Genes within 1Mb (chr6:136888720:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 6.29e-01 0.0529 0.109 0.103 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0713 0.0485 0.103 B L1
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.67e-06 0.605 0.123 0.103 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0491 0.069 0.103 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 5.52e-01 0.0573 0.0962 0.103 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0567 0.109 0.103 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0394 0.0729 0.103 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 7.36e-02 -0.0985 0.0548 0.103 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.35e-03 0.372 0.115 0.103 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.08e-01 -0.118 0.0734 0.103 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 9.07e-01 0.00659 0.0563 0.103 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 6.37e-01 -0.044 0.093 0.103 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 5.87e-01 0.0451 0.0829 0.103 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.26e-01 -0.068 0.056 0.103 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.80e-03 0.427 0.135 0.103 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.73e-02 -0.153 0.069 0.103 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 4.71e-01 0.0533 0.0737 0.103 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 1.40e-01 -0.151 0.102 0.103 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 4.61e-01 0.0742 0.1 0.101 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0997 0.0902 0.101 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 6.69e-01 0.0605 0.142 0.101 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 3.23e-01 -0.106 0.107 0.101 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0669 0.116 0.101 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 7.74e-01 0.0321 0.111 0.101 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 4.44e-02 -0.219 0.108 0.101 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 5.24e-01 0.0929 0.145 0.101 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 6.27e-01 0.0401 0.0824 0.103 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0981 0.0702 0.103 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 3.19e-01 0.138 0.138 0.103 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.93e-01 -0.091 0.0697 0.103 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 7.89e-01 0.0328 0.122 0.103 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0574 0.0815 0.103 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 2.07e-01 -0.109 0.0863 0.103 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 1.09e-01 -0.158 0.0982 0.103 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.66e-01 0.0842 0.0928 0.103 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0574 0.0492 0.103 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.82e-04 0.529 0.139 0.103 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0894 0.0772 0.103 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 2.12e-04 0.405 0.107 0.103 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 1.17e-01 -0.172 0.109 0.103 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0672 0.0884 0.103 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0896 0.0739 0.103 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 7.26e-02 0.258 0.143 0.103 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 4.84e-01 0.0386 0.055 0.103 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 638385 sc-eQTL 7.31e-01 0.0287 0.0834 0.103 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 9.13e-02 0.179 0.106 0.103 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 4.71e-02 -0.216 0.108 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 1.27e-02 0.333 0.132 0.112 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 4.02e-02 0.223 0.108 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 5.99e-01 0.0696 0.132 0.112 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 4.46e-01 0.101 0.133 0.112 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 8.64e-01 0.0255 0.149 0.112 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 9.60e-02 -0.192 0.115 0.112 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 4.99e-01 0.0867 0.128 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 1.39e-01 -0.108 0.0725 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.05e-01 0.217 0.133 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0647 0.0957 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0584 0.116 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 3.09e-01 -0.138 0.136 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 2.85e-01 0.148 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0181 0.0821 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 2.94e-02 0.303 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00268 0.0904 0.101 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.24e-02 0.307 0.122 0.101 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0219 0.135 0.101 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0164 0.111 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0669 0.0633 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 3.69e-03 0.422 0.144 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.68e-01 -0.102 0.074 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0213 0.104 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0224 0.116 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.94e-01 0.117 0.137 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0448 0.0792 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.05e-02 0.38 0.147 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 7.13e-01 0.0402 0.109 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 8.92e-01 0.0157 0.116 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0949 0.141 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 7.08e-01 0.0489 0.131 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 3.28e-01 -0.113 0.116 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.05e-01 0.234 0.144 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0936 0.0854 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 8.18e-03 0.359 0.134 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 9.23e-01 0.0128 0.133 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 7.62e-01 0.0208 0.0686 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0838 0.0548 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.30e-01 0.196 0.129 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0802 0.0748 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0323 0.055 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0431 0.0971 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 7.96e-01 0.0248 0.0961 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 4.03e-02 -0.124 0.06 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 9.67e-04 0.46 0.137 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.54e-02 -0.154 0.0684 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.73e-01 0.107 0.0785 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 2.62e-01 -0.109 0.0967 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 8.21e-02 -0.189 0.108 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 7.40e-02 -0.138 0.0767 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 2.54e-01 0.161 0.14 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0776 0.0722 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 9.06e-01 0.0132 0.112 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 3.15e-01 -0.117 0.116 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.71e-01 0.0885 0.0987 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0868 0.0656 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.20e-02 0.34 0.134 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.87e-02 -0.181 0.0822 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 3.81e-01 0.103 0.117 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0565 0.117 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0728 0.101 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0811 0.0703 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 3.16e-03 0.428 0.143 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 7.01e-02 -0.143 0.0784 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 6.57e-01 0.0416 0.0935 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 9.71e-02 -0.193 0.116 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0911 0.137 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.24e-01 -0.125 0.102 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 2.79e-01 0.17 0.157 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 9.47e-02 -0.124 0.0737 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 3.04e-01 0.136 0.132 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0143 0.136 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 8.26e-01 0.0271 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.17e-01 -0.144 0.116 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0992 0.142 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.72e-01 -0.1 0.0908 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 5.45e-02 0.27 0.14 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 8.29e-02 -0.234 0.134 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 5.42e-01 0.0614 0.101 0.104 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 6.17e-02 -0.156 0.0829 0.104 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 3.26e-01 0.134 0.136 0.104 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 7.08e-01 0.0254 0.0677 0.104 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 638385 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0604 0.113 0.104 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 2.50e-02 0.263 0.117 0.104 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 1.38e-01 -0.185 0.125 0.104 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 8.14e-02 0.201 0.115 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0419 0.0853 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0342 0.151 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 4.87e-01 0.0598 0.086 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 4.57e-01 0.0974 0.131 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 6.59e-01 0.0606 0.137 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 6.68e-01 0.0374 0.087 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0587 0.0567 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.97e-03 0.459 0.146 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.31e-01 -0.098 0.0816 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.91e-03 0.362 0.115 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 4.04e-01 -0.102 0.123 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 5.74e-01 0.0628 0.112 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0103 0.0945 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 3.29e-01 0.138 0.141 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0461 0.0884 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.95e-02 0.327 0.139 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0451 0.143 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.60e-01 0.0833 0.0909 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00765 0.068 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 1.06e-02 0.363 0.141 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0927 0.081 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 4.83e-03 0.312 0.11 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 1.95e-01 -0.159 0.122 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.72e-01 0.151 0.168 0.122 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0881 0.146 0.122 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 2.16e-02 0.395 0.169 0.122 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.74e-01 0.178 0.13 0.122 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.32e-01 -0.224 0.148 0.122 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 1.32e-01 0.237 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 1.63e-01 -0.163 0.117 0.096 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 6.90e-02 0.22 0.121 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 8.92e-01 0.0194 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 8.67e-01 -0.012 0.0714 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 638385 sc-eQTL 5.49e-01 0.0594 0.0989 0.096 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.20e-01 0.215 0.137 0.096 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 9.19e-02 -0.233 0.138 0.096 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 8.92e-01 0.0177 0.131 0.103 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.17e-01 -0.104 0.0842 0.103 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 8.60e-01 0.0243 0.138 0.103 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.05e-02 -0.211 0.0819 0.103 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.15e-01 0.142 0.0896 0.103 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 2.02e-01 -0.162 0.126 0.103 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 6.65e-01 0.0473 0.109 0.11 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.59e-01 -0.124 0.11 0.11 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 5.57e-01 0.083 0.141 0.11 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0964 0.107 0.11 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0201 0.126 0.11 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0171 0.111 0.11 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 6.85e-02 -0.254 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 7.43e-01 0.0473 0.144 0.11 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.49e-01 0.0723 0.077 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 7.77e-02 -0.146 0.0821 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 5.11e-01 0.0913 0.139 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0996 0.0827 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 3.67e-01 -0.108 0.119 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 5.78e-01 -0.048 0.0863 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 2.24e-01 -0.108 0.0884 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 1.47e-02 -0.269 0.109 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 8.87e-01 0.0127 0.0896 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0614 0.0919 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 2.03e-01 0.183 0.143 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.85e-01 -0.106 0.0793 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 2.10e-01 0.168 0.134 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00639 0.108 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 1.18e-01 -0.178 0.114 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0046 0.112 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.76e-01 -0.124 0.14 0.085 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00673 0.124 0.085 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0125 0.178 0.085 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0432 0.0863 0.085 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 638385 sc-eQTL 8.65e-01 0.0233 0.136 0.085 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 4.76e-01 0.13 0.182 0.085 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 2.42e-02 -0.35 0.154 0.085 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 1.29e-01 -0.142 0.0929 0.107 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0404 0.123 0.107 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0236 0.126 0.107 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.90e-01 -0.106 0.0803 0.107 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 8.27e-01 0.0271 0.124 0.107 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 5.29e-02 -0.253 0.13 0.107 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 4.86e-01 0.0839 0.12 0.107 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 7.55e-01 0.0433 0.139 0.107 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 7.09e-01 0.0425 0.114 0.104 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 5.66e-01 0.0507 0.0882 0.104 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 7.81e-01 0.0392 0.141 0.104 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.73e-01 -0.137 0.1 0.104 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0557 0.124 0.104 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 8.55e-01 0.0239 0.131 0.104 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 7.61e-01 0.0383 0.126 0.104 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 9.13e-02 -0.223 0.132 0.104 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 8.74e-01 0.0235 0.148 0.088 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0799 0.111 0.088 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 7.86e-01 0.0444 0.163 0.088 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.45e-01 -0.2 0.136 0.088 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 6.27e-01 0.0553 0.114 0.088 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 3.94e-01 0.155 0.182 0.088 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 4.45e-01 -0.106 0.139 0.088 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 3.90e-01 0.144 0.167 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 6.88e-02 0.204 0.112 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 7.88e-01 -0.017 0.0631 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 9.00e-03 0.336 0.127 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00486 0.0793 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 6.81e-01 0.0432 0.105 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 1.49e-01 -0.193 0.133 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00888 0.117 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0565 0.0537 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 2.13e-04 0.521 0.138 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0918 0.0669 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 9.59e-01 0.00504 0.0984 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0713 0.119 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 5.73e-01 0.0439 0.0777 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 8.09e-02 -0.126 0.0719 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 3.70e-01 0.125 0.139 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0844 0.0717 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000539 0.125 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0404 0.0843 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 9.83e-02 -0.142 0.0857 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 5.34e-02 -0.193 0.0994 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0407 0.0916 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 8.76e-01 0.0129 0.0828 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 3.20e-01 0.138 0.138 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 4.55e-02 -0.171 0.0849 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 337901 sc-eQTL 7.27e-01 0.0468 0.134 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 2.65e-01 -0.122 0.11 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 5.75e-01 0.0645 0.115 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 104675 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0304 0.13 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -330729 sc-eQTL 3.76e-01 0.0779 0.0878 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 598869 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0509 0.0509 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 66156 sc-eQTL 2.53e-04 0.535 0.144 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -978494 sc-eQTL 2.11e-01 -0.1 0.0799 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 sc-eQTL 1.45e-04 0.405 0.105 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -979513 sc-eQTL 8.25e-02 -0.194 0.111 0.103 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112357 PEX7 66156 eQTL 2.31e-16 0.365 0.0437 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000135525 MAP7 337901 eQTL 0.0358 0.0854 0.0406 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000182747 SLC35D3 -33581 eQTL 3.09e-09 -0.315 0.0526 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 pQTL 0.00666 0.0972 0.0358 0.0 0.00108 0.0972
ENSG00000197442 MAP3K5 96243 eQTL 0.00874 0.0554 0.0211 0.0 0.0 0.0952


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina