logo

Genes within 1Mb (chr6:137540891:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 1.05e-01 0.206 0.127 0.077 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 6.81e-02 0.182 0.0993 0.077 B L1
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 1.61e-01 -0.212 0.15 0.077 B L1
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0513 0.0999 0.077 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00356 0.0805 0.077 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 8.26e-03 -0.294 0.11 0.077 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 5.22e-01 0.0811 0.127 0.077 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 9.05e-01 0.0101 0.0844 0.077 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 8.67e-02 0.165 0.0961 0.077 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.85e-01 0.145 0.136 0.077 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0432 0.0912 0.077 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0236 0.0855 0.077 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0252 0.0651 0.077 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 2.01e-01 0.138 0.107 0.077 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.06e-01 0.121 0.0954 0.077 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.23e-01 0.0363 0.102 0.077 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.33e-02 -0.36 0.158 0.077 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 2.11e-01 -0.131 0.104 0.077 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0941 0.0803 0.077 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.11e-01 0.0433 0.0851 0.077 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 8.84e-02 0.201 0.117 0.077 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 8.76e-01 0.0202 0.129 0.068 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 9.20e-01 0.0123 0.123 0.068 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 3.17e-01 -0.182 0.182 0.068 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0693 0.138 0.068 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 4.92e-01 0.103 0.15 0.068 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.84e-01 0.0584 0.143 0.068 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 8.90e-02 0.239 0.14 0.068 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 3.61e-01 -0.171 0.187 0.068 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.64e-01 -0.108 0.0961 0.077 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.44e-01 0.0255 0.0782 0.077 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 6.54e-02 -0.298 0.161 0.077 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00336 0.0818 0.077 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 3.75e-01 0.127 0.143 0.077 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0796 0.0953 0.077 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 8.59e-01 -0.018 0.101 0.077 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0847 0.115 0.077 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 7.18e-01 0.0397 0.11 0.077 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.61e-01 0.115 0.125 0.077 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 4.62e-01 -0.125 0.169 0.077 NK L1
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 1.33e-01 -0.16 0.106 0.077 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 1.68e-01 -0.126 0.0909 0.077 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 9.22e-01 0.0128 0.131 0.077 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 7.05e-01 0.0491 0.129 0.077 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0263 0.0995 0.077 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.83e-01 0.0291 0.106 0.077 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 1.82e-01 0.217 0.162 0.077 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0833 0.13 0.077 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 6.92e-02 -0.112 0.0615 0.077 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0508 0.12 0.077 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 3.74e-01 -0.109 0.123 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 6.10e-01 0.0914 0.179 0.069 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 4.84e-01 -0.123 0.175 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0536 0.176 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0345 0.0911 0.069 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 4.88e-01 0.123 0.176 0.069 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.02e-01 -0.103 0.198 0.069 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 3.39e-01 0.148 0.154 0.069 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 3.63e-01 0.141 0.155 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0176 0.116 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 3.57e-01 -0.15 0.162 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0148 0.148 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 5.90e-01 0.0627 0.116 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 3.73e-02 -0.291 0.139 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 3.12e-01 -0.167 0.164 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 8.18e-01 0.0399 0.173 0.078 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0226 0.132 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 9.90e-02 -0.288 0.174 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00228 0.165 0.078 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 4.93e-01 0.0777 0.113 0.078 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 1.45e-02 -0.376 0.153 0.078 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 5.87e-01 0.0917 0.169 0.078 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 4.28e-01 0.1 0.127 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 4.18e-02 0.219 0.107 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.21e-01 -0.204 0.167 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 5.19e-01 0.0944 0.146 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 5.28e-01 0.0535 0.0847 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 4.41e-02 -0.239 0.118 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 9.96e-01 0.000739 0.133 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.38e-01 0.189 0.159 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 8.76e-01 0.0166 0.106 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 6.96e-01 0.0685 0.175 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 9.88e-01 0.00192 0.128 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 2.10e-02 0.293 0.126 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.34e-02 -0.251 0.135 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 2.16e-01 0.204 0.164 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 3.91e-03 0.411 0.141 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.19e-01 0.132 0.132 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 9.36e-01 0.0129 0.159 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0463 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 1.63e-01 -0.131 0.0938 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 3.90e-01 0.129 0.15 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00339 0.147 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0235 0.08 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 9.31e-02 0.158 0.0938 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 5.23e-01 0.0966 0.151 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 4.72e-02 0.247 0.124 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.24e-01 0.00833 0.0875 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 7.69e-02 -0.113 0.0638 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 9.55e-02 0.188 0.113 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 7.24e-01 0.0393 0.111 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.91e-02 0.226 0.109 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.04e-01 0.207 0.163 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 3.34e-01 -0.133 0.138 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0106 0.0801 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 4.55e-01 0.0681 0.0911 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 5.02e-02 0.219 0.111 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 3.37e-01 0.124 0.129 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.16e-02 0.249 0.115 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0171 0.167 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00729 0.135 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.32e-01 0.00736 0.0858 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 8.38e-01 0.0271 0.132 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 3.91e-01 0.118 0.137 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 4.68e-01 0.0828 0.114 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 1.86e-01 -0.16 0.12 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 9.99e-02 -0.258 0.156 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 2.15e-02 -0.345 0.149 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0957 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00133 0.135 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 9.40e-01 0.0102 0.135 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 6.38e-01 0.0532 0.113 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 1.72e-01 0.141 0.103 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 4.65e-02 -0.325 0.162 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 9.69e-01 0.00489 0.124 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 8.85e-01 0.0128 0.0883 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 5.25e-01 0.0665 0.105 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 3.46e-02 0.275 0.129 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 6.41e-01 0.0739 0.158 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.40e-02 0.284 0.133 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 1.94e-01 -0.236 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 4.86e-01 -0.124 0.178 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 2.33e-01 -0.102 0.0855 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 8.20e-01 0.035 0.153 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 4.51e-02 0.313 0.155 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.75e-01 0.153 0.14 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0405 0.147 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 1.51e-01 0.231 0.161 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 5.40e-01 0.103 0.168 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0674 0.103 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.01e-01 0.0838 0.16 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0868 0.153 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0147 0.117 0.076 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.48e-01 0.04 0.125 0.076 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.62e-01 -0.177 0.158 0.076 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 5.16e-01 0.107 0.165 0.076 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 1.12e-02 -0.198 0.0772 0.076 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 5.64e-01 0.0789 0.137 0.076 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 4.29e-01 -0.115 0.145 0.076 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.98e-01 0.133 0.127 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 4.58e-01 -0.104 0.139 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0243 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 3.11e-01 0.151 0.149 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 5.81e-02 -0.18 0.0943 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 7.41e-02 0.258 0.144 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0456 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00475 0.102 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.97e-01 0.0354 0.137 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 8.73e-01 0.0282 0.175 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 3.71e-03 -0.354 0.121 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 1.40e-01 -0.141 0.0953 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0825 0.138 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 6.38e-01 0.0675 0.143 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 7.00e-01 0.048 0.125 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 1.57e-01 0.204 0.144 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 4.50e-01 -0.12 0.158 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0306 0.128 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 6.50e-01 0.0449 0.0987 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00806 0.157 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 2.06e-01 0.201 0.159 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0651 0.105 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 1.64e-01 0.188 0.134 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 3.67e-01 -0.15 0.165 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 2.57e-01 -0.143 0.125 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0208 0.0942 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 5.52e-01 0.0771 0.129 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 9.93e-01 0.0012 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 1.61e-01 -0.251 0.178 0.093 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 8.16e-01 0.0351 0.151 0.093 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 1.75e-01 -0.249 0.182 0.093 PB L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 1.89e-01 0.151 0.114 0.093 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0319 0.139 0.093 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 8.21e-01 -0.036 0.159 0.093 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 3.28e-02 -0.354 0.164 0.093 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 1.44e-01 0.19 0.129 0.078 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0484 0.136 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 5.00e-01 0.107 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 6.11e-02 -0.234 0.125 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0355 0.0791 0.078 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 4.81e-01 -0.108 0.153 0.078 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 2.17e-01 -0.19 0.153 0.078 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 1.81e-03 -0.465 0.147 0.077 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 8.37e-01 0.0225 0.109 0.077 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 6.69e-01 0.0681 0.159 0.077 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 8.03e-01 -0.043 0.172 0.077 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00589 0.0958 0.077 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0931 0.104 0.077 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 4.02e-01 0.122 0.146 0.077 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.41e-01 -0.171 0.145 0.071 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 6.02e-01 -0.067 0.128 0.071 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.13e-01 -0.235 0.188 0.071 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0342 0.144 0.071 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0239 0.168 0.071 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.56e-01 0.066 0.148 0.071 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 5.81e-02 0.354 0.185 0.071 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0947 0.192 0.071 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 1.55e-01 -0.129 0.09 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.89e-01 0.0239 0.0891 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0758 0.163 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0762 0.0972 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0455 0.14 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0523 0.101 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0664 0.104 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00542 0.13 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0386 0.106 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.96e-01 0.0842 0.0989 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 1.46e-01 -0.248 0.17 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 2.70e-01 -0.104 0.0942 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 1.75e-01 0.215 0.158 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0668 0.128 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 6.09e-01 0.0694 0.136 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 4.22e-01 -0.106 0.132 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 4.44e-01 -0.133 0.173 0.067 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 6.37e-01 0.0974 0.206 0.067 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 3.31e-01 0.214 0.219 0.067 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 2.42e-02 -0.429 0.188 0.067 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 5.60e-02 -0.203 0.105 0.067 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 4.41e-01 -0.174 0.225 0.067 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 1.69e-01 -0.265 0.192 0.067 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.61e-02 -0.261 0.117 0.073 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.41e-01 0.112 0.117 0.073 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.63e-01 0.178 0.159 0.073 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.05e-01 0.0122 0.102 0.073 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 4.96e-01 0.107 0.156 0.073 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 5.58e-01 0.0974 0.166 0.073 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 6.47e-01 0.0698 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 7.35e-01 0.0594 0.175 0.073 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000484 0.141 0.072 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0184 0.0989 0.072 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 2.20e-01 -0.214 0.174 0.072 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 5.25e-01 0.0796 0.125 0.072 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 5.63e-02 0.294 0.153 0.072 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 2.03e-01 -0.206 0.162 0.072 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0403 0.156 0.072 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 9.61e-01 0.0081 0.165 0.072 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.77e-01 0.189 0.173 0.065 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.45e-01 -0.052 0.16 0.065 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 5.87e-01 0.104 0.191 0.065 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.20e-01 0.0162 0.161 0.065 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 5.72e-01 0.0756 0.134 0.065 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 8.77e-01 0.0331 0.214 0.065 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 2.72e-01 0.18 0.163 0.065 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 5.53e-01 0.117 0.197 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 3.39e-01 0.133 0.139 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 7.54e-01 0.0354 0.113 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 7.82e-02 -0.281 0.159 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 9.71e-01 0.00548 0.149 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0982 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 3.91e-03 -0.372 0.127 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 7.57e-01 0.0515 0.166 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 8.51e-02 0.232 0.134 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 2.13e-02 0.229 0.0989 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0305 0.164 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 8.91e-01 0.0203 0.147 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 3.58e-01 0.0711 0.0772 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 1.19e-02 -0.283 0.112 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 6.64e-01 0.0599 0.138 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0954 0.0909 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 5.08e-01 0.0565 0.0852 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 6.77e-02 -0.298 0.162 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0554 0.0842 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 5.62e-01 0.0848 0.146 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0741 0.0986 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0407 0.101 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 3.78e-01 -0.104 0.117 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 3.75e-01 -0.099 0.111 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 6.53e-01 0.0383 0.0851 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 5.81e-01 -0.093 0.168 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 7.51e-01 0.0331 0.104 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 990072 sc-eQTL 2.10e-01 0.204 0.162 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0627 0.134 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00819 0.14 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 756846 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0501 0.159 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 321442 sc-eQTL 9.81e-01 0.00243 0.104 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 sc-eQTL 3.18e-01 0.128 0.128 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 718327 sc-eQTL 6.19e-01 -0.087 0.175 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -566528 sc-eQTL 4.65e-02 -0.215 0.107 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -326323 sc-eQTL 1.96e-01 -0.122 0.094 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 sc-eQTL 9.88e-01 0.00191 0.127 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -327342 sc-eQTL 6.42e-01 0.0615 0.132 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -862640 eQTL 0.00831 0.0824 0.0312 0.00118 0.0 0.103
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 eQTL 0.0156 0.0483 0.0199 0.00156 0.0 0.103

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000197442 MAP3K5 748414 8.7e-07 6.07e-07 9.89e-08 4.35e-07 1.04e-07 3.39e-07 5.2e-07 1.11e-07 4.26e-07 2.28e-07 7.44e-07 4.28e-07 6.27e-07 1.56e-07 3.27e-07 1.84e-07 1.73e-07 3.74e-07 2.12e-07 1.86e-07 2.01e-07 3.34e-07 3.07e-07 1.32e-07 7.72e-07 2.33e-07 3.04e-07 2.59e-07 2.66e-07 3.93e-07 2.43e-07 7.03e-08 5.58e-08 1.38e-07 3.55e-07 1.18e-07 1.09e-07 6e-08 4.78e-08 5.96e-08 3.24e-08 4.55e-07 5.91e-08 1.75e-08 1.26e-07 1.42e-08 7.89e-08 2.41e-08 5.05e-08