logo

Genes within 1Mb (chr6:137454572:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.07e-03 0.366 0.122 0.081 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.41e-01 0.144 0.0973 0.081 B L1
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 3.90e-01 -0.127 0.147 0.081 B L1
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0344 0.0976 0.081 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0504 0.0786 0.081 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000704 0.11 0.081 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 2.41e-01 0.145 0.123 0.081 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 8.25e-01 0.0186 0.0841 0.081 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 8.86e-02 0.164 0.0958 0.081 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.50e-03 0.359 0.133 0.081 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 5.66e-03 0.25 0.0893 0.081 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 8.93e-01 0.0115 0.0852 0.081 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.59e-01 0.0596 0.0648 0.081 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 2.36e-02 0.241 0.106 0.081 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 6.94e-01 0.0375 0.0952 0.081 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.102 0.081 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0781 0.159 0.081 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0235 0.104 0.081 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0319 0.0801 0.081 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0231 0.0847 0.081 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 2.74e-01 0.129 0.117 0.081 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 2.17e-01 0.143 0.115 0.079 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00943 0.11 0.079 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.40e-01 0.0542 0.163 0.079 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0713 0.124 0.079 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 8.50e-01 0.0253 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.85e-01 0.112 0.128 0.079 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 5.90e-01 -0.068 0.126 0.079 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.079 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 1.47e-01 0.137 0.094 0.081 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0573 0.0766 0.081 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 1.36e-01 0.237 0.158 0.081 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 4.11e-01 0.0659 0.08 0.081 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 6.09e-01 0.0717 0.14 0.081 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 6.03e-01 0.0487 0.0935 0.081 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0614 0.0992 0.081 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 8.70e-01 0.0185 0.113 0.081 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 8.09e-01 0.0258 0.107 0.082 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 4.94e-01 0.0838 0.122 0.082 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 5.53e-01 0.0978 0.165 0.082 NK L1
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 3.90e-01 0.0893 0.104 0.082 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0682 0.0888 0.082 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.21e-01 -0.156 0.127 0.082 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0878 0.126 0.082 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 5.81e-01 0.0549 0.0993 0.081 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 2.17e-01 0.13 0.105 0.081 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 5.41e-01 -0.099 0.162 0.081 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 8.01e-01 0.0329 0.13 0.081 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0287 0.0618 0.081 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 8.44e-02 0.206 0.119 0.081 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 3.58e-01 -0.113 0.123 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.65e-01 0.152 0.168 0.079 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 5.72e-02 0.312 0.163 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.24e-01 0.0584 0.165 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0134 0.0855 0.079 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.47e-01 -0.1 0.166 0.079 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00363 0.186 0.079 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0257 0.145 0.079 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.15e-01 0.153 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.01e-01 0.187 0.113 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 3.50e-01 0.149 0.159 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 3.91e-01 0.124 0.145 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 1.45e-01 -0.166 0.113 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.34e-01 0.133 0.137 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 3.26e-01 0.159 0.161 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 6.48e-02 0.308 0.166 0.082 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 1.46e-01 0.245 0.168 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 2.78e-02 0.348 0.157 0.082 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 2.79e-01 -0.118 0.109 0.082 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0493 0.149 0.082 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 1.35e-02 0.4 0.16 0.082 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 1.94e-02 0.295 0.125 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.05e-01 0.175 0.107 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.61e-01 0.0734 0.167 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 2.21e-02 0.333 0.144 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0436 0.0848 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.81e-01 -0.129 0.119 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 9.16e-01 0.0141 0.133 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.77e-03 0.445 0.152 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0562 0.103 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 2.26e-01 -0.205 0.169 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 9.67e-02 0.205 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.89e-01 0.0668 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 6.27e-01 -0.064 0.131 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 2.72e-01 0.175 0.159 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 9.38e-01 0.0111 0.143 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.82e-01 0.176 0.132 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 1.28e-01 0.241 0.158 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 5.05e-02 0.314 0.159 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 7.95e-01 0.0244 0.0939 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 5.35e-02 0.288 0.148 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 8.86e-02 0.248 0.145 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 8.98e-01 0.0101 0.0791 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 2.55e-01 0.106 0.0931 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.93e-02 0.271 0.148 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 2.55e-03 0.368 0.121 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 8.53e-01 -0.016 0.0865 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 5.41e-01 0.0388 0.0635 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 5.67e-03 0.307 0.11 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.04e-01 0.113 0.109 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 4.44e-02 0.217 0.107 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 2.93e-02 0.349 0.159 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 1.34e-01 0.203 0.135 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 3.35e-01 0.0761 0.0788 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 5.88e-01 0.0487 0.0899 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 2.98e-02 0.239 0.109 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.35e-01 0.12 0.124 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.98e-01 0.144 0.111 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0502 0.16 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 1.01e-01 0.212 0.129 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 8.82e-01 0.0122 0.0824 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0849 0.127 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 1.79e-01 0.177 0.132 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 2.98e-01 -0.12 0.115 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 6.58e-01 -0.054 0.122 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.97e-01 0.0617 0.158 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 5.09e-01 -0.101 0.152 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0547 0.0967 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00766 0.137 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0329 0.136 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 4.06e-01 0.0934 0.112 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.69e-01 0.142 0.103 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 2.57e-01 -0.185 0.162 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0862 0.124 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0245 0.0878 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 4.38e-01 0.0807 0.104 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 8.36e-02 0.224 0.129 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 4.02e-01 0.131 0.156 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.78e-01 0.179 0.133 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0259 0.18 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 9.59e-01 0.00895 0.176 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 9.59e-01 0.00436 0.0848 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0578 0.151 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 5.44e-02 0.297 0.154 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 4.72e-01 0.104 0.145 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 3.42e-02 0.321 0.15 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 1.31e-01 0.251 0.166 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 6.16e-01 0.0871 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 1.74e-01 -0.145 0.106 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 7.62e-01 0.05 0.165 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 2.55e-02 -0.352 0.157 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 5.95e-01 0.0616 0.116 0.082 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 2.11e-01 0.155 0.123 0.082 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0604 0.157 0.082 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 2.25e-01 0.199 0.163 0.082 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0528 0.0778 0.082 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 9.77e-02 0.224 0.135 0.082 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00955 0.144 0.082 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 5.49e-01 0.0757 0.126 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0257 0.138 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 3.54e-01 -0.153 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 8.11e-01 0.0354 0.147 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 1.56e-01 -0.133 0.0936 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 5.67e-01 0.082 0.143 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 1.39e-01 -0.222 0.149 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.90e-01 0.0846 0.0981 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 2.68e-01 0.147 0.132 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 2.54e-01 0.193 0.169 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0413 0.119 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 1.63e-01 -0.129 0.0922 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.23e-01 -0.132 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 1.96e-01 -0.179 0.138 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 2.59e-02 -0.284 0.126 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 9.49e-01 0.00956 0.148 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0849 0.163 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 2.30e-01 0.158 0.132 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 9.11e-01 0.0113 0.102 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.62e-01 -0.147 0.161 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0593 0.164 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 8.56e-01 0.0187 0.103 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 9.29e-01 0.0118 0.132 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.29e-01 0.0783 0.162 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 7.88e-01 -0.033 0.123 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 2.08e-01 -0.116 0.0918 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0114 0.127 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0719 0.139 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 2.03e-01 -0.235 0.184 0.096 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 3.81e-01 -0.136 0.155 0.096 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0646 0.19 0.096 PB L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 6.62e-01 -0.052 0.119 0.096 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 1.53e-01 0.205 0.143 0.096 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 1.03e-01 0.266 0.162 0.096 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 5.49e-01 -0.104 0.173 0.096 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 3.93e-01 -0.107 0.125 0.083 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 4.19e-01 -0.106 0.131 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0761 0.152 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0996 0.121 0.083 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0243 0.0763 0.083 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0225 0.148 0.083 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 6.56e-01 0.066 0.148 0.083 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 4.86e-01 0.105 0.15 0.081 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 3.03e-01 0.112 0.109 0.081 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 6.54e-01 0.0712 0.159 0.081 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 2.57e-01 0.195 0.171 0.081 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0713 0.0955 0.081 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.34e-01 -0.1 0.103 0.081 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 3.44e-01 -0.138 0.146 0.081 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 1.76e-01 0.172 0.127 0.078 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0208 0.112 0.078 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 4.19e-01 0.133 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0533 0.125 0.078 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0466 0.147 0.078 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.56e-01 0.147 0.129 0.078 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 6.88e-01 0.0656 0.163 0.078 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 5.64e-01 0.0971 0.168 0.078 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 2.23e-01 0.106 0.0869 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0458 0.0859 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 5.08e-02 0.305 0.155 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 7.79e-01 0.0263 0.0939 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 4.95e-02 0.265 0.134 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.22e-02 0.222 0.0964 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0185 0.1 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 8.88e-01 0.0177 0.126 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 7.79e-02 0.178 0.1 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 2.67e-01 -0.104 0.094 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 2.99e-01 0.169 0.162 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 7.79e-01 0.0252 0.0899 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 8.80e-01 0.0229 0.151 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0577 0.122 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 9.20e-01 -0.013 0.129 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 2.42e-01 -0.147 0.126 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 2.80e-01 -0.178 0.164 0.064 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 1.75e-01 0.266 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.15e-01 0.0765 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0253 0.182 0.064 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 9.50e-01 0.0064 0.101 0.064 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.54e-01 -0.244 0.214 0.064 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 1.42e-01 0.269 0.182 0.064 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 1.45e-01 0.157 0.107 0.084 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 3.43e-01 -0.102 0.107 0.084 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0822 0.145 0.084 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.06e-01 0.0621 0.0931 0.084 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000998 0.143 0.084 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0852 0.152 0.084 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 1.68e-01 0.192 0.138 0.084 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 1.08e-01 0.257 0.159 0.084 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 8.94e-02 0.217 0.127 0.081 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 7.90e-01 0.024 0.0899 0.081 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 9.05e-01 0.0189 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 8.04e-02 0.198 0.113 0.081 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 8.33e-02 0.242 0.139 0.081 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.17e-01 -0.148 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00846 0.142 0.081 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 5.34e-01 0.0933 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 4.74e-01 0.103 0.143 0.09 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 6.97e-01 0.0512 0.131 0.09 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 7.47e-01 0.051 0.158 0.09 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0735 0.133 0.09 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 1.11e-01 0.176 0.109 0.09 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 1.39e-01 0.261 0.175 0.09 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 1.08e-01 -0.217 0.134 0.09 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 2.36e-01 0.193 0.162 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 1.36e-01 0.199 0.133 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 5.85e-02 0.204 0.107 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 1.82e-01 0.205 0.153 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 2.21e-02 0.325 0.141 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 1.53e-01 -0.135 0.0938 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 6.20e-01 0.0619 0.125 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 4.33e-02 0.321 0.158 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 4.17e-03 0.378 0.13 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.0983 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 5.28e-01 -0.102 0.162 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 1.52e-02 0.35 0.143 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0422 0.0761 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.111 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 5.47e-01 0.0818 0.135 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 9.04e-02 0.15 0.0882 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 3.60e-01 -0.076 0.083 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 1.04e-01 0.259 0.158 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 4.87e-01 0.0572 0.082 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 5.14e-01 0.093 0.142 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.33e-01 0.115 0.0959 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0221 0.0984 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0284 0.115 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 2.09e-01 0.132 0.104 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 9.57e-01 0.00435 0.0799 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0262 0.158 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0978 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 903753 sc-eQTL 6.48e-01 0.0699 0.153 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.60e-02 -0.278 0.124 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 4.14e-01 0.107 0.131 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 670527 sc-eQTL 1.16e-01 0.234 0.148 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 sc-eQTL 7.32e-01 0.0347 0.101 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -948959 sc-eQTL 3.79e-01 0.11 0.125 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 632008 sc-eQTL 2.35e-01 0.203 0.17 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -652847 sc-eQTL 4.34e-01 0.0829 0.106 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -412642 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0868 0.092 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 662095 sc-eQTL 2.53e-01 -0.142 0.124 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -413661 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0866 0.129 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 235123 pQTL 0.0287 0.0583 0.0266 0.0 0.0 0.09
ENSG00000135525 MAP7 903753 eQTL 0.0189 -0.0935 0.0398 0.00145 0.0 0.0918

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 532271 5.74e-07 2.67e-07 9.16e-08 2.61e-07 1.05e-07 1.54e-07 3.57e-07 9.78e-08 2.76e-07 1.65e-07 3.25e-07 2.55e-07 4.34e-07 9.15e-08 1.27e-07 1.63e-07 1.17e-07 2.93e-07 1.27e-07 8.25e-08 1.6e-07 2.51e-07 2.48e-07 1.03e-07 3.98e-07 2.13e-07 1.87e-07 1.7e-07 2.11e-07 2.75e-07 1.86e-07 6.04e-08 4.93e-08 1.21e-07 1.76e-07 5.51e-08 6.67e-08 6.67e-08 5.89e-08 7.77e-08 2.87e-08 2.6e-07 2.32e-08 1.14e-08 7.89e-08 8.76e-09 9.83e-08 2.8e-09 5.52e-08
ENSG00000226004 \N -491230 7.23e-07 3.47e-07 9.89e-08 3.19e-07 1.06e-07 1.71e-07 4.42e-07 1.31e-07 3.51e-07 2.12e-07 4.39e-07 3.36e-07 5.62e-07 1.01e-07 1.57e-07 2e-07 2.07e-07 3.39e-07 1.69e-07 1.24e-07 1.91e-07 3.1e-07 3.02e-07 1.27e-07 4.88e-07 2.46e-07 2.52e-07 1.95e-07 2.76e-07 4.1e-07 2.11e-07 7.71e-08 5.38e-08 1.25e-07 2.7e-07 6.94e-08 9.52e-08 7.66e-08 4.17e-08 5.88e-08 5.38e-08 3.26e-07 2.67e-08 2.06e-08 9.95e-08 1.37e-08 8.24e-08 3.25e-09 5.56e-08