Genes within 1Mb (chr6:137491024:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.26e-01 -0.111 0.0914 0.173 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 7.56e-01 0.0224 0.0719 0.173 B L1
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 6.15e-01 0.0547 0.108 0.173 B L1
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00522 0.0718 0.173 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 4.69e-01 0.0419 0.0578 0.173 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 8.42e-02 0.139 0.0801 0.173 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 1.15e-01 -0.143 0.0905 0.173 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 1.70e-02 -0.146 0.0606 0.173 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 4.89e-01 0.0487 0.0703 0.173 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.79e-01 -0.087 0.0987 0.173 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0197 0.0664 0.173 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 7.32e-01 0.0213 0.0622 0.173 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.79e-02 -0.104 0.0468 0.173 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 1.88e-01 -0.103 0.078 0.173 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0611 0.0699 0.173 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 7.48e-01 0.0241 0.0749 0.173 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 6.37e-01 0.0552 0.117 0.173 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0347 0.0763 0.173 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 3.19e-01 0.0587 0.0588 0.173 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0696 0.0621 0.173 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0458 0.0865 0.173 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0842 0.0846 0.178 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 2.66e-01 0.0894 0.0801 0.178 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.77e-01 0.0667 0.119 0.178 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00883 0.0906 0.178 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 2.64e-01 0.11 0.0978 0.178 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 9.41e-01 0.00699 0.0941 0.178 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0323 0.0923 0.178 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 5.10e-01 -0.081 0.123 0.178 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 8.62e-02 -0.119 0.0692 0.173 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 8.22e-02 0.0981 0.0562 0.173 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.35e-01 -0.113 0.117 0.173 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00261 0.0591 0.173 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 6.87e-01 0.0417 0.103 0.173 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000548 0.069 0.173 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 3.76e-01 0.0649 0.0731 0.173 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 6.07e-01 0.043 0.0835 0.173 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0881 0.0773 0.174 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 9.96e-02 0.146 0.0883 0.174 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 7.39e-01 0.04 0.12 0.174 NK L1
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 4.67e-01 0.0549 0.0753 0.174 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 5.91e-01 0.0348 0.0645 0.174 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 7.71e-01 0.027 0.0925 0.174 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 8.02e-01 0.0229 0.0915 0.174 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0185 0.0736 0.173 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 5.03e-01 0.0523 0.078 0.173 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 1.85e-01 -0.159 0.12 0.173 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00767 0.0964 0.173 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 4.32e-01 0.0361 0.0458 0.173 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 1.90e-01 -0.116 0.0882 0.173 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0303 0.091 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0251 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0771 0.121 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 1.48e-01 0.176 0.121 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 2.39e-01 -0.074 0.0627 0.163 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 2.76e-01 0.133 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0861 0.137 0.163 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 7.29e-01 -0.037 0.107 0.163 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0127 0.11 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 9.46e-01 0.00557 0.0826 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 2.28e-01 0.139 0.115 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0567 0.105 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 2.04e-01 0.105 0.0822 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0349 0.0997 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 9.57e-01 0.00631 0.117 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 1.45e-01 -0.173 0.118 0.17 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 3.91e-01 0.0777 0.0905 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0375 0.12 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0496 0.113 0.17 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 1.44e-01 -0.113 0.0774 0.17 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.04e-01 0.135 0.106 0.17 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 2.90e-02 -0.252 0.114 0.17 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.77e-01 -0.101 0.0924 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 8.68e-01 0.0132 0.0788 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 6.50e-01 0.0555 0.122 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 1.94e-01 -0.139 0.106 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 2.37e-01 0.0733 0.0618 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.16e-02 0.199 0.086 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 2.55e-01 -0.111 0.0968 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 7.53e-02 -0.201 0.112 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 4.89e-01 0.0519 0.0749 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.94e-01 -0.066 0.124 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 2.48e-01 0.104 0.0899 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00054 0.0901 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 4.44e-02 0.192 0.095 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 2.90e-01 -0.123 0.116 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 7.82e-02 -0.193 0.109 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0544 0.101 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 2.43e-01 0.142 0.121 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 3.20e-01 -0.123 0.123 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 7.86e-02 0.126 0.0715 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 1.11e-02 -0.29 0.113 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 6.14e-02 -0.209 0.111 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0669 0.058 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 4.75e-01 0.049 0.0685 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 1.84e-01 -0.146 0.109 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00172 0.0906 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 7.15e-01 0.0232 0.0636 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0436 0.0466 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0675 0.0822 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 1.70e-02 -0.193 0.0803 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 6.34e-01 0.0383 0.0805 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 9.98e-01 0.000232 0.12 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 3.80e-01 0.0888 0.101 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0118 0.0587 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.66e-02 -0.147 0.066 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0783 0.082 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 1.18e-01 -0.149 0.0951 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 8.59e-02 0.148 0.0855 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 1.44e-01 0.18 0.123 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 7.86e-01 0.0273 0.1 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 9.82e-01 0.00144 0.0636 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 1.63e-01 -0.137 0.0977 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 4.29e-02 -0.206 0.101 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0668 0.0839 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 5.58e-01 0.0523 0.089 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0183 0.116 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 2.73e-01 -0.122 0.111 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 8.23e-01 0.0158 0.0707 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0466 0.0997 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0305 0.0994 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00807 0.0832 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0239 0.0762 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 2.43e-01 0.141 0.12 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0687 0.0915 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 7.10e-01 0.0243 0.065 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0462 0.077 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0793 0.0961 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0975 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 2.56e-01 -0.107 0.0936 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0719 0.127 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 3.26e-01 0.122 0.124 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 4.17e-01 0.0485 0.0597 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.50e-01 -0.123 0.106 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0938 0.109 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 3.69e-01 -0.1 0.111 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 1.59e-01 0.165 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.92e-02 -0.241 0.127 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0965 0.133 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 5.49e-01 0.0493 0.0821 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 8.09e-01 0.0308 0.127 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 6.07e-01 0.0628 0.122 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0637 0.0885 0.171 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0216 0.0947 0.171 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.53e-01 -0.111 0.12 0.171 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0277 0.125 0.171 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 2.57e-01 0.0675 0.0594 0.171 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 3.35e-01 -0.1 0.104 0.171 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 6.47e-01 0.0505 0.11 0.171 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 7.25e-01 -0.033 0.0938 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 2.49e-01 0.118 0.102 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 1.69e-01 -0.168 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0105 0.11 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 3.06e-01 0.0715 0.0696 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.77e-01 -0.115 0.106 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0894 0.111 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.00e-01 -0.092 0.0716 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 2.13e-01 0.121 0.0968 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.64e-01 -0.112 0.124 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 9.19e-01 0.00888 0.0871 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 3.68e-01 0.061 0.0676 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 8.71e-01 0.0158 0.0975 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 5.70e-01 0.0577 0.101 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.10e-01 -0.118 0.0936 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 4.59e-01 0.0808 0.109 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.85e-02 0.246 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 3.26e-01 0.0952 0.0966 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0701 0.0743 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 7.75e-01 0.0339 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 8.33e-01 0.0253 0.12 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0823 0.0757 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 4.36e-01 0.0756 0.0969 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 2.62e-01 0.134 0.119 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 1.51e-01 0.13 0.09 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 4.27e-01 0.0538 0.0677 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 8.74e-01 0.0148 0.0932 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 2.80e-01 0.11 0.102 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0488 0.139 0.167 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 8.24e-02 0.202 0.115 0.167 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 8.05e-02 0.248 0.141 0.167 PB L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0387 0.089 0.167 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 2.55e-01 0.123 0.107 0.167 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 4.03e-01 -0.103 0.123 0.167 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0328 0.13 0.167 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 3.48e-01 0.09 0.0957 0.174 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 4.54e-01 0.0751 0.1 0.174 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0115 0.117 0.174 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 2.30e-01 0.111 0.0924 0.174 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0282 0.0584 0.174 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0361 0.113 0.174 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 2.99e-01 -0.118 0.113 0.174 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.29e-01 -0.136 0.113 0.173 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 3.85e-01 0.0715 0.0821 0.173 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.80e-02 -0.226 0.119 0.173 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 7.48e-01 0.0417 0.129 0.173 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 6.26e-01 0.0351 0.072 0.173 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 7.13e-01 0.0288 0.078 0.173 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 7.83e-01 0.0303 0.11 0.173 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 5.76e-02 -0.178 0.0931 0.185 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00128 0.0828 0.185 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0676 0.122 0.185 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 8.64e-01 0.0159 0.0927 0.185 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 4.53e-01 0.0813 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 7.51e-01 0.0303 0.0954 0.185 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 8.07e-01 0.0295 0.121 0.185 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 6.57e-01 0.0552 0.124 0.185 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0889 0.0653 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 3.39e-01 0.0618 0.0645 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0543 0.118 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0233 0.0706 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 3.44e-01 0.0962 0.101 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0646 0.0733 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 5.07e-01 0.05 0.0753 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 8.67e-01 0.0159 0.0944 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.57e-01 -0.086 0.0757 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 1.95e-01 0.0916 0.0704 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 1.39e-01 -0.18 0.121 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 7.42e-01 0.0222 0.0675 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0489 0.114 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 5.28e-01 0.058 0.0916 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 6.86e-01 0.0392 0.0968 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 2.53e-01 0.108 0.0943 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 8.96e-01 0.0149 0.114 0.191 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 8.90e-01 0.0187 0.135 0.191 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 9.54e-02 -0.239 0.143 0.191 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 2.90e-01 0.133 0.125 0.191 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 4.75e-01 0.05 0.0698 0.191 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0278 0.148 0.191 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0605 0.127 0.191 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 8.29e-01 0.0176 0.081 0.176 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 1.81e-01 0.108 0.0804 0.176 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.52e-01 0.102 0.109 0.176 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0609 0.0698 0.176 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0719 0.107 0.176 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 2.52e-01 0.13 0.114 0.176 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0909 0.104 0.176 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 1.90e-01 -0.157 0.12 0.176 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 5.28e-02 -0.182 0.0934 0.174 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0107 0.0661 0.174 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.65e-01 0.0673 0.117 0.174 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 9.27e-01 0.0077 0.0834 0.174 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 1.12e-01 -0.163 0.102 0.174 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 9.16e-01 0.0114 0.108 0.174 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 8.92e-01 0.0142 0.104 0.174 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0569 0.11 0.174 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 9.05e-01 -0.013 0.109 0.172 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 2.02e-01 0.127 0.0993 0.172 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 4.43e-01 0.092 0.12 0.172 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0864 0.101 0.172 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 2.92e-01 0.0882 0.0834 0.172 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 1.19e-01 -0.208 0.133 0.172 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 8.33e-01 0.0216 0.102 0.172 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0999 0.123 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0839 0.096 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00731 0.078 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.33e-01 0.107 0.11 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 9.09e-01 0.0118 0.103 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 7.29e-01 0.0236 0.0679 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0541 0.0898 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0889 0.115 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 1.00e-01 -0.16 0.0967 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 7.27e-01 0.0253 0.0722 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 9.09e-01 0.0135 0.118 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0873 0.106 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 5.39e-01 0.0343 0.0557 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 6.70e-03 0.22 0.0803 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 1.19e-01 -0.154 0.0987 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 9.51e-02 -0.11 0.0657 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 2.37e-01 0.0732 0.0617 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 2.27e-01 -0.143 0.118 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0107 0.0611 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 4.37e-01 0.0824 0.106 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0355 0.0716 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 4.54e-01 0.0549 0.0732 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 4.26e-01 0.0679 0.0851 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0908 0.0773 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 1.30e-01 0.0896 0.0589 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 3.49e-01 0.11 0.117 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00375 0.0725 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 940205 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0563 0.113 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 5.47e-01 0.056 0.0929 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0466 0.0971 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 706979 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0988 0.11 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 271575 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0986 0.073 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -912507 sc-eQTL 1.32e-01 0.137 0.0905 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 668460 sc-eQTL 5.85e-01 0.0676 0.124 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -616395 sc-eQTL 2.81e-01 0.0828 0.0765 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -376190 sc-eQTL 5.14e-01 0.0436 0.0668 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 698547 sc-eQTL 7.65e-01 0.027 0.0903 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -377209 sc-eQTL 5.63e-01 0.0542 0.0935 0.175 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 568723 eQTL 0.0482 -0.0862 0.0436 0.00204 0.0 0.15


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina