Genes within 1Mb (chr6:137442468:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.85e-01 -0.122 0.0914 0.175 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 7.14e-01 0.0264 0.072 0.175 B L1
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 5.61e-01 0.0633 0.109 0.175 B L1
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0135 0.0719 0.175 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 4.29e-01 0.0459 0.0578 0.175 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 1.07e-01 0.13 0.0802 0.175 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 9.93e-02 -0.15 0.0906 0.175 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.21e-02 -0.153 0.0604 0.175 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 4.80e-01 0.0497 0.0703 0.175 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0838 0.0986 0.175 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0119 0.0663 0.175 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 6.69e-01 0.0266 0.0621 0.175 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.41e-02 -0.106 0.0468 0.175 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0938 0.078 0.175 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0684 0.0697 0.175 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 7.79e-01 0.021 0.0747 0.175 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 5.60e-01 0.068 0.116 0.175 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0362 0.0761 0.175 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 2.75e-01 0.0641 0.0586 0.175 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.53e-01 -0.071 0.0619 0.175 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0432 0.0863 0.175 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0741 0.0844 0.18 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 2.68e-01 0.0887 0.0799 0.18 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 3.35e-01 0.115 0.119 0.18 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00742 0.0903 0.18 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 3.54e-01 0.0908 0.0976 0.18 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 8.26e-01 0.0206 0.0938 0.18 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0499 0.092 0.18 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0753 0.122 0.18 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 7.84e-02 -0.122 0.069 0.175 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 1.05e-01 0.0913 0.0561 0.175 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 3.77e-01 -0.103 0.117 0.175 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00508 0.059 0.175 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 8.59e-01 0.0184 0.103 0.175 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00581 0.0689 0.175 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 3.83e-01 0.0638 0.073 0.175 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 6.45e-01 0.0384 0.0834 0.175 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0919 0.0772 0.176 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 8.17e-02 0.154 0.0881 0.176 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 6.52e-01 0.0539 0.119 0.176 NK L1
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 4.80e-01 0.0532 0.0752 0.176 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 5.47e-01 0.0388 0.0644 0.176 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 8.07e-01 0.0226 0.0923 0.176 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 6.98e-01 0.0354 0.0913 0.176 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0231 0.0734 0.175 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 4.32e-01 0.0613 0.0777 0.175 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 2.06e-01 -0.151 0.119 0.175 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0177 0.0961 0.175 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 4.48e-01 0.0347 0.0456 0.175 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.22e-01 -0.108 0.0879 0.175 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0281 0.0907 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0333 0.124 0.166 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0632 0.121 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 1.59e-01 0.171 0.121 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0762 0.0627 0.166 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 3.44e-01 0.116 0.122 0.166 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0865 0.137 0.166 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 9.99e-01 0.000193 0.107 0.166 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0393 0.11 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 9.21e-01 0.00819 0.0825 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 1.37e-01 0.171 0.115 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0755 0.105 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 2.27e-01 0.0994 0.0821 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0368 0.0995 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 9.50e-01 0.00728 0.117 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 9.90e-02 -0.196 0.118 0.172 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 2.02e-01 0.116 0.0902 0.172 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0346 0.12 0.172 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0484 0.113 0.172 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 1.35e-01 -0.116 0.0773 0.172 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.11e-01 0.133 0.106 0.172 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 6.06e-02 -0.216 0.115 0.172 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0957 0.0923 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 8.53e-01 0.0146 0.0788 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 6.06e-01 0.063 0.122 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 2.05e-01 -0.135 0.106 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 1.65e-01 0.0858 0.0617 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.23e-02 0.198 0.086 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 1.89e-01 -0.128 0.0967 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 6.30e-02 -0.21 0.112 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 4.96e-01 0.0511 0.0749 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0754 0.124 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 2.80e-01 0.0972 0.0898 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00387 0.09 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 6.03e-02 0.179 0.095 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 2.61e-01 -0.131 0.116 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 6.95e-02 -0.198 0.109 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0466 0.101 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 2.48e-01 0.14 0.121 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 3.23e-01 -0.122 0.123 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 5.07e-02 0.14 0.0711 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 1.43e-02 -0.279 0.113 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 5.54e-02 -0.213 0.111 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0708 0.0579 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 4.74e-01 0.0491 0.0685 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 1.88e-01 -0.144 0.109 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00258 0.0906 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 6.64e-01 0.0276 0.0635 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0551 0.0465 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 4.66e-01 -0.06 0.0822 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.49e-02 -0.197 0.0802 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 6.21e-01 0.0398 0.0804 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0111 0.119 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 3.28e-01 0.0988 0.101 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00864 0.0586 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.84e-02 -0.146 0.066 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0722 0.082 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 7.92e-02 -0.167 0.0949 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 7.59e-02 0.152 0.0854 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 1.13e-01 0.195 0.123 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 7.46e-01 0.0324 0.1 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 9.36e-01 0.00512 0.0635 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 1.65e-01 -0.136 0.0976 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 5.52e-02 -0.195 0.101 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0826 0.0836 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 5.99e-01 0.0468 0.0888 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00703 0.115 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 2.81e-01 -0.12 0.111 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 7.34e-01 0.024 0.0705 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0476 0.0995 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0271 0.0991 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0168 0.0832 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0268 0.0762 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 2.20e-01 0.148 0.12 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0768 0.0915 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 6.68e-01 0.0279 0.065 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0538 0.077 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0779 0.096 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0996 0.11 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 2.61e-01 -0.105 0.0935 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0604 0.126 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 3.61e-01 0.113 0.124 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 3.86e-01 0.0518 0.0596 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 2.67e-01 -0.118 0.106 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0914 0.109 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.32e-01 -0.108 0.111 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 1.46e-01 0.169 0.116 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 6.02e-02 -0.239 0.127 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 3.86e-01 -0.115 0.133 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 5.60e-01 0.0477 0.0818 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 8.34e-01 0.0266 0.127 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 6.44e-01 0.0562 0.121 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0697 0.0883 0.173 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00694 0.0945 0.173 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0974 0.12 0.173 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0362 0.125 0.173 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 2.96e-01 0.0621 0.0593 0.173 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0969 0.103 0.173 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 6.04e-01 0.0571 0.11 0.173 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0449 0.0936 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 2.18e-01 0.126 0.102 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 1.72e-01 -0.166 0.121 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0211 0.109 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 2.60e-01 0.0785 0.0695 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 3.03e-01 -0.109 0.106 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0833 0.111 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0965 0.0715 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 1.79e-01 0.13 0.0965 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 3.99e-01 -0.104 0.123 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 8.21e-01 0.0197 0.0869 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 3.86e-01 0.0586 0.0675 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 8.69e-01 0.016 0.0973 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 5.35e-01 0.0628 0.101 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.47e-01 -0.136 0.0935 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 4.82e-01 0.0767 0.109 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 5.65e-02 0.227 0.118 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 3.08e-01 0.0987 0.0966 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0694 0.0744 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 8.55e-01 0.0217 0.118 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 9.32e-01 0.0103 0.12 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0773 0.0756 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 3.56e-01 0.0895 0.0967 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 1.93e-01 0.155 0.118 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 1.50e-01 0.13 0.0898 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 3.99e-01 0.0571 0.0675 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 9.24e-01 0.00894 0.093 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 2.04e-01 0.129 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0488 0.139 0.167 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 8.24e-02 0.202 0.115 0.167 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 8.05e-02 0.248 0.141 0.167 PB L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0387 0.089 0.167 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 2.55e-01 0.123 0.107 0.167 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 4.03e-01 -0.103 0.123 0.167 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0328 0.13 0.167 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.85e-01 0.0834 0.0959 0.176 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 4.11e-01 0.0826 0.1 0.176 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 8.91e-01 -0.016 0.117 0.176 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 2.46e-01 0.108 0.0925 0.176 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0111 0.0585 0.176 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0324 0.113 0.176 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 2.28e-01 -0.137 0.113 0.176 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.84e-01 -0.151 0.113 0.175 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 3.40e-01 0.0784 0.0821 0.175 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 8.46e-02 -0.206 0.119 0.175 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 8.14e-01 0.0306 0.129 0.175 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 6.22e-01 0.0356 0.072 0.175 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 7.22e-01 0.0278 0.078 0.175 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 7.22e-01 0.0391 0.11 0.175 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.04e-01 -0.152 0.093 0.188 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00466 0.0824 0.188 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0189 0.121 0.188 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 7.77e-01 0.0262 0.0923 0.188 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 5.91e-01 0.058 0.108 0.188 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 5.81e-01 0.0524 0.0949 0.188 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 9.52e-01 0.0073 0.12 0.188 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 6.07e-01 0.0637 0.124 0.188 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0936 0.0651 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 4.04e-01 0.0538 0.0644 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0554 0.118 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0287 0.0704 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 4.50e-01 0.0767 0.101 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0679 0.0731 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 4.79e-01 0.0533 0.0752 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 9.37e-01 0.00748 0.0942 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0855 0.0755 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 1.95e-01 0.0915 0.0703 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 2.11e-01 -0.152 0.121 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 7.86e-01 0.0183 0.0673 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0739 0.113 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 5.12e-01 0.06 0.0914 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 8.03e-01 0.0242 0.0966 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 2.70e-01 0.104 0.0941 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000212 0.114 0.194 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 7.27e-01 0.0475 0.136 0.194 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 6.15e-02 -0.269 0.143 0.194 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 3.72e-01 0.113 0.126 0.194 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 5.80e-01 0.0389 0.0701 0.194 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 8.43e-01 0.0294 0.148 0.194 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0681 0.127 0.194 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 7.47e-01 0.0261 0.0809 0.178 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 2.20e-01 0.0989 0.0803 0.178 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 4.42e-01 0.0838 0.109 0.178 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0522 0.0697 0.178 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0898 0.107 0.178 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 3.25e-01 0.112 0.113 0.178 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0918 0.104 0.178 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 2.06e-01 -0.152 0.12 0.178 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 3.72e-02 -0.195 0.0931 0.176 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00648 0.066 0.176 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 6.41e-01 0.0544 0.117 0.176 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 8.90e-01 0.0115 0.0833 0.176 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 1.67e-01 -0.142 0.102 0.176 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00883 0.108 0.176 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 8.42e-01 0.0208 0.104 0.176 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0625 0.11 0.176 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0259 0.109 0.175 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 1.61e-01 0.14 0.0991 0.175 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 3.20e-01 0.119 0.119 0.175 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0793 0.101 0.175 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 3.16e-01 0.084 0.0834 0.175 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 1.23e-01 -0.206 0.133 0.175 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 9.20e-01 0.0103 0.102 0.175 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 3.74e-01 -0.11 0.123 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 2.06e-01 -0.122 0.0958 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 8.77e-01 0.0121 0.078 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 2.56e-01 0.126 0.11 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 9.27e-01 0.00949 0.103 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 7.86e-01 0.0184 0.0678 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0547 0.0898 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0596 0.115 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 9.57e-02 -0.162 0.0967 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 7.38e-01 0.0241 0.0722 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 8.76e-01 0.0185 0.118 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0869 0.106 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 4.91e-01 0.0384 0.0557 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 1.03e-02 0.208 0.0804 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 8.54e-02 -0.17 0.0986 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 8.71e-02 -0.113 0.0655 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 2.91e-01 0.0652 0.0616 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 2.89e-01 -0.126 0.118 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0151 0.061 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 6.03e-01 0.0551 0.106 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0366 0.0715 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 4.76e-01 0.0522 0.0731 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 4.88e-01 0.059 0.085 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0935 0.0771 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 1.40e-01 0.0869 0.0588 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 4.22e-01 0.0938 0.117 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 9.25e-01 0.00683 0.0723 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 891649 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0537 0.113 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 7.23e-01 0.0329 0.0927 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0433 0.0969 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 658423 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 223019 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0977 0.0729 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961063 sc-eQTL 1.09e-01 0.145 0.0903 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619904 sc-eQTL 5.02e-01 0.083 0.123 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -664951 sc-eQTL 2.52e-01 0.0878 0.0764 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -424746 sc-eQTL 5.00e-01 0.0451 0.0667 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649991 sc-eQTL 8.21e-01 0.0204 0.0901 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -425765 sc-eQTL 4.61e-01 0.0689 0.0933 0.177 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 520167 eQTL 0.0366 -0.0893 0.0427 0.0025 0.0 0.152


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina