logo

Genes within 1Mb (chr6:137441851:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 4.50e-01 0.0617 0.0816 0.259 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.87e-01 0.0845 0.0638 0.259 B L1
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00913 0.0967 0.259 B L1
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0149 0.064 0.259 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.29e-01 0.0111 0.0515 0.259 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 1.22e-01 0.111 0.0714 0.259 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0599 0.081 0.259 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 2.98e-02 -0.118 0.054 0.259 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 8.78e-02 0.107 0.0621 0.259 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 3.08e-01 0.0896 0.0877 0.259 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 1.07e-01 0.0948 0.0586 0.259 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.49e-01 0.0252 0.0553 0.259 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0606 0.0419 0.259 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 6.19e-01 0.0347 0.0695 0.259 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0354 0.0622 0.259 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 2.90e-01 0.0705 0.0665 0.259 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 8.45e-01 0.0203 0.104 0.259 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0395 0.0678 0.259 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 4.79e-01 0.0371 0.0523 0.259 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0708 0.0552 0.259 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 7.17e-01 0.0279 0.0769 0.259 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 9.98e-01 0.00015 0.0764 0.261 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 3.47e-01 0.068 0.0722 0.261 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 2.61e-01 0.121 0.107 0.261 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0335 0.0816 0.261 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 2.84e-01 0.0948 0.0881 0.261 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 4.09e-01 0.0699 0.0846 0.261 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0713 0.083 0.261 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 8.00e-01 0.028 0.111 0.261 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0407 0.0626 0.259 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 3.13e-01 0.0513 0.0507 0.259 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 7.86e-01 0.0287 0.105 0.259 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 7.24e-01 0.0188 0.0531 0.259 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 6.35e-01 0.0442 0.0929 0.259 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.61e-01 0.0189 0.062 0.259 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 6.99e-01 0.0255 0.0658 0.259 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 5.68e-01 0.0429 0.0751 0.259 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0572 0.069 0.26 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 4.90e-02 0.155 0.0784 0.26 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 4.47e-01 0.0811 0.106 0.26 NK L1
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 1.85e-01 0.089 0.0669 0.26 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00291 0.0575 0.26 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 5.85e-01 -0.045 0.0823 0.26 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00757 0.0815 0.26 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 9.20e-01 0.00649 0.0649 0.259 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.46e-01 0.0998 0.0685 0.259 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.29e-01 -0.161 0.105 0.259 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 8.69e-01 0.0141 0.0849 0.259 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.94e-01 0.0159 0.0404 0.259 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 9.04e-01 0.00946 0.078 0.259 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0683 0.08 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.27e-01 0.0383 0.109 0.247 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 4.19e-01 0.0868 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.06e-01 0.174 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0516 0.0556 0.247 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.50e-01 0.0491 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0676 0.121 0.247 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0116 0.0944 0.247 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.23e-01 0.0345 0.0971 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 2.87e-01 0.0775 0.0726 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 7.65e-02 0.18 0.101 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 9.41e-01 0.00684 0.0927 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.34e-01 0.0152 0.0727 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.79e-01 0.0247 0.0879 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 4.58e-01 0.0766 0.103 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0305 0.106 0.256 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 7.49e-02 0.143 0.08 0.256 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 5.36e-01 0.0662 0.107 0.256 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 2.43e-01 0.117 0.1 0.256 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 4.64e-02 -0.137 0.0685 0.256 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 3.71e-01 0.0845 0.0943 0.256 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0198 0.103 0.256 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 5.53e-01 0.0488 0.0821 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 2.06e-01 0.0884 0.0697 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 4.78e-01 0.077 0.108 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 7.37e-01 0.0319 0.0948 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 4.23e-01 0.0441 0.0549 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 1.88e-01 0.102 0.077 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0976 0.0859 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 8.25e-01 0.0224 0.101 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 8.39e-01 0.0136 0.0671 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.78e-01 -0.149 0.11 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 3.23e-02 0.172 0.0797 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 7.45e-01 0.0262 0.0805 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 1.75e-01 0.116 0.0853 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 7.59e-01 -0.032 0.104 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 1.59e-01 -0.137 0.0966 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 6.49e-01 0.0408 0.0896 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 3.16e-02 0.23 0.106 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 7.33e-01 0.0373 0.109 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.79e-02 0.116 0.0632 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 3.97e-01 -0.086 0.101 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0537 0.099 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0557 0.0514 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.71e-01 0.0832 0.0606 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 9.98e-01 0.000193 0.0974 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 6.58e-02 0.147 0.0797 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 7.58e-01 0.0174 0.0564 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0284 0.0414 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 2.25e-01 0.0886 0.0728 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 1.34e-01 -0.109 0.0723 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 7.52e-02 0.128 0.0714 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.68e-01 0.147 0.106 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 4.42e-02 0.181 0.0894 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.81e-01 0.0216 0.0524 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0954 0.0593 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 4.54e-01 0.055 0.0733 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0709 0.0843 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.63e-02 0.182 0.075 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 2.26e-01 0.132 0.109 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 1.51e-01 0.127 0.088 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 9.05e-01 0.00673 0.0561 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 9.47e-02 -0.145 0.0861 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0624 0.0899 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 1.51e-01 -0.107 0.0741 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 8.71e-01 0.0128 0.0789 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 8.20e-01 0.0234 0.102 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 1.74e-01 -0.134 0.0981 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00576 0.0627 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0455 0.0884 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0322 0.0881 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 6.87e-01 0.0299 0.074 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 5.86e-01 0.037 0.0678 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 7.31e-01 0.0369 0.107 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 2.81e-01 -0.088 0.0813 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.17e-01 0.0134 0.0579 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0174 0.0686 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 6.11e-01 0.0435 0.0856 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0444 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0212 0.0869 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0608 0.117 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 3.70e-01 0.103 0.115 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 4.43e-01 0.0425 0.0552 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 1.61e-01 -0.138 0.0983 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 6.08e-01 0.0519 0.101 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0338 0.097 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 6.46e-03 0.275 0.0999 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0749 0.112 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 6.12e-01 -0.059 0.116 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0356 0.0715 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 5.84e-01 0.0607 0.111 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 3.26e-01 -0.104 0.106 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0264 0.077 0.258 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 4.55e-01 0.0616 0.0822 0.258 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0974 0.104 0.258 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 5.27e-01 0.0689 0.109 0.258 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 6.95e-01 0.0203 0.0518 0.258 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.19e-01 0.0325 0.0903 0.258 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 6.90e-01 0.0383 0.0958 0.258 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0127 0.0833 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 3.33e-01 0.0881 0.0907 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 6.92e-02 -0.197 0.108 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 8.94e-01 0.013 0.0973 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0068 0.062 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0507 0.0943 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 9.52e-02 -0.165 0.0982 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0349 0.0636 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 6.62e-02 0.157 0.0853 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00954 0.11 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 8.94e-01 0.0103 0.077 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0132 0.0599 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0364 0.0862 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0275 0.0897 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.60e-03 -0.218 0.0807 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 5.26e-01 0.0604 0.0952 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.69e-01 0.144 0.104 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 9.28e-02 0.142 0.0841 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0443 0.0651 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 6.78e-01 -0.043 0.104 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0448 0.0671 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 3.61e-01 0.0785 0.0857 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.37e-01 0.157 0.105 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 2.23e-01 0.0974 0.0798 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0117 0.06 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00559 0.0825 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 4.07e-01 0.075 0.0903 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 2.61e-01 -0.134 0.119 0.263 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 3.57e-01 0.0928 0.1 0.263 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 2.01e-01 0.157 0.122 0.263 PB L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0503 0.0765 0.263 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 5.61e-02 0.177 0.0915 0.263 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.41e-01 0.0351 0.106 0.263 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0675 0.111 0.263 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.73e-01 0.0245 0.0848 0.261 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 9.29e-01 0.00792 0.0887 0.261 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0559 0.103 0.261 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 5.66e-01 0.0471 0.0819 0.261 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.01e-01 -0.013 0.0517 0.261 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0327 0.1 0.261 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0723 0.1 0.261 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0715 0.101 0.259 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.34e-01 0.11 0.0728 0.259 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 2.44e-01 -0.124 0.106 0.259 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 3.06e-01 0.118 0.115 0.259 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00446 0.0641 0.259 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0285 0.0695 0.259 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0264 0.0978 0.259 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0477 0.0839 0.268 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0081 0.074 0.268 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 6.16e-01 0.0545 0.109 0.268 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 9.91e-01 0.000902 0.0828 0.268 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 6.95e-01 0.0381 0.0968 0.268 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 2.01e-01 0.109 0.0848 0.268 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 7.57e-01 0.0334 0.108 0.268 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 3.36e-01 0.107 0.111 0.268 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0287 0.0587 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 7.03e-01 0.0221 0.0578 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 3.53e-01 0.098 0.105 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0148 0.0632 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 5.59e-02 0.173 0.0901 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 4.56e-01 0.049 0.0656 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 5.79e-01 0.0375 0.0674 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 8.17e-01 0.0195 0.0845 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 8.77e-01 0.0106 0.0683 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 6.92e-01 0.0252 0.0636 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 6.68e-01 -0.047 0.11 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 7.00e-01 0.0234 0.0607 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0372 0.102 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.74e-01 0.0237 0.0825 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 9.30e-01 0.00767 0.0871 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 8.79e-01 0.013 0.085 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0689 0.102 0.261 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 3.45e-01 0.115 0.121 0.261 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.50e-01 -0.186 0.129 0.261 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 4.00e-01 0.0954 0.113 0.261 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 5.61e-01 0.0367 0.0629 0.261 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0644 0.133 0.261 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 6.88e-01 0.0459 0.114 0.261 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 2.37e-01 0.0859 0.0724 0.264 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 5.72e-01 0.0409 0.0724 0.264 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 6.18e-01 0.0489 0.0979 0.264 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0128 0.0628 0.264 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0605 0.0963 0.264 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 6.27e-01 0.0497 0.102 0.264 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 8.28e-01 0.0203 0.0935 0.264 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00635 0.108 0.264 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0595 0.0843 0.26 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 9.37e-01 0.00469 0.0591 0.26 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 5.03e-01 0.0701 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 2.21e-01 0.0913 0.0744 0.26 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0173 0.0923 0.26 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0715 0.0969 0.26 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 9.21e-01 0.00929 0.0934 0.26 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00662 0.0985 0.26 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 8.60e-01 0.0175 0.0986 0.268 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.39e-01 0.134 0.0897 0.268 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 2.83e-01 0.116 0.108 0.268 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 2.94e-01 -0.096 0.0911 0.268 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 4.21e-02 0.153 0.0748 0.268 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0352 0.121 0.268 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0968 0.0925 0.268 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 9.90e-01 0.00138 0.112 0.268 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00896 0.0857 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.94e-01 0.0901 0.0692 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 7.67e-02 0.174 0.0979 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 7.46e-02 0.163 0.0909 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0397 0.0604 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0172 0.0801 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 4.09e-01 0.0845 0.102 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.03e-01 0.033 0.0865 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 2.52e-01 0.0734 0.064 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0329 0.105 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 3.92e-01 0.0806 0.0941 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.81e-01 0.00745 0.0495 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 8.95e-02 0.123 0.0721 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 2.39e-01 -0.104 0.0879 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0264 0.0591 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 7.20e-01 0.0199 0.0554 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 8.81e-01 0.0159 0.106 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 8.62e-01 0.0095 0.0547 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 3.70e-01 0.0852 0.0948 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 7.03e-01 0.0245 0.0641 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 6.16e-01 0.0329 0.0656 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 6.35e-01 0.0363 0.0763 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0179 0.0699 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 1.66e-01 0.0737 0.0531 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 4.20e-01 0.0852 0.105 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 7.19e-01 0.0236 0.0653 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 891032 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0127 0.102 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0981 0.0834 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 8.98e-01 0.0113 0.0875 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 657806 sc-eQTL 7.92e-01 0.0263 0.0993 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 222402 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0575 0.0651 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -961680 sc-eQTL 4.96e-02 0.158 0.0801 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 619287 sc-eQTL 1.73e-01 0.15 0.109 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -665568 sc-eQTL 9.92e-02 0.112 0.0678 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -425363 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00525 0.0594 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 649374 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0406 0.0802 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -426382 sc-eQTL 8.25e-01 0.0183 0.0831 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112378 PERP -665568 eQTL 0.044 0.0601 0.0298 0.0 0.0 0.244
ENSG00000182747 SLC35D3 519550 eQTL 0.00633 -0.0962 0.0352 0.0 0.0 0.244

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 519550 2.67e-07 1.25e-07 3.59e-08 1.82e-07 9.91e-08 9.65e-08 1.6e-07 5.21e-08 1.45e-07 4.38e-08 1.57e-07 8.14e-08 1.41e-07 6.56e-08 5.4e-08 7.26e-08 5.1e-08 1.18e-07 5.19e-08 3.29e-08 1.08e-07 1.28e-07 1.44e-07 4.99e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.02e-07 1.1e-07 9.91e-08 3.41e-08 2.75e-08 8.49e-08 8.99e-08 3.97e-08 5.1e-08 8.78e-08 8.55e-08 3e-08 3.66e-08 1.33e-07 4.34e-08 0.0 1.01e-07 1.69e-08 1.37e-07 4.96e-09 4.72e-08