logo

Genes within 1Mb (chr6:137502729:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 4.26e-01 -0.102 0.128 0.079 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00961 0.1 0.079 B L1
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 9.78e-04 0.494 0.148 0.079 B L1
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 8.07e-02 -0.175 0.0996 0.079 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.63e-01 0.0905 0.0806 0.079 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0926 0.112 0.079 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0236 0.127 0.079 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 8.51e-01 0.0161 0.0856 0.079 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 2.02e-01 -0.125 0.0978 0.079 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0474 0.138 0.079 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0916 0.0924 0.079 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 6.43e-01 0.0402 0.0867 0.079 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0342 0.0661 0.079 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0249 0.109 0.079 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 1.32e-03 -0.312 0.0958 0.079 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 1.83e-01 -0.14 0.105 0.079 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 8.00e-01 0.0415 0.164 0.079 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 3.44e-01 0.101 0.107 0.079 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 9.17e-02 0.139 0.0821 0.079 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0591 0.0872 0.079 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 9.62e-01 0.00573 0.121 0.079 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.117 0.081 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 2.85e-01 -0.119 0.111 0.081 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 2.66e-01 -0.184 0.165 0.081 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 8.51e-01 0.0237 0.126 0.081 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 9.89e-01 0.0019 0.136 0.081 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0815 0.13 0.081 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 1.07e-01 0.206 0.127 0.081 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 6.64e-01 -0.074 0.17 0.081 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 1.20e-01 -0.152 0.0974 0.079 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 8.95e-01 0.0105 0.0795 0.079 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 1.28e-01 0.25 0.164 0.079 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.09e-01 0.104 0.0828 0.079 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0712 0.145 0.079 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0255 0.097 0.079 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0295 0.103 0.079 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 2.28e-01 0.142 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 9.12e-01 0.012 0.109 0.079 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0439 0.125 0.079 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0162 0.168 0.079 NK L1
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0292 0.106 0.079 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.05e-01 0.147 0.0899 0.079 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 7.88e-01 0.0349 0.13 0.079 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 9.01e-01 0.016 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 6.39e-02 -0.188 0.101 0.079 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 1.56e-01 -0.152 0.107 0.079 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 5.30e-01 -0.104 0.165 0.079 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 8.41e-01 0.0266 0.133 0.079 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.98e-02 0.137 0.0625 0.079 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0931 0.122 0.079 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 5.77e-01 -0.07 0.125 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0126 0.17 0.079 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0444 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0217 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0878 0.0863 0.079 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.32e-01 0.2 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 3.67e-01 0.17 0.187 0.079 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0556 0.146 0.079 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 1.54e-01 -0.215 0.15 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.63e-01 0.0341 0.113 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 3.36e-02 0.334 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 2.75e-01 0.157 0.143 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 3.39e-01 0.108 0.113 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 6.80e-02 -0.248 0.135 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 3.80e-01 0.14 0.16 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 2.47e-01 0.191 0.165 0.08 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.57e-01 0.039 0.126 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 2.40e-01 0.196 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 5.33e-01 0.098 0.157 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 3.81e-02 0.223 0.107 0.08 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0587 0.147 0.08 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 6.42e-01 0.0747 0.161 0.08 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0262 0.13 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0566 0.11 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 2.40e-01 0.201 0.171 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 5.53e-02 -0.286 0.148 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.64e-01 0.0968 0.0865 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 7.29e-01 0.0422 0.122 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0955 0.136 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0449 0.159 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 2.09e-01 -0.132 0.105 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 1.24e-01 0.266 0.173 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 1.19e-01 0.197 0.126 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 3.59e-01 0.116 0.126 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 3.59e-01 0.123 0.134 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0413 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0878 0.147 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 2.19e-01 -0.167 0.136 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0415 0.164 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 6.40e-01 0.0775 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 7.95e-02 0.169 0.096 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 5.92e-01 0.0829 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.28e-01 0.0328 0.151 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 9.58e-01 0.00433 0.0815 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0958 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 3.92e-01 0.132 0.154 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 8.88e-02 -0.216 0.126 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 8.17e-01 0.0206 0.0891 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0147 0.0654 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 6.78e-01 -0.048 0.115 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 2.65e-01 0.126 0.113 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 3.03e-01 -0.115 0.111 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 4.85e-01 -0.116 0.166 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0372 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 7.21e-01 0.0291 0.0814 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 8.20e-01 0.0211 0.0927 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.44e-01 0.0224 0.114 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0748 0.127 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.114 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 1.23e-01 -0.252 0.163 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 1.10e-01 -0.212 0.132 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.86e-01 0.0899 0.084 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 3.23e-01 0.129 0.13 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0915 0.135 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 1.23e-01 -0.181 0.117 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0295 0.124 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 9.22e-01 0.0159 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 3.77e-01 0.137 0.155 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.49e-01 0.142 0.0982 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0714 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 2.56e-01 0.158 0.138 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 4.93e-02 -0.227 0.115 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 3.35e-01 -0.102 0.106 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 2.46e-01 0.195 0.168 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0149 0.128 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.75e-01 0.0991 0.0905 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 8.39e-01 0.0218 0.108 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 7.61e-01 0.0408 0.134 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 5.61e-02 -0.292 0.152 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0486 0.131 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0689 0.176 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 1.99e-01 -0.221 0.172 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 8.88e-01 0.0117 0.0832 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 3.17e-02 0.318 0.147 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0328 0.152 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 4.51e-02 -0.295 0.146 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0352 0.155 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 3.03e-01 -0.175 0.17 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 6.49e-01 0.0806 0.177 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.90e-02 0.255 0.108 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 8.68e-02 -0.288 0.168 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0173 0.162 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 4.79e-01 -0.082 0.116 0.08 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 1.74e-01 -0.168 0.123 0.08 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00915 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 6.64e-01 0.0713 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 3.72e-03 0.224 0.0764 0.08 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 8.89e-02 -0.231 0.135 0.08 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0896 0.144 0.08 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0178 0.128 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 3.96e-01 -0.119 0.14 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 4.19e-01 0.135 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 1.73e-01 -0.204 0.149 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.16e-01 0.15 0.0951 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 1.97e-01 -0.187 0.145 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 3.68e-01 0.137 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 9.54e-01 0.00586 0.101 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 8.93e-01 0.0185 0.137 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 3.78e-01 -0.154 0.174 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 6.20e-01 0.061 0.123 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 3.93e-01 0.0815 0.0953 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 7.58e-01 0.0424 0.137 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 7.61e-01 0.0436 0.143 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 6.67e-01 0.0546 0.127 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 6.24e-01 -0.072 0.147 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0786 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 2.91e-01 -0.138 0.13 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.74e-01 0.136 0.1 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 8.94e-01 0.0214 0.16 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 5.68e-01 0.0925 0.162 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 7.50e-01 0.0337 0.106 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0344 0.135 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 8.23e-01 0.0371 0.166 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 5.80e-01 0.0697 0.126 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.12e-01 0.118 0.094 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 5.99e-01 0.0682 0.13 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0123 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 2.75e-01 0.257 0.234 0.063 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 3.08e-01 -0.202 0.197 0.063 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 4.16e-01 0.197 0.241 0.063 PB L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0235 0.151 0.063 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 8.07e-01 0.0448 0.183 0.063 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 7.85e-01 0.0571 0.208 0.063 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 6.01e-01 0.115 0.22 0.063 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 8.98e-02 -0.232 0.136 0.076 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 1.84e-01 -0.19 0.143 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 7.71e-01 0.0486 0.167 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 4.17e-01 0.108 0.132 0.076 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.33e-01 0.125 0.0831 0.076 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 3.95e-01 0.138 0.162 0.076 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0301 0.162 0.076 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 1.73e-01 0.208 0.152 0.079 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 2.28e-01 -0.134 0.111 0.079 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 3.86e-01 -0.14 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00409 0.175 0.079 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 3.37e-01 0.0933 0.097 0.079 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 8.13e-01 0.025 0.105 0.079 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0234 0.148 0.079 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 8.74e-02 -0.22 0.128 0.08 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0329 0.114 0.08 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 1.65e-01 -0.231 0.166 0.08 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0661 0.127 0.08 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 5.77e-01 0.083 0.149 0.08 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 2.82e-01 -0.141 0.131 0.08 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 3.44e-01 -0.157 0.165 0.08 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 9.06e-01 0.0202 0.171 0.08 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 2.16e-02 -0.21 0.0905 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 9.38e-01 0.00706 0.0904 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 1.74e-01 0.224 0.164 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.62e-01 0.138 0.0982 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0799 0.142 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 6.93e-01 0.0405 0.103 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0768 0.105 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 7.82e-01 0.0366 0.132 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 5.14e-02 -0.206 0.105 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0524 0.0987 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 4.26e-01 0.135 0.17 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0939 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 9.40e-01 0.0119 0.159 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 3.75e-01 -0.114 0.128 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 5.61e-01 0.0787 0.135 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 2.03e-01 0.168 0.131 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 1.37e-01 -0.222 0.149 0.091 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 9.02e-01 0.022 0.178 0.091 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0453 0.19 0.091 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0702 0.166 0.091 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0603 0.092 0.091 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0217 0.195 0.091 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0778 0.167 0.091 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0416 0.112 0.082 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.14e-01 0.041 0.112 0.082 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 8.56e-02 -0.259 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.57e-01 0.11 0.0966 0.082 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0511 0.149 0.082 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 9.89e-01 0.00227 0.158 0.082 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 4.08e-01 0.12 0.144 0.082 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 5.21e-01 0.107 0.166 0.082 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.132 0.079 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 9.67e-01 0.0039 0.0929 0.079 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 7.12e-03 0.439 0.161 0.079 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 5.61e-01 0.0683 0.117 0.079 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 3.04e-01 -0.149 0.145 0.079 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0156 0.153 0.079 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 2.48e-01 -0.17 0.146 0.079 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0695 0.155 0.079 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 7.81e-01 0.041 0.147 0.09 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 4.34e-01 -0.106 0.135 0.09 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 6.76e-01 0.0677 0.162 0.09 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 5.50e-01 0.0815 0.136 0.09 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0654 0.113 0.09 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00351 0.181 0.09 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 6.14e-03 0.375 0.135 0.09 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 1.05e-01 -0.27 0.165 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0578 0.135 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 9.48e-01 0.00722 0.11 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 3.31e-02 0.33 0.154 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 5.21e-01 0.0928 0.144 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 2.32e-02 0.215 0.0941 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 9.26e-02 -0.212 0.125 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 6.12e-01 0.0817 0.161 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0282 0.137 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0674 0.102 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 3.56e-02 0.35 0.165 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 3.50e-01 -0.14 0.149 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.82e-01 0.105 0.0783 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 5.59e-01 0.0674 0.115 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 4.49e-01 -0.106 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 3.62e-02 -0.192 0.0913 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0227 0.0863 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 1.32e-01 0.249 0.165 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 6.85e-02 0.155 0.0846 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0423 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0306 0.0999 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00792 0.102 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 2.15e-01 0.147 0.119 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0635 0.109 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 9.66e-01 0.00361 0.0836 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 1.55e-01 0.235 0.164 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 9.11e-01 0.0115 0.102 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 951910 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0246 0.16 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 9.89e-01 0.00174 0.131 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0274 0.137 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 718684 sc-eQTL 7.78e-01 0.044 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 283280 sc-eQTL 5.91e-01 0.0552 0.103 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -900802 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0388 0.128 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 680165 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0465 0.173 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -604690 sc-eQTL 9.37e-01 0.00848 0.108 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -364485 sc-eQTL 1.39e-01 0.138 0.0932 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 710252 sc-eQTL 6.87e-01 0.0511 0.127 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -365504 sc-eQTL 7.90e-01 0.035 0.131 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 580428 eQTL 0.0163 0.164 0.068 0.0 0.0 0.053
ENSG00000220412 AL356234.1 -204472 eQTL 0.0447 -0.106 0.0526 0.00121 0.0 0.053

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N -604690 3.27e-07 1.76e-07 5.91e-08 2.53e-07 1.01e-07 8.89e-08 2.1e-07 5.75e-08 1.54e-07 6.75e-08 1.61e-07 1.19e-07 2.74e-07 8.15e-08 5.62e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.64e-07 7.09e-08 6.16e-08 1.25e-07 1.42e-07 1.58e-07 3.07e-08 2.02e-07 1.26e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.34e-07 1.17e-07 1.21e-07 3.72e-08 3.29e-08 9.58e-08 6.78e-08 2.85e-08 5.1e-08 8.68e-08 6.28e-08 3.75e-08 5.34e-08 1.64e-07 4.76e-08 1.58e-08 3.4e-08 9.65e-09 1e-07 1.98e-09 4.98e-08