logo

Genes within 1Mb (chr6:136956260:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 9.81e-01 0.00277 0.115 0.096 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00812 0.0514 0.096 B L1
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.89e-02 -0.319 0.135 0.096 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 7.68e-01 0.0215 0.0728 0.096 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0853 0.101 0.096 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0396 0.115 0.096 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 8.57e-01 0.0139 0.077 0.096 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0747 0.058 0.096 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 3.42e-01 -0.118 0.124 0.096 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.54e-01 0.0889 0.0778 0.096 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0867 0.0591 0.096 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 2.34e-02 0.221 0.097 0.096 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 7.71e-02 0.153 0.0863 0.096 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.07e-01 0.0391 0.0588 0.096 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0166 0.145 0.096 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 8.65e-01 0.0124 0.0732 0.096 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 7.16e-02 -0.139 0.0767 0.096 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00255 0.107 0.096 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0732 0.107 0.097 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00167 0.0965 0.097 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 6.74e-01 0.0637 0.151 0.097 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.76e-01 0.125 0.114 0.097 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 1.66e-01 0.172 0.124 0.097 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 1.91e-01 -0.156 0.118 0.097 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 5.63e-01 0.0677 0.117 0.097 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0123 0.155 0.097 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0989 0.0879 0.096 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0582 0.0753 0.096 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 7.37e-03 -0.395 0.146 0.096 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0584 0.0747 0.096 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0713 0.131 0.096 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0804 0.0871 0.096 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0512 0.0926 0.096 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0472 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 5.58e-01 0.0573 0.0975 0.097 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 6.27e-02 0.0962 0.0514 0.097 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.42e-01 -0.221 0.15 0.097 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0854 0.081 0.097 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 5.65e-01 -0.067 0.116 0.097 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.115 0.097 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0072 0.0928 0.096 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 4.29e-02 -0.157 0.0771 0.096 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0198 0.151 0.096 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 6.63e-01 0.0252 0.0577 0.096 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 705925 sc-eQTL 6.13e-01 0.0442 0.0874 0.096 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 5.36e-03 -0.308 0.109 0.096 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 8.59e-01 0.0203 0.115 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 3.14e-01 0.171 0.17 0.092 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0796 0.138 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.17e-01 -0.262 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.32e-01 0.201 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 4.58e-01 0.14 0.188 0.092 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 2.48e-01 0.169 0.146 0.092 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 1.53e-01 -0.195 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0256 0.0776 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 3.44e-01 -0.135 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 6.10e-01 0.0521 0.102 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 9.86e-01 0.00211 0.123 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 2.82e-01 0.156 0.144 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0401 0.155 0.097 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 8.86e-01 0.0132 0.0918 0.097 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.10e-01 -0.249 0.155 0.097 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 1.51e-01 -0.145 0.101 0.097 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 4.22e-01 0.111 0.138 0.097 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 4.18e-02 -0.305 0.149 0.097 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 5.24e-01 0.0742 0.116 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0629 0.0663 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.77e-02 -0.362 0.151 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.30e-01 0.0933 0.0776 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 2.76e-01 0.119 0.109 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0536 0.122 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 3.11e-01 -0.145 0.143 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 9.52e-02 0.138 0.0824 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0617 0.156 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 1.57e-01 -0.161 0.113 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0517 0.121 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 8.35e-01 0.0307 0.147 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 8.91e-02 -0.226 0.132 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 3.18e-01 -0.118 0.118 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 9.95e-01 0.00101 0.147 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 5.22e-04 0.298 0.0846 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 9.31e-01 0.0121 0.139 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 1.21e-01 0.21 0.135 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 4.32e-01 0.0576 0.0733 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0775 0.0587 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 8.79e-01 0.021 0.139 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 4.96e-01 0.0547 0.0801 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 5.52e-02 -0.113 0.0584 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 7.88e-03 0.274 0.102 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0241 0.102 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0411 0.064 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 4.53e-02 -0.297 0.148 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 5.02e-01 0.0492 0.0731 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0161 0.0833 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 4.09e-01 0.0847 0.102 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 1.33e-01 0.178 0.118 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 3.06e-02 -0.181 0.083 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 4.76e-01 -0.109 0.153 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 3.39e-01 0.0753 0.0785 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0734 0.121 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 2.50e-02 0.281 0.125 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 1.21e-01 0.165 0.106 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 8.82e-01 0.0106 0.0713 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0671 0.147 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 7.75e-01 0.0258 0.09 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 2.95e-02 -0.275 0.126 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 5.96e-01 0.0672 0.126 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 1.12e-01 0.164 0.103 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00696 0.072 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 4.84e-02 -0.294 0.148 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 3.73e-01 0.0718 0.0805 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0844 0.0954 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 5.22e-01 0.0763 0.119 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0134 0.142 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0026 0.106 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 6.21e-01 0.0806 0.163 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0155 0.0768 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 7.18e-01 0.0495 0.137 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 1.91e-01 -0.184 0.14 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 8.26e-01 -0.029 0.131 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 7.65e-01 0.0371 0.124 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0803 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 6.58e-02 0.178 0.0961 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0344 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 9.73e-01 0.00491 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.106 0.097 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0938 0.0884 0.097 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 4.35e-01 -0.113 0.144 0.097 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000601 0.0718 0.097 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 705925 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0207 0.12 0.097 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 7.17e-03 -0.334 0.123 0.097 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 7.39e-01 0.0442 0.133 0.097 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 7.96e-01 0.0302 0.116 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 8.06e-01 0.021 0.0858 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 6.70e-02 -0.277 0.15 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0563 0.0865 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 2.47e-01 -0.152 0.131 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 2.78e-01 0.15 0.138 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 7.09e-01 0.0336 0.0899 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 4.34e-02 0.118 0.0582 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.68e-01 -0.214 0.154 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.31e-01 -0.101 0.0844 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0582 0.122 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 5.22e-01 0.0813 0.127 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 9.24e-03 0.303 0.115 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0986 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 6.92e-02 -0.269 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0277 0.0928 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 8.75e-01 0.0233 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 9.40e-02 0.25 0.148 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 8.01e-01 -0.024 0.0952 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 6.74e-01 0.0299 0.071 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 2.92e-01 0.158 0.149 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.00e-01 -0.109 0.0846 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0538 0.117 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 4.64e-02 0.254 0.127 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 2.83e-01 0.206 0.191 0.1 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 2.22e-01 0.202 0.164 0.1 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0369 0.197 0.1 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 1.79e-01 0.2 0.148 0.1 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0421 0.169 0.1 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0228 0.179 0.1 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.12 0.098 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.22e-03 -0.346 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 8.45e-01 0.0286 0.146 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0898 0.0731 0.098 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 705925 sc-eQTL 3.31e-01 0.0988 0.101 0.098 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 8.56e-01 0.0258 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 1.41e-01 -0.209 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00974 0.137 0.096 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0275 0.0887 0.096 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00569 0.145 0.096 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 7.90e-01 0.0233 0.0873 0.096 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 6.87e-01 0.0381 0.0946 0.096 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 2.50e-01 0.153 0.133 0.096 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 8.44e-01 0.0237 0.121 0.09 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 2.63e-01 -0.136 0.121 0.09 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 2.20e-01 0.191 0.156 0.09 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 7.76e-01 0.0339 0.119 0.09 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 1.42e-01 0.204 0.138 0.09 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0656 0.122 0.09 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0147 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 6.61e-01 0.07 0.159 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0985 0.0823 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0597 0.0885 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 7.06e-02 -0.268 0.147 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0635 0.0888 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0379 0.128 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0629 0.0923 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0681 0.0948 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0464 0.119 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 7.79e-01 -0.027 0.0961 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0211 0.0987 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.13e-01 -0.244 0.153 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 6.40e-01 -0.04 0.0853 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 2.41e-01 -0.168 0.143 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 2.22e-01 -0.142 0.116 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 8.09e-01 0.0296 0.123 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0485 0.12 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 1.98e-01 -0.183 0.142 0.1 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 3.05e-01 -0.129 0.125 0.1 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 2.17e-01 0.223 0.18 0.1 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 4.30e-01 0.0692 0.0875 0.1 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 705925 sc-eQTL 9.23e-01 0.0134 0.138 0.1 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 2.78e-01 -0.201 0.185 0.1 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 9.16e-02 0.267 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 2.09e-01 -0.127 0.101 0.096 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0841 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 3.45e-02 -0.288 0.135 0.096 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0891 0.0874 0.096 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 4.38e-01 0.104 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0858 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00839 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0289 0.151 0.096 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 1.26e-01 -0.184 0.12 0.097 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0678 0.0937 0.097 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0895 0.149 0.097 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0293 0.107 0.097 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.132 0.097 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0054 0.139 0.097 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0269 0.134 0.097 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 5.75e-02 0.267 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 3.52e-01 -0.13 0.14 0.096 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0283 0.105 0.096 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 5.47e-01 0.0928 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 8.46e-02 0.223 0.128 0.096 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0938 0.107 0.096 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 1.57e-02 -0.413 0.169 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 6.13e-01 0.0667 0.132 0.096 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 3.48e-01 0.149 0.158 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0579 0.123 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00162 0.0689 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 9.06e-02 -0.238 0.14 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0557 0.0864 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 4.90e-01 0.079 0.114 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 2.79e-01 0.158 0.146 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 8.87e-01 0.0176 0.123 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00395 0.0566 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 1.68e-01 -0.207 0.149 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 9.63e-01 0.0033 0.0706 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 9.09e-01 0.0119 0.103 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 4.02e-01 -0.105 0.125 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0653 0.0826 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0469 0.077 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 2.67e-02 -0.328 0.147 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0593 0.0764 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 4.02e-01 -0.111 0.133 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0828 0.0895 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 7.77e-01 -0.026 0.0917 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0669 0.107 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 6.29e-02 -0.185 0.0989 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0514 0.09 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 2.27e-02 -0.341 0.149 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0079 0.0931 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 405441 sc-eQTL 2.18e-01 0.179 0.145 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0547 0.119 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 6.78e-01 -0.052 0.125 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 172215 sc-eQTL 3.13e-01 0.143 0.141 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 sc-eQTL 7.41e-01 0.0306 0.0924 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 666409 sc-eQTL 7.65e-02 0.0948 0.0532 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 133696 sc-eQTL 4.09e-01 -0.129 0.156 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -910954 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0875 0.084 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 163783 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0718 0.114 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -911973 sc-eQTL 1.51e-01 0.169 0.117 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000016402 IL20RA -88920 pQTL 0.0105 -0.121 0.0471 0.00291 0.0 0.105
ENSG00000027697 IFNGR1 -263189 pQTL 0.0453 0.0482 0.024 0.0 0.0 0.105
ENSG00000112357 PEX7 133696 eQTL 0.0375 -0.0843 0.0405 0.0 0.0 0.106
ENSG00000135525 MAP7 405441 eQTL 0.034 -0.0772 0.0364 0.0 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 33959 1.3e-05 1.4e-05 2.51e-06 7.63e-06 2.42e-06 5.91e-06 1.81e-05 2.2e-06 1.32e-05 6.24e-06 1.79e-05 6.87e-06 2.26e-05 4.89e-06 3.97e-06 8.32e-06 7.66e-06 1.16e-05 3.53e-06 3.23e-06 6.73e-06 1.27e-05 1.32e-05 3.99e-06 2.34e-05 4.96e-06 7.15e-06 5.22e-06 1.45e-05 1.3e-05 8.7e-06 9.64e-07 1.33e-06 3.69e-06 5.46e-06 2.81e-06 1.78e-06 2.13e-06 2.35e-06 1.3e-06 1.2e-06 1.76e-05 1.97e-06 2.69e-07 1.27e-06 1.94e-06 2.11e-06 7.25e-07 5e-07