logo

Genes within 1Mb (chr6:137488265:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.77e-03 0.245 0.081 0.244 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 7.39e-01 0.0216 0.0649 0.244 B L1
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 6.19e-01 0.0488 0.0978 0.244 B L1
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 6.90e-01 0.0259 0.0647 0.244 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0774 0.0519 0.244 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 6.96e-02 0.132 0.0722 0.244 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 5.09e-01 0.0543 0.082 0.244 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 5.43e-01 0.034 0.0558 0.244 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 4.92e-01 0.0441 0.064 0.244 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 2.30e-01 0.108 0.0897 0.244 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 2.75e-01 0.0659 0.0603 0.244 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0455 0.0565 0.244 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.12e-02 0.0877 0.0427 0.244 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.79e-02 0.141 0.0706 0.244 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0419 0.0633 0.244 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 5.27e-01 0.043 0.0678 0.244 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.35e-01 -0.102 0.105 0.244 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 8.07e-01 0.0169 0.0691 0.244 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0465 0.0532 0.244 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 5.08e-01 0.0373 0.0563 0.244 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0061 0.0783 0.244 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 6.22e-01 0.0373 0.0756 0.245 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0134 0.0717 0.245 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.16e-01 -0.107 0.106 0.245 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 8.66e-01 0.0137 0.0809 0.245 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 9.59e-02 -0.146 0.087 0.245 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 3.77e-01 0.0742 0.0838 0.245 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0984 0.0821 0.245 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 7.37e-01 0.0368 0.11 0.245 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 1.56e-02 0.153 0.0628 0.244 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0252 0.0517 0.244 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 1.28e-01 0.163 0.107 0.244 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0288 0.054 0.244 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 2.79e-01 0.102 0.0943 0.244 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.89e-02 0.137 0.0624 0.244 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0533 0.0669 0.244 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 9.16e-01 0.00804 0.0764 0.244 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0118 0.0715 0.242 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 3.40e-01 0.0782 0.0817 0.242 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 2.24e-01 -0.134 0.11 0.242 NK L1
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 7.26e-01 0.0244 0.0695 0.242 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0878 0.0592 0.242 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.27e-01 -0.103 0.0849 0.242 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 8.07e-01 0.0207 0.0843 0.242 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000281 0.0662 0.244 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 2.36e-01 0.0831 0.07 0.244 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0726 0.108 0.244 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 6.98e-01 0.0337 0.0866 0.244 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0409 0.0411 0.244 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.12e-02 0.183 0.0786 0.244 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 6.02e-01 0.0427 0.0818 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 7.71e-01 0.0315 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0471 0.106 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 8.88e-01 0.015 0.106 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 3.08e-01 0.056 0.0548 0.247 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 2.24e-01 -0.13 0.106 0.247 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.38e-01 0.0926 0.119 0.247 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0601 0.093 0.247 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 1.40e-01 0.144 0.0974 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 1.22e-01 0.113 0.073 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.28e-01 0.1 0.102 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0229 0.0934 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 1.16e-01 -0.115 0.0729 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 3.29e-01 0.0864 0.0884 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 3.82e-01 0.0908 0.104 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 3.74e-01 0.0956 0.107 0.246 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 8.88e-01 0.0116 0.0821 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 2.74e-01 0.119 0.108 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 1.24e-03 0.327 0.0998 0.246 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0167 0.0704 0.246 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.41e-01 -0.113 0.0958 0.246 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 1.28e-02 0.259 0.103 0.246 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 3.22e-03 0.242 0.0813 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 6.91e-01 0.0281 0.0706 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 1.84e-01 0.146 0.109 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 7.46e-02 0.17 0.0951 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0795 0.0553 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 3.07e-01 0.0797 0.0779 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 8.13e-01 0.0206 0.087 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 4.66e-03 0.284 0.0993 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0441 0.0671 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0835 0.111 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 5.53e-02 0.154 0.08 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0644 0.0805 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 8.17e-01 0.0199 0.0858 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.56e-01 0.0778 0.104 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00475 0.0952 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 7.78e-01 0.0248 0.0878 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.55e-01 0.0977 0.105 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0187 0.0624 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.97e-01 0.0677 0.0995 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 1.40e-01 0.143 0.0966 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00641 0.0533 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 6.95e-01 0.0247 0.0629 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0303 0.101 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 2.10e-02 0.191 0.082 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0199 0.0583 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 1.14e-01 0.0675 0.0426 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 3.98e-02 0.155 0.0747 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 3.55e-01 0.0682 0.0735 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 3.27e-01 0.0714 0.0727 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 1.46e-03 0.341 0.106 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 8.88e-01 0.0129 0.0914 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0165 0.0531 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.12e-01 0.0754 0.0602 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 3.58e-02 0.156 0.0736 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.89e-01 0.0889 0.0836 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 6.86e-01 0.0305 0.0754 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.24e-01 -0.107 0.108 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00924 0.0877 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.49e-02 -0.103 0.0552 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0349 0.086 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 3.62e-02 0.186 0.0883 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0914 0.0751 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 9.41e-01 0.00588 0.0799 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 7.99e-01 0.0264 0.104 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 5.17e-01 0.0646 0.0996 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.57e-02 -0.116 0.0629 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.77e-01 0.0973 0.0893 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 8.49e-01 -0.017 0.0892 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.36e-01 0.0882 0.0742 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 4.61e-01 0.0503 0.0682 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.108 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 5.76e-01 -0.046 0.082 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 7.06e-01 -0.022 0.0582 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 7.59e-02 0.122 0.0685 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.74e-01 0.0617 0.086 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 6.98e-01 0.0379 0.0976 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 8.29e-01 0.018 0.0831 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 7.54e-01 0.0352 0.112 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 2.21e-01 -0.134 0.109 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0628 0.0527 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00711 0.0945 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 2.20e-01 0.119 0.0965 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 4.10e-01 0.0794 0.0962 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 1.76e-01 0.137 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0417 0.111 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0765 0.115 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0566 0.071 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 6.49e-01 0.0501 0.11 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 1.10e-01 -0.168 0.105 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 8.53e-01 0.0142 0.0764 0.245 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 1.36e-01 0.122 0.0812 0.245 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 8.83e-01 0.0153 0.104 0.245 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 1.76e-01 0.146 0.108 0.245 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0415 0.0513 0.245 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.90e-03 0.25 0.0879 0.245 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 5.10e-01 0.0627 0.095 0.245 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0925 0.085 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0917 0.0928 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0553 0.111 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0217 0.0995 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0273 0.0634 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 6.32e-01 0.0463 0.0965 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0976 0.101 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 4.74e-01 0.048 0.067 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 1.72e-01 0.124 0.0902 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0479 0.115 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 8.53e-01 0.0151 0.0812 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.53e-02 -0.116 0.0626 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0116 0.0909 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0761 0.0944 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.14e-01 -0.104 0.0837 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 7.52e-01 0.0308 0.0974 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.36e-01 -0.103 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 1.22e-01 0.134 0.0861 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00299 0.0666 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0732 0.106 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 8.37e-01 0.0222 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 7.49e-01 0.022 0.0688 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 7.52e-01 0.0278 0.088 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0524 0.108 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 2.88e-02 -0.178 0.0811 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 2.34e-02 -0.139 0.0607 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0438 0.0844 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0332 0.0926 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 5.01e-01 -0.084 0.125 0.259 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 3.17e-01 -0.105 0.105 0.259 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 7.41e-01 0.0425 0.128 0.259 PB L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0298 0.0799 0.259 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.13e-01 0.0492 0.0969 0.259 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.15e-02 0.223 0.108 0.259 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0887 0.116 0.259 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 8.19e-02 -0.148 0.0845 0.246 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0496 0.0889 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 5.81e-01 -0.057 0.103 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 3.01e-01 -0.085 0.082 0.246 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0807 0.0515 0.246 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 5.87e-01 0.0545 0.1 0.246 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0293 0.101 0.246 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 1.97e-01 0.13 0.101 0.244 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 4.49e-01 0.0557 0.0733 0.244 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 4.01e-01 0.0898 0.107 0.244 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0198 0.116 0.244 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0911 0.064 0.244 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00164 0.0697 0.244 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 9.66e-01 0.00423 0.0981 0.244 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 5.71e-01 0.0483 0.0851 0.239 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 8.10e-01 0.0181 0.075 0.239 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0542 0.11 0.239 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 9.83e-01 0.00177 0.084 0.239 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 1.12e-01 -0.156 0.0975 0.239 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.20e-01 0.106 0.0861 0.239 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0227 0.109 0.239 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 6.57e-01 -0.05 0.112 0.239 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.14e-02 0.136 0.0586 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0273 0.0584 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 1.12e-01 0.169 0.106 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0331 0.0638 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 6.67e-01 0.0395 0.0919 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 3.45e-03 0.192 0.0651 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 9.26e-01 0.00634 0.0682 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 9.53e-01 0.005 0.0854 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 3.25e-02 0.147 0.0683 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0464 0.0642 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 2.93e-01 0.116 0.111 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 8.35e-01 0.0128 0.0614 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 4.80e-01 0.0729 0.103 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.92e-01 0.0574 0.0833 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 8.17e-01 0.0204 0.0881 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 8.43e-01 -0.017 0.086 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0745 0.101 0.227 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 5.01e-01 0.0812 0.12 0.227 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 8.14e-01 0.0302 0.128 0.227 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 2.79e-01 0.121 0.111 0.227 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0305 0.0622 0.227 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0762 0.131 0.227 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 7.66e-02 0.199 0.111 0.227 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 7.26e-02 0.131 0.0727 0.24 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0569 0.073 0.24 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.68e-01 -0.089 0.0987 0.24 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00466 0.0633 0.24 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 7.95e-01 0.0253 0.0973 0.24 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 8.75e-01 0.0163 0.103 0.24 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0338 0.0943 0.24 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0571 0.109 0.24 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 1.65e-01 0.121 0.0866 0.235 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0348 0.0609 0.235 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0139 0.108 0.235 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 9.22e-01 0.00753 0.077 0.235 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 1.46e-01 0.138 0.0946 0.235 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 9.22e-02 0.168 0.0993 0.235 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0634 0.0962 0.235 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.102 0.235 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 8.17e-01 -0.023 0.0994 0.254 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0352 0.0911 0.254 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 5.48e-01 0.0658 0.109 0.254 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0422 0.0921 0.254 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 4.18e-01 0.0619 0.0763 0.254 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 5.89e-01 0.0661 0.122 0.254 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.75e-02 -0.184 0.0923 0.254 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 5.13e-01 0.0738 0.113 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 1.97e-01 0.113 0.0872 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 2.20e-01 0.0871 0.0708 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.02e-01 0.104 0.1 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 1.90e-02 0.218 0.0924 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 5.06e-02 -0.12 0.0612 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 4.24e-01 0.0654 0.0817 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 3.21e-01 0.104 0.104 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 2.28e-03 0.265 0.0858 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 9.03e-01 0.00794 0.065 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 5.35e-01 0.0663 0.107 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 2.74e-02 0.21 0.0944 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0799 0.0499 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 2.34e-01 0.0875 0.0733 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 5.94e-01 0.0477 0.0893 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 7.80e-03 0.159 0.059 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0394 0.0561 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 8.38e-02 0.186 0.107 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0161 0.0555 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 5.68e-01 0.055 0.0963 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 8.47e-03 0.17 0.064 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00957 0.0665 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 5.53e-01 0.0459 0.0773 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 9.05e-02 0.121 0.0709 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0485 0.0544 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0701 0.108 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0268 0.0667 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 937446 sc-eQTL 6.12e-01 0.0529 0.104 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 6.42e-01 0.0399 0.0856 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0674 0.0893 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 704220 sc-eQTL 9.63e-01 0.00468 0.102 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 268816 sc-eQTL 7.63e-01 0.0204 0.0675 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -915266 sc-eQTL 2.22e-01 0.102 0.0835 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 665701 sc-eQTL 3.13e-01 -0.115 0.114 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -619154 sc-eQTL 6.38e-01 0.0333 0.0706 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -378949 sc-eQTL 8.06e-02 -0.107 0.0611 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 sc-eQTL 3.01e-01 -0.086 0.0829 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -379968 sc-eQTL 7.09e-01 0.0322 0.0861 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000197442 MAP3K5 695788 eQTL 0.0182 0.0314 0.0133 0.0 0.0 0.312
ENSG00000220412 AL356234.1 -218936 eQTL 0.0235 -0.059 0.026 0.00141 0.0 0.312
ENSG00000237499 AL357060.1 -379968 eQTL 0.0423 -0.0274 0.0135 0.0 0.0 0.312

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -915266 2.66e-07 1.08e-07 3.56e-08 1.7e-07 1.02e-07 9.32e-08 1.41e-07 5.24e-08 1.41e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.3e-07 6.21e-08 4.89e-08 7.87e-08 4.94e-08 1.07e-07 5.2e-08 3.74e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.26e-07 4.99e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.13e-07 8.71e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.72e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.56e-08 4.02e-08 4.72e-08 9.6e-08 6.59e-08 3.12e-08 4.27e-08 1.4e-07 5.27e-08 0.0 1.12e-07 1.7e-08 1.44e-07 4.41e-09 4.74e-08
ENSG00000112357 \N 665701 2.74e-07 1.16e-07 5.72e-08 1.8e-07 9.65e-08 9.8e-08 1.6e-07 5.21e-08 1.47e-07 4.57e-08 1.56e-07 8.59e-08 1.79e-07 6.76e-08 5.53e-08 7.3e-08 3.9e-08 1.26e-07 6.07e-08 4.04e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.58e-07 4.54e-08 1.5e-07 1.14e-07 1.11e-07 9.36e-08 1.12e-07 1e-07 1.08e-07 4.03e-08 3.61e-08 8.72e-08 8.87e-08 3.93e-08 4.49e-08 8.2e-08 5.25e-08 3.87e-08 5.14e-08 1.36e-07 1.6e-08 0.0 9.88e-08 1.8e-08 1.25e-07 3.8e-09 4.85e-08
ENSG00000118503 \N -378949 9.39e-07 4.78e-07 2.75e-07 3.87e-07 1.07e-07 2.67e-07 6.54e-07 6.12e-08 9.89e-07 2.16e-07 3.92e-07 4.31e-07 1.2e-06 1.54e-07 2.14e-07 3.41e-07 1.73e-07 4.22e-07 3.43e-07 3.06e-07 2.8e-07 5.34e-07 5.77e-07 4.91e-08 9.26e-07 2.42e-07 2.43e-07 2.68e-07 4.13e-07 7.06e-07 4.47e-07 6.92e-08 1.31e-07 4.83e-07 2.58e-07 1.28e-07 6.81e-07 3.18e-07 4.8e-07 1.83e-08 1.12e-07 2.19e-07 6.19e-07 7.21e-09 3.29e-08 1.11e-07 9.1e-08 8.66e-08 5.4e-08
ENSG00000220412 AL356234.1 -218936 2.17e-06 2.54e-06 8.95e-07 1.69e-06 4.59e-07 7.53e-07 1.94e-06 4.06e-07 3.13e-06 8.16e-07 1.97e-06 1.44e-06 3.68e-06 1.4e-06 9.33e-07 2e-06 1.06e-06 2.3e-06 1.48e-06 1.02e-06 1.99e-06 3.05e-06 2.44e-06 7.1e-07 2.95e-06 1.36e-06 1.22e-06 1.45e-06 1.92e-06 1.79e-06 2.08e-06 4.38e-07 7.32e-07 1.52e-06 1e-06 8.93e-07 1.21e-06 1.46e-06 9.23e-07 3.61e-07 3.62e-07 2.09e-06 1.42e-06 1.9e-07 3.71e-07 9.16e-07 4.63e-07 6.58e-07 3.29e-07
ENSG00000237499 AL357060.1 -379968 9.36e-07 4.78e-07 2.75e-07 3.87e-07 1.07e-07 2.63e-07 6.33e-07 6.12e-08 9.42e-07 2.16e-07 3.92e-07 4.24e-07 1.16e-06 1.54e-07 2.15e-07 3.36e-07 1.73e-07 4.22e-07 3.5e-07 2.86e-07 2.89e-07 5.5e-07 5.63e-07 4.91e-08 9.15e-07 2.42e-07 2.43e-07 2.54e-07 4.06e-07 7.06e-07 4.47e-07 6.84e-08 1.21e-07 4.51e-07 2.58e-07 1.21e-07 6.37e-07 3.27e-07 5.07e-07 1.82e-08 1.02e-07 2.19e-07 6.18e-07 7.2e-09 3.29e-08 1.02e-07 9.23e-08 8.58e-08 5.81e-08