logo

Genes within 1Mb (chr6:137424312:AT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 3.57e-02 0.204 0.0963 0.167 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0198 0.0764 0.167 B L1
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 1.41e-01 0.169 0.115 0.167 B L1
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 5.72e-01 0.0431 0.0762 0.167 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0819 0.0612 0.167 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 5.70e-02 0.162 0.0849 0.167 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0229 0.0966 0.167 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 3.03e-01 0.0679 0.0657 0.167 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00866 0.0755 0.167 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0621 0.106 0.167 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0827 0.071 0.167 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0894 0.0665 0.167 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.51e-02 0.101 0.0504 0.167 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 4.31e-01 0.0662 0.0839 0.167 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0823 0.0739 0.167 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 8.92e-01 0.0107 0.0793 0.167 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.33e-01 -0.147 0.123 0.167 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 8.52e-01 0.0151 0.0808 0.167 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0565 0.0623 0.167 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 2.74e-01 0.0722 0.0657 0.167 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0657 0.0915 0.167 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0196 0.0903 0.169 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0486 0.0855 0.169 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.53e-01 -0.145 0.127 0.169 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 3.96e-01 0.0819 0.0963 0.169 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 1.19e-01 -0.162 0.104 0.169 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 9.05e-01 -0.012 0.1 0.169 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0648 0.0982 0.169 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00416 0.131 0.169 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 3.69e-02 0.159 0.0757 0.167 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0185 0.062 0.167 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 3.51e-01 0.12 0.128 0.167 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0365 0.0648 0.167 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 3.72e-01 0.101 0.113 0.167 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.72e-02 0.15 0.075 0.167 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0402 0.0803 0.167 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 9.59e-01 0.00468 0.0917 0.167 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0534 0.0854 0.165 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 3.91e-01 0.084 0.0977 0.165 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 5.96e-02 -0.248 0.131 0.165 NK L1
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0319 0.0831 0.165 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0902 0.0708 0.165 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0358 0.102 0.165 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 4.93e-01 0.0692 0.101 0.165 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0249 0.0775 0.167 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 3.40e-01 0.0785 0.0821 0.167 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0651 0.126 0.167 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 7.43e-01 0.0333 0.101 0.167 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0481 0.0482 0.167 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 1.17e-01 0.146 0.0927 0.167 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 5.85e-01 0.0524 0.0957 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 9.30e-01 0.0114 0.129 0.168 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 5.72e-02 -0.24 0.125 0.168 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0184 0.127 0.168 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 2.11e-01 0.0821 0.0655 0.168 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 2.66e-01 -0.142 0.127 0.168 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.73e-01 0.103 0.143 0.168 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0597 0.111 0.168 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 3.33e-01 0.111 0.114 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 3.29e-01 0.0836 0.0854 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 5.27e-01 0.0756 0.119 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0866 0.109 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0809 0.0853 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 7.78e-01 0.0292 0.103 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 9.83e-01 0.00259 0.121 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 9.20e-01 0.0126 0.125 0.168 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0601 0.0951 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 9.23e-01 0.0122 0.126 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 3.67e-02 0.247 0.117 0.168 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 6.20e-01 0.0405 0.0816 0.168 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 2.07e-01 -0.141 0.111 0.168 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 2.66e-01 0.135 0.121 0.168 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 2.23e-02 0.223 0.0968 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0167 0.0834 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 3.25e-02 0.275 0.128 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 7.43e-01 0.0372 0.113 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0858 0.0653 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 1.62e-01 0.129 0.0918 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0137 0.103 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 2.64e-02 0.261 0.117 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0227 0.0783 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0542 0.129 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 2.03e-01 0.12 0.0938 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.56e-01 -0.133 0.0936 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.55e-01 0.0748 0.1 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 6.94e-01 0.0479 0.122 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 9.01e-01 0.0141 0.112 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0251 0.104 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.06e-01 0.0644 0.125 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 8.38e-01 0.0259 0.126 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0381 0.0736 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0885 0.117 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 4.76e-01 0.0817 0.115 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 6.20e-01 0.0315 0.0634 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 9.54e-01 0.00431 0.0748 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.52e-02 -0.22 0.119 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 6.30e-01 0.0477 0.0987 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0398 0.0692 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 1.15e-01 0.08 0.0506 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 4.55e-01 0.0671 0.0896 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 4.09e-01 0.0727 0.0878 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 8.64e-01 0.0149 0.0869 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.19e-02 0.294 0.127 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 2.39e-01 -0.128 0.109 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0717 0.0631 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 2.81e-01 0.0778 0.0719 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 3.49e-01 0.0831 0.0886 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 5.12e-01 0.0646 0.0983 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0133 0.0885 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.87e-01 -0.135 0.127 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 1.28e-01 -0.156 0.102 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 8.56e-03 -0.171 0.0643 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 6.76e-01 0.0422 0.101 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 1.44e-01 0.153 0.104 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 2.08e-01 -0.112 0.0883 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 9.04e-01 0.0114 0.094 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0618 0.122 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 4.54e-01 0.0879 0.117 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 6.02e-02 -0.14 0.074 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 3.11e-01 0.107 0.105 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 9.25e-01 0.00987 0.105 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 2.30e-01 0.105 0.0869 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 8.82e-01 0.0118 0.0799 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0795 0.126 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 9.17e-01 -0.01 0.0961 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0348 0.0682 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 7.29e-02 0.145 0.0802 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0349 0.101 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000328 0.115 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 4.46e-01 -0.075 0.0981 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 8.14e-01 0.0312 0.132 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 1.12e-01 -0.206 0.129 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0781 0.0623 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.99e-01 0.0755 0.112 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0101 0.114 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0234 0.112 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.15e-01 0.043 0.117 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 4.20e-01 -0.104 0.129 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 2.01e-01 -0.171 0.133 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00195 0.0825 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 9.21e-01 0.0127 0.128 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0394 0.122 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 9.47e-01 0.00604 0.09 0.167 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 1.50e-01 0.138 0.0957 0.167 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 3.68e-01 0.11 0.122 0.167 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 2.38e-01 0.15 0.127 0.167 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0252 0.0605 0.167 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 8.75e-02 0.18 0.105 0.167 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 5.52e-01 0.0667 0.112 0.167 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 3.15e-02 -0.221 0.102 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 2.69e-01 -0.125 0.112 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0168 0.135 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0585 0.121 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 8.67e-01 0.0129 0.077 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.33e-01 0.0919 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0497 0.123 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000436 0.0805 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 4.17e-01 0.0883 0.109 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 3.02e-01 -0.143 0.138 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0367 0.0974 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.82e-01 -0.101 0.0754 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 6.55e-01 0.0488 0.109 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00323 0.114 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0322 0.103 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.77e-01 0.0337 0.119 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.03e-01 -0.166 0.13 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 1.13e-01 0.167 0.105 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 8.11e-01 0.0195 0.0814 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0401 0.129 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 1.84e-01 0.174 0.131 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00961 0.0826 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 8.57e-01 0.019 0.106 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.79e-01 -0.14 0.129 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 2.73e-02 -0.216 0.0972 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.25e-01 -0.113 0.0733 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00283 0.101 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0392 0.111 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 6.28e-01 0.0708 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0406 0.123 0.17 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.69e-01 0.0641 0.15 0.17 PB L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 8.14e-01 -0.022 0.0935 0.17 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0257 0.113 0.17 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 1.89e-01 0.169 0.128 0.17 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 1.14e-01 -0.215 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 5.91e-02 -0.197 0.104 0.167 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 9.13e-01 0.0119 0.109 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0624 0.127 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0374 0.101 0.167 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 6.12e-02 -0.119 0.0632 0.167 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 3.94e-01 0.105 0.123 0.167 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 2.62e-01 -0.139 0.123 0.167 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 3.11e-01 0.119 0.117 0.167 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 9.89e-01 0.00114 0.0852 0.167 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 7.60e-01 0.0379 0.124 0.167 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 1.77e-01 -0.181 0.133 0.167 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.79e-01 -0.1 0.0743 0.167 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 4.04e-01 0.0675 0.0807 0.167 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 3.66e-01 0.103 0.114 0.167 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0133 0.104 0.166 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0296 0.0911 0.166 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.25e-01 -0.162 0.133 0.166 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 3.84e-01 0.0888 0.102 0.166 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 2.18e-01 -0.147 0.119 0.166 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 7.45e-01 0.0342 0.105 0.166 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00712 0.133 0.166 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0703 0.137 0.166 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 4.27e-02 0.144 0.0708 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0203 0.0704 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 3.45e-01 0.121 0.128 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 6.50e-01 -0.035 0.0769 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00775 0.111 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 1.59e-01 0.112 0.0796 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 7.00e-01 0.0316 0.0821 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0255 0.103 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 1.39e-01 0.122 0.082 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0335 0.0768 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 7.55e-01 0.0414 0.132 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 5.53e-01 0.0436 0.0732 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 9.08e-01 0.0143 0.123 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 2.20e-01 0.122 0.0993 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 7.27e-01 0.0368 0.105 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 5.83e-01 0.0565 0.103 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0181 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00128 0.144 0.167 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0446 0.153 0.167 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 1.61e-01 0.187 0.133 0.167 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0436 0.0742 0.167 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 9.60e-01 0.00795 0.157 0.167 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 4.22e-01 0.108 0.134 0.167 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 1.37e-01 0.13 0.0871 0.162 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0368 0.0873 0.162 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0519 0.118 0.162 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0138 0.0756 0.162 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 4.45e-01 0.0887 0.116 0.162 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 6.65e-01 0.0533 0.123 0.162 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0988 0.112 0.162 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 8.90e-02 -0.221 0.129 0.162 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 4.96e-01 0.0723 0.106 0.156 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0853 0.0742 0.156 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00344 0.132 0.156 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0195 0.094 0.156 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 4.43e-01 0.0892 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 1.13e-02 0.307 0.12 0.156 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0973 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0492 0.124 0.156 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0232 0.12 0.167 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0583 0.11 0.167 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 5.59e-01 0.0772 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 9.26e-01 0.0103 0.111 0.167 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00147 0.0922 0.167 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 2.66e-01 -0.164 0.147 0.167 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 3.20e-01 -0.112 0.112 0.167 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0595 0.136 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 5.59e-01 0.0602 0.103 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 6.93e-01 0.033 0.0835 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.79e-01 0.0491 0.118 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 3.93e-01 0.094 0.11 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.55e-01 -0.103 0.0723 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 8.87e-01 0.0137 0.0962 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0713 0.123 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 1.49e-02 0.25 0.102 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0223 0.0767 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 7.23e-02 0.226 0.125 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 5.12e-01 0.0739 0.113 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0914 0.0589 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 1.08e-01 0.139 0.0862 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 9.70e-01 0.00393 0.105 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 2.31e-02 0.163 0.0712 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0273 0.0675 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 2.87e-01 0.138 0.129 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0154 0.0667 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 9.50e-01 0.0072 0.116 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 5.64e-02 0.149 0.0775 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 9.48e-01 0.00524 0.0799 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 3.89e-01 0.0802 0.0928 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 1.69e-01 0.117 0.0852 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0894 0.065 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0501 0.129 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 9.88e-01 0.00122 0.08 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 873493 sc-eQTL 4.72e-01 0.0898 0.125 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 9.26e-02 0.172 0.102 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 2.21e-01 -0.131 0.107 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 640267 sc-eQTL 2.08e-01 -0.153 0.121 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204863 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0125 0.0808 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979219 sc-eQTL 3.65e-01 0.0908 0.1 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601748 sc-eQTL 4.39e-02 -0.274 0.135 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -683107 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0188 0.0845 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -442902 sc-eQTL 1.57e-01 -0.104 0.0733 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0249 0.0995 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -443921 sc-eQTL 3.47e-01 0.0969 0.103 0.166 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000197442 MAP3K5 631835 eQTL 0.0129 0.0373 0.015 0.0 0.0 0.228
ENSG00000220412 AL356234.1 -282889 eQTL 0.0155 -0.071 0.0293 0.00178 0.0 0.228
ENSG00000226004 AL591468.1 -521490 eQTL 0.0385 -0.0568 0.0274 0.0 0.0 0.228
ENSG00000237499 AL357060.1 -443921 eQTL 0.00857 -0.04 0.0152 0.00185 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -979219 2.6e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.66e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.31e-07 5.29e-08 1.32e-07 3.99e-08 1.59e-07 7.4e-08 1.2e-07 6.07e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.33e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.08e-07 9.5e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.32e-08 3.84e-08 8e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.71e-08 1.42e-07 4.33e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000112357 \N 601748 2.61e-07 1.11e-07 3.28e-08 1.68e-07 1.03e-07 9.13e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.36e-07 3.99e-08 1.63e-07 7.6e-08 1.21e-07 6.21e-08 4.77e-08 7.76e-08 5.15e-08 1.06e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.19e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.75e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.09e-08 1.01e-07 4.14e-08 4.01e-08 8e-08 8.44e-08 3.96e-08 2.71e-08 1.4e-07 4.36e-08 0.0 1.15e-07 1.83e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000135525 \N 873493 2.66e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.65e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.32e-07 3.99e-08 1.59e-07 7.49e-08 1.2e-07 6.07e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.06e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.33e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.23e-08 3.84e-08 8e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.71e-08 1.42e-07 4.51e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000237499 AL357060.1 -443921 2.74e-07 1.06e-07 3.31e-08 1.78e-07 1.02e-07 9.32e-08 1.42e-07 5.29e-08 1.37e-07 3.99e-08 1.6e-07 8.02e-08 1.23e-07 6.56e-08 4.89e-08 7.87e-08 5.12e-08 1.1e-07 5.12e-08 2.88e-08 1.03e-07 1.33e-07 1.29e-07 5.19e-08 1.31e-07 1.09e-07 1.11e-07 8.49e-08 9.97e-08 1.11e-07 9.58e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.26e-08 9.56e-08 4.12e-08 5.09e-08 8.48e-08 8.44e-08 3.96e-08 2.71e-08 1.37e-07 4.01e-08 0.0 1.15e-07 1.8e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08