logo

Genes within 1Mb (chr6:137391755:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0828 0.0817 0.25 B L1
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00262 0.097 0.25 B L1
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 7.52e-01 0.0203 0.0641 0.25 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0298 0.0517 0.25 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 3.53e-02 0.151 0.0713 0.25 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 5.20e-02 -0.157 0.0806 0.25 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0275 0.0558 0.25 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 1.93e-01 -0.117 0.0895 0.25 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 8.60e-01 0.0107 0.0603 0.25 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0175 0.0565 0.25 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 5.18e-02 -0.0835 0.0427 0.25 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0771 0.071 0.25 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00437 0.0634 0.25 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 4.60e-01 0.0782 0.106 0.25 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 8.86e-01 0.00995 0.0692 0.25 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 4.09e-01 0.0441 0.0533 0.25 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0541 0.0563 0.25 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0162 0.0784 0.25 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0292 0.075 0.255 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.27e-01 0.0231 0.106 0.255 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0763 0.0799 0.255 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 8.39e-02 0.15 0.0861 0.255 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 8.64e-01 0.0143 0.0832 0.255 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0142 0.0817 0.255 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 8.39e-01 0.0221 0.109 0.255 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0278 0.0626 0.25 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 7.95e-02 -0.184 0.105 0.25 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0171 0.0531 0.25 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 8.76e-01 0.0146 0.0929 0.25 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 3.68e-01 0.0558 0.0619 0.25 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 5.45e-01 0.0399 0.0658 0.25 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 8.26e-01 0.0165 0.0751 0.25 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0514 0.0695 0.251 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 4.81e-01 0.0757 0.107 0.251 NK L1
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000231 0.0677 0.251 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.93e-01 0.0153 0.0579 0.251 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 8.63e-01 0.0144 0.083 0.251 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 1.87e-01 0.108 0.0817 0.251 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.54e-01 0.0297 0.0661 0.25 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0661 0.108 0.25 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 3.69e-01 0.0777 0.0864 0.25 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 6.37e-01 0.0194 0.0412 0.25 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0184 0.0795 0.25 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 6.51e-01 -0.037 0.0817 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0227 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 5.22e-01 0.0701 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0422 0.0566 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 4.03e-01 0.092 0.11 0.242 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 5.11e-01 0.081 0.123 0.242 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 4.30e-01 0.0757 0.0958 0.242 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.52e-01 0.0439 0.0973 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 5.69e-01 0.058 0.102 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 1.10e-01 -0.148 0.0923 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.36e-01 0.0246 0.0728 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0273 0.088 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00902 0.103 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0556 0.106 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 7.69e-01 0.0292 0.0993 0.248 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 1.19e-02 -0.171 0.0673 0.248 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 2.38e-01 0.11 0.0931 0.248 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 1.64e-01 -0.141 0.101 0.248 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0735 0.0823 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0446 0.109 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0903 0.0949 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0163 0.0552 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 4.34e-02 0.156 0.0768 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 1.99e-01 -0.111 0.0861 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0958 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0104 0.111 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 9.64e-01 0.00367 0.0806 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0742 0.0804 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 5.34e-02 0.165 0.085 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 9.38e-02 -0.174 0.103 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 2.28e-01 -0.117 0.0965 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 6.11e-01 0.0547 0.107 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 3.21e-01 -0.108 0.109 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 2.10e-01 0.0795 0.0633 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 4.39e-02 -0.203 0.1 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0823 0.0987 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.42e-01 0.0247 0.053 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 1.23e-01 -0.154 0.0995 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 8.11e-01 0.0197 0.0826 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00497 0.0579 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 4.24e-01 -0.034 0.0425 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0702 0.0749 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.05e-02 -0.138 0.0731 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 7.52e-01 0.0342 0.108 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 6.01e-02 0.171 0.0907 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0462 0.053 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 4.89e-03 -0.169 0.0594 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 1.78e-01 -0.1 0.0741 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0523 0.0843 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 9.68e-01 0.00431 0.109 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 1.52e-01 0.126 0.0878 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0191 0.056 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0394 0.0865 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0765 0.0897 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0622 0.0755 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 9.43e-01 0.00742 0.104 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 6.06e-01 0.0517 0.1 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 4.36e-01 0.0496 0.0636 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 9.60e-01 0.00455 0.0898 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 3.34e-01 0.0865 0.0893 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 3.41e-01 0.0712 0.0746 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 6.11e-01 0.0552 0.108 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0311 0.0824 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 6.84e-01 0.0238 0.0585 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0392 0.0693 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0836 0.0863 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0327 0.0974 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0242 0.112 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00912 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 5.63e-01 0.0306 0.0527 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 1.71e-01 -0.129 0.0938 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 1.54e-01 -0.138 0.0961 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00363 0.0988 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 3.71e-01 -0.102 0.113 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 9.97e-02 -0.194 0.117 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.66e-01 0.0217 0.0728 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 1.70e-01 0.154 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 5.83e-01 0.0594 0.108 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0486 0.0773 0.247 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.45e-01 0.0205 0.105 0.247 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 7.53e-01 0.0345 0.109 0.247 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00503 0.0521 0.247 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0572 0.0906 0.247 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0404 0.0962 0.247 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.68e-01 0.00333 0.0826 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0644 0.108 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 1.94e-01 -0.125 0.0961 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.45e-01 0.02 0.0615 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0203 0.0936 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 5.35e-01 0.061 0.098 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0419 0.0641 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 7.74e-01 0.0318 0.111 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 9.71e-01 0.0028 0.0777 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 8.39e-01 0.0123 0.0605 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 6.43e-01 0.0404 0.087 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 2.95e-01 0.0949 0.0903 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.23e-01 0.00811 0.0839 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 4.84e-01 0.0746 0.106 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 7.33e-01 0.0296 0.0865 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0616 0.0664 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 8.88e-01 0.0149 0.106 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 2.35e-01 0.127 0.107 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0504 0.0677 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 2.28e-01 0.128 0.106 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 3.20e-01 0.0803 0.0806 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.37e-01 0.0204 0.0605 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 9.57e-01 0.00448 0.0832 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 7.15e-02 0.164 0.0905 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00537 0.127 0.248 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 1.11e-01 0.207 0.129 0.248 PB L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 5.99e-01 0.0429 0.0812 0.248 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.06e-01 0.0373 0.0986 0.248 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 8.28e-01 0.0244 0.112 0.248 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 8.75e-02 -0.201 0.117 0.248 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 7.64e-02 0.151 0.0846 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0562 0.104 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 1.55e-01 0.117 0.082 0.252 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0414 0.0519 0.252 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000319 0.101 0.252 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0968 0.101 0.252 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0119 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.21e-02 -0.185 0.106 0.25 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 8.52e-01 0.0216 0.116 0.25 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 6.92e-01 0.0255 0.0643 0.25 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 7.82e-01 0.0193 0.0697 0.25 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 1.30e-01 0.148 0.0976 0.25 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0634 0.0826 0.268 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.11e-01 0.0257 0.107 0.268 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0209 0.0815 0.268 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 2.77e-01 0.104 0.095 0.268 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 1.15e-01 0.132 0.0833 0.268 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 5.53e-01 0.0631 0.106 0.268 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 2.58e-01 0.123 0.109 0.268 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0213 0.0588 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 2.03e-01 -0.134 0.105 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0438 0.0632 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 8.07e-01 0.0223 0.0911 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0366 0.0658 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00497 0.0676 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 6.03e-01 -0.044 0.0846 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00416 0.0684 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 1.02e-01 -0.179 0.109 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.57e-01 0.0188 0.0608 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0486 0.102 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 1.44e-01 0.12 0.0822 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 4.43e-01 0.067 0.0871 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 6.62e-01 0.0372 0.0851 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 4.54e-01 0.0739 0.0983 0.261 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 4.21e-01 0.0879 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 6.17e-01 0.0304 0.0606 0.261 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 5.78e-01 0.0714 0.128 0.261 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0263 0.11 0.261 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 7.04e-01 0.0274 0.0721 0.256 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 4.96e-01 0.0663 0.0972 0.256 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0515 0.0622 0.256 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0683 0.0956 0.256 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 1.30e-01 0.153 0.101 0.256 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 6.38e-01 0.0438 0.0928 0.256 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 8.67e-01 0.0179 0.107 0.256 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0734 0.0841 0.253 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00419 0.104 0.253 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0255 0.0746 0.253 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0324 0.0921 0.253 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 3.04e-01 0.0995 0.0966 0.253 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0827 0.0931 0.253 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0106 0.0983 0.253 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0293 0.095 0.26 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 4.74e-01 -0.075 0.104 0.26 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0974 0.0877 0.26 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 4.17e-01 0.0593 0.0729 0.26 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 3.69e-02 -0.243 0.115 0.26 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0304 0.0894 0.26 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0242 0.108 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00614 0.0858 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.77e-01 0.0153 0.0986 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00185 0.0917 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0225 0.0605 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00973 0.0801 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0234 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 1.85e-01 -0.115 0.0863 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0166 0.106 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0948 0.0942 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0418 0.0496 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 9.63e-03 0.187 0.0716 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 7.05e-02 -0.159 0.0877 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0273 0.0593 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 3.40e-02 -0.225 0.105 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 6.62e-01 -0.024 0.0548 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 7.90e-01 0.0253 0.0952 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 7.92e-01 0.017 0.0643 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 7.33e-01 0.0224 0.0657 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0121 0.0765 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0303 0.0694 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 8.16e-01 0.0244 0.105 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0145 0.0649 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 840936 sc-eQTL 8.52e-01 0.0189 0.101 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 1.94e-01 0.108 0.0828 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0308 0.0869 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 607710 sc-eQTL 7.73e-01 0.0285 0.0987 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 172306 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0505 0.0656 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 569191 sc-eQTL 3.04e-01 0.114 0.111 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -715664 sc-eQTL 7.04e-01 0.0262 0.0687 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -475459 sc-eQTL 8.11e-01 0.0144 0.0599 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 599278 sc-eQTL 7.51e-01 0.0257 0.0809 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -476478 sc-eQTL 1.86e-01 0.111 0.0834 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 469454 eQTL 0.0255 -0.0792 0.0354 0.00301 0.0 0.267
ENSG00000220412 AL356234.1 -315446 eQTL 0.0193 -0.064 0.0273 0.00142 0.0 0.267

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 \N 172306 1.29e-06 2.68e-06 2.73e-07 1.27e-06 1.38e-07 5.91e-07 1.25e-06 3.5e-07 1.73e-06 3.95e-07 2.05e-06 8.15e-07 2.94e-06 8.7e-07 6.23e-07 1.04e-06 1.17e-06 1.44e-06 8.48e-07 5.97e-07 6.57e-07 1.96e-06 1.13e-06 6.25e-07 2.48e-06 6.73e-07 9.28e-07 8.75e-07 1.59e-06 1.47e-06 7.66e-07 4.97e-08 2.69e-07 5.5e-07 5.95e-07 6.66e-07 7.11e-07 1.38e-07 4.04e-07 2.18e-07 1.2e-07 1.96e-06 1.24e-07 1.04e-08 1.91e-07 2.13e-07 1.41e-07 5.79e-08 5.54e-08