logo

Genes within 1Mb (chr6:137416972:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 1.37e-01 -0.174 0.116 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 1.26e-01 -0.14 0.0913 0.1 B L1
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0131 0.139 0.1 B L1
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0795 0.0915 0.1 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0385 0.0738 0.1 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.77e-02 -0.243 0.102 0.1 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 7.20e-02 0.208 0.115 0.1 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0268 0.0778 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 7.20e-01 -0.032 0.0893 0.1 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0645 0.125 0.1 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 8.61e-01 0.0147 0.0842 0.1 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 7.81e-01 0.0219 0.0789 0.1 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0395 0.06 0.1 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 1.50e-01 -0.143 0.0988 0.1 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 8.26e-01 0.0198 0.0898 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 2.43e-01 -0.112 0.0958 0.1 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 4.15e-01 -0.122 0.15 0.1 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0113 0.0979 0.1 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0386 0.0755 0.1 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 9.17e-01 0.00835 0.0799 0.1 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0232 0.111 0.1 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0906 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.36e-01 0.0478 0.101 0.099 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 2.61e-03 0.447 0.147 0.099 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 2.12e-01 0.142 0.113 0.099 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 3.36e-01 0.119 0.123 0.099 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0501 0.118 0.099 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 3.98e-03 0.331 0.114 0.099 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0258 0.154 0.099 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0523 0.09 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 1.38e-01 0.108 0.0727 0.1 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 9.70e-01 0.00572 0.152 0.1 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0912 0.0762 0.1 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 3.52e-01 -0.125 0.134 0.1 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0884 0.089 0.1 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 2.18e-01 -0.117 0.0944 0.1 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0974 0.108 0.1 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.96e-01 0.0387 0.0988 0.101 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0383 0.113 0.101 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 3.08e-01 -0.156 0.152 0.101 NK L1
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 6.88e-01 0.0387 0.0961 0.101 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0403 0.0822 0.101 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00451 0.118 0.101 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0193 0.117 0.101 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0768 0.0932 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 2.96e-02 -0.214 0.0978 0.1 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 1.89e-01 0.2 0.152 0.1 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 6.56e-02 -0.224 0.121 0.1 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 1.18e-02 -0.145 0.0572 0.1 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 2.44e-02 -0.251 0.111 0.1 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 9.34e-01 0.00952 0.115 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00748 0.151 0.102 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.30e-01 0.0717 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 7.12e-01 0.0551 0.149 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 8.42e-01 0.0154 0.0771 0.102 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0338 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 4.13e-01 -0.137 0.167 0.102 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 3.87e-01 -0.113 0.13 0.102 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 4.03e-01 0.115 0.138 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0909 0.103 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 2.01e-02 -0.334 0.143 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 3.24e-01 0.13 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 1.44e-01 -0.151 0.103 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 6.31e-01 -0.06 0.125 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 5.60e-01 0.0855 0.146 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 8.31e-01 0.0322 0.151 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00509 0.115 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 4.55e-01 0.114 0.152 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 2.83e-01 -0.154 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 3.10e-01 -0.1 0.0984 0.101 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.13e-01 -0.213 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0908 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 2.63e-01 -0.133 0.119 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 1.15e-01 -0.159 0.101 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 8.74e-01 0.0249 0.157 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0878 0.137 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0886 0.0794 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.16e-01 -0.176 0.111 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 1.56e-01 0.177 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 1.65e-01 -0.202 0.145 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0893 0.0966 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 9.39e-01 0.0123 0.16 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 3.09e-01 -0.118 0.116 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0755 0.116 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 9.56e-03 -0.318 0.122 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 1.30e-01 0.227 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 8.46e-01 0.0269 0.138 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 4.30e-01 0.1 0.127 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 7.81e-01 0.0426 0.153 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 2.39e-01 -0.182 0.155 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0935 0.0902 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.73e-02 -0.342 0.142 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 3.57e-01 -0.13 0.14 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0326 0.0741 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0351 0.0875 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0868 0.14 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0548 0.115 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 9.74e-01 0.00269 0.0811 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00914 0.0595 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 2.83e-01 -0.113 0.105 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 3.52e-01 0.0973 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 3.07e-01 -0.106 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 7.33e-02 -0.274 0.152 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 4.04e-01 -0.108 0.13 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 8.12e-01 -0.018 0.0754 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0304 0.0858 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 1.04e-01 -0.171 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0121 0.118 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0559 0.106 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 8.39e-03 0.4 0.15 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 9.31e-01 0.0108 0.124 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 1.86e-01 0.104 0.0782 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 7.52e-01 0.0383 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 1.14e-01 -0.198 0.125 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.50e-01 0.049 0.108 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 1.80e-01 -0.153 0.114 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 3.90e-02 -0.305 0.147 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 3.22e-01 -0.141 0.142 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 1.29e-01 -0.138 0.0903 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 8.02e-01 0.0322 0.128 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 2.27e-02 -0.289 0.126 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0276 0.107 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0375 0.0977 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 5.04e-01 0.103 0.154 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 5.82e-01 0.0648 0.117 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 2.76e-01 0.0908 0.0832 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0786 0.0987 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 2.26e-01 0.149 0.123 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 1.22e-01 0.213 0.137 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0584 0.117 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0354 0.158 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 3.21e-01 0.154 0.155 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 4.68e-01 0.0542 0.0746 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 6.83e-01 0.0546 0.133 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 2.22e-01 -0.167 0.136 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00145 0.132 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0494 0.138 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 8.29e-01 0.0328 0.152 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 5.24e-01 -0.101 0.158 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 1.52e-02 -0.235 0.0958 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 5.50e-01 -0.09 0.15 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0589 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0346 0.108 0.102 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 7.41e-02 -0.205 0.114 0.102 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 8.84e-01 0.0214 0.146 0.102 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0708 0.152 0.102 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 2.60e-02 -0.161 0.0717 0.102 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.25e-04 -0.477 0.122 0.102 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 6.85e-01 0.0545 0.134 0.102 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 4.23e-01 0.0943 0.118 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0594 0.128 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 3.75e-01 0.136 0.153 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00886 0.138 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 8.97e-01 0.0113 0.0877 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 3.52e-01 0.124 0.133 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0235 0.14 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 7.73e-01 0.0262 0.0908 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 2.92e-01 -0.129 0.122 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 2.05e-01 -0.198 0.156 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 7.93e-01 0.029 0.11 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0619 0.0854 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.00e+00 2.66e-05 0.123 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0604 0.128 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 2.34e-01 0.14 0.117 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 5.64e-01 0.0786 0.136 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 8.85e-01 0.0216 0.149 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0956 0.121 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 1.22e-01 -0.144 0.0925 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 2.53e-01 0.169 0.147 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 3.71e-01 0.134 0.15 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0122 0.0961 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0696 0.123 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 1.36e-01 -0.225 0.15 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 4.46e-01 0.0874 0.114 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0147 0.0858 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0958 0.118 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0728 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 3.98e-01 -0.165 0.195 0.096 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 4.95e-01 0.112 0.164 0.096 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 3.41e-01 0.191 0.2 0.096 PB L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 2.50e-01 0.144 0.125 0.096 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 7.98e-01 0.039 0.152 0.096 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.37e-01 -0.257 0.171 0.096 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0154 0.183 0.096 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 5.47e-01 0.0732 0.121 0.1 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 5.34e-02 -0.244 0.126 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 5.33e-01 0.0919 0.147 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.117 0.1 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0255 0.0739 0.1 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 1.54e-01 0.204 0.142 0.1 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 7.68e-01 0.0424 0.143 0.1 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 5.23e-01 -0.09 0.141 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0271 0.102 0.1 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 6.78e-01 0.0618 0.149 0.1 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 5.18e-01 0.104 0.161 0.1 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 8.92e-01 0.0122 0.0895 0.1 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0582 0.0969 0.1 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 2.12e-01 -0.17 0.136 0.1 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0693 0.118 0.102 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 1.91e-01 0.136 0.104 0.102 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 5.26e-02 0.295 0.151 0.102 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 7.44e-01 0.0381 0.117 0.102 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 5.39e-01 0.0837 0.136 0.102 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0566 0.12 0.102 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 9.18e-02 0.255 0.151 0.102 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 7.05e-01 0.0593 0.156 0.102 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 3.02e-01 -0.086 0.0832 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 4.82e-01 0.0578 0.0821 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 5.36e-01 0.0929 0.15 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0543 0.0897 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0183 0.129 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 2.83e-01 -0.1 0.0931 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0789 0.0957 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 4.95e-01 -0.082 0.12 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 3.43e-01 0.0915 0.0964 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 1.31e-01 0.136 0.0894 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0987 0.155 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 1.24e-01 -0.132 0.0853 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 2.15e-01 -0.179 0.144 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 3.99e-01 0.0985 0.116 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 7.15e-01 0.0451 0.123 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 2.18e-01 -0.148 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0665 0.14 0.1 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 8.24e-01 0.0374 0.167 0.1 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0646 0.178 0.1 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 4.53e-02 -0.31 0.153 0.1 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00695 0.0865 0.1 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 6.02e-01 0.0954 0.183 0.1 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 4.13e-04 -0.542 0.15 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 2.07e-01 -0.129 0.102 0.098 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.38e-01 0.0481 0.102 0.098 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 5.14e-01 0.0903 0.138 0.098 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 9.21e-01 0.00876 0.0886 0.098 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0222 0.136 0.098 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 4.82e-01 -0.102 0.144 0.098 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0374 0.132 0.098 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 7.79e-01 0.0427 0.152 0.098 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0589 0.121 0.097 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0338 0.0849 0.097 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 4.14e-01 0.123 0.15 0.097 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0194 0.107 0.097 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 1.65e-01 -0.184 0.132 0.097 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 3.49e-01 -0.131 0.139 0.097 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 1.06e-01 -0.217 0.133 0.097 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 2.92e-01 -0.149 0.141 0.097 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.17e-01 0.0685 0.137 0.096 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0879 0.125 0.096 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 2.65e-01 -0.168 0.15 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 5.92e-02 0.238 0.125 0.096 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 1.51e-01 -0.151 0.105 0.096 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0486 0.168 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 5.49e-02 0.246 0.127 0.096 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 4.04e-01 0.13 0.155 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 4.23e-01 0.0984 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0624 0.0995 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 7.15e-02 -0.254 0.14 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0545 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0889 0.0864 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 3.66e-01 -0.104 0.114 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 7.89e-01 0.0392 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 1.85e-01 -0.166 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 4.55e-02 -0.186 0.0923 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 7.80e-01 0.0428 0.153 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 4.10e-01 -0.113 0.137 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0508 0.0719 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 2.20e-02 -0.24 0.104 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 4.54e-02 0.255 0.127 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0327 0.0843 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 2.31e-01 0.0945 0.0786 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 8.79e-01 0.0231 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0636 0.0778 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0993 0.135 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0531 0.0913 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0613 0.0934 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 2.66e-01 -0.121 0.108 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0515 0.0991 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 8.59e-01 0.0135 0.0757 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 3.02e-01 0.155 0.149 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0302 0.0926 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 866153 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0419 0.145 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 3.27e-01 -0.116 0.119 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 1.00e-01 -0.204 0.123 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 632927 sc-eQTL 2.91e-01 -0.149 0.141 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 sc-eQTL 6.35e-01 0.0443 0.0931 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -986559 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0704 0.115 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 594408 sc-eQTL 1.74e-01 -0.213 0.156 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -690447 sc-eQTL 5.92e-01 0.0523 0.0974 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -450242 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0455 0.0848 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 624495 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0313 0.115 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -451261 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0263 0.119 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 197523 eQTL 0.139 -0.0403 0.0272 0.00103 0.0 0.0653

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000197442 \N 624495 1.92e-06 2.47e-06 3.32e-07 1.76e-06 2.31e-07 7.82e-07 1.25e-06 3.24e-07 1.72e-06 6.77e-07 1.89e-06 7.85e-07 3.08e-06 8.9e-07 3.4e-07 9.48e-07 9.75e-07 1.42e-06 7.04e-07 5.57e-07 6.61e-07 1.95e-06 1.21e-06 6.63e-07 2.37e-06 7.32e-07 9.62e-07 8.09e-07 1.47e-06 1.32e-06 1.21e-06 4.97e-08 2.36e-07 6.94e-07 7.4e-07 4.49e-07 5.58e-07 1.55e-07 3.52e-07 2.93e-07 8.42e-08 4.93e-06 1.28e-07 5.96e-09 1.89e-07 1.25e-07 2.3e-07 3.13e-08 8.83e-08
ENSG00000220412 \N -290229 7.22e-06 9.39e-06 6.67e-07 3.85e-06 6.1e-07 2.02e-06 6.11e-06 8.83e-07 4.91e-06 2.59e-06 7.5e-06 3.37e-06 1.06e-05 2.13e-06 9.47e-07 3.71e-06 1.84e-06 3.76e-06 1.45e-06 1.45e-06 2.73e-06 4.91e-06 4.49e-06 1.78e-06 8.14e-06 1.43e-06 2.62e-06 1.79e-06 4.3e-06 4.36e-06 3.35e-06 3.1e-07 6.01e-07 1.59e-06 1.93e-06 9.43e-07 9.09e-07 4.38e-07 1.31e-06 3.41e-07 2.81e-07 1.41e-05 5.26e-07 1.06e-07 3.4e-07 3.52e-07 7.84e-07 2.7e-07 2.29e-07