logo

Genes within 1Mb (chr6:137403162:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0828 0.0817 0.25 B L1
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00262 0.097 0.25 B L1
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 7.52e-01 0.0203 0.0641 0.25 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0298 0.0517 0.25 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 3.53e-02 0.151 0.0713 0.25 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 5.20e-02 -0.157 0.0806 0.25 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0275 0.0558 0.25 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 1.93e-01 -0.117 0.0895 0.25 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 8.60e-01 0.0107 0.0603 0.25 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0175 0.0565 0.25 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 5.18e-02 -0.0835 0.0427 0.25 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0771 0.071 0.25 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00437 0.0634 0.25 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 4.60e-01 0.0782 0.106 0.25 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 8.86e-01 0.00995 0.0692 0.25 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 4.09e-01 0.0441 0.0533 0.25 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0541 0.0563 0.25 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0162 0.0784 0.25 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0292 0.075 0.255 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.27e-01 0.0231 0.106 0.255 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0763 0.0799 0.255 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 8.39e-02 0.15 0.0861 0.255 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 8.64e-01 0.0143 0.0832 0.255 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0142 0.0817 0.255 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 8.39e-01 0.0221 0.109 0.255 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0278 0.0626 0.25 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 7.95e-02 -0.184 0.105 0.25 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0171 0.0531 0.25 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 8.76e-01 0.0146 0.0929 0.25 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 3.68e-01 0.0558 0.0619 0.25 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 5.45e-01 0.0399 0.0658 0.25 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 8.26e-01 0.0165 0.0751 0.25 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0514 0.0695 0.251 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 4.81e-01 0.0757 0.107 0.251 NK L1
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000231 0.0677 0.251 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.93e-01 0.0153 0.0579 0.251 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 8.63e-01 0.0144 0.083 0.251 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 1.87e-01 0.108 0.0817 0.251 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.54e-01 0.0297 0.0661 0.25 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0661 0.108 0.25 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 3.69e-01 0.0777 0.0864 0.25 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 6.37e-01 0.0194 0.0412 0.25 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0184 0.0795 0.25 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 6.51e-01 -0.037 0.0817 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0227 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 5.22e-01 0.0701 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0422 0.0566 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 4.03e-01 0.092 0.11 0.242 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 5.11e-01 0.081 0.123 0.242 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 4.30e-01 0.0757 0.0958 0.242 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.52e-01 0.0439 0.0973 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 5.69e-01 0.058 0.102 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 1.10e-01 -0.148 0.0923 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.36e-01 0.0246 0.0728 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0273 0.088 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00902 0.103 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0556 0.106 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 7.69e-01 0.0292 0.0993 0.248 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 1.19e-02 -0.171 0.0673 0.248 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 2.38e-01 0.11 0.0931 0.248 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 1.64e-01 -0.141 0.101 0.248 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0735 0.0823 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0446 0.109 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0903 0.0949 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0163 0.0552 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 4.34e-02 0.156 0.0768 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 1.99e-01 -0.111 0.0861 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0958 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0104 0.111 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 9.64e-01 0.00367 0.0806 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0742 0.0804 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 5.34e-02 0.165 0.085 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 9.38e-02 -0.174 0.103 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 2.28e-01 -0.117 0.0965 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 6.11e-01 0.0547 0.107 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 3.21e-01 -0.108 0.109 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 2.10e-01 0.0795 0.0633 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 4.39e-02 -0.203 0.1 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0823 0.0987 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.42e-01 0.0247 0.053 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 1.23e-01 -0.154 0.0995 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 8.11e-01 0.0197 0.0826 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00497 0.0579 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 4.24e-01 -0.034 0.0425 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0702 0.0749 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.05e-02 -0.138 0.0731 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 7.52e-01 0.0342 0.108 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 6.01e-02 0.171 0.0907 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0462 0.053 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 4.89e-03 -0.169 0.0594 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 1.78e-01 -0.1 0.0741 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0523 0.0843 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 9.68e-01 0.00431 0.109 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 1.52e-01 0.126 0.0878 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0191 0.056 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0394 0.0865 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0765 0.0897 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0622 0.0755 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 9.43e-01 0.00742 0.104 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 6.06e-01 0.0517 0.1 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 4.36e-01 0.0496 0.0636 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 9.60e-01 0.00455 0.0898 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 3.34e-01 0.0865 0.0893 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 3.41e-01 0.0712 0.0746 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 6.11e-01 0.0552 0.108 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0311 0.0824 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 6.84e-01 0.0238 0.0585 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0392 0.0693 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0836 0.0863 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0327 0.0974 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0242 0.112 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00912 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 5.63e-01 0.0306 0.0527 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 1.71e-01 -0.129 0.0938 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 1.54e-01 -0.138 0.0961 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00363 0.0988 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 3.71e-01 -0.102 0.113 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 9.97e-02 -0.194 0.117 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.66e-01 0.0217 0.0728 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 1.70e-01 0.154 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 5.83e-01 0.0594 0.108 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0486 0.0773 0.247 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.45e-01 0.0205 0.105 0.247 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 7.53e-01 0.0345 0.109 0.247 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00503 0.0521 0.247 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0572 0.0906 0.247 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0404 0.0962 0.247 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.68e-01 0.00333 0.0826 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0644 0.108 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 1.94e-01 -0.125 0.0961 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.45e-01 0.02 0.0615 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0203 0.0936 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 5.35e-01 0.061 0.098 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0419 0.0641 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 7.74e-01 0.0318 0.111 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 9.71e-01 0.0028 0.0777 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 8.39e-01 0.0123 0.0605 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 6.43e-01 0.0404 0.087 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 2.95e-01 0.0949 0.0903 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.23e-01 0.00811 0.0839 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 4.84e-01 0.0746 0.106 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 7.33e-01 0.0296 0.0865 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0616 0.0664 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 8.88e-01 0.0149 0.106 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 2.35e-01 0.127 0.107 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0504 0.0677 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 2.28e-01 0.128 0.106 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 3.20e-01 0.0803 0.0806 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.37e-01 0.0204 0.0605 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 9.57e-01 0.00448 0.0832 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 7.15e-02 0.164 0.0905 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00537 0.127 0.248 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 1.11e-01 0.207 0.129 0.248 PB L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 5.99e-01 0.0429 0.0812 0.248 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.06e-01 0.0373 0.0986 0.248 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 8.28e-01 0.0244 0.112 0.248 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 8.75e-02 -0.201 0.117 0.248 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 7.64e-02 0.151 0.0846 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0562 0.104 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 1.55e-01 0.117 0.082 0.252 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0414 0.0519 0.252 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000319 0.101 0.252 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0968 0.101 0.252 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0119 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.21e-02 -0.185 0.106 0.25 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 8.52e-01 0.0216 0.116 0.25 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 6.92e-01 0.0255 0.0643 0.25 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 7.82e-01 0.0193 0.0697 0.25 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 1.30e-01 0.148 0.0976 0.25 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0634 0.0826 0.268 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.11e-01 0.0257 0.107 0.268 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0209 0.0815 0.268 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 2.77e-01 0.104 0.095 0.268 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 1.15e-01 0.132 0.0833 0.268 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 5.53e-01 0.0631 0.106 0.268 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 2.58e-01 0.123 0.109 0.268 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0213 0.0588 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 2.03e-01 -0.134 0.105 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0438 0.0632 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 8.07e-01 0.0223 0.0911 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0366 0.0658 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00497 0.0676 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 6.03e-01 -0.044 0.0846 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00416 0.0684 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 1.02e-01 -0.179 0.109 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.57e-01 0.0188 0.0608 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0486 0.102 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 1.44e-01 0.12 0.0822 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 4.43e-01 0.067 0.0871 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 6.62e-01 0.0372 0.0851 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 4.54e-01 0.0739 0.0983 0.261 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 4.21e-01 0.0879 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 6.17e-01 0.0304 0.0606 0.261 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 5.78e-01 0.0714 0.128 0.261 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0263 0.11 0.261 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 7.04e-01 0.0274 0.0721 0.256 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 4.96e-01 0.0663 0.0972 0.256 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0515 0.0622 0.256 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0683 0.0956 0.256 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 1.30e-01 0.153 0.101 0.256 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 6.38e-01 0.0438 0.0928 0.256 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 8.67e-01 0.0179 0.107 0.256 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0734 0.0841 0.253 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00419 0.104 0.253 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0255 0.0746 0.253 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0324 0.0921 0.253 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 3.04e-01 0.0995 0.0966 0.253 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0827 0.0931 0.253 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0106 0.0983 0.253 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0293 0.095 0.26 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 4.74e-01 -0.075 0.104 0.26 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0974 0.0877 0.26 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 4.17e-01 0.0593 0.0729 0.26 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 3.69e-02 -0.243 0.115 0.26 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0304 0.0894 0.26 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0242 0.108 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00614 0.0858 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.77e-01 0.0153 0.0986 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00185 0.0917 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0225 0.0605 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00973 0.0801 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0234 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 1.85e-01 -0.115 0.0863 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0166 0.106 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0948 0.0942 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0418 0.0496 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 9.63e-03 0.187 0.0716 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 7.05e-02 -0.159 0.0877 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0273 0.0593 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 3.40e-02 -0.225 0.105 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 6.62e-01 -0.024 0.0548 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 7.90e-01 0.0253 0.0952 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 7.92e-01 0.017 0.0643 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 7.33e-01 0.0224 0.0657 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0121 0.0765 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0303 0.0694 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 8.16e-01 0.0244 0.105 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0145 0.0649 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 852343 sc-eQTL 8.52e-01 0.0189 0.101 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 1.94e-01 0.108 0.0828 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0308 0.0869 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 619117 sc-eQTL 7.73e-01 0.0285 0.0987 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 183713 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0505 0.0656 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 580598 sc-eQTL 3.04e-01 0.114 0.111 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -704257 sc-eQTL 7.04e-01 0.0262 0.0687 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -464052 sc-eQTL 8.11e-01 0.0144 0.0599 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 610685 sc-eQTL 7.51e-01 0.0257 0.0809 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -465071 sc-eQTL 1.86e-01 0.111 0.0834 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 480861 eQTL 0.0155 -0.0852 0.0351 0.00338 0.0 0.27
ENSG00000220412 AL356234.1 -304039 eQTL 0.0342 -0.0576 0.0271 0.001 0.0 0.27

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 \N 183713 1.33e-06 9.37e-07 2.57e-07 3.61e-07 1.03e-07 1.71e-07 4.14e-07 5.35e-08 1.85e-07 5.67e-08 2.18e-07 1.37e-07 3.95e-07 1.59e-07 6.6e-08 1.1e-07 6.63e-08 3.39e-07 7.16e-08 4.03e-08 1.22e-07 1.89e-07 2.81e-07 2.68e-08 6.65e-07 1.43e-07 1.29e-07 1.06e-07 1.4e-07 3.52e-07 1.35e-07 3.19e-08 2.91e-08 9.9e-08 1.29e-07 3.11e-08 5.8e-08 9.44e-08 8e-08 4.02e-08 3.25e-08 2.72e-07 8.26e-08 2.02e-08 8.03e-08 1.65e-08 1.25e-07 4.6e-09 4.61e-08