logo

Genes within 1Mb (chr6:136959525:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0206 0.115 0.098 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00707 0.0512 0.098 B L1
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.12e-02 -0.343 0.134 0.098 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 7.58e-01 0.0223 0.0725 0.098 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 2.72e-01 -0.111 0.101 0.098 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0348 0.114 0.098 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00236 0.0765 0.098 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0822 0.0576 0.098 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 4.13e-01 -0.101 0.123 0.098 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 3.19e-01 0.0772 0.0773 0.098 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0905 0.0587 0.098 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 3.98e-02 0.2 0.0966 0.098 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 9.49e-02 0.144 0.0858 0.098 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 5.40e-01 0.0358 0.0584 0.098 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 7.97e-01 -0.037 0.144 0.098 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 8.23e-01 0.0162 0.0727 0.098 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.80e-02 -0.131 0.0763 0.098 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0238 0.107 0.098 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0815 0.107 0.099 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 8.55e-01 0.0176 0.0961 0.099 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 7.67e-01 0.0446 0.15 0.099 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 2.22e-01 0.139 0.114 0.099 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 2.75e-01 0.135 0.123 0.099 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 1.98e-01 -0.152 0.118 0.099 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 4.90e-01 0.0803 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 8.50e-01 0.0292 0.155 0.099 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 2.52e-01 -0.1 0.0874 0.098 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0556 0.0748 0.098 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 6.76e-03 -0.396 0.145 0.098 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0642 0.0742 0.098 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0764 0.13 0.098 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0857 0.0866 0.098 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0601 0.092 0.098 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 6.83e-01 -0.043 0.105 0.098 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 6.98e-01 0.0378 0.0971 0.099 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 1.21e-01 0.08 0.0513 0.099 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.49e-01 -0.216 0.149 0.099 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0999 0.0806 0.099 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 5.01e-01 -0.078 0.116 0.099 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 2.12e-01 0.143 0.114 0.099 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0305 0.0926 0.098 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 2.17e-02 -0.177 0.0767 0.098 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00917 0.151 0.098 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 8.10e-01 0.0139 0.0576 0.098 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 709190 sc-eQTL 5.53e-01 0.0518 0.0872 0.098 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 7.42e-03 -0.296 0.109 0.098 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00602 0.114 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 3.14e-01 0.171 0.17 0.092 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0796 0.138 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.17e-01 -0.262 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 2.32e-01 0.201 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 4.58e-01 0.14 0.188 0.092 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 2.48e-01 0.169 0.146 0.092 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 1.49e-01 -0.195 0.135 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0265 0.0771 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.67e-01 -0.196 0.141 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 5.16e-01 0.066 0.101 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 9.16e-01 0.0129 0.123 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 4.60e-01 0.106 0.144 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 6.87e-01 -0.062 0.154 0.099 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 7.21e-01 0.0327 0.0914 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.47e-01 -0.225 0.155 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 1.61e-01 -0.141 0.1 0.099 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 6.46e-01 0.0633 0.137 0.099 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 7.85e-02 -0.263 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 6.92e-01 0.046 0.116 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0656 0.0661 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.71e-02 -0.363 0.151 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 2.31e-01 0.0929 0.0773 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 3.49e-01 0.102 0.109 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0517 0.121 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 2.89e-01 -0.151 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 1.03e-01 0.134 0.082 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0781 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 1.95e-01 -0.147 0.113 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0901 0.12 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 7.33e-01 0.0501 0.146 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 8.41e-02 -0.228 0.131 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 2.68e-01 -0.13 0.117 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0235 0.147 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 8.38e-04 0.286 0.0843 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000547 0.138 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 1.98e-01 0.174 0.134 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 5.18e-01 0.0472 0.0728 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0875 0.0582 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 8.46e-01 0.0268 0.138 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 5.90e-01 0.043 0.0796 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 5.82e-02 -0.111 0.058 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 1.39e-02 0.252 0.102 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0356 0.101 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0516 0.0636 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 6.69e-02 -0.271 0.147 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 5.80e-01 0.0403 0.0727 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0286 0.0828 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 4.68e-01 0.0741 0.102 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 1.72e-01 0.161 0.117 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 3.74e-02 -0.173 0.0826 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 5.28e-01 -0.096 0.152 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 3.09e-01 0.0795 0.078 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0845 0.121 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 3.75e-02 0.26 0.124 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 1.61e-01 0.149 0.106 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00239 0.071 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 4.18e-01 -0.119 0.146 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 8.36e-01 0.0186 0.0896 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 3.71e-02 -0.263 0.125 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 8.00e-01 0.032 0.126 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 9.60e-02 0.17 0.102 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0112 0.0716 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 5.60e-02 -0.283 0.147 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 3.14e-01 0.0808 0.08 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0817 0.0949 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 5.54e-01 0.0702 0.118 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0274 0.141 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0195 0.106 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 6.45e-01 0.0744 0.161 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0319 0.0762 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 7.73e-01 0.0392 0.136 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 1.31e-01 -0.21 0.139 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 6.18e-01 -0.065 0.13 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 9.30e-01 0.0108 0.123 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 4.76e-01 -0.107 0.15 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 5.06e-02 0.187 0.0952 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0015 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 7.85e-01 -0.039 0.143 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 1.78e-01 -0.143 0.106 0.1 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 2.12e-01 -0.11 0.088 0.1 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 4.13e-01 -0.118 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0114 0.0715 0.1 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 709190 sc-eQTL 9.72e-01 0.00426 0.119 0.1 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 9.41e-03 -0.321 0.123 0.1 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 8.79e-01 0.0202 0.132 0.1 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.116 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 7.43e-01 0.0281 0.0854 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 8.51e-02 -0.259 0.15 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0636 0.086 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 2.89e-01 -0.139 0.131 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 3.19e-01 0.137 0.137 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 8.21e-01 0.0203 0.0895 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 7.95e-02 0.102 0.0581 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.82e-01 -0.206 0.154 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 1.57e-01 -0.119 0.0839 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0709 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 6.47e-01 0.058 0.126 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 1.39e-02 0.284 0.114 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 8.61e-02 -0.168 0.0976 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 6.25e-02 -0.274 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0388 0.092 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.97e-01 0.0189 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 8.48e-02 0.255 0.147 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0399 0.0947 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 8.46e-01 0.0138 0.0707 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 3.01e-01 0.154 0.148 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 1.47e-01 -0.123 0.0842 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0705 0.116 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 7.48e-02 0.227 0.127 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 2.83e-01 0.206 0.191 0.1 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 2.22e-01 0.202 0.164 0.1 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0369 0.197 0.1 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 1.79e-01 0.2 0.148 0.1 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0421 0.169 0.1 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0228 0.179 0.1 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 4.89e-01 0.0827 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 4.15e-03 -0.352 0.122 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 7.27e-01 0.0507 0.145 0.1 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0944 0.0725 0.1 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 709190 sc-eQTL 3.11e-01 0.102 0.101 0.1 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.36e-01 0.0293 0.141 0.1 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 1.25e-01 -0.217 0.141 0.1 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0325 0.137 0.098 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0492 0.0882 0.098 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 9.00e-01 0.0181 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 7.73e-01 0.025 0.0868 0.098 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.06e-01 0.0232 0.0941 0.098 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 3.45e-01 0.125 0.132 0.098 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 9.18e-01 0.0124 0.12 0.093 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 3.44e-01 -0.114 0.12 0.093 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 2.80e-01 0.167 0.155 0.093 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 6.79e-01 0.0489 0.118 0.093 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 2.31e-01 0.165 0.138 0.093 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0235 0.122 0.093 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 9.74e-01 0.00495 0.154 0.093 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 3.95e-01 0.135 0.158 0.093 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0978 0.0818 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0574 0.0879 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 7.16e-02 -0.265 0.146 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0749 0.0882 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0313 0.127 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0777 0.0917 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0791 0.0942 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0394 0.118 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0231 0.0955 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0297 0.0981 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 9.21e-02 -0.258 0.152 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 4.80e-01 -0.06 0.0848 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 1.71e-01 -0.195 0.142 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 2.81e-01 -0.124 0.115 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00428 0.122 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0193 0.119 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 1.48e-01 -0.203 0.139 0.103 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 3.12e-01 -0.125 0.123 0.103 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 2.69e-01 0.197 0.177 0.103 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 4.48e-01 0.0656 0.0862 0.103 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 709190 sc-eQTL 8.86e-01 0.0196 0.136 0.103 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 1.54e-01 -0.26 0.182 0.103 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 1.84e-01 0.208 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 2.47e-01 -0.116 0.1 0.098 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0703 0.133 0.098 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 6.58e-02 -0.249 0.135 0.098 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0914 0.0867 0.098 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 4.79e-01 0.0945 0.133 0.098 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0826 0.141 0.098 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0229 0.129 0.098 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0555 0.149 0.098 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 1.18e-01 -0.188 0.119 0.1 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0724 0.0932 0.1 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 4.62e-01 -0.109 0.149 0.1 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 7.85e-01 -0.029 0.106 0.1 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 3.95e-01 0.112 0.131 0.1 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0155 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0118 0.133 0.1 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 6.48e-02 0.258 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 3.10e-01 -0.141 0.138 0.099 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00982 0.104 0.099 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 6.12e-01 0.0776 0.152 0.099 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 8.70e-02 0.219 0.127 0.099 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 3.01e-01 -0.11 0.106 0.099 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.23e-03 -0.446 0.167 0.099 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 6.29e-01 0.063 0.13 0.099 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 3.53e-01 0.146 0.157 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0736 0.122 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 9.27e-01 0.00624 0.0685 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 5.35e-02 -0.27 0.139 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0487 0.086 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 5.39e-01 0.07 0.114 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 3.18e-01 0.145 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00288 0.123 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0101 0.0564 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 1.41e-01 -0.219 0.149 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 9.26e-01 0.0065 0.0703 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0234 0.103 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0947 0.125 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 4.30e-01 -0.065 0.0822 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0478 0.0765 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 2.28e-02 -0.335 0.146 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0708 0.0759 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 3.80e-01 -0.116 0.132 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0847 0.089 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0395 0.0912 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0568 0.106 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 6.41e-02 -0.183 0.0982 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0532 0.0894 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 2.28e-02 -0.339 0.148 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00812 0.0925 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 408706 sc-eQTL 2.36e-01 0.171 0.144 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0556 0.119 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0475 0.124 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 175480 sc-eQTL 4.00e-01 0.118 0.141 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -259924 sc-eQTL 8.94e-01 0.0122 0.092 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 669674 sc-eQTL 1.50e-01 0.0768 0.0532 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 136961 sc-eQTL 4.08e-01 -0.129 0.155 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -907689 sc-eQTL 2.19e-01 -0.103 0.0836 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 167048 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0876 0.113 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -908708 sc-eQTL 2.23e-01 0.143 0.117 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000016402 IL20RA -85655 pQTL 0.0219 -0.107 0.0466 0.00192 0.0 0.108
ENSG00000135525 MAP7 408706 eQTL 0.04 -0.0738 0.0359 0.0 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 37224 6.23e-05 5.79e-05 1.34e-05 2.74e-05 1.47e-05 3.04e-05 8.32e-05 1.61e-05 7.46e-05 4.73e-05 9.24e-05 4e-05 0.000104 3.07e-05 1.65e-05 5.44e-05 3.88e-05 5.79e-05 1.78e-05 1.76e-05 3.81e-05 7.69e-05 6.27e-05 2.01e-05 9.94e-05 2.42e-05 3.63e-05 3.68e-05 6.95e-05 4e-05 4.84e-05 5.33e-06 8.67e-06 1.73e-05 2.38e-05 1.24e-05 7.41e-06 9.45e-06 1.06e-05 8.06e-06 3.53e-06 6.43e-05 6.88e-06 1.38e-06 6.71e-06 1.15e-05 1.23e-05 5.96e-06 4.19e-06