logo

Genes within 1Mb (chr6:136956752:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 9.81e-01 0.00277 0.115 0.096 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00812 0.0514 0.096 B L1
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.89e-02 -0.319 0.135 0.096 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 7.68e-01 0.0215 0.0728 0.096 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0853 0.101 0.096 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0396 0.115 0.096 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 8.57e-01 0.0139 0.077 0.096 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0747 0.058 0.096 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 3.42e-01 -0.118 0.124 0.096 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.54e-01 0.0889 0.0778 0.096 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0867 0.0591 0.096 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 2.34e-02 0.221 0.097 0.096 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 7.71e-02 0.153 0.0863 0.096 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.07e-01 0.0391 0.0588 0.096 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0166 0.145 0.096 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 8.65e-01 0.0124 0.0732 0.096 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 7.16e-02 -0.139 0.0767 0.096 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00255 0.107 0.096 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0732 0.107 0.097 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00167 0.0965 0.097 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 6.74e-01 0.0637 0.151 0.097 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.76e-01 0.125 0.114 0.097 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 1.66e-01 0.172 0.124 0.097 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 1.91e-01 -0.156 0.118 0.097 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 5.63e-01 0.0677 0.117 0.097 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0123 0.155 0.097 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0989 0.0879 0.096 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0582 0.0753 0.096 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 7.37e-03 -0.395 0.146 0.096 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0584 0.0747 0.096 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0713 0.131 0.096 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0804 0.0871 0.096 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0512 0.0926 0.096 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0472 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 5.58e-01 0.0573 0.0975 0.097 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 6.27e-02 0.0962 0.0514 0.097 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.42e-01 -0.221 0.15 0.097 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0854 0.081 0.097 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 5.65e-01 -0.067 0.116 0.097 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.115 0.097 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0072 0.0928 0.096 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 4.29e-02 -0.157 0.0771 0.096 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0198 0.151 0.096 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 6.63e-01 0.0252 0.0577 0.096 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 706417 sc-eQTL 6.13e-01 0.0442 0.0874 0.096 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 5.36e-03 -0.308 0.109 0.096 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 8.59e-01 0.0203 0.115 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 3.14e-01 0.171 0.17 0.092 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0796 0.138 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.17e-01 -0.262 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.32e-01 0.201 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 4.58e-01 0.14 0.188 0.092 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 2.48e-01 0.169 0.146 0.092 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 1.53e-01 -0.195 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0256 0.0776 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 3.44e-01 -0.135 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 6.10e-01 0.0521 0.102 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 9.86e-01 0.00211 0.123 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 2.82e-01 0.156 0.144 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0401 0.155 0.097 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 8.86e-01 0.0132 0.0918 0.097 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.10e-01 -0.249 0.155 0.097 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 1.51e-01 -0.145 0.101 0.097 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 4.22e-01 0.111 0.138 0.097 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 4.18e-02 -0.305 0.149 0.097 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 5.24e-01 0.0742 0.116 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0629 0.0663 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.77e-02 -0.362 0.151 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.30e-01 0.0933 0.0776 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 2.76e-01 0.119 0.109 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0536 0.122 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 3.11e-01 -0.145 0.143 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 9.52e-02 0.138 0.0824 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0617 0.156 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 1.57e-01 -0.161 0.113 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0517 0.121 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 8.35e-01 0.0307 0.147 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 8.91e-02 -0.226 0.132 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 3.18e-01 -0.118 0.118 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 9.95e-01 0.00101 0.147 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 5.22e-04 0.298 0.0846 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 9.31e-01 0.0121 0.139 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 1.21e-01 0.21 0.135 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 4.32e-01 0.0576 0.0733 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0775 0.0587 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 8.79e-01 0.021 0.139 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 4.96e-01 0.0547 0.0801 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 5.52e-02 -0.113 0.0584 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 7.88e-03 0.274 0.102 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0241 0.102 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0411 0.064 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 4.53e-02 -0.297 0.148 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 5.02e-01 0.0492 0.0731 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0161 0.0833 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 4.09e-01 0.0847 0.102 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 1.33e-01 0.178 0.118 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 3.06e-02 -0.181 0.083 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 4.76e-01 -0.109 0.153 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 3.39e-01 0.0753 0.0785 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0734 0.121 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 2.50e-02 0.281 0.125 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 1.21e-01 0.165 0.106 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 8.82e-01 0.0106 0.0713 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0671 0.147 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 7.75e-01 0.0258 0.09 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 2.95e-02 -0.275 0.126 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 5.96e-01 0.0672 0.126 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 1.12e-01 0.164 0.103 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00696 0.072 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 4.84e-02 -0.294 0.148 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 3.73e-01 0.0718 0.0805 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0844 0.0954 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 5.22e-01 0.0763 0.119 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0134 0.142 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0026 0.106 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 6.21e-01 0.0806 0.163 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0155 0.0768 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 7.18e-01 0.0495 0.137 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 1.91e-01 -0.184 0.14 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 8.26e-01 -0.029 0.131 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 7.65e-01 0.0371 0.124 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0803 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 6.58e-02 0.178 0.0961 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0344 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 9.73e-01 0.00491 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.106 0.097 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0938 0.0884 0.097 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 4.35e-01 -0.113 0.144 0.097 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000601 0.0718 0.097 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 706417 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0207 0.12 0.097 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 7.17e-03 -0.334 0.123 0.097 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 7.39e-01 0.0442 0.133 0.097 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 7.96e-01 0.0302 0.116 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 8.06e-01 0.021 0.0858 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 6.70e-02 -0.277 0.15 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0563 0.0865 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 2.47e-01 -0.152 0.131 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 2.78e-01 0.15 0.138 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 7.09e-01 0.0336 0.0899 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 4.34e-02 0.118 0.0582 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.68e-01 -0.214 0.154 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.31e-01 -0.101 0.0844 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0582 0.122 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 5.22e-01 0.0813 0.127 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 9.24e-03 0.303 0.115 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0986 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 6.92e-02 -0.269 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0277 0.0928 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 8.75e-01 0.0233 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 9.40e-02 0.25 0.148 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 8.01e-01 -0.024 0.0952 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 6.74e-01 0.0299 0.071 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 2.92e-01 0.158 0.149 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.00e-01 -0.109 0.0846 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0538 0.117 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 4.64e-02 0.254 0.127 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 2.83e-01 0.206 0.191 0.1 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 2.22e-01 0.202 0.164 0.1 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0369 0.197 0.1 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 1.79e-01 0.2 0.148 0.1 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0421 0.169 0.1 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0228 0.179 0.1 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.12 0.098 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.22e-03 -0.346 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 8.45e-01 0.0286 0.146 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0898 0.0731 0.098 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 706417 sc-eQTL 3.31e-01 0.0988 0.101 0.098 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 8.56e-01 0.0258 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 1.41e-01 -0.209 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00974 0.137 0.096 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0275 0.0887 0.096 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00569 0.145 0.096 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 7.90e-01 0.0233 0.0873 0.096 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 6.87e-01 0.0381 0.0946 0.096 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 2.50e-01 0.153 0.133 0.096 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 8.44e-01 0.0237 0.121 0.09 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 2.63e-01 -0.136 0.121 0.09 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 2.20e-01 0.191 0.156 0.09 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 7.76e-01 0.0339 0.119 0.09 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 1.42e-01 0.204 0.138 0.09 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0656 0.122 0.09 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0147 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 6.61e-01 0.07 0.159 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0985 0.0823 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0597 0.0885 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 7.06e-02 -0.268 0.147 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0635 0.0888 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0379 0.128 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0629 0.0923 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0681 0.0948 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0464 0.119 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 7.79e-01 -0.027 0.0961 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0211 0.0987 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.13e-01 -0.244 0.153 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 6.40e-01 -0.04 0.0853 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 2.41e-01 -0.168 0.143 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 2.22e-01 -0.142 0.116 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 8.09e-01 0.0296 0.123 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0485 0.12 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 1.98e-01 -0.183 0.142 0.1 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 3.05e-01 -0.129 0.125 0.1 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 2.17e-01 0.223 0.18 0.1 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 4.30e-01 0.0692 0.0875 0.1 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 706417 sc-eQTL 9.23e-01 0.0134 0.138 0.1 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 2.78e-01 -0.201 0.185 0.1 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 9.16e-02 0.267 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 2.09e-01 -0.127 0.101 0.096 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0841 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 3.45e-02 -0.288 0.135 0.096 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0891 0.0874 0.096 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 4.38e-01 0.104 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0858 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00839 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0289 0.151 0.096 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 1.26e-01 -0.184 0.12 0.097 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0678 0.0937 0.097 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0895 0.149 0.097 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0293 0.107 0.097 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.132 0.097 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0054 0.139 0.097 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0269 0.134 0.097 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 5.75e-02 0.267 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 3.52e-01 -0.13 0.14 0.096 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0283 0.105 0.096 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 5.47e-01 0.0928 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 8.46e-02 0.223 0.128 0.096 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0938 0.107 0.096 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 1.57e-02 -0.413 0.169 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 6.13e-01 0.0667 0.132 0.096 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 3.48e-01 0.149 0.158 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0579 0.123 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00162 0.0689 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 9.06e-02 -0.238 0.14 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0557 0.0864 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 4.90e-01 0.079 0.114 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 2.79e-01 0.158 0.146 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 8.87e-01 0.0176 0.123 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00395 0.0566 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 1.68e-01 -0.207 0.149 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 9.63e-01 0.0033 0.0706 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 9.09e-01 0.0119 0.103 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 4.02e-01 -0.105 0.125 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0653 0.0826 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0469 0.077 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 2.67e-02 -0.328 0.147 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0593 0.0764 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 4.02e-01 -0.111 0.133 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0828 0.0895 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 7.77e-01 -0.026 0.0917 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0669 0.107 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 6.29e-02 -0.185 0.0989 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0514 0.09 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 2.27e-02 -0.341 0.149 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0079 0.0931 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 405933 sc-eQTL 2.18e-01 0.179 0.145 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0547 0.119 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 6.78e-01 -0.052 0.125 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 172707 sc-eQTL 3.13e-01 0.143 0.141 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 sc-eQTL 7.41e-01 0.0306 0.0924 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666901 sc-eQTL 7.65e-02 0.0948 0.0532 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 134188 sc-eQTL 4.09e-01 -0.129 0.156 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910462 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0875 0.084 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 164275 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0718 0.114 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911481 sc-eQTL 1.51e-01 0.169 0.117 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000016402 IL20RA -88428 pQTL 0.0107 -0.12 0.0471 0.00288 0.0 0.105
ENSG00000027697 IFNGR1 -262697 pQTL 0.0455 0.0482 0.0241 0.0 0.0 0.105
ENSG00000112357 PEX7 134188 eQTL 0.0376 -0.0844 0.0405 0.0 0.0 0.106
ENSG00000135525 MAP7 405933 eQTL 0.0335 -0.0775 0.0364 0.0 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 34451 1.07e-05 1.32e-05 1.56e-06 7.63e-06 2.39e-06 5.49e-06 1.46e-05 1.92e-06 1.05e-05 5.16e-06 1.35e-05 5.8e-06 2.3e-05 4.89e-06 2.49e-06 6.38e-06 6.74e-06 7.71e-06 3.37e-06 2.82e-06 5.18e-06 1.03e-05 8.1e-06 3.16e-06 1.81e-05 3.24e-06 4.88e-06 4.08e-06 1.33e-05 1.18e-05 6.63e-06 9.55e-07 1.29e-06 2.99e-06 5.63e-06 2.36e-06 1.82e-06 1.84e-06 2.15e-06 9.56e-07 8.54e-07 1.58e-05 1.43e-06 1.92e-07 6.85e-07 1.29e-06 9.12e-07 7.08e-07 6.2e-07