Genes within 1Mb (chr6:137505604:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0693 0.123 0.085 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0152 0.0969 0.085 B L1
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 6.14e-02 0.273 0.145 0.085 B L1
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 8.04e-01 -0.024 0.0968 0.085 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0123 0.078 0.085 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 2.62e-01 0.122 0.108 0.085 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 2.65e-01 -0.137 0.122 0.085 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.37e-02 -0.204 0.0822 0.085 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0104 0.0957 0.085 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 4.24e-01 0.107 0.134 0.085 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 1.83e-01 0.12 0.0898 0.085 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.03e-01 0.138 0.084 0.085 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0345 0.0643 0.085 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 5.89e-01 0.0575 0.106 0.085 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0468 0.0941 0.085 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 3.05e-01 -0.103 0.101 0.085 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0568 0.157 0.085 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 1.79e-01 0.138 0.102 0.085 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 6.11e-02 0.148 0.0786 0.085 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 3.33e-01 -0.081 0.0836 0.085 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 3.58e-01 0.107 0.116 0.085 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.69e-01 -0.102 0.114 0.088 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 2.23e-01 -0.131 0.107 0.088 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 5.28e-02 0.309 0.159 0.088 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.71e-01 -0.166 0.121 0.088 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 3.99e-01 0.111 0.132 0.088 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0993 0.126 0.088 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 1.68e-01 -0.171 0.123 0.088 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 8.19e-01 0.0378 0.165 0.088 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 2.34e-02 -0.215 0.0942 0.085 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0481 0.0773 0.085 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0965 0.16 0.085 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0744 0.0808 0.085 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 4.27e-01 0.112 0.141 0.085 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 7.88e-01 0.0254 0.0944 0.085 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 9.52e-01 0.00608 0.1 0.085 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 2.13e-01 0.142 0.114 0.085 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0897 0.106 0.086 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0812 0.121 0.086 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 4.19e-01 0.132 0.163 0.086 NK L1
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 3.70e-01 0.0922 0.103 0.086 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.67e-01 0.122 0.0877 0.086 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 9.58e-02 0.21 0.125 0.086 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 7.20e-02 0.224 0.124 0.086 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0894 0.0995 0.085 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0758 0.106 0.085 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.58e-01 -0.149 0.162 0.085 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 9.79e-01 0.00336 0.13 0.085 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0142 0.062 0.085 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0547 0.12 0.085 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 3.49e-01 0.115 0.123 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.82e-01 0.222 0.166 0.082 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 7.34e-01 0.0555 0.163 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 5.21e-04 0.56 0.158 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0637 0.0847 0.082 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.11e-01 0.262 0.163 0.082 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0213 0.184 0.082 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 7.55e-01 0.0448 0.144 0.082 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.17e-01 -0.232 0.148 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 4.76e-01 0.0793 0.111 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 8.20e-01 0.0354 0.155 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 4.57e-01 -0.105 0.141 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0682 0.111 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0665 0.134 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 2.79e-01 0.171 0.157 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 7.44e-01 0.0522 0.16 0.084 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00288 0.122 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 4.70e-01 -0.117 0.161 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0879 0.152 0.084 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.084 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0251 0.143 0.084 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 1.56e-01 -0.221 0.155 0.084 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.33e-01 -0.121 0.124 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 9.59e-01 0.0054 0.106 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 4.30e-02 0.332 0.163 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 2.58e-01 0.163 0.143 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 5.95e-01 0.0444 0.0834 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 7.55e-02 0.208 0.116 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 1.26e-01 -0.2 0.13 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.67e-01 -0.216 0.156 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 3.05e-01 -0.106 0.103 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.53e-01 0.159 0.171 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 8.93e-01 0.0167 0.125 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 8.42e-01 0.0249 0.124 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 4.27e-01 0.105 0.132 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 8.38e-01 0.033 0.161 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.85e-01 -0.196 0.147 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 4.14e-01 0.112 0.136 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 9.39e-01 0.0126 0.164 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 4.20e-01 0.134 0.166 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 7.94e-01 0.0254 0.097 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 4.21e-01 -0.125 0.155 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 6.19e-01 0.0752 0.151 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 5.68e-02 -0.15 0.0784 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0479 0.0933 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 8.07e-01 0.0365 0.149 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 6.97e-01 0.0481 0.123 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 4.66e-02 0.172 0.0857 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0717 0.0633 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 2.40e-01 0.131 0.112 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.12e-01 -0.111 0.109 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0211 0.108 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 2.04e-01 0.204 0.16 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 9.38e-01 0.0105 0.136 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 4.22e-01 0.0632 0.0786 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 4.63e-01 0.0658 0.0896 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0491 0.11 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 7.52e-02 -0.225 0.126 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0549 0.114 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 6.32e-01 0.0784 0.164 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 3.12e-01 0.134 0.132 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 6.50e-01 0.0383 0.0842 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0176 0.13 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 4.57e-01 -0.101 0.135 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 5.36e-01 0.0698 0.112 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 9.92e-01 0.00116 0.119 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 9.95e-02 -0.255 0.154 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 8.53e-01 0.0276 0.149 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 3.64e-01 0.086 0.0946 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 7.52e-01 0.0422 0.134 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 7.71e-01 0.0389 0.133 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 7.25e-02 -0.2 0.111 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 1.04e-01 -0.166 0.102 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.79e-01 0.143 0.162 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 5.11e-01 -0.081 0.123 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.40e-01 0.129 0.0869 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 2.81e-01 -0.112 0.103 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00552 0.129 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 5.53e-01 0.0872 0.147 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 1.87e-01 -0.165 0.125 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 9.50e-01 0.0105 0.169 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 5.07e-02 0.322 0.164 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.82e-01 0.106 0.0793 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 1.67e-01 -0.197 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 7.19e-01 0.0525 0.146 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 8.10e-01 -0.034 0.142 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 5.41e-01 0.0909 0.148 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 1.16e-01 -0.256 0.162 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0608 0.169 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.05e-01 0.169 0.104 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 6.65e-01 0.07 0.161 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 1.29e-01 0.235 0.154 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0213 0.116 0.084 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0821 0.124 0.084 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0107 0.157 0.084 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 7.33e-01 0.0559 0.164 0.084 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 4.04e-01 0.0651 0.0778 0.084 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0428 0.136 0.084 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 4.43e-01 0.111 0.144 0.084 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.76e-01 0.113 0.128 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 2.67e-01 -0.155 0.139 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 7.02e-01 0.0639 0.167 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 4.89e-01 0.103 0.149 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 5.11e-01 0.0626 0.0952 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 6.76e-01 0.0606 0.145 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 9.92e-01 0.00161 0.152 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0812 0.0982 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 8.37e-01 0.0273 0.133 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 8.32e-01 -0.036 0.17 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0213 0.119 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.09e-01 0.148 0.0921 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 5.29e-02 0.257 0.132 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 5.44e-02 0.266 0.138 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0186 0.131 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 5.02e-02 -0.296 0.15 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0935 0.166 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 5.19e-01 0.087 0.135 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 7.09e-01 0.0387 0.104 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 6.69e-02 0.301 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 2.76e-01 -0.182 0.167 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0958 0.103 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 3.43e-01 -0.126 0.132 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 5.90e-01 0.0876 0.162 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0476 0.123 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 4.29e-01 0.0732 0.0923 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 7.14e-01 0.0467 0.127 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 2.14e-01 0.173 0.139 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 2.71e-01 -0.209 0.189 0.093 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 2.98e-01 0.167 0.159 0.093 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 2.98e-02 0.421 0.191 0.093 PB L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0606 0.122 0.093 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 2.83e-02 0.322 0.145 0.093 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 4.65e-01 -0.123 0.168 0.093 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0791 0.178 0.093 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 5.55e-01 0.0777 0.131 0.085 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 7.99e-01 -0.035 0.137 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0233 0.16 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 4.39e-01 0.0983 0.127 0.085 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 7.42e-01 0.0264 0.0801 0.085 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00697 0.155 0.085 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 4.03e-01 0.13 0.155 0.085 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.74e-01 -0.134 0.15 0.085 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 7.41e-01 0.0361 0.109 0.085 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.83e-01 -0.139 0.158 0.085 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 2.44e-01 0.2 0.171 0.085 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 7.97e-01 0.0246 0.0955 0.085 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 3.20e-01 0.103 0.103 0.085 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 3.74e-01 -0.13 0.145 0.085 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0394 0.123 0.093 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 5.64e-02 -0.206 0.107 0.093 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 1.18e-01 0.248 0.158 0.093 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 9.53e-01 0.00719 0.121 0.093 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 1.93e-01 0.184 0.141 0.093 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.093 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0128 0.158 0.093 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 8.33e-01 0.0342 0.162 0.093 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 8.78e-03 -0.232 0.0878 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0846 0.0878 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 8.92e-01 0.0217 0.16 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 2.53e-01 -0.11 0.0958 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 4.83e-01 0.0971 0.138 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 8.61e-01 0.0175 0.0999 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0326 0.103 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 6.66e-01 0.0556 0.128 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 2.10e-01 -0.13 0.103 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0016 0.0964 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.32e-02 -0.352 0.164 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00122 0.0919 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 4.42e-01 0.119 0.155 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 8.84e-01 0.0182 0.125 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 8.54e-01 0.0243 0.132 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 6.53e-01 0.0579 0.129 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.31e-01 -0.233 0.153 0.082 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0983 0.184 0.082 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0592 0.196 0.082 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 7.93e-02 0.299 0.169 0.082 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 2.78e-01 0.103 0.0947 0.082 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 4.44e-01 -0.154 0.201 0.082 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 4.17e-01 0.14 0.172 0.082 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 3.43e-02 -0.233 0.109 0.087 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0482 0.11 0.087 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 2.85e-01 0.159 0.148 0.087 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 8.22e-01 0.0215 0.0953 0.087 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00718 0.146 0.087 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 5.86e-01 0.0847 0.155 0.087 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 2.77e-01 0.154 0.142 0.087 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0735 0.164 0.087 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.74e-01 -0.179 0.131 0.084 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0937 0.0921 0.084 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 5.49e-01 0.0979 0.163 0.084 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 9.89e-01 0.0016 0.117 0.084 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 3.74e-01 -0.128 0.144 0.084 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0269 0.151 0.084 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 3.74e-01 -0.13 0.145 0.084 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 7.62e-01 0.0466 0.154 0.084 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0567 0.144 0.093 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 4.22e-01 -0.106 0.131 0.093 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.74e-01 0.141 0.158 0.093 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 3.54e-02 -0.279 0.131 0.093 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0816 0.11 0.093 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 9.33e-01 0.015 0.177 0.093 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 9.55e-02 -0.225 0.134 0.093 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 7.17e-01 0.0591 0.163 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 6.39e-01 -0.061 0.13 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0149 0.105 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.56e-01 0.138 0.149 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0472 0.139 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0867 0.0915 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 2.75e-01 -0.132 0.121 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 8.21e-01 0.035 0.155 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 1.62e-01 -0.184 0.131 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0102 0.0976 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 2.19e-02 0.365 0.158 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 4.97e-01 0.0973 0.143 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 7.24e-01 0.0266 0.0753 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 5.24e-02 0.213 0.109 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 2.14e-01 -0.167 0.134 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 2.02e-02 -0.208 0.0888 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0659 0.084 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 3.28e-01 -0.158 0.161 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0437 0.0831 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 3.51e-01 0.135 0.144 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00375 0.0974 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00926 0.0997 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 6.54e-01 0.0521 0.116 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 6.20e-02 -0.2 0.106 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0892 0.0816 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 2.08e-01 0.204 0.161 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 8.33e-01 0.0212 0.1 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 954785 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0549 0.156 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 8.73e-01 0.0205 0.129 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 7.88e-01 0.0361 0.134 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 721559 sc-eQTL 4.90e-01 0.105 0.152 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 286155 sc-eQTL 2.83e-01 -0.107 0.0996 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0543 0.124 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 683040 sc-eQTL 4.66e-01 0.123 0.168 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -601815 sc-eQTL 5.49e-01 0.0628 0.104 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -361610 sc-eQTL 1.73e-01 0.124 0.0906 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 713127 sc-eQTL 8.65e-02 0.21 0.122 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -362629 sc-eQTL 7.54e-02 0.226 0.126 0.086 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -897927 eQTL 0.0431 0.0691 0.0341 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000226004 AL591468.1 -440198 eQTL 0.0389 0.0826 0.0399 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000237499 AL357060.1 -362629 eQTL 0.00421 -0.0634 0.0221 0.00176 0.0 0.0829


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina