Genes within 1Mb (chr6:137426130:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.62e-02 0.184 0.104 0.13 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 3.92e-01 0.07 0.0817 0.13 B L1
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 1.38e-01 0.183 0.123 0.13 B L1
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 9.45e-01 0.0056 0.0817 0.13 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0215 0.0658 0.13 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 9.97e-02 0.151 0.0911 0.13 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 9.45e-01 0.00709 0.104 0.13 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 8.70e-01 0.0114 0.0699 0.13 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.44e-01 0.0262 0.0801 0.13 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0555 0.112 0.13 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0356 0.0755 0.13 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0613 0.0707 0.13 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 2.23e-02 0.123 0.0533 0.13 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 1.83e-01 0.119 0.0888 0.13 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 2.02e-01 -0.1 0.0784 0.13 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 6.43e-01 0.0391 0.0842 0.13 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 3.85e-01 -0.114 0.131 0.13 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 2.42e-01 0.1 0.0855 0.13 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0568 0.0661 0.13 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.08e-01 0.112 0.0695 0.13 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 3.39e-01 -0.093 0.097 0.13 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 8.46e-01 0.0187 0.0959 0.133 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0852 0.0907 0.133 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0957 0.135 0.133 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 4.01e-01 0.0862 0.102 0.133 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 3.31e-02 -0.236 0.11 0.133 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0176 0.106 0.133 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 2.38e-01 -0.123 0.104 0.133 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0686 0.139 0.133 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 1.62e-01 0.113 0.0808 0.13 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0353 0.0658 0.13 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 2.02e-01 0.174 0.136 0.13 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0473 0.0688 0.13 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 1.17e-01 0.188 0.12 0.13 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.15e-01 0.126 0.0798 0.13 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0959 0.085 0.13 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0632 0.0972 0.13 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0485 0.09 0.129 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 5.40e-01 0.0633 0.103 0.129 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 2.21e-02 -0.316 0.137 0.129 NK L1
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0558 0.0875 0.129 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0862 0.0747 0.129 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 5.03e-01 0.072 0.107 0.129 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 5.90e-01 0.0572 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0313 0.084 0.13 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 3.88e-01 0.0769 0.0889 0.13 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0698 0.137 0.13 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 5.93e-01 0.0589 0.11 0.13 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0367 0.0522 0.13 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.61e-01 0.141 0.1 0.13 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 4.55e-01 0.0776 0.104 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 9.60e-01 0.00711 0.14 0.133 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 4.33e-02 -0.276 0.136 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0775 0.137 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 9.09e-01 0.00818 0.0712 0.133 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 2.50e-01 -0.159 0.138 0.133 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 5.94e-01 0.0825 0.154 0.133 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0531 0.121 0.133 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 6.66e-01 0.0525 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 5.71e-03 0.25 0.0894 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 6.68e-01 0.0546 0.127 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0933 0.116 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0561 0.0908 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 6.10e-01 0.0561 0.11 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 9.26e-01 0.0119 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 8.32e-01 0.0281 0.133 0.131 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 9.24e-01 0.00963 0.101 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 9.73e-01 0.00457 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 2.78e-01 0.137 0.126 0.131 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 6.96e-01 0.0339 0.0867 0.131 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 9.45e-02 -0.198 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 1.60e-01 0.181 0.128 0.131 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 3.28e-02 0.222 0.103 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 3.99e-01 0.0751 0.0888 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 2.01e-02 0.319 0.136 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 7.81e-01 0.0336 0.121 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0323 0.07 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.44e-01 0.144 0.0979 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0564 0.11 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 1.26e-01 0.195 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 6.87e-01 0.0342 0.0848 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0809 0.14 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 8.33e-02 0.176 0.101 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0729 0.102 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 5.55e-01 0.0641 0.108 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 6.25e-01 0.0643 0.132 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0122 0.121 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0406 0.111 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 7.71e-01 0.039 0.134 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 3.77e-01 0.12 0.135 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0346 0.0791 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0526 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 4.71e-01 0.0888 0.123 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0265 0.0666 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 8.31e-01 0.0168 0.0786 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 7.34e-02 -0.225 0.125 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 8.63e-01 0.018 0.104 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0135 0.0729 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 3.47e-02 0.113 0.053 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 1.76e-01 0.128 0.094 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 4.32e-01 0.0731 0.093 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 3.63e-01 0.0838 0.0919 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 9.26e-02 0.229 0.136 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 3.49e-01 -0.108 0.115 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0621 0.0669 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 8.37e-02 0.132 0.0759 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 4.23e-01 0.0754 0.0939 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0178 0.105 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 9.88e-01 0.00139 0.094 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0491 0.135 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 3.01e-01 -0.113 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 3.51e-02 -0.146 0.0687 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 4.09e-01 0.0886 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 1.59e-02 0.267 0.11 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 1.26e-01 -0.144 0.0937 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.65e-01 0.0299 0.0999 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 9.93e-01 0.00118 0.13 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 5.48e-01 0.075 0.125 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 6.92e-02 -0.144 0.0787 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 3.45e-01 0.106 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0668 0.111 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 2.13e-01 0.116 0.0926 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 9.14e-01 0.00918 0.0852 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0452 0.135 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 5.86e-01 0.0558 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0514 0.0726 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 4.54e-02 0.172 0.0854 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 9.30e-01 0.00947 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0492 0.123 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0191 0.105 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0331 0.142 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0902 0.139 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 1.17e-01 -0.105 0.0664 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 4.63e-01 0.0876 0.119 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0357 0.122 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0922 0.118 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 5.01e-01 0.0839 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0931 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 3.15e-01 -0.142 0.142 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 9.22e-01 0.00855 0.0874 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 7.91e-01 0.0359 0.135 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 9.92e-01 0.00129 0.13 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 6.91e-01 0.0384 0.0965 0.132 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 2.51e-01 0.118 0.103 0.132 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 6.12e-01 0.0664 0.131 0.132 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 8.47e-02 0.235 0.136 0.132 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 9.82e-01 0.00143 0.065 0.132 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 4.31e-02 0.228 0.112 0.132 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 1.89e-01 0.158 0.12 0.132 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.24e-02 -0.199 0.11 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 2.26e-01 -0.147 0.121 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0643 0.145 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0446 0.13 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 6.66e-01 0.0357 0.0827 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 2.53e-01 0.144 0.125 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 4.32e-01 -0.104 0.132 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0117 0.083 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.01e-01 0.0431 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 4.60e-02 -0.284 0.142 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0783 0.1 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0984 0.0779 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0116 0.117 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0384 0.109 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 5.63e-01 0.0729 0.126 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 3.75e-01 -0.122 0.138 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 5.30e-02 0.216 0.111 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 9.26e-01 0.00799 0.0861 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 6.07e-01 0.0705 0.137 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 4.26e-01 0.111 0.139 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00712 0.0876 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 8.36e-01 0.0232 0.112 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0985 0.137 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 4.83e-02 -0.205 0.103 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0989 0.0779 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 4.96e-01 0.0732 0.107 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0605 0.118 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.141 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 8.33e-01 0.0276 0.131 0.141 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0255 0.16 0.141 PB L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0225 0.0997 0.141 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 7.91e-01 0.0322 0.121 0.141 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 3.52e-01 0.128 0.137 0.141 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 3.97e-01 -0.123 0.145 0.141 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 3.61e-02 -0.236 0.112 0.13 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 5.87e-01 0.0643 0.118 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 8.47e-01 0.0266 0.137 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 9.12e-01 0.012 0.109 0.13 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0992 0.0686 0.13 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 5.06e-01 0.0887 0.133 0.13 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 2.48e-02 -0.299 0.132 0.13 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 6.00e-01 0.0649 0.124 0.13 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.98e-01 0.023 0.0898 0.13 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 9.91e-01 0.00148 0.131 0.13 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 2.71e-01 -0.156 0.141 0.13 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0674 0.0786 0.13 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 6.05e-01 0.0442 0.0852 0.13 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 5.38e-01 0.0739 0.12 0.13 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.82e-01 0.0303 0.11 0.129 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0216 0.0964 0.129 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 2.04e-01 -0.18 0.141 0.129 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 5.74e-01 0.0607 0.108 0.129 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 1.94e-01 -0.164 0.126 0.129 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0185 0.111 0.129 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0466 0.141 0.129 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0655 0.145 0.129 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 1.77e-01 0.102 0.0753 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0224 0.0745 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 3.71e-01 0.122 0.136 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0527 0.0813 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 4.59e-01 0.0867 0.117 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 8.89e-02 0.144 0.084 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00596 0.0869 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 5.03e-01 -0.073 0.109 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 5.35e-01 0.0545 0.0877 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 9.85e-01 0.00157 0.0817 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 4.95e-01 0.0962 0.141 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0209 0.078 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0313 0.131 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 5.91e-01 0.057 0.106 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0621 0.112 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0265 0.109 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 9.16e-01 0.0135 0.128 0.133 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0389 0.153 0.133 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 1.31e-01 -0.245 0.161 0.133 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 1.60e-01 0.199 0.141 0.133 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0715 0.0786 0.133 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0696 0.167 0.133 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 1.39e-01 0.211 0.142 0.133 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.21e-01 0.0335 0.0937 0.127 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0795 0.0933 0.127 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 3.23e-01 -0.125 0.126 0.127 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0856 0.0807 0.127 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 4.53e-02 0.248 0.123 0.127 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0126 0.132 0.127 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 9.21e-02 -0.203 0.12 0.127 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 2.38e-02 -0.313 0.137 0.127 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.92e-01 0.0303 0.115 0.12 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 1.85e-01 -0.106 0.0799 0.12 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 6.64e-01 0.0616 0.142 0.12 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 9.87e-01 0.00167 0.101 0.12 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 3.29e-01 0.122 0.125 0.12 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 8.82e-02 0.224 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0761 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0651 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0762 0.127 0.124 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0913 0.117 0.124 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 2.28e-02 0.318 0.138 0.124 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 5.39e-01 0.0727 0.118 0.124 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 5.13e-01 0.0642 0.0979 0.124 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.63e-01 -0.219 0.156 0.124 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 2.64e-01 -0.134 0.12 0.124 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0789 0.145 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 8.91e-01 0.015 0.109 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 3.66e-02 0.184 0.0874 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 8.76e-01 0.0195 0.125 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 8.11e-01 0.0279 0.116 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0831 0.0766 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 8.39e-01 0.0207 0.102 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0401 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 3.01e-02 0.238 0.109 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 4.71e-01 0.0591 0.0818 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 6.50e-02 0.247 0.133 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 5.07e-01 0.0799 0.12 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0359 0.0632 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.70e-01 0.127 0.0922 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0172 0.113 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 1.96e-01 0.0984 0.0759 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0204 0.0713 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 1.78e-01 0.184 0.136 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0437 0.0704 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 6.31e-01 0.0588 0.122 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 1.08e-01 0.132 0.082 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0599 0.0843 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0107 0.0982 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 4.02e-01 0.0763 0.0909 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 9.68e-02 -0.115 0.069 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0343 0.137 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0131 0.0851 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 875311 sc-eQTL 1.45e-01 0.193 0.132 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 3.52e-01 0.102 0.109 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 1.22e-01 -0.176 0.113 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 642085 sc-eQTL 1.75e-01 -0.176 0.129 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0321 0.085 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -977401 sc-eQTL 5.10e-01 0.0696 0.105 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 603566 sc-eQTL 1.66e-02 -0.342 0.141 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -681289 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0456 0.0889 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -441084 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0911 0.0772 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 633653 sc-eQTL 4.49e-01 0.0793 0.105 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -442103 sc-eQTL 3.86e-01 0.094 0.108 0.129 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 206681 eQTL 0.00988 0.0476 0.0184 0.0 0.0 0.171
ENSG00000112357 PEX7 603566 eQTL 0.0135 0.0888 0.0359 0.0 0.0 0.171


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -977401 2.76e-07 1.19e-07 3.54e-08 2.07e-07 9.65e-08 8.37e-08 1.67e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.74e-08 1.6e-07 8.14e-08 1.47e-07 6.38e-08 5.53e-08 7.37e-08 3.88e-08 1.26e-07 5.82e-08 4.03e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.39e-07 3.79e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.07e-07 8.7e-08 1.05e-07 1.03e-07 9.73e-08 3.71e-08 3.28e-08 8.56e-08 4.84e-08 3.9e-08 5.06e-08 9.61e-08 6.71e-08 6.67e-08 3.92e-08 1.33e-07 5.22e-08 7.23e-09 3.83e-08 1.84e-08 1.19e-07 4.14e-09 4.77e-08
ENSG00000112357 PEX7 603566 7.76e-07 2.67e-07 6.99e-08 4.32e-07 9.8e-08 3.41e-07 5.28e-07 5.62e-08 1.86e-07 1.5e-07 2.98e-07 1.86e-07 6e-07 8.85e-08 9.2e-08 1.46e-07 8.64e-08 3.02e-07 9.97e-08 5.2e-08 1.6e-07 2.24e-07 2.56e-07 4.34e-08 4.67e-07 1.94e-07 1.97e-07 1.12e-07 1.54e-07 3.93e-07 1.59e-07 4.93e-08 4.16e-08 1.54e-07 2.82e-07 3.07e-08 6.14e-08 6.11e-08 5.93e-08 4.07e-08 4.53e-08 2.43e-07 5.54e-08 2.65e-08 9.64e-08 1.3e-08 9.1e-08 2.07e-09 4.99e-08
ENSG00000135525 \N 875311 2.95e-07 1.3e-07 4.08e-08 2.25e-07 8.92e-08 1.03e-07 2.1e-07 5.33e-08 1.41e-07 5.67e-08 1.55e-07 8.68e-08 1.71e-07 6.76e-08 6.17e-08 7.49e-08 3.98e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.2e-08 1.22e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.23e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.18e-07 9.15e-08 1.09e-07 1e-07 9.64e-08 3.96e-08 3.56e-08 9.78e-08 3.12e-08 3.97e-08 5.03e-08 9.36e-08 6.28e-08 7.53e-08 5.13e-08 1.33e-07 3.08e-08 2.09e-08 2.82e-08 1.92e-08 1.19e-07 3.99e-09 4.91e-08
ENSG00000237499 \N -442103 1.25e-06 9.07e-07 1.54e-07 7.96e-07 9.93e-08 6.09e-07 1.13e-06 9.07e-08 5.3e-07 2.85e-07 1.07e-06 5.22e-07 1.58e-06 2.09e-07 3.9e-07 4.84e-07 7.79e-07 5.27e-07 3.06e-07 8.11e-08 2.72e-07 5.49e-07 5.87e-07 2.49e-07 1.74e-06 2.37e-07 5.82e-07 2.24e-07 5.56e-07 1.04e-06 4.26e-07 4.75e-08 4.49e-08 6.38e-07 3.42e-07 6.85e-08 1.09e-07 1.09e-07 2.44e-07 2.44e-07 8.15e-08 8.79e-07 4.26e-07 1.31e-07 1.85e-07 3.54e-08 1.54e-07 1.26e-08 5.52e-08