logo

Genes within 1Mb (chr6:137375223:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.20e-02 0.356 0.141 0.058 B L1
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0916 0.169 0.058 B L1
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0409 0.112 0.058 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 1.36e-01 -0.134 0.0896 0.058 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 7.01e-01 0.0483 0.125 0.058 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 4.50e-01 0.107 0.142 0.058 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00421 0.0977 0.058 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 2.37e-02 0.354 0.155 0.058 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 4.39e-02 0.212 0.105 0.058 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 7.37e-01 0.0332 0.0989 0.058 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 7.91e-01 -0.02 0.0754 0.058 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 9.39e-02 0.208 0.124 0.058 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 7.54e-01 0.0344 0.11 0.058 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 8.39e-01 0.0371 0.183 0.058 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 6.42e-01 0.0556 0.12 0.058 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 8.58e-01 0.0165 0.0923 0.058 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0537 0.0975 0.058 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 4.04e-01 0.113 0.135 0.058 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 4.41e-01 0.104 0.135 0.056 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 8.84e-01 0.0279 0.191 0.056 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 2.75e-01 -0.158 0.144 0.056 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0512 0.157 0.056 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.15 0.056 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0471 0.147 0.056 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 5.46e-01 0.119 0.196 0.056 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 4.10e-02 0.223 0.108 0.058 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 2.18e-01 0.227 0.184 0.058 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00468 0.0929 0.058 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 5.84e-01 0.089 0.162 0.058 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 2.24e-01 0.132 0.108 0.058 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 1.08e-01 -0.185 0.114 0.058 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0327 0.131 0.058 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.75e-01 0.169 0.124 0.058 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 6.42e-01 0.0896 0.192 0.058 NK L1
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 2.10e-01 0.152 0.121 0.058 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0588 0.104 0.058 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 1.06e-01 -0.24 0.148 0.058 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0671 0.147 0.058 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 2.74e-01 0.127 0.116 0.058 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 4.42e-01 -0.146 0.189 0.058 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0292 0.152 0.058 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00824 0.0723 0.058 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 5.83e-01 0.0767 0.139 0.058 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 7.13e-01 0.0528 0.143 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0103 0.183 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 7.40e-01 0.0599 0.18 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 8.51e-01 0.0175 0.0934 0.061 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 5.12e-01 -0.119 0.181 0.061 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 4.42e-01 0.156 0.202 0.061 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 7.04e-01 0.0601 0.158 0.061 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 4.38e-01 0.132 0.17 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 4.83e-01 0.125 0.178 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 8.29e-01 -0.035 0.162 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 7.49e-02 -0.226 0.126 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0173 0.154 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 6.80e-01 0.0744 0.18 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.81e-01 0.247 0.184 0.058 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 2.47e-02 0.417 0.184 0.058 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.51e-02 0.424 0.173 0.058 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 1.92e-01 -0.157 0.12 0.058 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 4.04e-01 -0.138 0.165 0.058 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 1.62e-02 0.43 0.177 0.058 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 3.78e-02 0.303 0.145 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 3.34e-01 -0.187 0.193 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 3.72e-02 0.351 0.167 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 2.61e-01 -0.11 0.0978 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0516 0.138 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 6.04e-01 0.0796 0.153 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 7.52e-02 0.321 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0905 0.198 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.02e-01 0.235 0.143 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0347 0.144 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 8.25e-01 -0.034 0.154 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 9.80e-01 0.00477 0.187 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 2.76e-01 -0.182 0.167 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0713 0.185 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 6.20e-01 0.0931 0.188 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0356 0.11 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 2.67e-01 0.194 0.174 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 6.94e-02 0.309 0.169 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00748 0.0923 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 5.21e-02 0.337 0.173 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.71e-02 0.341 0.142 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 8.76e-01 0.0158 0.101 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 9.71e-01 0.00268 0.0741 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 3.57e-02 0.273 0.129 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.89e-01 0.169 0.128 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 6.84e-02 0.343 0.187 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.92e-01 0.208 0.159 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 2.07e-01 0.117 0.0922 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0335 0.105 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 2.89e-02 0.282 0.128 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 3.33e-01 0.139 0.143 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 8.46e-01 -0.036 0.185 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 7.24e-02 0.269 0.149 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 6.82e-01 0.0391 0.0953 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 4.10e-01 -0.121 0.147 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 3.16e-01 0.153 0.152 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0587 0.133 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 3.51e-01 0.171 0.183 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 5.04e-01 0.118 0.176 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0159 0.112 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 5.33e-01 0.0987 0.158 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 8.58e-01 0.0284 0.158 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 4.80e-01 0.0934 0.132 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 3.54e-01 -0.177 0.191 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 2.11e-01 -0.182 0.145 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 7.72e-01 0.03 0.103 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00606 0.123 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 7.79e-02 0.269 0.152 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 7.61e-01 0.0534 0.176 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 7.02e-01 0.0772 0.202 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 3.02e-01 0.204 0.197 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0159 0.0952 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0832 0.17 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 1.55e-01 0.247 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 5.72e-02 0.311 0.163 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 8.64e-02 0.323 0.188 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 5.93e-01 -0.105 0.196 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0364 0.121 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00904 0.187 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 3.22e-02 -0.383 0.178 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.133 0.058 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 1.03e-01 -0.293 0.179 0.058 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 3.26e-01 0.184 0.187 0.058 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0661 0.0893 0.058 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 2.74e-01 0.17 0.155 0.058 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 6.41e-01 0.0773 0.165 0.058 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 4.39e-01 0.114 0.147 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 4.46e-01 0.147 0.192 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 6.17e-01 0.0862 0.172 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0668 0.11 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 3.98e-01 -0.141 0.167 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 2.71e-01 -0.193 0.175 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 5.03e-02 0.224 0.114 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 5.07e-01 0.132 0.198 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.98e-01 0.179 0.139 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 3.43e-01 -0.103 0.108 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 2.97e-01 -0.163 0.156 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 5.29e-01 -0.102 0.162 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 9.98e-01 0.000367 0.154 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 9.64e-01 0.00889 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.64e-01 0.22 0.158 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0333 0.122 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 1.88e-01 -0.255 0.193 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 5.52e-01 -0.117 0.196 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.25e-01 0.185 0.12 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 9.87e-01 0.00307 0.19 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0281 0.144 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 1.52e-01 -0.155 0.108 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0956 0.148 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 9.59e-01 0.00842 0.163 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 8.52e-02 -0.387 0.223 0.07 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0829 0.232 0.07 PB L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 7.79e-01 0.0408 0.145 0.07 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 1.37e-01 0.261 0.174 0.07 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 1.33e-01 0.3 0.198 0.07 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 3.28e-01 0.206 0.21 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 9.85e-01 0.00282 0.147 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 5.40e-01 0.11 0.179 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 4.59e-01 -0.105 0.142 0.059 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 5.75e-01 0.0503 0.0896 0.059 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 4.85e-01 -0.121 0.173 0.059 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 1.40e-01 0.257 0.173 0.059 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 2.27e-01 0.214 0.176 0.058 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 6.62e-01 0.0818 0.187 0.058 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 7.14e-01 0.0742 0.202 0.058 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0193 0.112 0.058 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 3.27e-01 -0.119 0.121 0.058 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 6.58e-02 -0.314 0.17 0.058 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 2.17e-01 0.183 0.148 0.056 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 4.48e-01 0.146 0.192 0.056 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 1.51e-01 -0.21 0.145 0.056 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 3.78e-01 -0.151 0.171 0.056 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 2.28e-01 0.181 0.15 0.056 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 9.22e-01 0.0186 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 8.42e-01 0.0392 0.196 0.056 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 7.56e-02 0.18 0.101 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 9.55e-02 0.304 0.181 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0422 0.109 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 1.02e-01 0.257 0.156 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 1.31e-02 0.28 0.112 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 1.88e-01 -0.154 0.116 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0502 0.146 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 8.55e-02 0.202 0.117 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 3.74e-01 0.168 0.189 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0596 0.105 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 3.76e-01 0.156 0.176 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0692 0.142 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 2.53e-01 -0.172 0.15 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.146 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 8.05e-02 0.218 0.124 0.06 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 5.86e-01 -0.092 0.169 0.06 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 9.99e-01 0.0002 0.108 0.06 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 2.89e-01 -0.176 0.166 0.06 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 4.41e-01 0.136 0.176 0.06 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 8.71e-01 0.0262 0.161 0.06 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 2.73e-01 0.204 0.185 0.06 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.18e-01 0.236 0.15 0.059 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0136 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 6.80e-01 0.0552 0.134 0.059 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 1.36e-01 0.246 0.164 0.059 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 3.05e-01 -0.178 0.173 0.059 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 5.28e-01 -0.106 0.167 0.059 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 9.00e-01 0.0222 0.176 0.059 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0605 0.168 0.065 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0986 0.185 0.065 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0769 0.156 0.065 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 2.59e-01 0.146 0.129 0.065 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 1.13e-01 0.328 0.206 0.065 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 1.09e-01 -0.254 0.157 0.065 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 1.36e-01 0.284 0.19 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 3.09e-01 0.152 0.149 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 1.60e-01 0.241 0.171 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.25e-02 0.395 0.157 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 1.98e-01 -0.135 0.105 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 9.71e-01 0.00502 0.139 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 7.89e-02 0.312 0.176 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 2.93e-02 0.335 0.153 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 1.84e-01 -0.249 0.187 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 9.27e-03 0.434 0.165 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0763 0.0882 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 8.72e-01 0.021 0.129 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 8.14e-01 0.0371 0.157 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 3.95e-02 0.211 0.102 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 1.28e-01 0.281 0.184 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 9.92e-01 0.000962 0.0952 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 4.20e-01 0.133 0.165 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 1.92e-01 0.146 0.111 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 1.64e-01 -0.159 0.114 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0701 0.133 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.02e-01 0.2 0.122 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0671 0.185 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0624 0.114 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 824404 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0319 0.179 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0057 0.153 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 591178 sc-eQTL 2.13e-01 0.216 0.173 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 sc-eQTL 1.28e-01 0.179 0.117 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 552659 sc-eQTL 5.44e-01 0.121 0.199 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -732196 sc-eQTL 1.79e-01 0.166 0.123 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -491991 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0763 0.107 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 582746 sc-eQTL 1.87e-01 -0.192 0.145 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -493010 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0656 0.15 0.056 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 pQTL 0.000314 0.127 0.0352 0.00165 0.0 0.0527

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 155774 4.99e-06 5.83e-06 9.85e-07 3.4e-06 1.63e-06 1.62e-06 6.29e-06 1.15e-06 4.55e-06 2.81e-06 6.45e-06 3.18e-06 7.66e-06 1.72e-06 1.02e-06 3.78e-06 2.72e-06 3.91e-06 1.66e-06 1.92e-06 2.77e-06 5.62e-06 4.6e-06 1.91e-06 8.25e-06 2.15e-06 2.29e-06 1.97e-06 4.84e-06 5.36e-06 2.65e-06 7.35e-07 7.24e-07 1.49e-06 2.06e-06 1.32e-06 9.56e-07 4.71e-07 8.39e-07 6.03e-07 2.79e-07 5.6e-06 6.4e-07 1.61e-07 7.84e-07 1.16e-06 9.47e-07 5.83e-07 5.99e-07
ENSG00000182747 \N 452922 1.13e-06 8.72e-07 3.49e-07 3.1e-07 1.04e-07 2.46e-07 6.29e-07 1.48e-07 8.92e-07 3.05e-07 1.09e-06 5.15e-07 1.07e-06 2.29e-07 3.9e-07 3.4e-07 6.29e-07 5.27e-07 4.95e-07 3.96e-07 2.8e-07 6.27e-07 4.96e-07 3.09e-07 1.25e-06 2.56e-07 4.27e-07 5.78e-07 4.88e-07 8.89e-07 4.55e-07 5.02e-08 6.78e-08 1.54e-07 3.52e-07 2.99e-07 3.12e-07 9.71e-08 7.45e-08 1.61e-08 4.73e-08 7.54e-07 6.75e-08 3.38e-08 1.73e-07 3.54e-08 1.03e-07 1.26e-08 5.32e-08