logo

Genes within 1Mb (chr6:137524019:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 1.85e-01 -0.166 0.124 0.085 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0132 0.0981 0.085 B L1
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 4.69e-01 0.107 0.148 0.085 B L1
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 1.86e-01 -0.129 0.0975 0.085 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 5.15e-01 0.0514 0.0788 0.085 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 8.93e-01 0.0148 0.11 0.085 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0892 0.124 0.085 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0604 0.0861 0.085 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0618 0.0987 0.085 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 4.42e-01 -0.107 0.139 0.085 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 1.49e-01 -0.134 0.0927 0.085 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.62e-01 -0.122 0.0869 0.085 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0147 0.0665 0.085 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0581 0.11 0.085 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 1.17e-01 0.152 0.0966 0.085 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 7.55e-01 0.0325 0.104 0.085 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 2.95e-01 0.17 0.162 0.085 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 4.80e-02 -0.209 0.105 0.085 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.36e-02 -0.201 0.0806 0.085 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 9.34e-01 0.00717 0.0864 0.085 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0482 0.12 0.085 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.85e-01 0.0317 0.116 0.088 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 3.21e-01 -0.109 0.11 0.088 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 3.68e-01 0.148 0.163 0.088 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 3.19e-01 0.124 0.124 0.088 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 9.03e-01 0.0164 0.135 0.088 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 3.26e-01 0.127 0.129 0.088 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0569 0.127 0.088 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 8.19e-01 0.0385 0.168 0.088 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0214 0.0974 0.085 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0615 0.0789 0.085 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 4.14e-01 0.134 0.164 0.085 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 4.18e-01 0.0669 0.0825 0.085 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 2.07e-01 0.182 0.144 0.085 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 5.83e-01 -0.053 0.0963 0.085 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 4.39e-01 0.0792 0.102 0.085 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 2.55e-01 0.133 0.116 0.085 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 2.46e-01 0.126 0.108 0.084 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0942 0.124 0.084 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 4.60e-01 -0.124 0.167 0.084 NK L1
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00734 0.106 0.084 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 2.42e-02 -0.203 0.0893 0.084 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 8.25e-01 0.0287 0.13 0.084 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 1.69e-02 -0.304 0.126 0.084 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0725 0.0995 0.085 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0286 0.106 0.085 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 3.53e-01 -0.151 0.162 0.085 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 1.17e-01 -0.204 0.13 0.085 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0438 0.062 0.085 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 3.33e-01 0.116 0.119 0.085 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0411 0.123 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.84e-01 -0.023 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 7.44e-01 0.0507 0.155 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0306 0.155 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0105 0.0803 0.094 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00427 0.156 0.094 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0686 0.174 0.094 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0485 0.136 0.094 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 4.53e-01 0.111 0.147 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 1.90e-01 0.145 0.11 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 5.87e-01 0.0839 0.154 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 9.15e-01 0.015 0.141 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 6.08e-01 0.0566 0.11 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 2.62e-01 -0.15 0.133 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0971 0.156 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.59e-01 0.0496 0.161 0.084 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 6.40e-01 0.0575 0.123 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.05e-01 0.0402 0.163 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00212 0.153 0.084 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 2.68e-01 0.117 0.105 0.084 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 1.72e-01 0.197 0.143 0.084 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 7.95e-01 0.0407 0.157 0.084 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 3.85e-01 -0.11 0.127 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 9.45e-01 0.00751 0.108 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 3.78e-01 0.148 0.167 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 2.25e-01 -0.178 0.146 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 7.93e-01 0.0223 0.085 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 6.28e-01 0.0579 0.119 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0326 0.133 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0291 0.156 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0796 0.103 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 7.30e-01 0.059 0.171 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0816 0.124 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 8.49e-01 0.0237 0.124 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 2.04e-01 0.168 0.132 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 2.42e-01 -0.188 0.16 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 4.89e-01 -0.103 0.148 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 2.39e-01 -0.161 0.137 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.78e-01 0.0254 0.165 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0313 0.167 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0244 0.0974 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0866 0.155 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 7.77e-01 0.043 0.151 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0489 0.081 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0646 0.0955 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 2.84e-01 -0.164 0.153 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 3.31e-01 -0.123 0.126 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0966 0.0883 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0408 0.065 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0353 0.115 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.34e-01 0.0389 0.114 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 7.37e-01 0.0379 0.113 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0889 0.168 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 5.11e-02 -0.275 0.14 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.65e-01 -0.114 0.0819 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 6.42e-01 0.0437 0.0937 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0804 0.115 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 1.59e-01 -0.181 0.128 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 6.47e-01 0.053 0.115 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 4.15e-01 0.135 0.165 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0836 0.134 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0787 0.0851 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0231 0.132 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 3.63e-01 -0.124 0.136 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.85e-01 0.0314 0.115 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0943 0.122 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 2.97e-02 0.343 0.157 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 1.33e-01 -0.228 0.151 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 8.15e-02 -0.168 0.0961 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 3.62e-01 -0.124 0.136 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0298 0.136 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.13e-01 -0.042 0.114 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 4.99e-01 0.0707 0.104 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 7.83e-01 0.0454 0.165 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0697 0.126 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.33e-01 -0.134 0.0887 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 9.55e-01 0.00598 0.106 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 9.51e-01 0.00803 0.132 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.40e-01 0.0502 0.151 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 1.72e-01 -0.175 0.128 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 5.17e-01 -0.112 0.173 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 2.45e-02 -0.379 0.167 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0996 0.0814 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 5.76e-01 0.0816 0.146 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 5.53e-01 0.0888 0.149 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.71e-01 0.0234 0.144 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0731 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0587 0.166 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 6.71e-01 0.0735 0.173 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 3.18e-01 -0.106 0.106 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 2.43e-01 0.192 0.164 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 2.93e-01 0.166 0.157 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 5.38e-01 0.0711 0.115 0.087 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 8.03e-01 0.0308 0.123 0.087 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0049 0.156 0.087 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 2.25e-01 -0.198 0.162 0.087 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00129 0.0775 0.087 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 1.39e-01 0.2 0.134 0.087 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 8.38e-01 0.0293 0.143 0.087 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0223 0.128 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 3.72e-01 -0.125 0.139 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0404 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0588 0.149 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0897 0.0951 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 2.84e-01 -0.155 0.145 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 4.01e-01 -0.128 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 3.67e-01 0.0904 0.0999 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 2.75e-01 -0.148 0.135 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0753 0.172 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 1.77e-01 0.164 0.121 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.80e-02 -0.222 0.093 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0517 0.136 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 1.21e-01 -0.218 0.14 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.00e-01 0.034 0.134 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 4.64e-02 -0.309 0.154 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 1.91e-01 -0.223 0.17 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 8.66e-01 0.0233 0.138 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 2.28e-01 -0.128 0.106 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 4.46e-01 0.129 0.169 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 2.25e-01 0.208 0.171 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.47e-01 0.0204 0.105 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 8.07e-01 0.033 0.135 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 7.29e-01 0.0574 0.165 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0377 0.125 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.53e-01 -0.134 0.0935 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 8.60e-01 0.0229 0.129 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 1.48e-02 -0.343 0.14 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 2.47e-01 0.228 0.196 0.089 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 2.63e-01 -0.186 0.165 0.089 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0356 0.202 0.089 PB L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 1.10e-01 -0.201 0.125 0.089 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0507 0.153 0.089 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00603 0.174 0.089 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00405 0.184 0.089 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00562 0.131 0.083 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0373 0.137 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.99e-01 0.0201 0.159 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 3.24e-01 0.125 0.126 0.083 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.49e-02 -0.193 0.0786 0.083 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 3.84e-01 -0.134 0.154 0.083 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 1.09e-01 -0.248 0.154 0.083 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 4.76e-01 0.109 0.153 0.085 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 2.66e-01 -0.124 0.111 0.085 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 1.12e-01 -0.257 0.161 0.085 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 1.81e-01 -0.234 0.174 0.085 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 1.98e-03 -0.298 0.0952 0.085 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 4.56e-01 0.0787 0.105 0.085 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 6.51e-01 0.0673 0.148 0.085 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 3.66e-01 -0.114 0.126 0.088 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 1.27e-01 -0.17 0.111 0.088 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 4.32e-01 0.129 0.164 0.088 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 5.79e-01 0.0693 0.125 0.088 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0607 0.146 0.088 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 1.61e-02 0.307 0.126 0.088 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 9.69e-01 0.0063 0.163 0.088 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 8.45e-01 0.0327 0.167 0.088 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.59e-01 -0.028 0.0912 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0466 0.0898 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 6.91e-01 0.0652 0.164 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 7.98e-01 0.0252 0.0981 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0195 0.141 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0861 0.102 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 4.20e-01 0.0845 0.105 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 3.86e-01 0.114 0.131 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 1.40e-01 -0.153 0.103 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0419 0.0964 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.92e-01 0.0226 0.166 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0713 0.0919 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 9.07e-01 0.0181 0.155 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0548 0.125 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 3.78e-01 -0.117 0.132 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 6.58e-02 0.237 0.128 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0188 0.155 0.079 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 3.31e-01 -0.18 0.184 0.079 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0273 0.197 0.079 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 9.73e-01 0.00585 0.172 0.079 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0196 0.0954 0.079 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 2.85e-01 -0.216 0.201 0.079 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 8.62e-01 0.03 0.173 0.079 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.97e-01 0.0287 0.111 0.084 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 2.27e-01 -0.134 0.111 0.084 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 5.54e-02 0.287 0.149 0.084 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0209 0.0962 0.084 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 3.96e-02 0.303 0.146 0.084 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 1.46e-01 -0.227 0.156 0.084 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 9.58e-01 0.00752 0.143 0.084 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0155 0.165 0.084 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00509 0.133 0.086 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 1.49e-01 -0.135 0.0929 0.086 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 7.28e-01 0.0574 0.165 0.086 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 2.59e-01 0.133 0.118 0.086 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 5.93e-01 0.0779 0.146 0.086 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0835 0.153 0.086 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 3.56e-02 0.309 0.146 0.086 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 3.19e-01 -0.155 0.155 0.086 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 7.03e-01 0.06 0.157 0.079 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 3.75e-01 0.128 0.144 0.079 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 3.90e-01 0.149 0.172 0.079 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 4.63e-01 0.107 0.145 0.079 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 2.09e-01 0.151 0.12 0.079 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 1.83e-01 -0.257 0.192 0.079 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 5.82e-01 0.0815 0.148 0.079 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 2.11e-01 -0.223 0.177 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 8.72e-01 0.021 0.13 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 3.27e-01 0.103 0.105 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 4.42e-01 0.115 0.149 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0695 0.139 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 3.84e-01 0.0799 0.0915 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0184 0.121 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 2.79e-01 -0.168 0.155 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 3.94e-01 -0.114 0.134 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0563 0.0994 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 3.61e-01 0.149 0.163 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 2.70e-01 -0.161 0.146 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 5.70e-01 0.0437 0.0767 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 3.03e-01 0.116 0.112 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0939 0.137 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0708 0.0911 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0495 0.0853 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 7.45e-01 0.0533 0.164 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 6.59e-01 0.0372 0.0843 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 6.76e-01 0.0613 0.146 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0408 0.0988 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 9.28e-01 0.00919 0.101 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 1.79e-01 0.158 0.117 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00926 0.109 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 1.44e-01 -0.121 0.0824 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 1.63e-01 0.228 0.163 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 5.81e-01 0.0561 0.101 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 973200 sc-eQTL 6.16e-02 0.295 0.157 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 2.63e-01 -0.146 0.13 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 9.85e-02 0.224 0.135 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 739974 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0401 0.154 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 304570 sc-eQTL 3.54e-01 0.0951 0.102 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -879512 sc-eQTL 4.15e-01 -0.104 0.127 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 701455 sc-eQTL 3.30e-01 -0.168 0.173 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -583400 sc-eQTL 7.28e-01 0.0374 0.107 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -343195 sc-eQTL 2.59e-02 -0.207 0.0924 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 731542 sc-eQTL 7.80e-01 0.0354 0.126 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -344214 sc-eQTL 1.21e-02 -0.326 0.129 0.084 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000220412 AL356234.1 -183182 eQTL 0.0306 0.0942 0.0435 0.00126 0.0 0.0839

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220412 AL356234.1 -183182 1.94e-06 2.4e-06 2.46e-07 1.71e-06 4.56e-07 7.96e-07 1.29e-06 4.17e-07 1.76e-06 7.24e-07 1.97e-06 1.34e-06 3.28e-06 1.04e-06 3.84e-07 1.06e-06 9.22e-07 1.36e-06 5.95e-07 8.01e-07 8.63e-07 1.99e-06 1.75e-06 9.76e-07 2.61e-06 1.07e-06 1.15e-06 1.17e-06 1.69e-06 1.66e-06 9.07e-07 2.48e-07 4.53e-07 1.01e-06 9.21e-07 7.36e-07 7.68e-07 4.12e-07 7.29e-07 2.76e-07 1.52e-07 2.83e-06 3.78e-07 1.74e-07 3.39e-07 2.94e-07 4.17e-07 2.22e-07 2.23e-07