logo

Genes within 1Mb (chr6:137447910:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.07e-03 0.366 0.122 0.081 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.41e-01 0.144 0.0973 0.081 B L1
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 3.90e-01 -0.127 0.147 0.081 B L1
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0344 0.0976 0.081 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0504 0.0786 0.081 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000704 0.11 0.081 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 2.41e-01 0.145 0.123 0.081 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 8.25e-01 0.0186 0.0841 0.081 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 8.86e-02 0.164 0.0958 0.081 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.50e-03 0.359 0.133 0.081 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 5.66e-03 0.25 0.0893 0.081 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 8.93e-01 0.0115 0.0852 0.081 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.59e-01 0.0596 0.0648 0.081 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 2.36e-02 0.241 0.106 0.081 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 6.94e-01 0.0375 0.0952 0.081 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.102 0.081 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0781 0.159 0.081 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0235 0.104 0.081 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0319 0.0801 0.081 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0231 0.0847 0.081 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 2.74e-01 0.129 0.117 0.081 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 2.17e-01 0.143 0.115 0.079 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00943 0.11 0.079 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.40e-01 0.0542 0.163 0.079 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0713 0.124 0.079 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 8.50e-01 0.0253 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.85e-01 0.112 0.128 0.079 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 5.90e-01 -0.068 0.126 0.079 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.079 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 1.47e-01 0.137 0.094 0.081 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0573 0.0766 0.081 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 1.36e-01 0.237 0.158 0.081 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 4.11e-01 0.0659 0.08 0.081 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 6.09e-01 0.0717 0.14 0.081 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 6.03e-01 0.0487 0.0935 0.081 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0614 0.0992 0.081 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 8.70e-01 0.0185 0.113 0.081 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 8.09e-01 0.0258 0.107 0.082 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 4.94e-01 0.0838 0.122 0.082 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 5.53e-01 0.0978 0.165 0.082 NK L1
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 3.90e-01 0.0893 0.104 0.082 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0682 0.0888 0.082 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.21e-01 -0.156 0.127 0.082 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0878 0.126 0.082 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 5.81e-01 0.0549 0.0993 0.081 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 2.17e-01 0.13 0.105 0.081 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 5.41e-01 -0.099 0.162 0.081 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 8.01e-01 0.0329 0.13 0.081 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0287 0.0618 0.081 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 8.44e-02 0.206 0.119 0.081 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 3.58e-01 -0.113 0.123 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.65e-01 0.152 0.168 0.079 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 5.72e-02 0.312 0.163 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.24e-01 0.0584 0.165 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0134 0.0855 0.079 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.47e-01 -0.1 0.166 0.079 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00363 0.186 0.079 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0257 0.145 0.079 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.15e-01 0.153 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.01e-01 0.187 0.113 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 3.50e-01 0.149 0.159 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 3.91e-01 0.124 0.145 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 1.45e-01 -0.166 0.113 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.34e-01 0.133 0.137 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 3.26e-01 0.159 0.161 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 6.48e-02 0.308 0.166 0.082 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 1.46e-01 0.245 0.168 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 2.78e-02 0.348 0.157 0.082 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 2.79e-01 -0.118 0.109 0.082 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0493 0.149 0.082 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 1.35e-02 0.4 0.16 0.082 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 1.94e-02 0.295 0.125 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.05e-01 0.175 0.107 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.61e-01 0.0734 0.167 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 2.21e-02 0.333 0.144 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0436 0.0848 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.81e-01 -0.129 0.119 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 9.16e-01 0.0141 0.133 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.77e-03 0.445 0.152 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0562 0.103 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 2.26e-01 -0.205 0.169 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 9.67e-02 0.205 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.89e-01 0.0668 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 6.27e-01 -0.064 0.131 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 2.72e-01 0.175 0.159 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 9.38e-01 0.0111 0.143 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.82e-01 0.176 0.132 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 1.28e-01 0.241 0.158 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 5.05e-02 0.314 0.159 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 7.95e-01 0.0244 0.0939 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 5.35e-02 0.288 0.148 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 8.86e-02 0.248 0.145 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 8.98e-01 0.0101 0.0791 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 2.55e-01 0.106 0.0931 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.93e-02 0.271 0.148 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 2.55e-03 0.368 0.121 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 8.53e-01 -0.016 0.0865 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 5.41e-01 0.0388 0.0635 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 5.67e-03 0.307 0.11 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.04e-01 0.113 0.109 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 4.44e-02 0.217 0.107 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 2.93e-02 0.349 0.159 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 1.34e-01 0.203 0.135 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 3.35e-01 0.0761 0.0788 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 5.88e-01 0.0487 0.0899 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 2.98e-02 0.239 0.109 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.35e-01 0.12 0.124 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.98e-01 0.144 0.111 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0502 0.16 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 1.01e-01 0.212 0.129 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 8.82e-01 0.0122 0.0824 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0849 0.127 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 1.79e-01 0.177 0.132 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 2.98e-01 -0.12 0.115 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 6.58e-01 -0.054 0.122 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.97e-01 0.0617 0.158 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 5.09e-01 -0.101 0.152 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0547 0.0967 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00766 0.137 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0329 0.136 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 4.06e-01 0.0934 0.112 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.69e-01 0.142 0.103 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 2.57e-01 -0.185 0.162 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0862 0.124 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0245 0.0878 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 4.38e-01 0.0807 0.104 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 8.36e-02 0.224 0.129 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 4.02e-01 0.131 0.156 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.78e-01 0.179 0.133 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0259 0.18 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 9.59e-01 0.00895 0.176 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 9.59e-01 0.00436 0.0848 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0578 0.151 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 5.44e-02 0.297 0.154 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 4.72e-01 0.104 0.145 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 3.42e-02 0.321 0.15 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 1.31e-01 0.251 0.166 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 6.16e-01 0.0871 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 1.74e-01 -0.145 0.106 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 7.62e-01 0.05 0.165 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 2.55e-02 -0.352 0.157 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 5.95e-01 0.0616 0.116 0.082 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 2.11e-01 0.155 0.123 0.082 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0604 0.157 0.082 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 2.25e-01 0.199 0.163 0.082 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0528 0.0778 0.082 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 9.77e-02 0.224 0.135 0.082 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00955 0.144 0.082 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 5.49e-01 0.0757 0.126 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0257 0.138 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 3.54e-01 -0.153 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 8.11e-01 0.0354 0.147 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 1.56e-01 -0.133 0.0936 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 5.67e-01 0.082 0.143 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 1.39e-01 -0.222 0.149 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.90e-01 0.0846 0.0981 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 2.68e-01 0.147 0.132 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 2.54e-01 0.193 0.169 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0413 0.119 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 1.63e-01 -0.129 0.0922 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.23e-01 -0.132 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 1.96e-01 -0.179 0.138 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 2.59e-02 -0.284 0.126 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 9.49e-01 0.00956 0.148 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0849 0.163 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 2.30e-01 0.158 0.132 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 9.11e-01 0.0113 0.102 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.62e-01 -0.147 0.161 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0593 0.164 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 8.56e-01 0.0187 0.103 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 9.29e-01 0.0118 0.132 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.29e-01 0.0783 0.162 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 7.88e-01 -0.033 0.123 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 2.08e-01 -0.116 0.0918 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0114 0.127 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0719 0.139 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 2.03e-01 -0.235 0.184 0.096 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 3.81e-01 -0.136 0.155 0.096 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0646 0.19 0.096 PB L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 6.62e-01 -0.052 0.119 0.096 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 1.53e-01 0.205 0.143 0.096 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 1.03e-01 0.266 0.162 0.096 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 5.49e-01 -0.104 0.173 0.096 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 3.93e-01 -0.107 0.125 0.083 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 4.19e-01 -0.106 0.131 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0761 0.152 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0996 0.121 0.083 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0243 0.0763 0.083 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0225 0.148 0.083 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 6.56e-01 0.066 0.148 0.083 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 4.86e-01 0.105 0.15 0.081 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 3.03e-01 0.112 0.109 0.081 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 6.54e-01 0.0712 0.159 0.081 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 2.57e-01 0.195 0.171 0.081 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0713 0.0955 0.081 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.34e-01 -0.1 0.103 0.081 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 3.44e-01 -0.138 0.146 0.081 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 1.76e-01 0.172 0.127 0.078 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0208 0.112 0.078 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 4.19e-01 0.133 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0533 0.125 0.078 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0466 0.147 0.078 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.56e-01 0.147 0.129 0.078 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 6.88e-01 0.0656 0.163 0.078 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 5.64e-01 0.0971 0.168 0.078 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 2.23e-01 0.106 0.0869 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0458 0.0859 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 5.08e-02 0.305 0.155 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 7.79e-01 0.0263 0.0939 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 4.95e-02 0.265 0.134 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.22e-02 0.222 0.0964 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0185 0.1 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 8.88e-01 0.0177 0.126 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 7.79e-02 0.178 0.1 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 2.67e-01 -0.104 0.094 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 2.99e-01 0.169 0.162 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 7.79e-01 0.0252 0.0899 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 8.80e-01 0.0229 0.151 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0577 0.122 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 9.20e-01 -0.013 0.129 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 2.42e-01 -0.147 0.126 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 2.80e-01 -0.178 0.164 0.064 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 1.75e-01 0.266 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.15e-01 0.0765 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0253 0.182 0.064 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 9.50e-01 0.0064 0.101 0.064 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.54e-01 -0.244 0.214 0.064 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 1.42e-01 0.269 0.182 0.064 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 1.45e-01 0.157 0.107 0.084 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 3.43e-01 -0.102 0.107 0.084 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0822 0.145 0.084 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.06e-01 0.0621 0.0931 0.084 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000998 0.143 0.084 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0852 0.152 0.084 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 1.68e-01 0.192 0.138 0.084 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 1.08e-01 0.257 0.159 0.084 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 8.94e-02 0.217 0.127 0.081 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 7.90e-01 0.024 0.0899 0.081 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 9.05e-01 0.0189 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 8.04e-02 0.198 0.113 0.081 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 8.33e-02 0.242 0.139 0.081 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.17e-01 -0.148 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00846 0.142 0.081 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 5.34e-01 0.0933 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 4.74e-01 0.103 0.143 0.09 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 6.97e-01 0.0512 0.131 0.09 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 7.47e-01 0.051 0.158 0.09 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0735 0.133 0.09 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 1.11e-01 0.176 0.109 0.09 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 1.39e-01 0.261 0.175 0.09 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 1.08e-01 -0.217 0.134 0.09 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 2.36e-01 0.193 0.162 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 1.36e-01 0.199 0.133 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 5.85e-02 0.204 0.107 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 1.82e-01 0.205 0.153 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 2.21e-02 0.325 0.141 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 1.53e-01 -0.135 0.0938 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 6.20e-01 0.0619 0.125 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 4.33e-02 0.321 0.158 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 4.17e-03 0.378 0.13 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.0983 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 5.28e-01 -0.102 0.162 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 1.52e-02 0.35 0.143 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0422 0.0761 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.111 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 5.47e-01 0.0818 0.135 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 9.04e-02 0.15 0.0882 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 3.60e-01 -0.076 0.083 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 1.04e-01 0.259 0.158 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 4.87e-01 0.0572 0.082 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 5.14e-01 0.093 0.142 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.33e-01 0.115 0.0959 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0221 0.0984 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0284 0.115 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 2.09e-01 0.132 0.104 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 9.57e-01 0.00435 0.0799 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0262 0.158 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0978 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 897091 sc-eQTL 6.48e-01 0.0699 0.153 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.60e-02 -0.278 0.124 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 4.14e-01 0.107 0.131 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 663865 sc-eQTL 1.16e-01 0.234 0.148 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 sc-eQTL 7.32e-01 0.0347 0.101 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -955621 sc-eQTL 3.79e-01 0.11 0.125 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 625346 sc-eQTL 2.35e-01 0.203 0.17 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -659509 sc-eQTL 4.34e-01 0.0829 0.106 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -419304 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0868 0.092 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 655433 sc-eQTL 2.53e-01 -0.142 0.124 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -420323 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0866 0.129 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 228461 pQTL 0.0287 0.0583 0.0266 0.0 0.0 0.09
ENSG00000135525 MAP7 897091 eQTL 0.0189 -0.0935 0.0398 0.00145 0.0 0.0918

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 525609 8.43e-07 4.93e-07 1.2e-07 3.58e-07 9.45e-08 2.01e-07 5.28e-07 1.56e-07 4.74e-07 2.37e-07 6.39e-07 3.73e-07 6.98e-07 1.17e-07 2.26e-07 2.69e-07 3.35e-07 3.74e-07 2.12e-07 1.32e-07 2.01e-07 3.8e-07 3.7e-07 1.44e-07 6.87e-07 2.7e-07 3.1e-07 2.19e-07 3.83e-07 4.61e-07 2.73e-07 7.79e-08 5.58e-08 1.5e-07 3e-07 9.51e-08 1.18e-07 9.46e-08 6.38e-08 5.32e-08 8.42e-08 4.02e-07 3.55e-08 1.77e-08 1.25e-07 1.59e-08 1.21e-07 1.13e-08 4.71e-08
ENSG00000226004 \N -497892 8.85e-07 5.7e-07 1.6e-07 3.96e-07 1.05e-07 2.24e-07 5.82e-07 1.91e-07 5.88e-07 2.82e-07 7.67e-07 4.31e-07 8.16e-07 1.49e-07 2.86e-07 2.89e-07 4.29e-07 4.11e-07 2.6e-07 1.73e-07 2.35e-07 4.38e-07 3.87e-07 1.8e-07 8.09e-07 2.57e-07 4e-07 2.65e-07 4.22e-07 5.67e-07 3.43e-07 5.62e-08 4.74e-08 1.73e-07 3.31e-07 1.44e-07 1.02e-07 1.09e-07 6.58e-08 2.62e-08 1.01e-07 4.82e-07 4.47e-08 1.89e-08 1.45e-07 1.31e-08 1.23e-07 1.26e-08 6.15e-08