28e-01 0.0796 0.1 0.243 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 9.23e-01 0.00485 0.0503 0.243 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 727301 sc-eQTL 8.47e-01 0.0134 0.0697 0.243 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 7.17e-01 0.0354 0.0974 0.243 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 9.84e-01 0.00199 0.0976 0.243 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0993 0.0951 0.244 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0589 0.0615 0.244 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0183 0.101 0.244 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00786 0.0606 0.244 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 6.07e-01 0.0338 0.0657 0.244 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0936 0.0923 0.244 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 8.61e-02 -0.139 0.0807 0.251 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 1.38e-02 -0.201 0.0807 0.251 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 7.56e-01 0.0328 0.105 0.251 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 1.90e-01 0.105 0.0799 0.251 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 6.50e-02 -0.172 0.0929 0.251 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 3.27e-01 0.0809 0.0823 0.251 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.46e-01 -0.152 0.104 0.251 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 9.55e-02 0.179 0.107 0.251 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0103 0.0577 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 6.61e-01 0.0271 0.0618 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 1.50e-01 0.149 0.103 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 5.67e-01 0.0356 0.062 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0414 0.0893 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0253 0.0645 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0992 0.066 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 8.40e-01 0.0168 0.083 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 8.70e-01 -0.011 0.0669 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 5.11e-01 0.0452 0.0687 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 2.22e-01 0.131 0.107 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.91e-01 0.0628 0.0593 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 8.72e-01 0.0161 0.1 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 8.63e-01 -0.014 0.0809 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0394 0.0854 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 2.33e-01 0.0993 0.0831 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 1.28e-01 -0.146 0.0955 0.258 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 5.79e-03 0.231 0.0825 0.258 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.02e-01 0.0637 0.122 0.258 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.41e-01 0.0564 0.059 0.258 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 727301 sc-eQTL 8.01e-01 0.0236 0.0934 0.258 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 8.09e-02 -0.218 0.124 0.258 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.80e-01 -0.143 0.107 0.258 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 9.74e-01 0.00231 0.0708 0.244 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 6.90e-01 0.0374 0.0935 0.244 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 4.51e-01 0.0721 0.0953 0.244 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.79e-01 0.0663 0.061 0.244 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0557 0.0939 0.244 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.86e-01 -0.106 0.0992 0.244 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0912 0.244 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0372 0.105 0.244 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0628 0.0824 0.251 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0186 0.0641 0.251 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 2.04e-02 -0.236 0.101 0.251 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 6.26e-03 0.198 0.0717 0.251 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 2.22e-01 0.11 0.0899 0.251 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0923 0.0947 0.251 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0495 0.0913 0.251 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0527 0.0962 0.251 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0244 0.0924 0.257 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 2.92e-02 0.15 0.0683 0.257 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 3.34e-02 -0.215 0.1 0.257 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 7.19e-01 0.0309 0.0857 0.257 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 2.58e-01 0.0803 0.0708 0.257 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.35e-03 -0.341 0.11 0.257 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 4.95e-01 0.0594 0.0869 0.257 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 5.48e-01 0.0631 0.105 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0388 0.0834 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0177 0.0468 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0401 0.0959 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 4.08e-01 0.0487 0.0588 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0344 0.0779 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 7.34e-01 0.0339 0.0995 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 7.15e-01 0.0307 0.0842 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 9.95e-01 0.000258 0.0387 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0552 0.0481 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0948 0.0704 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 7.13e-02 -0.154 0.0852 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 9.63e-01 0.00268 0.0582 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 6.71e-01 0.023 0.0541 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 1.80e-01 0.14 0.104 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 4.28e-01 0.0426 0.0537 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0101 0.0934 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00338 0.0631 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0872 0.0642 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 5.73e-01 0.0423 0.075 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0894 0.0675 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 9.04e-01 0.00736 0.0612 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 1.21e-01 -0.158 0.102 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 4.77e-02 0.125 0.0627 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 426817 sc-eQTL 3.89e-01 0.0851 0.0987 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 5.32e-02 -0.157 0.0805 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0476 0.0848 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 193591 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0703 0.0962 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -241813 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0456 0.0641 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687785 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0333 0.0372 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 155072 sc-eQTL 1.63e-01 0.151 0.108 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -889578 sc-eQTL 3.65e-01 0.0529 0.0584 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0921 0.0787 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -890597 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0708 0.0817 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 55335 eQTL 9.79e-12 0.249 0.0361 0.0 0.0 0.222
ENSG00000197442 MAP3K5 185159 eQTL 0.0162 -0.035 0.0145 0.0 0.0 0.222

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 55335 7.7e-06 9.4e-06 9.56e-07 4e-06 1.74e-06 3.59e-06 9.38e-06 1.15e-06 5.24e-06 3.3e-06 9.93e-06 4.15e-06 1.32e-05 3.95e-06 1.55e-06 4.5e-06 3.86e-06 3.89e-06 2.3e-06 1.92e-06 2.66e-06 7.74e-06 6.57e-06 1.99e-06 1.24e-05 2.4e-06 2.88e-06 1.75e-06 7.85e-06 8.22e-06 4.07e-06 3.85e-07 7.79e-07 2.5e-06 2.6e-06 1.49e-06 1.18e-06 5e-07 1.46e-06 7.33e-07 4.48e-07 1.16e-05 6.73e-07 1.61e-07 6.37e-07 1.12e-06 1.08e-06 7.35e-07 3.58e-07