logo

Genes within 1Mb (chr6:136972719:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 9.51e-01 0.00487 0.079 0.244 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 8.03e-01 0.00878 0.0352 0.244 B L1
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.94e-01 0.0369 0.0935 0.244 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0211 0.0499 0.244 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0913 0.0692 0.244 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 9.23e-02 -0.132 0.078 0.244 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0373 0.0528 0.244 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 4.09e-01 -0.033 0.04 0.244 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 5.35e-01 0.0529 0.0851 0.244 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 8.85e-02 0.0911 0.0532 0.244 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0515 0.0407 0.244 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.05e-01 -0.109 0.067 0.244 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0498 0.0599 0.244 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0392 0.0405 0.244 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 8.30e-02 0.173 0.0993 0.244 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 1.34e-01 0.0755 0.0502 0.244 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 3.01e-02 -0.115 0.0528 0.244 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 4.00e-03 -0.212 0.0727 0.244 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 8.78e-01 -0.011 0.072 0.252 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 2.55e-01 0.0737 0.0646 0.252 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0673 0.101 0.252 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0766 0.252 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0873 0.0831 0.252 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.70e-01 -0.088 0.0796 0.252 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 6.33e-01 0.0375 0.0784 0.252 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.252 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0528 0.0607 0.244 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 4.62e-01 0.0383 0.052 0.244 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00176 0.102 0.244 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 7.58e-01 0.0159 0.0516 0.244 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 7.58e-01 0.0278 0.0903 0.244 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0416 0.0602 0.244 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.08e-01 -0.103 0.0636 0.244 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 9.92e-01 0.000736 0.073 0.244 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0597 0.0684 0.245 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0374 0.0363 0.245 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.105 0.245 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.78e-01 0.0618 0.0569 0.245 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.03e-01 -0.104 0.0814 0.245 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0886 0.0806 0.245 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00787 0.0629 0.244 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0685 0.0525 0.244 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 9.12e-01 0.0113 0.103 0.244 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 1.82e-01 0.0522 0.039 0.244 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 722384 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0677 0.0591 0.244 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 4.19e-02 -0.153 0.0749 0.244 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 8.44e-02 -0.134 0.0772 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 3.34e-01 0.105 0.109 0.24 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0645 0.0882 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.27e-01 0.052 0.107 0.24 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.93e-03 0.307 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0334 0.12 0.24 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.74e-03 0.29 0.0912 0.24 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0639 0.0944 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0105 0.0537 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 8.36e-01 0.0205 0.0988 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.20e-01 0.0703 0.0705 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0929 0.0852 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.1 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 9.81e-01 0.00242 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 4.62e-01 0.0443 0.0601 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.52e-02 -0.188 0.102 0.244 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.26e-01 0.0651 0.0661 0.244 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 9.30e-02 0.152 0.0899 0.244 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0983 0.244 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 4.43e-01 0.0613 0.0797 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 6.06e-01 0.0235 0.0456 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.105 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0497 0.0533 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 7.95e-01 0.0195 0.0751 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.10e-01 -0.134 0.0832 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0533 0.0987 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 7.53e-01 0.0181 0.0573 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0114 0.0787 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 1.50e-03 -0.263 0.0818 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0792 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 3.82e-02 -0.187 0.0895 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0296 0.0803 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.78e-01 0.0418 0.1 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 1.53e-01 0.0848 0.059 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 7.70e-01 0.0277 0.0947 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 3.64e-02 -0.192 0.0913 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 8.92e-01 0.00687 0.0505 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0252 0.0405 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.54e-01 0.0428 0.0953 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.03e-01 0.0569 0.0551 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0144 0.0405 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0784 0.0713 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0456 0.0697 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 5.06e-02 -0.0858 0.0436 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 8.36e-02 0.177 0.102 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.35e-01 0.0485 0.0502 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0368 0.0572 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.84e-02 -0.165 0.0695 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0238 0.0802 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0428 0.0568 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 8.26e-02 -0.179 0.103 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 6.63e-02 0.0976 0.0529 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0583 0.0822 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0686 0.0853 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 7.16e-01 -0.026 0.0715 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 7.02e-02 -0.0861 0.0473 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.14e-01 0.0497 0.0983 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.07e-02 0.129 0.0595 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 1.12e-01 -0.135 0.0844 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 2.33e-01 -0.101 0.0843 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 6.67e-01 0.0309 0.0717 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0245 0.05 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 3.51e-01 0.0968 0.104 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.87e-01 0.0596 0.0559 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.07e-02 -0.153 0.0656 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 3.19e-03 -0.242 0.0812 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0305 0.0944 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0962 0.0705 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 2.44e-01 -0.126 0.108 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.27e-01 0.0618 0.051 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 1.89e-01 -0.12 0.0909 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.05e-01 -0.151 0.093 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 1.83e-01 -0.123 0.0918 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 1.98e-01 -0.112 0.0867 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 2.79e-01 0.115 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 1.02e-01 0.111 0.0676 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.32e-01 -0.126 0.105 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.84e-01 -0.134 0.1 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0723 0.0728 0.242 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 7.62e-01 0.0184 0.0606 0.242 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 9.27e-01 0.00909 0.0989 0.242 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.95e-01 0.0417 0.049 0.242 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 722384 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0754 0.0816 0.242 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0914 0.0853 0.242 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 2.27e-02 -0.206 0.0896 0.242 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0778 0.0799 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 9.82e-01 0.00135 0.0591 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 5.21e-01 -0.067 0.104 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 1.48e-01 0.0862 0.0593 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 4.88e-01 -0.063 0.0906 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.27e-01 -0.145 0.0945 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0295 0.0624 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0185 0.0408 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 5.28e-01 0.068 0.107 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.36e-01 0.0697 0.0586 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 6.31e-02 -0.157 0.084 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 6.88e-01 0.0354 0.0881 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0886 0.081 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0494 0.0687 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.32e-02 0.191 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 4.10e-01 0.0531 0.0643 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 8.02e-02 -0.179 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 8.29e-02 -0.18 0.103 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0829 0.066 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0268 0.0494 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 3.28e-01 0.102 0.104 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 4.48e-01 0.0449 0.0591 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0161 0.0813 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 2.31e-01 -0.107 0.0889 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 6.38e-02 0.234 0.125 0.244 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0171 0.11 0.244 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 5.32e-01 0.0817 0.13 0.244 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.68e-01 0.109 0.0982 0.244 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0263 0.112 0.244 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0433 0.119 0.244 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0382 0.0825 0.243 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 1.41e-01 -0.126 0.0852 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 4.28e-01 0.0796 0.1 0.243 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 9.23e-01 0.00485 0.0503 0.243 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 722384 sc-eQTL 8.47e-01 0.0134 0.0697 0.243 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 7.17e-01 0.0354 0.0974 0.243 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 9.84e-01 0.00199 0.0976 0.243 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0993 0.0951 0.244 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0589 0.0615 0.244 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0183 0.101 0.244 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00786 0.0606 0.244 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 6.07e-01 0.0338 0.0657 0.244 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0936 0.0923 0.244 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 8.61e-02 -0.139 0.0807 0.251 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 1.38e-02 -0.201 0.0807 0.251 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 7.56e-01 0.0328 0.105 0.251 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 1.90e-01 0.105 0.0799 0.251 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 6.50e-02 -0.172 0.0929 0.251 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 3.27e-01 0.0809 0.0823 0.251 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.46e-01 -0.152 0.104 0.251 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 9.55e-02 0.179 0.107 0.251 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0103 0.0577 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 6.61e-01 0.0271 0.0618 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 1.50e-01 0.149 0.103 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 5.67e-01 0.0356 0.062 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0414 0.0893 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0253 0.0645 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0992 0.066 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 8.40e-01 0.0168 0.083 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 8.70e-01 -0.011 0.0669 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 5.11e-01 0.0452 0.0687 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 2.22e-01 0.131 0.107 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.91e-01 0.0628 0.0593 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 8.72e-01 0.0161 0.1 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 8.63e-01 -0.014 0.0809 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0394 0.0854 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 2.33e-01 0.0993 0.0831 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 1.28e-01 -0.146 0.0955 0.258 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 5.79e-03 0.231 0.0825 0.258 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.02e-01 0.0637 0.122 0.258 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.41e-01 0.0564 0.059 0.258 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 722384 sc-eQTL 8.01e-01 0.0236 0.0934 0.258 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 8.09e-02 -0.218 0.124 0.258 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.80e-01 -0.143 0.107 0.258 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 9.74e-01 0.00231 0.0708 0.244 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 6.90e-01 0.0374 0.0935 0.244 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 4.51e-01 0.0721 0.0953 0.244 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.79e-01 0.0663 0.061 0.244 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0557 0.0939 0.244 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.86e-01 -0.106 0.0992 0.244 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0912 0.244 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0372 0.105 0.244 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0628 0.0824 0.251 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0186 0.0641 0.251 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 2.04e-02 -0.236 0.101 0.251 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 6.26e-03 0.198 0.0717 0.251 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 2.22e-01 0.11 0.0899 0.251 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0923 0.0947 0.251 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0495 0.0913 0.251 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0527 0.0962 0.251 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0244 0.0924 0.257 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 2.92e-02 0.15 0.0683 0.257 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 3.34e-02 -0.215 0.1 0.257 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 7.19e-01 0.0309 0.0857 0.257 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 2.58e-01 0.0803 0.0708 0.257 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.35e-03 -0.341 0.11 0.257 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 4.95e-01 0.0594 0.0869 0.257 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 5.48e-01 0.0631 0.105 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0388 0.0834 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0177 0.0468 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0401 0.0959 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 4.08e-01 0.0487 0.0588 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0344 0.0779 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 7.34e-01 0.0339 0.0995 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 7.15e-01 0.0307 0.0842 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 9.95e-01 0.000258 0.0387 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0552 0.0481 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0948 0.0704 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 7.13e-02 -0.154 0.0852 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 9.63e-01 0.00268 0.0582 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 6.71e-01 0.023 0.0541 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 1.80e-01 0.14 0.104 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 4.28e-01 0.0426 0.0537 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0101 0.0934 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00338 0.0631 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0872 0.0642 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 5.73e-01 0.0423 0.075 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0894 0.0675 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 9.04e-01 0.00736 0.0612 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 1.21e-01 -0.158 0.102 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 4.77e-02 0.125 0.0627 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 421900 sc-eQTL 3.89e-01 0.0851 0.0987 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 5.32e-02 -0.157 0.0805 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0476 0.0848 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 188674 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0703 0.0962 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -246730 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0456 0.0641 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 682868 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0333 0.0372 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 150155 sc-eQTL 1.63e-01 0.151 0.108 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -894495 sc-eQTL 3.65e-01 0.0529 0.0584 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0921 0.0787 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -895514 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0708 0.0817 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 50418 eQTL 1.69e-11 0.246 0.0361 0.0 0.0 0.221
ENSG00000197442 MAP3K5 180242 eQTL 0.0139 -0.0358 0.0145 0.0 0.0 0.221

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 50418 1.88e-05 1.8e-05 1.54e-06 6.07e-06 1.88e-06 5.49e-06 1.41e-05 1.17e-06 8.33e-06 4.24e-06 1.24e-05 5.23e-06 1.91e-05 3.88e-06 2.36e-06 5.43e-06 6.78e-06 6.63e-06 2.63e-06 1.4e-06 4.48e-06 9.68e-06 9.75e-06 1.93e-06 1.67e-05 2.4e-06 4.48e-06 1.74e-06 1.13e-05 7.87e-06 5.24e-06 5.25e-07 7.92e-07 1.62e-06 3.62e-06 1.18e-06 1.02e-06 4.39e-07 1.2e-06 7.31e-07 2.8e-07 2.52e-05 1.76e-06 1.87e-07 6.98e-07 1.06e-06 1.17e-06 3.03e-07 6e-07