logo

Genes within 1Mb (chr6:137439262:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 2.91e-03 0.367 0.122 0.083 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 1.30e-01 0.148 0.0972 0.083 B L1
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 3.50e-01 -0.138 0.147 0.083 B L1
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00963 0.0975 0.083 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0586 0.0785 0.083 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 8.67e-01 0.0184 0.11 0.083 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 2.69e-01 0.137 0.123 0.083 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 9.32e-01 0.00719 0.0838 0.083 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 9.81e-02 0.159 0.0955 0.083 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 6.03e-03 0.368 0.133 0.083 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 6.27e-03 0.246 0.089 0.083 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 9.08e-01 0.00985 0.0849 0.083 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 3.91e-01 0.0555 0.0646 0.083 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 1.57e-02 0.257 0.105 0.083 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 6.43e-01 0.0439 0.0946 0.083 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.101 0.083 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0781 0.158 0.083 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 8.09e-01 -0.025 0.103 0.083 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 6.88e-01 -0.032 0.0797 0.083 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0331 0.0842 0.083 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 2.19e-01 0.144 0.117 0.083 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 2.30e-01 0.138 0.115 0.081 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 9.27e-01 -0.01 0.109 0.081 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.02e-01 0.0622 0.162 0.081 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0627 0.123 0.081 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 7.24e-01 0.0472 0.134 0.081 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 3.43e-01 0.121 0.128 0.081 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0698 0.126 0.081 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 2.21e-01 0.204 0.166 0.081 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 1.61e-01 0.132 0.0938 0.083 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0515 0.0764 0.083 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 1.07e-01 0.255 0.158 0.083 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 5.17e-01 0.0519 0.0799 0.083 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 6.36e-01 0.0663 0.14 0.083 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.67e-01 0.0535 0.0933 0.083 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0594 0.099 0.083 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 8.14e-01 0.0266 0.113 0.083 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 7.21e-01 0.0379 0.106 0.084 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 5.27e-01 0.0769 0.121 0.084 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 5.84e-01 0.0898 0.164 0.084 NK L1
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 2.86e-01 0.11 0.103 0.084 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0798 0.0881 0.084 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.40e-01 -0.148 0.126 0.084 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0844 0.125 0.084 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 5.64e-01 0.0572 0.099 0.083 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.49e-01 0.121 0.105 0.083 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0987 0.161 0.083 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 6.16e-01 0.065 0.13 0.083 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0261 0.0617 0.083 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 6.58e-02 0.219 0.118 0.083 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 3.77e-01 -0.108 0.122 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.69e-01 0.15 0.167 0.082 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 5.14e-02 0.318 0.162 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 5.72e-01 0.0932 0.164 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 8.28e-01 0.0185 0.0852 0.082 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0967 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 9.99e-01 0.000184 0.185 0.082 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0276 0.144 0.082 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 2.95e-01 0.159 0.151 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 1.27e-01 0.173 0.113 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 4.76e-01 0.113 0.158 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 2.68e-01 0.16 0.144 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 1.81e-01 -0.152 0.113 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 3.43e-01 0.13 0.137 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 2.83e-01 0.173 0.161 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 6.30e-02 0.309 0.165 0.084 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.13e-01 0.128 0.127 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 1.67e-01 0.232 0.168 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 1.41e-02 0.386 0.156 0.084 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 3.02e-01 -0.112 0.109 0.084 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0509 0.149 0.084 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 1.97e-02 0.376 0.16 0.084 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 1.96e-02 0.293 0.125 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 9.02e-02 0.182 0.107 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 6.99e-01 0.0646 0.167 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 2.41e-02 0.327 0.144 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0555 0.0844 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.80e-01 -0.128 0.118 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 9.59e-01 0.00687 0.132 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.78e-03 0.443 0.151 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0635 0.102 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 2.22e-01 -0.206 0.168 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 7.41e-02 0.219 0.122 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 5.79e-01 0.0684 0.123 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0638 0.131 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 2.86e-01 0.17 0.159 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 7.72e-01 0.0414 0.143 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.04e-01 0.167 0.131 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 1.00e-01 0.26 0.157 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 7.27e-02 0.287 0.159 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 8.91e-01 0.0128 0.0936 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.30e-02 0.288 0.148 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 8.97e-02 0.247 0.145 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 9.97e-01 0.000269 0.0788 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.63e-01 0.104 0.0927 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.36e-02 0.266 0.148 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 4.16e-03 0.349 0.12 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0101 0.0861 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.82e-01 0.0348 0.0632 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 4.16e-03 0.317 0.109 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.15e-01 0.11 0.109 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 4.43e-02 0.217 0.107 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 2.75e-02 0.353 0.159 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 8.85e-02 0.231 0.135 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 4.13e-01 0.0645 0.0787 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.97e-01 0.0476 0.0897 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 2.04e-02 0.255 0.109 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.01e-01 0.128 0.123 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.28e-01 0.134 0.111 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0435 0.159 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 9.32e-02 0.216 0.128 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 9.43e-01 0.00583 0.082 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0818 0.126 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 1.46e-01 0.191 0.131 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0981 0.114 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0566 0.121 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 6.65e-01 0.068 0.157 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0927 0.151 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0581 0.096 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0187 0.136 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0256 0.135 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.77e-01 0.0991 0.112 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 1.93e-01 0.134 0.102 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 2.57e-01 -0.184 0.162 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0623 0.123 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0199 0.0877 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.78e-01 0.0579 0.104 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 6.18e-02 0.242 0.129 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 5.40e-01 0.0957 0.156 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.24e-01 0.161 0.132 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 9.07e-01 -0.021 0.179 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 9.37e-01 0.0138 0.175 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0047 0.0845 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0854 0.151 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 4.84e-02 0.304 0.153 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 4.56e-01 0.108 0.144 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.20e-02 0.324 0.15 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 1.50e-01 0.239 0.166 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 7.11e-01 0.0641 0.173 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 1.33e-01 -0.16 0.106 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.87e-01 0.0897 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 3.79e-02 -0.327 0.156 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 6.07e-01 0.0593 0.115 0.084 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.24e-01 0.15 0.123 0.084 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0525 0.156 0.084 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 1.85e-01 0.216 0.162 0.084 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0602 0.0775 0.084 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 7.78e-02 0.238 0.134 0.084 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0114 0.144 0.084 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 6.79e-01 0.052 0.125 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 8.49e-01 -0.026 0.137 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 3.68e-01 -0.147 0.163 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 6.46e-01 0.0673 0.147 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 9.30e-02 -0.157 0.0928 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.67e-01 0.0814 0.142 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 1.32e-01 -0.224 0.148 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.24e-01 0.0963 0.0974 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.23e-01 0.13 0.132 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 3.10e-01 0.171 0.168 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0123 0.118 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 1.28e-01 -0.14 0.0915 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 3.83e-01 -0.115 0.132 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 1.88e-01 -0.181 0.137 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 3.20e-02 -0.271 0.125 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 9.77e-01 0.00431 0.147 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0713 0.161 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 2.25e-01 0.159 0.13 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 8.37e-01 0.0208 0.101 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 3.74e-01 -0.142 0.16 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0532 0.162 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 7.16e-01 0.0373 0.103 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 8.86e-01 0.0188 0.131 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 6.12e-01 0.0817 0.161 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0108 0.122 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 1.50e-01 -0.132 0.0911 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0294 0.126 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0625 0.138 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 2.03e-01 -0.235 0.184 0.096 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.81e-01 -0.136 0.155 0.096 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0646 0.19 0.096 PB L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 6.62e-01 -0.052 0.119 0.096 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 1.53e-01 0.205 0.143 0.096 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 1.03e-01 0.266 0.162 0.096 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 5.49e-01 -0.104 0.173 0.096 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0877 0.125 0.085 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.48e-01 -0.122 0.13 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0938 0.151 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0798 0.12 0.085 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00935 0.076 0.085 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0161 0.147 0.085 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 6.14e-01 0.0745 0.147 0.085 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 4.81e-01 0.106 0.15 0.083 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.083 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 5.85e-01 0.0866 0.158 0.083 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 2.27e-01 0.207 0.171 0.083 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0721 0.0952 0.083 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.80e-01 -0.111 0.103 0.083 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 3.84e-01 -0.127 0.145 0.083 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 1.81e-01 0.169 0.126 0.08 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0099 0.112 0.08 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 3.33e-01 0.159 0.164 0.08 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 7.13e-01 -0.046 0.125 0.08 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0197 0.146 0.08 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.37e-01 0.152 0.128 0.08 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 7.00e-01 0.0627 0.163 0.08 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 4.50e-01 0.126 0.167 0.08 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 2.40e-01 0.102 0.0866 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0465 0.0856 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 4.47e-02 0.313 0.155 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 8.46e-01 0.0182 0.0936 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 6.82e-02 0.245 0.134 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 1.88e-02 0.227 0.096 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0117 0.0999 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 8.13e-01 0.0296 0.125 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 8.24e-02 0.175 0.1 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 2.54e-01 -0.107 0.0937 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 3.02e-01 0.167 0.161 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 8.36e-01 0.0186 0.0896 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 7.41e-01 0.0499 0.151 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0547 0.122 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0261 0.129 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 2.14e-01 -0.156 0.125 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 2.79e-01 -0.178 0.164 0.067 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.10e-01 0.199 0.195 0.067 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.06e-01 0.0789 0.209 0.067 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 9.48e-01 0.0119 0.182 0.067 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 8.91e-01 0.0139 0.101 0.067 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.87e-01 -0.228 0.213 0.067 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 1.54e-01 0.261 0.182 0.067 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 1.88e-01 0.141 0.107 0.087 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0849 0.107 0.087 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.77e-01 -0.041 0.145 0.087 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 4.90e-01 0.064 0.0926 0.087 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 8.54e-01 0.0262 0.142 0.087 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0888 0.151 0.087 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 1.35e-01 0.206 0.137 0.087 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 1.11e-01 0.253 0.158 0.087 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 8.02e-02 0.222 0.127 0.084 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 8.01e-01 0.0226 0.0893 0.084 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 7.03e-01 0.0603 0.158 0.084 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 9.61e-02 0.187 0.112 0.084 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 1.12e-01 0.221 0.139 0.084 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 3.16e-01 -0.147 0.146 0.084 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 9.04e-01 -0.017 0.141 0.084 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 5.04e-01 0.0995 0.149 0.084 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 5.69e-01 0.0818 0.143 0.093 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 7.59e-01 0.0403 0.131 0.093 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 8.03e-01 0.0394 0.158 0.093 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0654 0.133 0.093 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 1.05e-01 0.178 0.109 0.093 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 1.08e-01 0.283 0.175 0.093 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 9.80e-02 -0.223 0.134 0.093 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 2.34e-01 0.193 0.162 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 1.12e-01 0.211 0.132 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 7.13e-02 0.194 0.107 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 2.42e-01 0.179 0.153 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 7.99e-03 0.375 0.14 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 1.62e-01 -0.131 0.0935 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 6.10e-01 0.0634 0.124 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 4.45e-02 0.318 0.157 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 4.05e-03 0.378 0.13 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 1.94e-01 0.128 0.098 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 4.89e-01 -0.112 0.161 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 1.46e-02 0.351 0.142 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0538 0.0758 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0974 0.111 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 5.94e-01 0.0721 0.135 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 1.04e-01 0.144 0.0881 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 3.79e-01 -0.073 0.0828 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 9.86e-02 0.262 0.158 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 5.55e-01 0.0484 0.0819 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 5.19e-01 0.0917 0.142 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.08e-01 0.121 0.0957 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0203 0.0982 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 8.27e-01 -0.025 0.114 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 2.13e-01 0.13 0.104 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 9.36e-01 0.00638 0.0796 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 9.01e-01 0.0195 0.157 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 6.81e-01 0.0401 0.0974 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 888443 sc-eQTL 6.50e-01 0.0692 0.152 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.52e-02 -0.278 0.123 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.13 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 655217 sc-eQTL 1.00e-01 0.243 0.147 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 sc-eQTL 6.39e-01 0.0472 0.1 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964269 sc-eQTL 4.10e-01 0.103 0.124 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616698 sc-eQTL 2.39e-01 0.199 0.169 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -668157 sc-eQTL 3.35e-01 0.101 0.105 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -427952 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0972 0.0913 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646785 sc-eQTL 2.76e-01 -0.135 0.123 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -428971 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0861 0.128 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 219813 pQTL 0.0287 0.0583 0.0266 0.0 0.0 0.09
ENSG00000135525 MAP7 888443 eQTL 0.0189 -0.0935 0.0398 0.00145 0.0 0.0918

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 516961 8.21e-07 4.63e-07 1.27e-07 3.58e-07 9.29e-08 1.85e-07 5.28e-07 1.54e-07 5.02e-07 2.37e-07 6.28e-07 3.84e-07 7.02e-07 1.1e-07 2.15e-07 2.45e-07 3.13e-07 3.82e-07 2.25e-07 1.55e-07 2.05e-07 3.92e-07 3.3e-07 1.58e-07 6.65e-07 2.56e-07 2.72e-07 2.24e-07 3.83e-07 4.27e-07 2.55e-07 7.03e-08 5.42e-08 1.73e-07 3.04e-07 1.19e-07 1.09e-07 7.93e-08 6.01e-08 3.05e-08 8.81e-08 3.66e-07 2.71e-08 1.58e-08 1.17e-07 1.88e-08 1.01e-07 1.13e-08 5.65e-08
ENSG00000226004 \N -506540 8.35e-07 4.93e-07 1.2e-07 3.58e-07 9.16e-08 2.01e-07 5.54e-07 1.62e-07 5.49e-07 2.57e-07 6.56e-07 4.03e-07 7.36e-07 1.17e-07 2.26e-07 2.83e-07 3.52e-07 3.95e-07 2.51e-07 1.73e-07 2.09e-07 4.11e-07 3.7e-07 1.71e-07 7.01e-07 2.57e-07 3.04e-07 2.57e-07 3.88e-07 4.51e-07 2.6e-07 6.06e-08 5.19e-08 1.73e-07 3.03e-07 1.36e-07 1.06e-07 9.33e-08 6.33e-08 2.53e-08 9.99e-08 4.02e-07 2.8e-08 2.03e-08 1.14e-07 1.95e-08 1.21e-07 1.18e-08 4.97e-08