logo

Genes within 1Mb (chr6:137423949:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 4.88e-01 -0.056 0.0806 0.254 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 9.36e-01 0.00511 0.0633 0.254 B L1
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 9.36e-01 0.00773 0.0955 0.254 B L1
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 7.14e-01 0.0232 0.0632 0.254 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0388 0.0508 0.254 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 1.42e-02 0.173 0.0699 0.254 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 1.02e-01 -0.131 0.0796 0.254 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0269 0.0546 0.254 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.94e-01 0.0658 0.0625 0.254 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 1.66e-01 -0.122 0.0876 0.254 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 5.72e-01 0.0334 0.059 0.254 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0331 0.0553 0.254 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 6.88e-02 -0.0766 0.0418 0.254 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0783 0.0695 0.254 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.52e-01 0.0116 0.0622 0.254 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 4.46e-01 0.0508 0.0665 0.254 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 4.74e-01 0.0743 0.104 0.254 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0216 0.0678 0.254 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 7.27e-01 0.0183 0.0523 0.254 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 3.66e-01 -0.05 0.0552 0.254 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0358 0.0768 0.254 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0323 0.0739 0.259 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.13e-01 0.111 0.0696 0.259 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 9.55e-01 0.00587 0.104 0.259 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0177 0.079 0.259 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 1.48e-01 0.124 0.0851 0.259 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00333 0.082 0.259 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00512 0.0805 0.259 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 9.38e-01 0.00837 0.107 0.259 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0308 0.0616 0.254 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.84e-02 0.109 0.0494 0.254 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 5.20e-02 -0.201 0.103 0.254 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0179 0.0522 0.254 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 6.23e-01 -0.045 0.0914 0.254 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 5.75e-01 0.0342 0.0609 0.254 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 5.33e-01 0.0404 0.0647 0.254 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00805 0.0739 0.254 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0549 0.0681 0.255 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.90e-02 0.182 0.0771 0.255 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 4.64e-01 0.0771 0.105 0.255 NK L1
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0066 0.0663 0.255 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00935 0.0568 0.255 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 8.25e-01 0.018 0.0813 0.255 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 3.13e-01 0.0812 0.0803 0.255 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.18e-01 0.0149 0.0649 0.254 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 4.82e-02 0.136 0.0682 0.254 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0397 0.106 0.254 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 3.04e-01 0.0873 0.0848 0.254 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.96e-01 0.00531 0.0404 0.254 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0387 0.078 0.254 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0366 0.0802 0.254 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.57e-01 -0.02 0.111 0.245 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00605 0.108 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 5.08e-01 0.0721 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0132 0.0563 0.245 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 3.79e-01 0.0961 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 6.48e-01 0.0559 0.122 0.245 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 4.35e-01 0.0745 0.0952 0.245 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 3.67e-01 0.0861 0.0953 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0951 0.0713 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 4.86e-01 0.0696 0.0998 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 2.37e-01 -0.108 0.0908 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.09e-01 0.0173 0.0715 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00591 0.0864 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0195 0.101 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 1.63e-01 -0.143 0.102 0.252 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 6.87e-01 0.0315 0.0781 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0508 0.103 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 8.79e-01 0.0149 0.0973 0.252 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 2.26e-02 -0.152 0.0662 0.252 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 3.65e-01 0.0829 0.0913 0.252 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 5.56e-02 -0.19 0.0988 0.252 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 7.02e-01 -0.031 0.0809 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 9.74e-01 0.00222 0.0689 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0322 0.107 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0788 0.0932 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0292 0.0541 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 2.97e-02 0.165 0.0753 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0776 0.0847 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 2.38e-01 -0.117 0.0991 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 5.05e-01 0.044 0.0659 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0232 0.109 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 6.56e-01 0.0353 0.0792 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0573 0.0791 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 3.62e-02 0.176 0.0834 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.86e-01 -0.109 0.102 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 2.75e-01 -0.103 0.0941 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0151 0.0871 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 8.19e-01 0.024 0.105 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 2.46e-01 -0.123 0.106 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 2.89e-01 0.0656 0.0617 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 2.13e-02 -0.226 0.0974 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.80e-01 -0.104 0.096 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.27e-01 0.0252 0.0519 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 9.60e-02 0.102 0.0608 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 7.81e-02 -0.172 0.0973 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 5.03e-01 0.0542 0.0808 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0266 0.0567 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0413 0.0416 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0751 0.0733 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.91e-02 -0.122 0.0716 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 5.50e-01 0.0426 0.0712 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 6.20e-01 0.0525 0.106 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 3.12e-02 0.192 0.0884 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0622 0.0517 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 1.96e-02 -0.137 0.0584 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0925 0.0725 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0353 0.0825 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.53e-02 0.165 0.0733 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 9.31e-01 0.00927 0.106 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 1.82e-01 0.115 0.0859 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0295 0.0548 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0513 0.0846 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.42e-01 -0.103 0.0876 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0378 0.0739 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 4.07e-01 0.0651 0.0783 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0339 0.102 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0192 0.0978 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 7.83e-01 0.0172 0.0622 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 8.95e-01 0.0116 0.0878 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.24e-01 0.0429 0.0874 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 2.52e-01 0.084 0.0731 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 6.11e-01 0.0342 0.0672 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 5.31e-01 0.0666 0.106 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0183 0.0808 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 9.26e-01 0.0053 0.0574 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0393 0.0679 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0897 0.0846 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00559 0.0952 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0682 0.0809 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 9.01e-01 0.0136 0.109 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0158 0.107 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 5.58e-01 0.0302 0.0516 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 2.25e-01 -0.112 0.0918 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.47e-01 -0.109 0.0941 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.69e-01 0.0158 0.0955 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.73e-01 0.11 0.0999 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 2.12e-01 -0.137 0.109 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 1.58e-01 -0.161 0.114 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0222 0.0704 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 2.44e-01 0.127 0.109 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0205 0.105 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0622 0.0757 0.251 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 4.64e-01 0.0594 0.081 0.251 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 7.46e-01 0.0333 0.103 0.251 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 6.80e-01 0.0443 0.107 0.251 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 7.84e-01 -0.014 0.051 0.251 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0722 0.0888 0.251 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0367 0.0943 0.251 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00918 0.081 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.84e-01 0.117 0.0881 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0856 0.105 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 1.65e-01 -0.131 0.0942 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.95e-01 0.00796 0.0603 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 9.92e-01 0.00097 0.0918 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 7.90e-01 0.0257 0.0962 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0516 0.0629 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 3.52e-02 0.179 0.0843 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 6.42e-01 0.0506 0.109 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00247 0.0763 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0162 0.0594 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 6.29e-01 0.0413 0.0854 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 4.76e-01 0.0634 0.0888 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.59e-01 0.0146 0.0819 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.81e-01 0.102 0.0946 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 5.65e-01 0.0599 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 6.43e-01 0.0391 0.0843 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0797 0.0647 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0121 0.103 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.90e-01 0.111 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0574 0.0665 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.51e-01 0.122 0.0847 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 2.35e-01 0.124 0.104 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 4.27e-01 0.0631 0.0792 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00186 0.0594 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 9.23e-01 0.00789 0.0817 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 5.59e-02 0.171 0.0888 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00802 0.129 0.256 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.87e-01 0.143 0.108 0.256 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 8.62e-02 0.226 0.13 0.256 PB L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 7.81e-01 0.023 0.0825 0.256 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 9.30e-01 0.00882 0.1 0.256 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 8.27e-01 0.025 0.114 0.256 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.25e-02 -0.223 0.118 0.256 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 1.79e-01 0.113 0.0836 0.257 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 5.40e-01 0.0538 0.0877 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0384 0.102 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 3.66e-01 0.0733 0.081 0.257 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0498 0.051 0.257 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0203 0.0991 0.257 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0591 0.0992 0.257 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0402 0.0986 0.254 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.58e-01 0.0809 0.0713 0.254 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 1.52e-01 -0.149 0.104 0.254 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 9.03e-01 0.0137 0.113 0.254 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 9.91e-01 0.000741 0.0627 0.254 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 5.34e-01 0.0422 0.0679 0.254 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 1.90e-01 0.125 0.0952 0.254 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0705 0.0808 0.271 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0194 0.0713 0.271 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.105 0.271 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 9.80e-01 0.00199 0.0798 0.271 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 4.94e-01 0.0639 0.0932 0.271 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 1.65e-01 0.114 0.0817 0.271 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.37e-01 0.0491 0.104 0.271 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 4.34e-01 0.0838 0.107 0.271 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0115 0.0578 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.29e-01 0.0862 0.0566 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 2.39e-01 -0.122 0.104 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0373 0.0621 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0215 0.0895 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0552 0.0645 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 9.34e-01 0.00551 0.0664 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0611 0.083 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 7.10e-01 0.025 0.0671 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 4.51e-01 0.0472 0.0624 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 1.08e-01 -0.173 0.107 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 6.18e-01 0.0298 0.0596 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0798 0.1 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 1.80e-01 0.109 0.0807 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 2.81e-01 0.0923 0.0854 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 5.51e-01 0.0498 0.0835 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 7.38e-01 0.0317 0.0944 0.264 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.35e-01 0.133 0.112 0.264 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 3.72e-01 -0.107 0.119 0.264 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 3.21e-01 0.104 0.104 0.264 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.79e-01 0.00883 0.0581 0.264 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 3.57e-01 0.113 0.123 0.264 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 3.40e-01 -0.1 0.105 0.264 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.95e-01 0.0279 0.0708 0.258 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.75e-02 0.155 0.0698 0.258 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 5.15e-01 0.0622 0.0954 0.258 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0457 0.0611 0.258 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0964 0.0938 0.258 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 1.13e-01 0.158 0.099 0.258 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.87e-01 0.0368 0.0912 0.258 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 9.96e-01 0.000482 0.105 0.258 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0641 0.0825 0.258 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 9.00e-01 0.00726 0.0579 0.258 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0492 0.102 0.258 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00384 0.0731 0.258 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0352 0.0904 0.258 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 2.10e-01 0.119 0.0946 0.258 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 3.20e-01 -0.091 0.0912 0.258 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0643 0.0963 0.258 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0377 0.0927 0.263 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.32e-02 0.192 0.0836 0.263 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0747 0.102 0.263 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0866 0.0857 0.263 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 4.54e-01 0.0535 0.0712 0.263 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 4.89e-02 -0.224 0.113 0.263 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0126 0.0873 0.263 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0328 0.105 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 7.92e-01 0.0223 0.0841 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0776 0.068 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 8.20e-01 0.022 0.0968 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 9.78e-01 0.00252 0.0899 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0285 0.0593 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00184 0.0786 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0679 0.1 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0905 0.0849 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 7.94e-01 0.0165 0.0631 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0115 0.104 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0756 0.0926 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0502 0.0486 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 6.68e-03 0.192 0.0702 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 1.89e-01 -0.114 0.0864 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00843 0.0583 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 1.71e-01 0.0745 0.0543 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 4.10e-02 -0.213 0.104 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0188 0.0539 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0262 0.0935 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 9.70e-01 0.00238 0.0632 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 6.08e-01 0.0332 0.0646 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0154 0.0752 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0333 0.0683 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.82e-02 0.114 0.0515 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0157 0.103 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.51e-01 -0.012 0.0638 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 873130 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0215 0.0996 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 1.16e-01 0.128 0.0814 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0512 0.0855 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 639904 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0318 0.0971 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 204500 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0563 0.0643 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -979582 sc-eQTL 2.64e-02 0.177 0.079 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 601385 sc-eQTL 2.69e-01 0.12 0.108 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -683470 sc-eQTL 6.94e-01 0.0265 0.0674 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -443265 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0111 0.0587 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 631472 sc-eQTL 7.52e-01 0.0251 0.0793 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -444284 sc-eQTL 3.05e-01 0.0842 0.0819 0.256 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 501648 eQTL 0.0139 -0.0859 0.0348 0.00222 0.0 0.27
ENSG00000220412 AL356234.1 -283252 eQTL 0.0288 -0.0589 0.0269 0.0011 0.0 0.27
ENSG00000237499 AL357060.1 -444284 eQTL 0.0364 -0.0293 0.014 0.0 0.0 0.27

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina