logo

Genes within 1Mb (chr6:136976870:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 9.51e-01 0.00487 0.079 0.244 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 8.03e-01 0.00878 0.0352 0.244 B L1
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.94e-01 0.0369 0.0935 0.244 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0211 0.0499 0.244 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0913 0.0692 0.244 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 9.23e-02 -0.132 0.078 0.244 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0373 0.0528 0.244 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 4.09e-01 -0.033 0.04 0.244 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 5.35e-01 0.0529 0.0851 0.244 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 8.85e-02 0.0911 0.0532 0.244 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0515 0.0407 0.244 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.05e-01 -0.109 0.067 0.244 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0498 0.0599 0.244 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0392 0.0405 0.244 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 8.30e-02 0.173 0.0993 0.244 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 1.34e-01 0.0755 0.0502 0.244 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 3.01e-02 -0.115 0.0528 0.244 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 4.00e-03 -0.212 0.0727 0.244 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 8.78e-01 -0.011 0.072 0.252 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 2.55e-01 0.0737 0.0646 0.252 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0673 0.101 0.252 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0766 0.252 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0873 0.0831 0.252 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.70e-01 -0.088 0.0796 0.252 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 6.33e-01 0.0375 0.0784 0.252 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.252 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0528 0.0607 0.244 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 4.62e-01 0.0383 0.052 0.244 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00176 0.102 0.244 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 7.58e-01 0.0159 0.0516 0.244 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 7.58e-01 0.0278 0.0903 0.244 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0416 0.0602 0.244 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.08e-01 -0.103 0.0636 0.244 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 9.92e-01 0.000736 0.073 0.244 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0597 0.0684 0.245 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0374 0.0363 0.245 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.105 0.245 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.78e-01 0.0618 0.0569 0.245 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.03e-01 -0.104 0.0814 0.245 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0886 0.0806 0.245 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00787 0.0629 0.244 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0685 0.0525 0.244 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 9.12e-01 0.0113 0.103 0.244 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 1.82e-01 0.0522 0.039 0.244 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 726535 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0677 0.0591 0.244 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 4.19e-02 -0.153 0.0749 0.244 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 8.44e-02 -0.134 0.0772 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 3.34e-01 0.105 0.109 0.24 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0645 0.0882 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.27e-01 0.052 0.107 0.24 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.93e-03 0.307 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0334 0.12 0.24 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.74e-03 0.29 0.0912 0.24 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0639 0.0944 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0105 0.0537 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 8.36e-01 0.0205 0.0988 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.20e-01 0.0703 0.0705 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0929 0.0852 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.1 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 9.81e-01 0.00242 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 4.62e-01 0.0443 0.0601 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.52e-02 -0.188 0.102 0.244 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.26e-01 0.0651 0.0661 0.244 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 9.30e-02 0.152 0.0899 0.244 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0983 0.244 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 4.43e-01 0.0613 0.0797 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 6.06e-01 0.0235 0.0456 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.105 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0497 0.0533 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 7.95e-01 0.0195 0.0751 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.10e-01 -0.134 0.0832 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0533 0.0987 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 7.53e-01 0.0181 0.0573 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0114 0.0787 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 1.50e-03 -0.263 0.0818 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0792 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 3.82e-02 -0.187 0.0895 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0296 0.0803 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.78e-01 0.0418 0.1 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 1.53e-01 0.0848 0.059 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 7.70e-01 0.0277 0.0947 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 3.64e-02 -0.192 0.0913 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 8.92e-01 0.00687 0.0505 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0252 0.0405 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.54e-01 0.0428 0.0953 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.03e-01 0.0569 0.0551 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0144 0.0405 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0784 0.0713 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0456 0.0697 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 5.06e-02 -0.0858 0.0436 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 8.36e-02 0.177 0.102 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.35e-01 0.0485 0.0502 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0368 0.0572 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.84e-02 -0.165 0.0695 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0238 0.0802 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0428 0.0568 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 8.26e-02 -0.179 0.103 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 6.63e-02 0.0976 0.0529 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0583 0.0822 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0686 0.0853 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 7.16e-01 -0.026 0.0715 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 7.02e-02 -0.0861 0.0473 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.14e-01 0.0497 0.0983 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.07e-02 0.129 0.0595 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 1.12e-01 -0.135 0.0844 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 2.33e-01 -0.101 0.0843 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 6.67e-01 0.0309 0.0717 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0245 0.05 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 3.51e-01 0.0968 0.104 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.87e-01 0.0596 0.0559 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.07e-02 -0.153 0.0656 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 3.19e-03 -0.242 0.0812 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0305 0.0944 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0962 0.0705 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 2.44e-01 -0.126 0.108 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.27e-01 0.0618 0.051 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 1.89e-01 -0.12 0.0909 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.05e-01 -0.151 0.093 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 1.83e-01 -0.123 0.0918 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 1.98e-01 -0.112 0.0867 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 2.79e-01 0.115 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 1.02e-01 0.111 0.0676 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.32e-01 -0.126 0.105 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.84e-01 -0.134 0.1 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0723 0.0728 0.242 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 7.62e-01 0.0184 0.0606 0.242 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 9.27e-01 0.00909 0.0989 0.242 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.95e-01 0.0417 0.049 0.242 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 726535 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0754 0.0816 0.242 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0914 0.0853 0.242 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 2.27e-02 -0.206 0.0896 0.242 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0778 0.0799 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 9.82e-01 0.00135 0.0591 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 5.21e-01 -0.067 0.104 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 1.48e-01 0.0862 0.0593 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 4.88e-01 -0.063 0.0906 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.27e-01 -0.145 0.0945 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0295 0.0624 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0185 0.0408 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 5.28e-01 0.068 0.107 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.36e-01 0.0697 0.0586 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 6.31e-02 -0.157 0.084 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 6.88e-01 0.0354 0.0881 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0886 0.081 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0494 0.0687 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.32e-02 0.191 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 4.10e-01 0.0531 0.0643 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 8.02e-02 -0.179 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 8.29e-02 -0.18 0.103 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0829 0.066 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0268 0.0494 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 3.28e-01 0.102 0.104 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 4.48e-01 0.0449 0.0591 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0161 0.0813 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 2.31e-01 -0.107 0.0889 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 6.38e-02 0.234 0.125 0.244 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0171 0.11 0.244 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 5.32e-01 0.0817 0.13 0.244 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.68e-01 0.109 0.0982 0.244 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0263 0.112 0.244 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0433 0.119 0.244 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0382 0.0825 0.243 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 1.41e-01 -0.126 0.0852 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 4.28e-01 0.0796 0.1 0.243 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 9.23e-01 0.00485 0.0503 0.243 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 726535 sc-eQTL 8.47e-01 0.0134 0.0697 0.243 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 7.17e-01 0.0354 0.0974 0.243 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 9.84e-01 0.00199 0.0976 0.243 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0993 0.0951 0.244 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0589 0.0615 0.244 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0183 0.101 0.244 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00786 0.0606 0.244 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 6.07e-01 0.0338 0.0657 0.244 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0936 0.0923 0.244 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 8.61e-02 -0.139 0.0807 0.251 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 1.38e-02 -0.201 0.0807 0.251 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 7.56e-01 0.0328 0.105 0.251 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 1.90e-01 0.105 0.0799 0.251 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 6.50e-02 -0.172 0.0929 0.251 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 3.27e-01 0.0809 0.0823 0.251 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.46e-01 -0.152 0.104 0.251 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 9.55e-02 0.179 0.107 0.251 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0103 0.0577 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 6.61e-01 0.0271 0.0618 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 1.50e-01 0.149 0.103 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 5.67e-01 0.0356 0.062 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0414 0.0893 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0253 0.0645 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0992 0.066 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 8.40e-01 0.0168 0.083 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 8.70e-01 -0.011 0.0669 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 5.11e-01 0.0452 0.0687 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 2.22e-01 0.131 0.107 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.91e-01 0.0628 0.0593 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 8.72e-01 0.0161 0.1 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 8.63e-01 -0.014 0.0809 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0394 0.0854 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 2.33e-01 0.0993 0.0831 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 1.28e-01 -0.146 0.0955 0.258 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 5.79e-03 0.231 0.0825 0.258 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.02e-01 0.0637 0.122 0.258 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.41e-01 0.0564 0.059 0.258 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 726535 sc-eQTL 8.01e-01 0.0236 0.0934 0.258 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 8.09e-02 -0.218 0.124 0.258 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.80e-01 -0.143 0.107 0.258 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 9.74e-01 0.00231 0.0708 0.244 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 6.90e-01 0.0374 0.0935 0.244 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 4.51e-01 0.0721 0.0953 0.244 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.79e-01 0.0663 0.061 0.244 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0557 0.0939 0.244 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.86e-01 -0.106 0.0992 0.244 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0912 0.244 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0372 0.105 0.244 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0628 0.0824 0.251 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0186 0.0641 0.251 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 2.04e-02 -0.236 0.101 0.251 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 6.26e-03 0.198 0.0717 0.251 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 2.22e-01 0.11 0.0899 0.251 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0923 0.0947 0.251 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0495 0.0913 0.251 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0527 0.0962 0.251 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0244 0.0924 0.257 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 2.92e-02 0.15 0.0683 0.257 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 3.34e-02 -0.215 0.1 0.257 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 7.19e-01 0.0309 0.0857 0.257 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 2.58e-01 0.0803 0.0708 0.257 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.35e-03 -0.341 0.11 0.257 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 4.95e-01 0.0594 0.0869 0.257 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 5.48e-01 0.0631 0.105 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0388 0.0834 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0177 0.0468 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0401 0.0959 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 4.08e-01 0.0487 0.0588 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0344 0.0779 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 7.34e-01 0.0339 0.0995 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 7.15e-01 0.0307 0.0842 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 9.95e-01 0.000258 0.0387 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0552 0.0481 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0948 0.0704 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 7.13e-02 -0.154 0.0852 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 9.63e-01 0.00268 0.0582 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 6.71e-01 0.023 0.0541 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 1.80e-01 0.14 0.104 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 4.28e-01 0.0426 0.0537 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0101 0.0934 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00338 0.0631 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0872 0.0642 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 5.73e-01 0.0423 0.075 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0894 0.0675 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 9.04e-01 0.00736 0.0612 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 1.21e-01 -0.158 0.102 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 4.77e-02 0.125 0.0627 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 426051 sc-eQTL 3.89e-01 0.0851 0.0987 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 5.32e-02 -0.157 0.0805 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0476 0.0848 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 192825 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0703 0.0962 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -242579 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0456 0.0641 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 687019 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0333 0.0372 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 154306 sc-eQTL 1.63e-01 0.151 0.108 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -890344 sc-eQTL 3.65e-01 0.0529 0.0584 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0921 0.0787 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -891363 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0708 0.0817 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 54569 eQTL 1.41e-11 0.247 0.0361 0.0 0.0 0.221
ENSG00000197442 MAP3K5 184393 eQTL 0.0134 -0.036 0.0145 0.0 0.0 0.221

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 54569 1.39e-05 1.24e-05 2.96e-06 7.87e-06 2.36e-06 6.16e-06 2.26e-05 1.55e-06 1.07e-05 5.61e-06 1.41e-05 5.9e-06 2.39e-05 3.66e-06 3.97e-06 6.47e-06 4.31e-06 7.69e-06 2.7e-06 2.88e-06 6.85e-06 1.1e-05 1.98e-05 2.22e-06 1.75e-05 4.36e-06 4.81e-06 3.98e-06 1.61e-05 8.53e-06 7.72e-06 5.23e-07 1.1e-06 3.59e-06 5.76e-06 3.86e-06 1.72e-06 2e-06 9.19e-07 1.01e-06 6.93e-07 3.49e-05 1.76e-06 1.5e-07 7.17e-07 1.89e-06 1.32e-06 6.95e-07 5.8e-07