logo

Genes within 1Mb (chr6:137439069:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 4.77e-01 0.0635 0.089 0.216 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0226 0.0699 0.216 B L1
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 4.35e-01 0.0825 0.105 0.216 B L1
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 2.54e-01 0.0796 0.0696 0.216 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0647 0.0561 0.216 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 2.49e-02 0.175 0.0775 0.216 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 1.48e-01 0.128 0.0881 0.216 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 9.35e-01 0.00486 0.0592 0.216 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.80e-01 -0.019 0.0679 0.216 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0354 0.0953 0.216 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0964 0.0637 0.216 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0385 0.0599 0.216 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.63e-01 0.0637 0.0455 0.216 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 2.40e-01 0.0887 0.0753 0.216 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 2.12e-01 -0.085 0.0678 0.216 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0185 0.0729 0.216 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00164 0.114 0.216 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 4.76e-01 0.053 0.0742 0.216 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 6.61e-01 0.0251 0.0573 0.216 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.96e-01 0.0783 0.0603 0.216 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 6.70e-01 0.0359 0.0841 0.216 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 1.17e-01 -0.132 0.0838 0.218 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0795 0.218 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 1.56e-01 -0.168 0.118 0.218 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0385 0.09 0.218 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0842 0.0974 0.218 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0451 0.0934 0.218 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0953 0.0915 0.218 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0628 0.122 0.218 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 4.19e-01 0.0559 0.0691 0.216 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0632 0.056 0.216 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 8.18e-01 0.0269 0.116 0.216 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0652 0.0585 0.216 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 5.54e-01 0.0608 0.103 0.216 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 3.10e-02 0.147 0.0677 0.216 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 6.30e-01 -0.035 0.0727 0.216 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0197 0.0829 0.216 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 1.75e-01 -0.105 0.0773 0.215 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 6.17e-01 0.0446 0.0888 0.215 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0671 0.12 0.215 NK L1
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0345 0.0754 0.215 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 6.76e-01 0.027 0.0646 0.215 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 3.16e-01 0.0928 0.0923 0.215 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 3.18e-01 0.0914 0.0913 0.215 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 7.82e-01 0.0196 0.0705 0.216 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 9.88e-01 0.0011 0.0748 0.216 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 8.24e-01 0.0255 0.115 0.216 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0114 0.0923 0.216 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0158 0.0439 0.216 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.71e-01 0.116 0.0844 0.216 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 8.31e-02 0.151 0.0865 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 2.74e-01 -0.131 0.119 0.222 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 4.28e-02 -0.237 0.116 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 4.29e-01 0.0932 0.118 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 4.98e-01 0.0414 0.0609 0.222 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0322 0.118 0.222 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 3.29e-01 0.129 0.132 0.222 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0139 0.103 0.222 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0133 0.106 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 6.56e-01 0.0354 0.0794 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 9.75e-01 0.00344 0.111 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 2.17e-01 -0.125 0.101 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 1.55e-01 -0.113 0.0789 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 3.00e-01 0.0992 0.0956 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 4.45e-01 0.0859 0.112 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 2.48e-01 -0.133 0.115 0.218 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0678 0.0876 0.218 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 2.91e-01 0.123 0.116 0.218 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 4.31e-02 0.22 0.108 0.218 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 6.51e-01 0.0341 0.0752 0.218 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0321 0.103 0.218 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 3.43e-01 0.106 0.112 0.218 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 1.93e-01 0.118 0.0902 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0315 0.0771 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.31e-01 0.0412 0.12 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 9.99e-01 0.000189 0.105 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0144 0.0606 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 2.10e-01 0.107 0.0849 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 8.29e-02 0.164 0.0943 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 3.35e-01 0.106 0.11 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 8.15e-01 0.0171 0.0729 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0727 0.12 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 2.70e-01 0.0966 0.0874 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 1.60e-01 -0.123 0.0872 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 8.78e-01 0.0143 0.0932 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 3.11e-01 0.115 0.113 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0751 0.105 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.28e-01 0.0336 0.0966 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0465 0.116 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 7.08e-01 0.0441 0.118 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 8.69e-01 0.0113 0.0687 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 4.96e-01 0.0747 0.109 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 3.18e-01 0.107 0.107 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0435 0.0567 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0217 0.0669 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0192 0.0884 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00867 0.062 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 6.34e-01 0.0217 0.0455 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 4.10e-01 0.0663 0.0802 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 7.32e-01 0.0273 0.0796 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0228 0.0787 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 4.08e-01 0.0967 0.117 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 1.13e-01 -0.156 0.0982 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 8.67e-01 -0.00961 0.0573 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 2.22e-01 0.0797 0.0651 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 7.84e-02 0.141 0.0798 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 5.92e-01 0.0483 0.09 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0586 0.0809 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0521 0.116 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 1.80e-01 -0.126 0.0938 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0525 0.0597 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 4.53e-01 0.0693 0.0923 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 2.82e-01 0.103 0.0957 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 1.78e-01 -0.11 0.0816 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 6.49e-01 0.0396 0.0868 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 9.91e-01 0.00129 0.113 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 1.27e-01 0.165 0.108 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0741 0.0688 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.26e-01 0.149 0.0968 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 6.14e-01 0.0489 0.0969 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0307 0.0799 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0271 0.0732 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0636 0.116 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0286 0.088 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 6.39e-01 0.0293 0.0625 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.01e-01 0.121 0.0736 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 4.01e-01 0.0776 0.0923 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 7.09e-01 0.0395 0.106 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 4.29e-01 0.0712 0.0898 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 6.46e-01 0.0558 0.121 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 9.60e-01 0.00596 0.119 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0175 0.0573 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0121 0.102 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 5.90e-01 0.0566 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 9.98e-01 0.000261 0.103 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 5.40e-01 0.066 0.108 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0453 0.118 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0578 0.123 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 1.84e-01 0.1 0.0753 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 2.70e-01 0.129 0.117 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 9.43e-01 0.00799 0.112 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 8.90e-01 0.0113 0.0822 0.216 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 4.33e-01 0.0689 0.0877 0.216 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 8.70e-01 0.0182 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 7.54e-01 0.0365 0.116 0.216 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 9.48e-01 0.00358 0.0553 0.216 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 9.55e-02 0.16 0.0957 0.216 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 3.64e-01 0.0929 0.102 0.216 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 9.85e-03 -0.239 0.0918 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 8.52e-01 0.019 0.102 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.30e-01 0.042 0.122 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 4.79e-01 0.0772 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 6.73e-01 0.0293 0.0695 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 5.28e-02 0.204 0.105 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 5.18e-01 0.0717 0.111 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0524 0.0726 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 9.06e-01 0.0116 0.0981 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0172 0.125 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0176 0.088 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 5.19e-01 0.0441 0.0683 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 7.06e-02 0.178 0.0977 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 6.66e-01 0.0443 0.102 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0157 0.0934 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 5.74e-01 0.0609 0.108 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 2.65e-01 -0.132 0.118 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 1.65e-01 0.134 0.0958 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 1.34e-01 0.111 0.0736 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.88e-01 0.155 0.117 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 2.87e-01 0.127 0.119 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0957 0.0749 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 9.08e-01 0.0111 0.0961 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 8.48e-01 0.0227 0.118 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 3.09e-02 -0.192 0.0886 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0227 0.0671 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 6.74e-01 0.0389 0.0922 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0155 0.101 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 3.79e-01 0.116 0.131 0.237 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00847 0.11 0.237 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0077 0.135 0.237 PB L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00641 0.0841 0.237 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0233 0.102 0.237 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 5.23e-01 0.0743 0.116 0.237 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 1.29e-01 -0.186 0.121 0.237 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 9.29e-02 -0.16 0.0949 0.217 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 9.24e-01 0.00953 0.0998 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0999 0.116 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0991 0.092 0.217 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0679 0.058 0.217 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 4.57e-01 0.0839 0.113 0.217 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0847 0.113 0.217 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0689 0.107 0.216 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 5.30e-01 0.0487 0.0775 0.216 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 3.60e-01 0.103 0.113 0.216 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 1.38e-01 -0.181 0.121 0.216 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0202 0.0679 0.216 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0193 0.0736 0.216 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 7.28e-01 0.036 0.104 0.216 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0606 0.0956 0.22 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0218 0.0842 0.22 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 6.59e-02 -0.227 0.123 0.22 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 9.05e-01 0.0113 0.0943 0.22 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 3.22e-01 -0.109 0.11 0.22 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0857 0.0969 0.22 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 3.02e-01 -0.127 0.123 0.22 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 1.29e-01 -0.191 0.126 0.22 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 4.18e-01 0.0523 0.0645 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0547 0.0636 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.63e-01 0.0351 0.116 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0769 0.0694 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 8.45e-01 0.0196 0.1 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 2.95e-01 0.0757 0.0721 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 8.76e-01 0.0116 0.0743 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 3.44e-01 -0.088 0.0928 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0105 0.0748 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0224 0.0697 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 9.60e-01 0.00602 0.12 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0211 0.0665 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0289 0.112 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 9.78e-02 0.149 0.0898 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 6.51e-01 0.0432 0.0954 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 4.45e-01 0.0711 0.093 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0751 0.108 0.218 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0649 0.128 0.218 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 1.12e-01 0.216 0.135 0.218 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 5.96e-01 0.0634 0.119 0.218 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.41e-01 0.022 0.0663 0.218 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 7.15e-01 0.0513 0.14 0.218 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 7.01e-02 0.217 0.119 0.218 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 9.44e-01 0.00555 0.0795 0.213 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0926 0.079 0.213 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0407 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 1.00e+00 7.56e-06 0.0687 0.213 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 1.71e-01 0.144 0.105 0.213 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 4.34e-01 0.0875 0.112 0.213 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.213 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 1.59e-02 -0.283 0.116 0.213 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0955 0.0957 0.208 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 9.89e-02 -0.111 0.0668 0.208 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.75e-01 0.034 0.119 0.208 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 2.95e-02 -0.184 0.0839 0.208 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0427 0.105 0.208 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 2.90e-02 0.24 0.109 0.208 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 2.16e-01 -0.131 0.106 0.208 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 7.56e-01 0.0348 0.112 0.208 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 2.14e-01 -0.136 0.109 0.22 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 1.30e-02 -0.247 0.0984 0.22 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 2.01e-01 0.154 0.12 0.22 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0568 0.101 0.22 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 5.61e-01 0.049 0.0841 0.22 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 8.64e-01 0.0232 0.135 0.22 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0703 0.103 0.22 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 5.53e-01 0.0738 0.124 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0395 0.0948 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0261 0.0769 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 6.90e-01 0.0435 0.109 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 5.32e-01 0.0633 0.101 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 5.66e-02 -0.127 0.0664 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.70e-01 0.122 0.0882 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 8.67e-01 -0.019 0.113 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 2.09e-01 0.12 0.0949 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00161 0.0706 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.86e-01 0.0315 0.116 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 7.70e-01 0.0304 0.104 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0358 0.0545 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 1.68e-01 0.11 0.0795 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 6.43e-02 0.179 0.0963 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 3.34e-01 0.063 0.065 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0524 0.0609 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 7.39e-01 0.039 0.117 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0537 0.0602 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0212 0.105 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 6.50e-02 0.13 0.0701 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 9.62e-01 0.00344 0.0722 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 8.05e-01 0.0207 0.0841 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0278 0.0771 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 4.35e-02 -0.118 0.0583 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0494 0.116 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0524 0.072 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 888250 sc-eQTL 4.08e-01 0.0931 0.112 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 4.00e-02 0.189 0.0915 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 1.96e-01 -0.125 0.0962 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 655024 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0749 0.11 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 219620 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0622 0.0734 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -964462 sc-eQTL 5.95e-01 0.0485 0.0912 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 616505 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0748 0.124 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -668350 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0617 0.0768 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -428145 sc-eQTL 7.35e-01 0.0227 0.067 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 sc-eQTL 3.12e-01 0.0915 0.0903 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -429164 sc-eQTL 2.36e-01 0.111 0.0935 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135525 MAP7 888250 eQTL 0.0102 0.0683 0.0265 0.00169 0.0 0.272
ENSG00000197442 MAP3K5 646592 eQTL 0.000829 0.0461 0.0138 0.0034 0.0 0.272
ENSG00000226004 AL591468.1 -506733 eQTL 0.0267 -0.056 0.0252 0.0 0.0 0.272

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -964462 2.67e-07 1.3e-07 5.49e-08 1.86e-07 9.79e-08 9.91e-08 1.61e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.52e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.5e-08 4.01e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.23e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.45e-07 2.93e-08 1.5e-07 1.26e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.2e-07 1.07e-07 1.02e-07 3.26e-08 3.96e-08 8.23e-08 6.34e-08 3.53e-08 5.04e-08 9.23e-08 6.37e-08 3.86e-08 5.45e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.57e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.2e-07 3.78e-09 5.01e-08
ENSG00000135525 MAP7 888250 2.8e-07 1.34e-07 5.82e-08 1.83e-07 9.8e-08 9.05e-08 1.67e-07 5.75e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.73e-07 1.11e-07 1.69e-07 7.37e-08 5.98e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.51e-07 6.75e-08 4.78e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.87e-08 1.63e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.01e-07 1.24e-07 9.49e-08 1.06e-07 2.96e-08 3.43e-08 8.89e-08 4.92e-08 3.14e-08 5.59e-08 8.61e-08 6.71e-08 4.55e-08 5.44e-08 1.46e-07 5.24e-08 1.18e-08 3.84e-08 1.89e-08 1.11e-07 1.88e-09 4.8e-08