logo

Genes within 1Mb (chr6:137476042:T:TA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 7.31e-03 0.338 0.125 0.079 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 1.12e-01 0.158 0.099 0.079 B L1
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 3.83e-01 -0.131 0.15 0.079 B L1
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0189 0.0994 0.079 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0337 0.0801 0.079 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 9.89e-01 0.0016 0.112 0.079 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 2.16e-01 0.156 0.126 0.079 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0024 0.0843 0.079 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 8.32e-02 0.167 0.096 0.079 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 1.13e-02 0.342 0.134 0.079 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 9.05e-03 0.236 0.0896 0.079 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 6.63e-01 0.0372 0.0853 0.079 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 5.19e-01 0.042 0.065 0.079 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 1.06e-02 0.273 0.106 0.079 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00411 0.0959 0.079 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 1.11e-01 0.163 0.102 0.079 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0127 0.16 0.079 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 9.70e-01 0.00391 0.105 0.079 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 9.85e-01 0.00147 0.0807 0.079 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0614 0.0852 0.079 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 1.49e-01 0.171 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.74e-01 0.16 0.117 0.077 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 8.57e-01 0.0202 0.112 0.077 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 6.83e-01 0.0677 0.166 0.077 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0254 0.126 0.077 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 7.14e-01 0.05 0.136 0.077 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 3.57e-01 0.12 0.13 0.077 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0818 0.128 0.077 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 1.89e-01 0.223 0.17 0.077 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 2.63e-01 0.107 0.0955 0.079 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0375 0.0777 0.079 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 2.26e-01 0.195 0.161 0.079 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 3.76e-01 0.072 0.0811 0.079 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 5.06e-01 0.0946 0.142 0.079 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 4.22e-01 0.0761 0.0947 0.079 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0771 0.101 0.079 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 7.02e-01 0.0439 0.115 0.079 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.73e-01 0.00365 0.108 0.079 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.94e-01 0.129 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.01e-01 0.112 0.166 0.079 NK L1
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 2.80e-01 0.113 0.104 0.079 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0649 0.0895 0.079 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 1.60e-01 -0.18 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0859 0.127 0.079 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 7.16e-01 0.0368 0.101 0.079 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 1.87e-01 0.141 0.107 0.079 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.31e-01 -0.103 0.164 0.079 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 5.59e-01 0.0772 0.132 0.079 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0102 0.0628 0.079 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.19e-01 0.149 0.121 0.079 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0975 0.124 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 4.16e-01 0.139 0.171 0.077 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 3.65e-02 0.349 0.166 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 4.92e-01 0.116 0.168 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 7.87e-01 0.0235 0.0871 0.077 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0329 0.169 0.077 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 4.82e-01 -0.133 0.189 0.077 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0073 0.148 0.077 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 3.02e-01 0.159 0.153 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 6.20e-02 0.214 0.114 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.63e-01 0.0932 0.161 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 3.22e-01 0.145 0.146 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.46e-01 -0.133 0.115 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 3.91e-01 0.119 0.139 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 2.57e-01 0.185 0.163 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 7.36e-02 0.303 0.168 0.08 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.88e-01 0.137 0.129 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 1.34e-01 0.256 0.17 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 5.35e-02 0.31 0.16 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 4.44e-01 -0.085 0.111 0.08 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 4.13e-01 -0.124 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 4.17e-02 0.335 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 4.59e-02 0.255 0.127 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 6.95e-02 0.197 0.108 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.43e-01 0.103 0.169 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 1.03e-02 0.377 0.145 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0268 0.0857 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 4.01e-01 -0.101 0.12 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 8.22e-01 0.0302 0.134 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.01e-02 0.4 0.154 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0794 0.104 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 1.34e-01 -0.256 0.17 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 1.23e-01 0.192 0.124 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 5.90e-01 0.0672 0.125 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0835 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 3.38e-01 0.155 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 6.78e-01 0.0602 0.145 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.39e-01 0.157 0.133 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 1.53e-01 0.229 0.16 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 8.58e-02 0.279 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 4.80e-01 0.0671 0.0948 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 1.02e-01 0.247 0.15 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 9.86e-02 0.243 0.147 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.87e-01 0.00129 0.0794 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.43e-01 0.109 0.0934 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 1.31e-01 0.226 0.149 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 7.09e-03 0.331 0.122 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 7.77e-01 0.0246 0.0868 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 8.80e-01 0.00963 0.0637 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 2.94e-03 0.331 0.11 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 3.69e-01 0.0997 0.111 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 1.77e-02 0.259 0.108 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.83e-02 0.307 0.161 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 7.34e-02 0.246 0.137 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.85e-01 0.0855 0.0797 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 8.18e-01 0.0209 0.091 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 1.52e-02 0.27 0.11 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 3.92e-01 0.107 0.124 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.04e-01 0.142 0.112 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 8.13e-01 0.038 0.161 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 1.88e-01 0.172 0.13 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 6.26e-01 0.0404 0.0827 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0962 0.128 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 1.59e-01 0.187 0.132 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 3.01e-01 -0.12 0.116 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0102 0.123 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 6.45e-01 0.0735 0.16 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0615 0.154 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 9.73e-01 0.00326 0.0977 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0574 0.138 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0257 0.137 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 5.01e-01 0.0764 0.113 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.47e-01 0.12 0.104 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 4.35e-01 -0.128 0.164 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0207 0.125 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 8.57e-01 0.016 0.0886 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 8.36e-01 0.0217 0.105 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 2.02e-02 0.303 0.129 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 7.16e-01 0.0578 0.159 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 1.36e-01 0.201 0.134 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 9.11e-01 0.0204 0.182 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 8.99e-01 0.0227 0.178 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 9.67e-01 0.00353 0.086 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 3.20e-01 -0.153 0.153 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 2.39e-02 0.354 0.155 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 7.89e-01 0.0394 0.147 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.25e-02 0.351 0.153 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 1.16e-01 0.266 0.169 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 5.64e-01 0.102 0.176 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.28e-01 -0.131 0.108 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 7.58e-01 0.052 0.168 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 8.60e-02 -0.276 0.16 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 4.91e-01 0.081 0.117 0.08 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.06e-01 0.159 0.125 0.08 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0739 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 2.17e-01 0.205 0.165 0.08 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0431 0.0789 0.08 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.30e-01 0.165 0.137 0.08 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 9.02e-01 0.018 0.146 0.08 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 8.76e-01 0.02 0.128 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 8.47e-01 0.027 0.14 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0827 0.167 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 6.45e-01 0.0691 0.15 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.85e-01 -0.102 0.0952 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 6.11e-01 0.0739 0.145 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 1.09e-01 -0.244 0.151 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 5.57e-01 0.0583 0.0991 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.09e-01 0.168 0.133 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 2.95e-01 0.179 0.17 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0222 0.12 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.093 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 3.06e-01 -0.138 0.134 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 1.96e-01 -0.181 0.139 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.37e-02 -0.319 0.128 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 6.09e-01 0.0775 0.151 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0184 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 1.08e-01 0.216 0.134 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 9.72e-01 0.0036 0.103 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.99e-01 -0.171 0.164 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 4.94e-01 -0.114 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.95e-01 0.000599 0.105 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 5.07e-01 0.0889 0.134 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 7.18e-01 0.0595 0.164 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0231 0.125 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.39e-01 -0.11 0.0932 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0641 0.128 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0284 0.141 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.43e-01 -0.275 0.186 0.093 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0979 0.158 0.093 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 7.21e-01 -0.069 0.193 0.093 PB L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0197 0.12 0.093 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 1.05e-01 0.236 0.144 0.093 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 1.41e-01 0.244 0.165 0.093 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0628 0.175 0.093 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 3.95e-01 -0.108 0.127 0.08 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 4.22e-01 -0.107 0.133 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.00e-01 -0.104 0.155 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0428 0.123 0.08 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 9.01e-01 0.00966 0.0776 0.08 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0455 0.15 0.08 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 6.95e-01 0.0592 0.151 0.08 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.18e-01 0.0156 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.37e-01 0.13 0.109 0.079 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 3.96e-01 0.135 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 2.86e-01 0.184 0.172 0.079 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0545 0.0959 0.079 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.80e-01 -0.112 0.104 0.079 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0938 0.146 0.079 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.75e-01 0.175 0.128 0.076 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 9.56e-01 0.00634 0.114 0.076 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 2.67e-01 0.185 0.167 0.076 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0017 0.127 0.076 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00655 0.149 0.076 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.32e-01 0.156 0.13 0.076 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 7.58e-01 0.0511 0.166 0.076 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 2.76e-01 0.186 0.17 0.076 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 3.47e-01 0.0831 0.0881 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0493 0.0869 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 6.43e-02 0.293 0.157 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 6.37e-01 0.0448 0.095 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 3.88e-02 0.281 0.135 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 1.12e-02 0.249 0.0973 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00838 0.101 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 8.01e-01 0.032 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.11e-01 0.163 0.102 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.64e-01 -0.107 0.0952 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.22e-01 0.105 0.164 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 6.17e-01 0.0457 0.0911 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 7.12e-01 0.0566 0.153 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0471 0.124 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 6.58e-01 -0.058 0.131 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 2.24e-01 -0.155 0.127 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.82e-01 -0.223 0.167 0.064 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 4.60e-01 0.148 0.199 0.064 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 5.91e-01 0.115 0.212 0.064 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00273 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 6.64e-01 0.0449 0.103 0.064 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.05e-01 -0.276 0.217 0.064 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 1.75e-01 0.253 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 2.00e-01 0.139 0.108 0.082 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0489 0.108 0.082 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0617 0.147 0.082 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.99e-01 0.0976 0.0938 0.082 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0342 0.144 0.082 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0533 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 2.13e-01 0.174 0.14 0.082 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 1.21e-01 0.25 0.161 0.082 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 6.58e-02 0.238 0.128 0.079 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 8.01e-01 0.023 0.0907 0.079 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 7.56e-01 0.0499 0.16 0.079 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.90e-02 0.249 0.113 0.079 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 4.93e-02 0.277 0.14 0.079 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.72e-01 -0.163 0.148 0.079 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0137 0.143 0.079 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 5.09e-01 0.0999 0.151 0.079 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 4.21e-01 0.117 0.145 0.088 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 5.94e-01 0.0709 0.133 0.088 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 8.74e-01 0.0253 0.16 0.088 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 6.99e-01 -0.052 0.134 0.088 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 6.91e-02 0.202 0.11 0.088 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 1.33e-01 0.267 0.177 0.088 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 6.79e-02 -0.248 0.135 0.088 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 3.41e-01 0.157 0.164 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.00e-02 0.228 0.134 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 4.33e-02 0.221 0.108 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 2.11e-01 0.194 0.155 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 3.29e-02 0.307 0.143 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 2.25e-01 -0.116 0.095 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 9.43e-01 0.00903 0.126 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 5.26e-02 0.311 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.58e-03 0.346 0.132 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 1.94e-01 0.129 0.0992 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 4.95e-01 -0.112 0.163 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 1.57e-02 0.352 0.144 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0225 0.0769 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0817 0.113 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 4.87e-01 0.0952 0.137 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 1.80e-01 0.12 0.0896 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 4.19e-01 -0.068 0.0841 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 1.73e-01 0.22 0.161 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 4.05e-01 0.0693 0.0831 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 3.84e-01 0.126 0.144 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 1.39e-01 0.144 0.097 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0328 0.0997 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0144 0.116 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 2.38e-01 0.125 0.106 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 7.70e-01 0.0237 0.0809 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00401 0.16 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 4.18e-01 0.0803 0.0989 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 925223 sc-eQTL 8.34e-01 0.0325 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 3.11e-02 -0.273 0.126 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 5.37e-01 0.082 0.133 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 691997 sc-eQTL 1.01e-01 0.247 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.102 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -927489 sc-eQTL 2.25e-01 0.154 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 653478 sc-eQTL 2.25e-01 0.209 0.172 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -631377 sc-eQTL 3.18e-01 0.107 0.107 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -391172 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0856 0.0928 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 683565 sc-eQTL 2.02e-01 -0.16 0.125 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -392191 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0921 0.13 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 256593 pQTL 0.0411 0.0546 0.0267 0.0 0.0 0.0907
ENSG00000135525 MAP7 925223 eQTL 0.0243 -0.0901 0.0399 0.00127 0.0 0.0927

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 553741 1.07e-06 4.24e-07 6.28e-08 3.56e-07 1.02e-07 1.71e-07 6.09e-07 7.52e-08 8.36e-07 2.98e-07 1.73e-06 2.55e-07 1.02e-06 1.1e-07 1.5e-07 1.76e-07 4.63e-08 2.93e-07 7.11e-08 4.1e-08 1.39e-07 4.38e-07 4.2e-07 3.17e-08 1.16e-06 1.21e-07 1.37e-07 2.24e-07 3.86e-07 3.71e-07 6.18e-07 3.95e-08 3.16e-08 1.23e-07 2.55e-07 2.79e-08 5.01e-08 9.62e-08 6.55e-08 3.01e-08 3.34e-08 7.45e-07 2.67e-08 1.8e-07 4.92e-08 2.07e-08 1.24e-07 1.88e-09 4.74e-08
ENSG00000226004 \N -469760 1.25e-06 6.65e-07 7.45e-08 4.29e-07 1.07e-07 2.63e-07 8.7e-07 1.37e-07 1.2e-06 3.24e-07 2.02e-06 4.21e-07 1.47e-06 1.84e-07 3.15e-07 2.89e-07 9.3e-08 3.74e-07 9.71e-08 4.8e-08 1.68e-07 7.26e-07 5.81e-07 3.59e-08 1.71e-06 1.26e-07 2.08e-07 3.78e-07 5.78e-07 6.42e-07 8.51e-07 3.95e-08 4.02e-08 1.9e-07 3.55e-07 3.94e-08 5.45e-08 9.36e-08 6.58e-08 3.55e-08 4.6e-08 1.34e-06 6.04e-08 1.8e-07 2.82e-08 7.36e-08 1.21e-07 1.98e-09 4.85e-08