Genes within 1Mb (chr6:137489007:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 9.32e-02 -0.161 0.0955 0.143 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00241 0.0754 0.143 B L1
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 6.06e-01 0.0587 0.114 0.143 B L1
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 7.30e-01 -0.026 0.0753 0.143 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 4.69e-01 0.0439 0.0606 0.143 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 7.42e-02 0.151 0.0839 0.143 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 1.46e-01 -0.139 0.095 0.143 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 2.68e-03 -0.193 0.0634 0.143 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 6.54e-01 0.0333 0.0742 0.143 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.143 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 5.67e-01 0.0402 0.07 0.143 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 3.53e-01 0.061 0.0655 0.143 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0589 0.0498 0.143 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0773 0.0824 0.143 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.57e-01 -0.103 0.0728 0.143 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0107 0.0782 0.143 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.41e-01 0.143 0.122 0.143 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0755 0.0795 0.143 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 2.41e-01 0.072 0.0613 0.143 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0846 0.0648 0.143 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 8.91e-01 0.0124 0.0904 0.143 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0814 0.0876 0.151 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 5.17e-01 0.0539 0.0831 0.151 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.69e-01 0.137 0.123 0.151 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 6.10e-01 0.0479 0.0938 0.151 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 4.91e-01 0.07 0.102 0.151 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00599 0.0974 0.151 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0746 0.0955 0.151 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0259 0.127 0.151 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 2.56e-02 -0.162 0.0721 0.143 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 3.42e-01 0.0563 0.0591 0.143 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.06e-01 -0.155 0.122 0.143 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 3.27e-01 0.0607 0.0617 0.143 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0073 0.108 0.143 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0345 0.0722 0.143 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.97e-02 0.134 0.0761 0.143 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 6.77e-01 0.0365 0.0874 0.143 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 9.43e-02 -0.135 0.0804 0.144 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 8.28e-02 0.16 0.0921 0.144 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 7.43e-01 0.041 0.125 0.144 NK L1
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 2.08e-01 0.0991 0.0784 0.144 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.03e-01 0.0452 0.0673 0.144 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 7.98e-01 0.0247 0.0965 0.144 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.79e-01 0.0269 0.0955 0.144 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0512 0.0761 0.143 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 6.15e-01 0.0406 0.0807 0.143 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 9.58e-01 0.00657 0.124 0.143 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0167 0.0997 0.143 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 4.36e-01 0.037 0.0474 0.143 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 2.13e-01 -0.114 0.0912 0.143 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.65e-01 0.0282 0.0941 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 9.74e-01 0.0043 0.13 0.135 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 9.53e-01 0.0076 0.128 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.82e-01 0.138 0.128 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0756 0.0661 0.135 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 1.06e-01 0.208 0.128 0.135 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0363 0.144 0.135 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0264 0.112 0.135 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0688 0.113 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0413 0.0847 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 3.37e-01 0.114 0.118 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 2.41e-01 -0.126 0.107 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 1.63e-01 0.118 0.0842 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0203 0.102 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 8.00e-01 0.0304 0.12 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 7.47e-02 -0.22 0.123 0.142 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 2.50e-01 0.109 0.0941 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.62e-01 -0.14 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 2.90e-01 -0.124 0.117 0.142 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0521 0.0809 0.142 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 2.02e-01 0.141 0.11 0.142 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 1.44e-01 -0.176 0.12 0.142 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 2.56e-01 -0.109 0.096 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 8.84e-01 -0.012 0.0819 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 5.07e-01 0.0843 0.127 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0531 0.111 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 1.68e-01 0.0887 0.0642 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 1.43e-02 0.22 0.0893 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 1.55e-01 -0.143 0.1 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 5.42e-02 -0.226 0.117 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 7.52e-01 0.0247 0.078 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 9.70e-01 0.0049 0.129 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 2.13e-01 0.117 0.0934 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 9.42e-01 0.00686 0.0937 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 3.30e-01 0.0971 0.0995 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0851 0.121 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 7.78e-02 -0.203 0.115 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0687 0.106 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.40e-01 0.15 0.128 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 4.22e-01 -0.104 0.13 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.65e-02 0.144 0.075 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 4.42e-03 -0.341 0.118 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.81e-02 -0.207 0.117 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 7.97e-02 -0.107 0.0608 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 5.78e-01 0.0402 0.0721 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 1.68e-01 -0.159 0.115 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 6.92e-01 0.0378 0.0953 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 4.67e-01 0.0487 0.0668 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0218 0.0491 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0411 0.0866 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 5.63e-03 -0.235 0.0838 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0148 0.0845 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00345 0.125 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 5.69e-01 0.0604 0.106 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00906 0.0615 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0603 0.07 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 9.62e-02 -0.143 0.0857 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.40e-02 -0.245 0.099 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 1.45e-01 0.131 0.0899 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 1.26e-01 0.198 0.129 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 6.58e-01 0.0466 0.105 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.56e-01 0.0393 0.0667 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 2.04e-01 -0.131 0.103 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 2.33e-01 -0.128 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 2.16e-01 -0.108 0.0871 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 7.93e-01 0.0244 0.0927 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 5.68e-01 0.0687 0.12 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 9.35e-02 -0.194 0.115 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 7.45e-01 0.024 0.0736 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 2.56e-01 -0.118 0.104 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 9.11e-01 0.0116 0.103 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00962 0.0866 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0506 0.0793 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.58e-01 0.142 0.125 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 1.78e-01 -0.129 0.095 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 3.58e-01 0.0623 0.0676 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0193 0.0803 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0421 0.1 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0385 0.116 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0866 0.0983 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0718 0.133 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 5.05e-01 0.0868 0.13 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.18e-01 0.0406 0.0627 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0615 0.112 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00178 0.115 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 9.70e-02 -0.193 0.116 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 3.97e-01 0.104 0.122 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 1.31e-01 -0.202 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 3.21e-01 -0.139 0.139 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 6.20e-01 0.0427 0.0859 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.85e-01 0.0193 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 4.08e-01 0.106 0.127 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 2.15e-01 -0.114 0.0915 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 7.37e-01 -0.033 0.0981 0.141 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0497 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 4.27e-01 -0.103 0.13 0.141 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 3.93e-01 0.0528 0.0617 0.141 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0429 0.108 0.141 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 4.43e-01 0.0876 0.114 0.141 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0357 0.0973 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 2.93e-01 0.112 0.106 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 1.44e-01 -0.185 0.126 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 5.64e-01 0.0656 0.114 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 2.51e-01 0.0832 0.0723 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0609 0.11 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.116 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 3.56e-02 -0.156 0.0739 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 2.75e-01 0.11 0.101 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0351 0.129 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 6.82e-01 0.0371 0.0904 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 3.11e-01 0.0712 0.0702 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 9.21e-01 0.0101 0.101 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 8.41e-01 0.0211 0.105 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 3.60e-02 -0.205 0.0973 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 3.16e-01 0.114 0.114 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 1.47e-01 0.181 0.124 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 2.25e-01 0.123 0.101 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0485 0.0779 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0103 0.124 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.97e-01 0.0324 0.126 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.15e-01 -0.125 0.079 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 2.68e-01 0.112 0.101 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 4.80e-01 0.0882 0.125 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 1.18e-01 0.148 0.094 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.72e-01 0.0401 0.0709 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 5.78e-01 0.0542 0.0974 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 2.50e-01 0.123 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 3.04e-01 -0.15 0.146 0.137 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 2.39e-01 0.145 0.122 0.137 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 4.17e-02 0.304 0.147 0.137 PB L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 7.59e-01 0.0288 0.0937 0.137 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 2.93e-01 0.119 0.113 0.137 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0622 0.129 0.137 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 9.08e-01 0.0159 0.137 0.137 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 4.48e-01 0.0755 0.0992 0.146 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 7.03e-01 0.0396 0.104 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0161 0.121 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 1.81e-01 0.128 0.0956 0.146 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00317 0.0605 0.146 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.85e-01 0.0169 0.117 0.146 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 2.87e-01 -0.125 0.117 0.146 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.09e-01 -0.189 0.117 0.143 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 4.54e-01 0.0641 0.0854 0.143 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 1.14e-02 -0.313 0.123 0.143 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 9.44e-01 0.00947 0.135 0.143 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 6.10e-01 0.0383 0.0749 0.143 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 5.22e-01 0.052 0.0811 0.143 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 6.71e-01 0.0485 0.114 0.143 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 2.27e-01 -0.118 0.0972 0.156 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0654 0.0858 0.156 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 5.28e-01 0.0796 0.126 0.156 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 3.01e-01 0.0995 0.0959 0.156 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 8.65e-01 0.0192 0.112 0.156 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.57e-01 0.0179 0.0989 0.156 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 9.30e-01 0.011 0.125 0.156 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 5.63e-01 0.0747 0.129 0.156 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 9.22e-02 -0.115 0.068 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 9.11e-01 0.00755 0.0675 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 6.79e-01 -0.051 0.123 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.35e-01 0.0458 0.0737 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 6.76e-01 0.0444 0.106 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.36e-02 -0.132 0.0761 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 1.75e-01 0.107 0.0784 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0147 0.0986 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.46e-01 -0.115 0.0787 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 3.20e-01 0.0732 0.0735 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 1.15e-01 -0.2 0.126 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.64e-01 0.0406 0.0702 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0434 0.118 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 5.01e-01 0.0644 0.0955 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 3.21e-01 0.1 0.101 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 2.06e-01 0.125 0.0981 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0236 0.118 0.161 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00625 0.14 0.161 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 3.79e-01 -0.131 0.149 0.161 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 2.17e-01 0.16 0.129 0.161 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 6.33e-01 0.0346 0.0722 0.161 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0596 0.153 0.161 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0522 0.131 0.161 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0159 0.0853 0.144 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 4.15e-01 0.0694 0.0849 0.144 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 6.11e-01 0.0585 0.115 0.144 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 8.35e-01 0.0153 0.0737 0.144 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0852 0.113 0.144 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 1.97e-01 0.155 0.119 0.144 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.09e-01 -0.041 0.11 0.144 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 2.36e-01 -0.15 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.71e-02 -0.234 0.0974 0.145 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0636 0.0691 0.145 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000572 0.122 0.145 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 4.27e-01 0.0694 0.0873 0.145 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 1.05e-01 -0.175 0.107 0.145 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0528 0.114 0.145 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 8.21e-01 0.0248 0.109 0.145 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0462 0.115 0.145 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0795 0.115 0.141 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 5.44e-01 0.0642 0.106 0.141 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 6.93e-01 0.0502 0.127 0.141 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0678 0.107 0.141 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 2.95e-01 0.0928 0.0884 0.141 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.48e-02 -0.261 0.14 0.141 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0532 0.108 0.141 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 7.20e-01 0.0469 0.131 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.81e-01 -0.133 0.0993 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0282 0.0808 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 9.35e-01 0.00943 0.115 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0992 0.106 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.35e-01 0.0437 0.0703 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0269 0.0931 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0375 0.119 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 7.42e-02 -0.181 0.101 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00315 0.0752 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 5.24e-01 0.0787 0.123 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0107 0.11 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 5.88e-01 0.0315 0.058 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 3.26e-02 0.181 0.0842 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 9.41e-02 -0.173 0.103 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 4.50e-02 -0.138 0.0684 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 7.47e-01 0.0209 0.0646 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 2.56e-01 -0.141 0.124 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 4.57e-01 0.0475 0.0637 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 7.33e-01 0.0378 0.111 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0765 0.0746 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 1.29e-01 0.116 0.0761 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 6.02e-01 0.0465 0.089 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 1.46e-01 -0.118 0.081 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 3.58e-01 0.0571 0.062 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 6.78e-01 0.0512 0.123 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 3.40e-01 0.0726 0.0759 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 938188 sc-eQTL 3.51e-01 -0.111 0.119 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 6.97e-01 0.0381 0.0976 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0268 0.102 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 704962 sc-eQTL 6.29e-01 -0.056 0.116 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 269558 sc-eQTL 4.08e-02 -0.156 0.0758 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -914524 sc-eQTL 1.16e-01 0.149 0.0945 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 666443 sc-eQTL 6.19e-01 0.0644 0.129 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -618412 sc-eQTL 1.29e-01 0.122 0.0797 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378207 sc-eQTL 4.67e-01 0.0508 0.0697 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 696530 sc-eQTL 8.21e-01 0.0214 0.0943 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379226 sc-eQTL 5.01e-01 0.0657 0.0976 0.144 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 566706 eQTL 0.0165 -0.11 0.0459 0.00122 0.0 0.134


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina