Genes within 1Mb (chr6:137453612:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 4.77e-01 0.0635 0.089 0.216 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0226 0.0699 0.216 B L1
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 4.35e-01 0.0825 0.105 0.216 B L1
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 2.54e-01 0.0796 0.0696 0.216 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0647 0.0561 0.216 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 2.49e-02 0.175 0.0775 0.216 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 1.48e-01 0.128 0.0881 0.216 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 9.35e-01 0.00486 0.0592 0.216 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.80e-01 -0.019 0.0679 0.216 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0354 0.0953 0.216 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0964 0.0637 0.216 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0385 0.0599 0.216 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.63e-01 0.0637 0.0455 0.216 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 2.40e-01 0.0887 0.0753 0.216 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 2.12e-01 -0.085 0.0678 0.216 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0185 0.0729 0.216 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00164 0.114 0.216 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 4.76e-01 0.053 0.0742 0.216 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 6.61e-01 0.0251 0.0573 0.216 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.96e-01 0.0783 0.0603 0.216 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 6.70e-01 0.0359 0.0841 0.216 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 1.17e-01 -0.132 0.0838 0.218 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0795 0.218 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 1.56e-01 -0.168 0.118 0.218 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0385 0.09 0.218 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0842 0.0974 0.218 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0451 0.0934 0.218 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0953 0.0915 0.218 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0628 0.122 0.218 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 4.19e-01 0.0559 0.0691 0.216 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0632 0.056 0.216 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 8.18e-01 0.0269 0.116 0.216 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0652 0.0585 0.216 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 5.54e-01 0.0608 0.103 0.216 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 3.10e-02 0.147 0.0677 0.216 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 6.30e-01 -0.035 0.0727 0.216 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0197 0.0829 0.216 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 1.75e-01 -0.105 0.0773 0.215 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 6.17e-01 0.0446 0.0888 0.215 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0671 0.12 0.215 NK L1
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0345 0.0754 0.215 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 6.76e-01 0.027 0.0646 0.215 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 3.16e-01 0.0928 0.0923 0.215 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 3.18e-01 0.0914 0.0913 0.215 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 7.82e-01 0.0196 0.0705 0.216 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 9.88e-01 0.0011 0.0748 0.216 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 8.24e-01 0.0255 0.115 0.216 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0114 0.0923 0.216 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0158 0.0439 0.216 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.71e-01 0.116 0.0844 0.216 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 8.31e-02 0.151 0.0865 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 2.74e-01 -0.131 0.119 0.222 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 4.28e-02 -0.237 0.116 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 4.29e-01 0.0932 0.118 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 4.98e-01 0.0414 0.0609 0.222 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0322 0.118 0.222 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 3.29e-01 0.129 0.132 0.222 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0139 0.103 0.222 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0133 0.106 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 6.56e-01 0.0354 0.0794 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 9.75e-01 0.00344 0.111 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 2.17e-01 -0.125 0.101 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 1.55e-01 -0.113 0.0789 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 3.00e-01 0.0992 0.0956 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 4.45e-01 0.0859 0.112 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 2.48e-01 -0.133 0.115 0.218 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0678 0.0876 0.218 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 2.91e-01 0.123 0.116 0.218 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 4.31e-02 0.22 0.108 0.218 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 6.51e-01 0.0341 0.0752 0.218 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0321 0.103 0.218 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 3.43e-01 0.106 0.112 0.218 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 1.93e-01 0.118 0.0902 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0315 0.0771 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.31e-01 0.0412 0.12 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 9.99e-01 0.000189 0.105 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0144 0.0606 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 2.10e-01 0.107 0.0849 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 8.29e-02 0.164 0.0943 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 3.35e-01 0.106 0.11 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 8.15e-01 0.0171 0.0729 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0727 0.12 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 2.70e-01 0.0966 0.0874 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 1.60e-01 -0.123 0.0872 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 8.78e-01 0.0143 0.0932 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 3.11e-01 0.115 0.113 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0751 0.105 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.28e-01 0.0336 0.0966 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0465 0.116 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 7.08e-01 0.0441 0.118 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 8.69e-01 0.0113 0.0687 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 4.96e-01 0.0747 0.109 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 3.18e-01 0.107 0.107 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0435 0.0567 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0217 0.0669 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0192 0.0884 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00867 0.062 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 6.34e-01 0.0217 0.0455 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 4.10e-01 0.0663 0.0802 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 7.32e-01 0.0273 0.0796 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0228 0.0787 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 4.08e-01 0.0967 0.117 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 1.13e-01 -0.156 0.0982 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 8.67e-01 -0.00961 0.0573 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 2.22e-01 0.0797 0.0651 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 7.84e-02 0.141 0.0798 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 5.92e-01 0.0483 0.09 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0586 0.0809 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0521 0.116 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 1.80e-01 -0.126 0.0938 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0525 0.0597 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 4.53e-01 0.0693 0.0923 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 2.82e-01 0.103 0.0957 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 1.78e-01 -0.11 0.0816 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 6.49e-01 0.0396 0.0868 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 9.91e-01 0.00129 0.113 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 1.27e-01 0.165 0.108 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0741 0.0688 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.26e-01 0.149 0.0968 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 6.14e-01 0.0489 0.0969 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0307 0.0799 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0271 0.0732 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0636 0.116 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0286 0.088 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 6.39e-01 0.0293 0.0625 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.01e-01 0.121 0.0736 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 4.01e-01 0.0776 0.0923 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 7.09e-01 0.0395 0.106 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 4.29e-01 0.0712 0.0898 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 6.46e-01 0.0558 0.121 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 9.60e-01 0.00596 0.119 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0175 0.0573 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0121 0.102 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 5.90e-01 0.0566 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 9.98e-01 0.000261 0.103 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 5.40e-01 0.066 0.108 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0453 0.118 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0578 0.123 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 1.84e-01 0.1 0.0753 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 2.70e-01 0.129 0.117 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 9.43e-01 0.00799 0.112 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 8.90e-01 0.0113 0.0822 0.216 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 4.33e-01 0.0689 0.0877 0.216 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 8.70e-01 0.0182 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 7.54e-01 0.0365 0.116 0.216 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 9.48e-01 0.00358 0.0553 0.216 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 9.55e-02 0.16 0.0957 0.216 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 3.64e-01 0.0929 0.102 0.216 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 9.85e-03 -0.239 0.0918 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 8.52e-01 0.019 0.102 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.30e-01 0.042 0.122 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 4.79e-01 0.0772 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 6.73e-01 0.0293 0.0695 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 5.28e-02 0.204 0.105 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 5.18e-01 0.0717 0.111 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0524 0.0726 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 9.06e-01 0.0116 0.0981 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0172 0.125 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0176 0.088 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 5.19e-01 0.0441 0.0683 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 7.06e-02 0.178 0.0977 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 6.66e-01 0.0443 0.102 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0157 0.0934 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 5.74e-01 0.0609 0.108 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 2.65e-01 -0.132 0.118 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 1.65e-01 0.134 0.0958 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 1.34e-01 0.111 0.0736 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.88e-01 0.155 0.117 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 2.87e-01 0.127 0.119 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0957 0.0749 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 9.08e-01 0.0111 0.0961 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 8.48e-01 0.0227 0.118 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 3.09e-02 -0.192 0.0886 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0227 0.0671 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 6.74e-01 0.0389 0.0922 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0155 0.101 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 3.79e-01 0.116 0.131 0.237 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00847 0.11 0.237 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0077 0.135 0.237 PB L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00641 0.0841 0.237 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0233 0.102 0.237 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 5.23e-01 0.0743 0.116 0.237 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 1.29e-01 -0.186 0.121 0.237 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 9.29e-02 -0.16 0.0949 0.217 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 9.24e-01 0.00953 0.0998 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0999 0.116 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0991 0.092 0.217 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0679 0.058 0.217 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 4.57e-01 0.0839 0.113 0.217 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0847 0.113 0.217 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0689 0.107 0.216 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 5.30e-01 0.0487 0.0775 0.216 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 3.60e-01 0.103 0.113 0.216 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 1.38e-01 -0.181 0.121 0.216 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0202 0.0679 0.216 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0193 0.0736 0.216 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 7.28e-01 0.036 0.104 0.216 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0606 0.0956 0.22 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0218 0.0842 0.22 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 6.59e-02 -0.227 0.123 0.22 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 9.05e-01 0.0113 0.0943 0.22 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 3.22e-01 -0.109 0.11 0.22 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0857 0.0969 0.22 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 3.02e-01 -0.127 0.123 0.22 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 1.29e-01 -0.191 0.126 0.22 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 4.18e-01 0.0523 0.0645 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0547 0.0636 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.63e-01 0.0351 0.116 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0769 0.0694 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 8.45e-01 0.0196 0.1 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 2.95e-01 0.0757 0.0721 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 8.76e-01 0.0116 0.0743 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 3.44e-01 -0.088 0.0928 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0105 0.0748 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0224 0.0697 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 9.60e-01 0.00602 0.12 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0211 0.0665 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0289 0.112 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 9.78e-02 0.149 0.0898 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 6.51e-01 0.0432 0.0954 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 4.45e-01 0.0711 0.093 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0751 0.108 0.218 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0649 0.128 0.218 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 1.12e-01 0.216 0.135 0.218 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 5.96e-01 0.0634 0.119 0.218 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.41e-01 0.022 0.0663 0.218 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 7.15e-01 0.0513 0.14 0.218 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 7.01e-02 0.217 0.119 0.218 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 9.44e-01 0.00555 0.0795 0.213 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0926 0.079 0.213 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0407 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 1.00e+00 7.56e-06 0.0687 0.213 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 1.71e-01 0.144 0.105 0.213 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 4.34e-01 0.0875 0.112 0.213 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.213 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 1.59e-02 -0.283 0.116 0.213 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0955 0.0957 0.208 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 9.89e-02 -0.111 0.0668 0.208 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.75e-01 0.034 0.119 0.208 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 2.95e-02 -0.184 0.0839 0.208 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0427 0.105 0.208 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 2.90e-02 0.24 0.109 0.208 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 2.16e-01 -0.131 0.106 0.208 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 7.56e-01 0.0348 0.112 0.208 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 2.14e-01 -0.136 0.109 0.22 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 1.30e-02 -0.247 0.0984 0.22 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 2.01e-01 0.154 0.12 0.22 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0568 0.101 0.22 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 5.61e-01 0.049 0.0841 0.22 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 8.64e-01 0.0232 0.135 0.22 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0703 0.103 0.22 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 5.53e-01 0.0738 0.124 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0395 0.0948 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0261 0.0769 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 6.90e-01 0.0435 0.109 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 5.32e-01 0.0633 0.101 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 5.66e-02 -0.127 0.0664 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.70e-01 0.122 0.0882 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 8.67e-01 -0.019 0.113 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 2.09e-01 0.12 0.0949 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00161 0.0706 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.86e-01 0.0315 0.116 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 7.70e-01 0.0304 0.104 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0358 0.0545 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 1.68e-01 0.11 0.0795 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 6.43e-02 0.179 0.0963 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 3.34e-01 0.063 0.065 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0524 0.0609 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 7.39e-01 0.039 0.117 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0537 0.0602 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0212 0.105 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 6.50e-02 0.13 0.0701 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 9.62e-01 0.00344 0.0722 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 8.05e-01 0.0207 0.0841 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0278 0.0771 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 4.35e-02 -0.118 0.0583 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0494 0.116 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0524 0.072 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 902793 sc-eQTL 4.08e-01 0.0931 0.112 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 4.00e-02 0.189 0.0915 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 1.96e-01 -0.125 0.0962 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 669567 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0749 0.11 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 234163 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0622 0.0734 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -949919 sc-eQTL 5.95e-01 0.0485 0.0912 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 631048 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0748 0.124 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -653807 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0617 0.0768 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -413602 sc-eQTL 7.35e-01 0.0227 0.067 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 sc-eQTL 3.12e-01 0.0915 0.0903 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -414621 sc-eQTL 2.36e-01 0.111 0.0935 0.216 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135525 MAP7 902793 eQTL 0.0102 0.068 0.0264 0.00167 0.0 0.272
ENSG00000197442 MAP3K5 661135 eQTL 0.000919 0.0456 0.0137 0.00318 0.0 0.272
ENSG00000226004 AL591468.1 -492190 eQTL 0.0271 -0.0557 0.0251 0.0 0.0 0.272


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -949919 2.67e-07 1.3e-07 5.03e-08 1.81e-07 9.25e-08 9.9e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.08e-07 1.52e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.5e-08 4.01e-08 1.33e-07 6.07e-08 4.23e-08 1.21e-07 1.26e-07 1.45e-07 3.03e-08 1.5e-07 1.25e-07 1.13e-07 9.61e-08 1.16e-07 1.07e-07 1.02e-07 3.66e-08 3.66e-08 8e-08 7.02e-08 3.04e-08 5.04e-08 9.36e-08 6.63e-08 3.76e-08 5.34e-08 1.36e-07 5.21e-08 3.16e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.19e-07 3.78e-09 5.04e-08
ENSG00000135525 MAP7 902793 2.8e-07 1.34e-07 5.35e-08 1.82e-07 9.24e-08 9.48e-08 1.67e-07 5.75e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.11e-07 1.53e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.74e-08 4.24e-08 1.4e-07 6.32e-08 4.3e-08 1.22e-07 1.25e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.22e-07 1.18e-07 9.74e-08 1.23e-07 1e-07 1.06e-07 3.06e-08 3.96e-08 8.23e-08 5.99e-08 2.99e-08 5.29e-08 8.63e-08 6.71e-08 3.86e-08 5.24e-08 1.4e-07 5.24e-08 2.63e-08 4.25e-08 1.87e-08 1.2e-07 1.88e-09 5.01e-08