logo

Genes within 1Mb (chr6:137349872:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 3.81e-01 0.083 0.0946 0.16 B L1
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.16 B L1
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0165 0.0742 0.16 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.26e-01 0.0724 0.0596 0.16 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 3.60e-01 0.0762 0.0831 0.16 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 1.04e-01 0.153 0.0935 0.16 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00847 0.0634 0.16 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 9.65e-01 0.00451 0.102 0.16 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0603 0.0684 0.16 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 5.39e-01 0.0395 0.0642 0.16 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 6.25e-01 0.0239 0.0489 0.16 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 1.14e-01 0.128 0.0804 0.16 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0362 0.0714 0.16 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0279 0.119 0.16 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 7.41e-03 -0.207 0.0766 0.16 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 3.55e-01 0.0556 0.06 0.16 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 8.11e-02 0.111 0.0631 0.16 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0527 0.0883 0.16 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 3.95e-01 0.0768 0.09 0.155 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 7.75e-01 0.0363 0.127 0.155 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 4.30e-01 0.076 0.0962 0.155 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0188 0.104 0.155 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 2.95e-01 0.105 0.0997 0.155 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 1.19e-01 -0.153 0.0976 0.155 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 1.37e-01 -0.194 0.13 0.155 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 6.49e-02 0.135 0.0725 0.16 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 2.84e-02 0.268 0.122 0.16 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.52e-01 0.071 0.0618 0.16 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 2.43e-01 -0.127 0.108 0.16 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 2.58e-01 0.0819 0.0722 0.16 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0208 0.0769 0.16 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0427 0.0876 0.16 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 6.13e-01 0.0416 0.0822 0.161 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 9.75e-01 0.00406 0.127 0.161 NK L1
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0972 0.0797 0.161 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 7.17e-01 0.0249 0.0685 0.161 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 1.08e-02 0.248 0.0966 0.161 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 7.94e-01 0.0254 0.0971 0.161 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0264 0.0756 0.16 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 2.89e-01 0.131 0.123 0.16 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 4.41e-01 0.0764 0.0989 0.16 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 6.20e-01 0.0234 0.0471 0.16 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 3.25e-02 0.194 0.0899 0.16 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 1.70e-01 -0.128 0.093 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 6.58e-01 0.0558 0.126 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 1.78e-01 -0.167 0.123 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 9.67e-01 0.00266 0.0641 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 1.25e-01 -0.19 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 2.33e-02 -0.314 0.137 0.156 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 1.45e-01 0.158 0.108 0.156 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0219 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 4.48e-01 0.0908 0.119 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 3.10e-01 -0.111 0.109 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.05e-01 0.108 0.0853 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 5.51e-01 0.0617 0.103 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0709 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0682 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 2.95e-01 0.132 0.125 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 7.59e-01 0.0363 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.80e-01 0.0879 0.0812 0.162 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.82e-01 0.0308 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 4.38e-01 0.094 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 3.44e-01 0.0907 0.0956 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 3.41e-01 0.12 0.126 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 6.12e-02 -0.206 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.72e-01 0.0704 0.0639 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0259 0.0901 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 2.40e-01 0.138 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0773 0.128 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 8.58e-01 0.0168 0.0936 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.27e-01 0.113 0.0932 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 4.61e-01 0.0734 0.0994 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 2.61e-01 0.136 0.121 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 3.67e-01 0.0989 0.109 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0269 0.122 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 5.93e-01 -0.066 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 8.46e-01 -0.014 0.0719 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 4.58e-02 0.228 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 3.24e-01 -0.11 0.112 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0289 0.0602 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 6.79e-01 -0.047 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 3.76e-01 -0.083 0.0936 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.73e-01 0.0721 0.0656 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0154 0.0483 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 2.85e-02 0.186 0.0843 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 5.83e-01 0.0465 0.0846 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0132 0.124 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 1.65e-01 -0.146 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 8.38e-01 0.0125 0.061 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 6.23e-01 0.0342 0.0695 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 8.13e-01 0.0203 0.0855 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0686 0.095 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 8.79e-01 0.0187 0.123 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 6.27e-01 0.0484 0.0995 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0579 0.0631 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 4.27e-02 0.197 0.0967 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0891 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 8.65e-01 0.0148 0.0874 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 5.33e-01 0.075 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 6.95e-03 -0.31 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.95e-01 -0.077 0.0733 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 2.31e-01 0.124 0.103 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 1.54e-01 -0.147 0.103 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 8.21e-01 0.0192 0.085 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 7.28e-01 0.0429 0.123 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 9.20e-01 0.0094 0.0937 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 6.40e-01 0.0312 0.0665 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 2.30e-02 0.178 0.0778 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 4.54e-01 0.0737 0.0982 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0284 0.115 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0495 0.132 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 1.83e-01 -0.172 0.128 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 1.54e-01 0.0887 0.0619 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0642 0.111 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0327 0.114 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 2.95e-01 -0.115 0.11 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0286 0.127 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0163 0.132 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00498 0.0811 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 5.92e-01 0.0672 0.125 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 6.13e-02 -0.224 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 5.70e-01 0.0491 0.0862 0.16 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 3.47e-01 0.11 0.117 0.16 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 6.08e-01 0.0626 0.122 0.16 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0156 0.058 0.16 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 3.94e-01 0.0861 0.101 0.16 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0985 0.107 0.16 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 2.95e-01 -0.103 0.0985 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 9.54e-01 0.00738 0.129 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 3.07e-01 0.118 0.115 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 4.90e-01 0.0508 0.0735 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 5.05e-01 0.0747 0.112 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 2.24e-01 -0.142 0.117 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 5.22e-01 0.0483 0.0753 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 5.44e-01 0.0788 0.13 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 2.72e-02 -0.201 0.0902 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 9.92e-01 0.000724 0.071 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.25e-03 0.272 0.1 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 7.32e-01 0.0365 0.106 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00234 0.0983 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0525 0.125 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 2.92e-01 0.107 0.101 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0333 0.0779 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 6.11e-01 0.063 0.124 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0117 0.126 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0207 0.0791 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0158 0.124 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0359 0.0942 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 4.32e-01 0.0555 0.0705 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 1.41e-02 0.237 0.0956 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0111 0.106 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0526 0.163 0.167 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 9.18e-01 0.0174 0.168 0.167 PB L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 2.77e-02 -0.229 0.103 0.167 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 3.39e-01 -0.122 0.127 0.167 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 4.13e-01 -0.119 0.144 0.167 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.167 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 1.74e-02 -0.238 0.0991 0.157 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 3.80e-01 0.107 0.122 0.157 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0968 0.157 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 3.47e-01 0.0576 0.0611 0.157 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 4.79e-01 0.084 0.118 0.157 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0339 0.119 0.157 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 6.87e-01 0.0461 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 4.20e-01 0.0974 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 7.55e-01 0.0407 0.13 0.16 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 8.03e-01 0.0181 0.0726 0.16 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0276 0.0786 0.16 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0178 0.111 0.16 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 2.85e-01 0.106 0.0985 0.156 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0476 0.128 0.156 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 6.01e-01 -0.051 0.0974 0.156 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0254 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0383 0.1 0.156 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 4.28e-01 -0.101 0.127 0.156 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 2.13e-01 -0.163 0.13 0.156 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 3.76e-01 0.0608 0.0685 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 1.48e-01 0.178 0.123 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.26e-01 0.0894 0.0736 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0794 0.106 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 3.07e-01 0.0785 0.0766 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 9.78e-01 0.0022 0.0789 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0833 0.0986 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 1.24e-01 0.121 0.0783 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 1.09e-01 0.202 0.126 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.77e-02 0.153 0.0691 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 1.10e-01 -0.188 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 4.13e-01 0.0779 0.0949 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 3.66e-01 0.0908 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 8.63e-01 0.0169 0.098 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0538 0.122 0.142 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 9.35e-01 0.0126 0.155 0.142 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 6.36e-01 0.0644 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0245 0.0754 0.142 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 4.50e-02 0.318 0.157 0.142 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 2.00e-01 -0.175 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 1.77e-01 0.115 0.0848 0.162 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 3.90e-01 0.0987 0.115 0.162 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 1.69e-01 0.101 0.0732 0.162 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0331 0.113 0.162 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0595 0.12 0.162 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 2.66e-01 -0.122 0.109 0.162 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 2.21e-01 -0.155 0.126 0.162 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 2.61e-01 0.114 0.101 0.156 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 2.37e-01 0.148 0.125 0.156 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 6.03e-01 0.0465 0.0894 0.156 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 7.61e-01 0.0337 0.111 0.156 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.81e-01 0.0323 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0207 0.112 0.156 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 1.59e-01 -0.166 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 2.47e-01 0.139 0.12 0.147 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 6.74e-01 0.0557 0.132 0.147 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 7.31e-02 0.199 0.11 0.147 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00206 0.0923 0.147 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 9.91e-02 0.243 0.147 0.147 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 1.32e-01 -0.17 0.112 0.147 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 1.83e-01 -0.181 0.135 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0638 0.101 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 5.34e-01 0.0723 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0324 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 3.35e-01 0.0688 0.0711 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 8.79e-01 0.0144 0.0944 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0295 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 1.39e-01 0.149 0.1 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 3.59e-02 -0.23 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.69e-01 0.0639 0.0577 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00942 0.0848 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 2.02e-01 0.131 0.103 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 2.09e-01 0.0871 0.0692 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 4.83e-02 0.245 0.124 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 1.59e-01 0.0903 0.0639 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 1.32e-01 -0.168 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 1.84e-01 0.0999 0.075 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00261 0.077 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 9.96e-01 0.000414 0.0896 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 7.81e-02 0.143 0.081 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 5.89e-02 0.232 0.122 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 2.94e-01 0.0801 0.076 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 799053 sc-eQTL 5.97e-01 0.0629 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00547 0.0978 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0396 0.102 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 565827 sc-eQTL 7.42e-02 -0.207 0.115 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 sc-eQTL 3.32e-01 0.0754 0.0775 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 527308 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00575 0.131 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -757547 sc-eQTL 8.14e-02 -0.141 0.0806 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -517342 sc-eQTL 8.75e-01 0.0111 0.0707 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 557395 sc-eQTL 7.91e-03 0.252 0.094 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -518361 sc-eQTL 6.53e-01 0.0446 0.0989 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 130423 eQTL 0.00724 0.0454 0.0169 0.00464 0.0 0.183
ENSG00000135525 MAP7 799053 eQTL 0.031 0.0639 0.0296 0.0 0.0 0.183
ENSG00000182747 SLC35D3 427571 eQTL 0.000193 -0.145 0.0388 0.0 0.0 0.183

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 427571 7.74e-07 6.65e-07 1.27e-07 4.36e-07 1.07e-07 1.77e-07 5.13e-07 1.09e-07 3.82e-07 2.12e-07 6.56e-07 3.61e-07 7.19e-07 1.49e-07 1.45e-07 2.18e-07 2.77e-07 3.82e-07 1.89e-07 1.28e-07 1.91e-07 3.34e-07 3.08e-07 1.44e-07 7.71e-07 2.42e-07 2.56e-07 2.57e-07 3e-07 6.19e-07 2.6e-07 7.03e-08 5.42e-08 1.38e-07 3.34e-07 1.02e-07 1.11e-07 9.58e-08 4.44e-08 2.68e-08 4.49e-08 5.09e-07 2.47e-08 5.93e-09 1.19e-07 1.61e-08 8.24e-08 1.79e-08 4.71e-08