logo

Genes within 1Mb (chr6:136965952:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 7.98e-01 0.0202 0.0789 0.252 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 7.71e-01 0.0102 0.0351 0.252 B L1
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 8.47e-01 0.0181 0.0934 0.252 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0116 0.0498 0.252 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.32e-01 -0.104 0.069 0.252 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.86e-01 -0.104 0.078 0.252 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0288 0.0528 0.252 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0319 0.0399 0.252 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 5.23e-01 0.0544 0.085 0.252 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.52e-01 0.0766 0.0532 0.252 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0561 0.0406 0.252 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 5.45e-02 -0.129 0.0668 0.252 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0341 0.0598 0.252 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0505 0.0403 0.252 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.32e-01 0.15 0.0992 0.252 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.60e-01 0.0706 0.0501 0.252 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.60e-02 -0.127 0.0525 0.252 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.38e-03 -0.222 0.0723 0.252 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 9.09e-01 0.00827 0.0723 0.261 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 3.07e-01 0.0664 0.0649 0.261 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0806 0.102 0.261 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.86e-01 0.102 0.0769 0.261 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 3.45e-01 -0.079 0.0835 0.261 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.84e-01 -0.106 0.0798 0.261 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 7.03e-01 0.03 0.0787 0.261 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 6.17e-02 0.195 0.104 0.261 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0453 0.0605 0.252 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 5.84e-01 0.0284 0.0517 0.252 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0134 0.102 0.252 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 4.36e-01 0.0401 0.0513 0.252 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00162 0.0899 0.252 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0664 0.0598 0.252 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.13e-01 -0.101 0.0633 0.252 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 9.13e-01 0.0079 0.0726 0.252 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0569 0.0685 0.253 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0434 0.0363 0.253 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 4.51e-01 0.0799 0.106 0.253 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 4.64e-01 0.0419 0.057 0.253 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.0814 0.253 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0922 0.0807 0.253 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00767 0.0628 0.252 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0759 0.0524 0.252 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0231 0.102 0.252 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.95e-01 0.0506 0.0389 0.252 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 715617 sc-eQTL 1.65e-01 -0.082 0.0589 0.252 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 4.12e-02 -0.153 0.0747 0.252 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 3.50e-02 -0.163 0.0767 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 4.96e-01 0.0739 0.108 0.25 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0567 0.0879 0.25 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 7.81e-01 0.0296 0.107 0.25 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.96e-03 0.305 0.104 0.25 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0408 0.12 0.25 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.86e-03 0.287 0.0909 0.25 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0739 0.0943 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000444 0.0537 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 9.58e-01 0.00515 0.0988 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.20e-01 0.0703 0.0705 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.99e-01 -0.11 0.085 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.88e-01 0.106 0.1 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0174 0.101 0.252 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 4.54e-01 0.0449 0.0599 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.07e-01 -0.164 0.101 0.252 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.89e-01 0.0867 0.0658 0.252 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 6.68e-02 0.165 0.0895 0.252 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.27e-01 -0.119 0.098 0.252 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 3.25e-01 0.0787 0.0798 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 4.08e-01 0.0378 0.0456 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 9.22e-01 0.0104 0.106 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0424 0.0535 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 8.46e-01 0.0146 0.0752 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0992 0.0836 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0313 0.098 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 8.68e-01 0.00946 0.0569 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.79e-01 0.144 0.107 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 9.16e-01 0.00824 0.0781 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 5.99e-04 -0.282 0.0808 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0815 0.101 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 3.65e-02 -0.189 0.0895 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0506 0.0802 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 7.47e-01 0.0325 0.1 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.23e-01 0.0914 0.059 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 6.47e-01 0.0435 0.0947 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 8.85e-03 -0.24 0.0908 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 6.61e-01 0.0221 0.0504 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0239 0.0405 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 5.78e-01 0.053 0.0952 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 4.48e-01 0.0418 0.0551 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0184 0.0405 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0838 0.0712 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0438 0.0696 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 5.09e-02 -0.0856 0.0436 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.74e-01 0.139 0.102 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 4.51e-01 0.0379 0.0501 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0426 0.0571 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 6.09e-03 -0.191 0.0691 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0172 0.08 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0639 0.0565 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.19e-01 -0.16 0.103 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.58e-01 0.075 0.0529 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0515 0.082 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0971 0.0849 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0164 0.0714 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 3.29e-02 -0.101 0.0471 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 7.12e-01 0.0363 0.0982 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.91e-02 0.124 0.0595 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 8.80e-02 -0.144 0.0843 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.34e-01 -0.101 0.0842 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 4.60e-01 0.0528 0.0712 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0311 0.0497 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 4.49e-01 0.0783 0.103 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.28e-01 0.0546 0.0557 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 9.97e-03 -0.169 0.0651 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 3.35e-03 -0.24 0.0808 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0142 0.0943 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 1.29e-01 -0.107 0.0704 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.64e-01 -0.151 0.108 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 2.01e-01 0.0652 0.0509 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 2.24e-01 -0.111 0.0909 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 6.30e-02 -0.173 0.0927 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 2.46e-01 -0.107 0.0917 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 2.03e-01 -0.11 0.0865 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 2.87e-01 0.113 0.106 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.16e-01 0.106 0.0674 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.67e-01 -0.145 0.104 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.18e-01 -0.157 0.1 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0639 0.0725 0.251 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 7.02e-01 0.0232 0.0604 0.251 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 9.17e-01 0.0103 0.0985 0.251 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.96e-01 0.0415 0.0488 0.251 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 715617 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0694 0.0813 0.251 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.75e-01 -0.115 0.0848 0.251 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 9.65e-03 -0.232 0.089 0.251 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0786 0.0803 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0102 0.0594 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0457 0.105 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.98e-01 0.0771 0.0597 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0609 0.091 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.68e-01 -0.132 0.0951 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 7.37e-01 -0.021 0.0624 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0214 0.0407 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 7.13e-01 0.0395 0.107 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.22e-01 0.0582 0.0586 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 2.83e-02 -0.185 0.0836 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 6.57e-01 0.0391 0.088 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0965 0.0808 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0558 0.0686 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 9.14e-02 0.174 0.102 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 6.63e-01 0.0281 0.0643 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 7.69e-02 -0.18 0.101 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 8.57e-02 -0.178 0.103 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0775 0.0661 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0372 0.0494 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 7.26e-01 0.0366 0.104 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 6.27e-01 0.0288 0.0592 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0197 0.0814 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 2.10e-01 -0.112 0.0889 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 6.87e-02 0.229 0.125 0.252 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0183 0.109 0.252 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 5.16e-01 0.0846 0.13 0.252 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.86e-01 0.0854 0.0981 0.252 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00908 0.112 0.252 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00194 0.118 0.252 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0306 0.0825 0.252 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 1.42e-01 -0.125 0.0852 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 5.54e-01 0.0593 0.1 0.252 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 9.21e-01 0.00496 0.0503 0.252 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 715617 sc-eQTL 8.48e-01 0.0134 0.0697 0.252 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 6.14e-01 0.0491 0.0973 0.252 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00764 0.0976 0.252 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0942 0.095 0.252 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0489 0.0614 0.252 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 8.04e-01 -0.025 0.101 0.252 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0164 0.0605 0.252 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 9.25e-01 0.00621 0.0656 0.252 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.42e-01 -0.135 0.0918 0.252 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0941 0.0809 0.259 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 1.06e-02 -0.207 0.0803 0.259 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 9.91e-01 0.0012 0.105 0.259 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.54e-01 0.114 0.0796 0.259 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 6.04e-02 -0.175 0.0926 0.259 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 4.80e-01 0.0582 0.0822 0.259 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.03e-01 -0.169 0.103 0.259 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 3.38e-02 0.227 0.106 0.259 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00192 0.0574 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 6.60e-01 0.0271 0.0616 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.91e-01 0.135 0.103 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.47e-01 0.0582 0.0617 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0644 0.0889 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0452 0.0642 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.02e-01 -0.108 0.0656 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 9.31e-01 0.0072 0.0827 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00747 0.0667 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00295 0.0685 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 2.05e-01 0.135 0.107 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.56e-01 0.0839 0.059 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0106 0.0997 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0379 0.0805 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0357 0.085 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 1.23e-01 0.128 0.0826 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 2.81e-01 -0.105 0.0969 0.267 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 4.75e-03 0.239 0.0833 0.267 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 8.87e-01 0.0175 0.123 0.267 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 5.91e-01 0.0322 0.0598 0.267 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 715617 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0944 0.267 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.79e-01 -0.17 0.126 0.267 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.70e-01 -0.149 0.108 0.267 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 9.90e-01 0.000848 0.0706 0.253 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 6.45e-01 0.043 0.0932 0.253 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 5.42e-01 0.058 0.0951 0.253 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 1.98e-01 0.0784 0.0607 0.253 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0894 0.0934 0.253 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.99e-01 -0.127 0.0988 0.253 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 8.79e-01 0.0139 0.0908 0.253 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0348 0.105 0.253 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0758 0.0823 0.26 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0169 0.064 0.26 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.06e-02 -0.259 0.1 0.26 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 7.92e-03 0.192 0.0717 0.26 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 3.23e-01 0.0891 0.0899 0.26 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0866 0.0946 0.26 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0228 0.0912 0.26 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0506 0.0961 0.26 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0186 0.0928 0.263 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 5.81e-02 0.131 0.0688 0.263 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 9.49e-02 -0.17 0.101 0.263 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 8.04e-01 0.0213 0.086 0.263 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 2.84e-01 0.0765 0.0711 0.263 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.60e-03 -0.355 0.111 0.263 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 3.86e-01 0.0756 0.0871 0.263 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 4.51e-01 0.0794 0.105 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0545 0.0832 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0127 0.0468 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0486 0.0957 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.71e-01 0.0526 0.0587 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0483 0.0777 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 7.36e-01 0.0336 0.0994 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 5.04e-01 0.0563 0.0842 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 7.37e-01 0.013 0.0387 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 2.67e-01 0.114 0.102 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0512 0.0481 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.43e-01 -0.103 0.0703 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.24e-01 -0.132 0.0854 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 8.48e-01 0.0111 0.0579 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 8.90e-01 0.00745 0.0539 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 1.78e-01 0.14 0.104 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 2.25e-01 0.065 0.0534 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0407 0.0929 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0279 0.0628 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0883 0.0639 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 4.96e-01 0.0509 0.0746 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0834 0.0674 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 7.35e-01 0.0207 0.0612 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 7.34e-02 -0.182 0.101 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 3.74e-02 0.131 0.0626 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 415133 sc-eQTL 6.03e-01 0.0515 0.0987 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 2.47e-02 -0.181 0.0801 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0112 0.0848 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 181907 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0569 0.0962 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -253497 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0438 0.0641 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 676101 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0377 0.0371 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 143388 sc-eQTL 4.14e-01 0.0884 0.108 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -901262 sc-eQTL 5.83e-01 0.0321 0.0584 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 sc-eQTL 1.76e-01 -0.107 0.0786 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -902281 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0773 0.0816 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112357 PEX7 143388 eQTL 0.0397 -0.0633 0.0307 0.0 0.0 0.232
ENSG00000182747 SLC35D3 43651 eQTL 7.58e-13 0.258 0.0355 0.0 0.0 0.232
ENSG00000197442 MAP3K5 173475 eQTL 0.0115 -0.0363 0.0143 0.0 0.0 0.232

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 43651 9.72e-06 9.82e-06 1.43e-06 5.63e-06 2.43e-06 4.26e-06 1.11e-05 1.92e-06 9.21e-06 5.11e-06 1.24e-05 5.31e-06 1.55e-05 3.66e-06 2.94e-06 6.47e-06 4.69e-06 7.74e-06 2.69e-06 2.85e-06 5.46e-06 9.61e-06 8.67e-06 3.3e-06 1.45e-05 3.91e-06 4.9e-06 3.89e-06 1.07e-05 1.02e-05 5.48e-06 9.52e-07 1.17e-06 3.37e-06 4.58e-06 2.66e-06 1.83e-06 1.86e-06 2.25e-06 9.95e-07 9.48e-07 1.3e-05 1.49e-06 1.35e-07 7.98e-07 1.76e-06 1.7e-06 7.5e-07 4.86e-07