logo

Genes within 1Mb (chr6:137348330:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 3.81e-01 0.083 0.0946 0.16 B L1
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.16 B L1
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0165 0.0742 0.16 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.26e-01 0.0724 0.0596 0.16 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 3.60e-01 0.0762 0.0831 0.16 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 1.04e-01 0.153 0.0935 0.16 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00847 0.0634 0.16 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 9.65e-01 0.00451 0.102 0.16 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0603 0.0684 0.16 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 5.39e-01 0.0395 0.0642 0.16 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 6.25e-01 0.0239 0.0489 0.16 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 1.14e-01 0.128 0.0804 0.16 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0362 0.0714 0.16 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0279 0.119 0.16 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 7.41e-03 -0.207 0.0766 0.16 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 3.55e-01 0.0556 0.06 0.16 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 8.11e-02 0.111 0.0631 0.16 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0527 0.0883 0.16 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 3.95e-01 0.0768 0.09 0.155 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 7.75e-01 0.0363 0.127 0.155 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 4.30e-01 0.076 0.0962 0.155 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0188 0.104 0.155 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 2.95e-01 0.105 0.0997 0.155 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 1.19e-01 -0.153 0.0976 0.155 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 1.37e-01 -0.194 0.13 0.155 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 6.49e-02 0.135 0.0725 0.16 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 2.84e-02 0.268 0.122 0.16 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.52e-01 0.071 0.0618 0.16 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 2.43e-01 -0.127 0.108 0.16 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 2.58e-01 0.0819 0.0722 0.16 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0208 0.0769 0.16 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0427 0.0876 0.16 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 6.13e-01 0.0416 0.0822 0.161 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 9.75e-01 0.00406 0.127 0.161 NK L1
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0972 0.0797 0.161 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 7.17e-01 0.0249 0.0685 0.161 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 1.08e-02 0.248 0.0966 0.161 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 7.94e-01 0.0254 0.0971 0.161 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0264 0.0756 0.16 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 2.89e-01 0.131 0.123 0.16 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 4.41e-01 0.0764 0.0989 0.16 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 6.20e-01 0.0234 0.0471 0.16 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 3.25e-02 0.194 0.0899 0.16 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 1.70e-01 -0.128 0.093 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 6.58e-01 0.0558 0.126 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 1.78e-01 -0.167 0.123 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 9.67e-01 0.00266 0.0641 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 1.25e-01 -0.19 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 2.33e-02 -0.314 0.137 0.156 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 1.45e-01 0.158 0.108 0.156 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0219 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 4.48e-01 0.0908 0.119 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 3.10e-01 -0.111 0.109 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.05e-01 0.108 0.0853 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 5.51e-01 0.0617 0.103 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0709 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0682 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 2.95e-01 0.132 0.125 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 7.59e-01 0.0363 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.80e-01 0.0879 0.0812 0.162 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.82e-01 0.0308 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 4.38e-01 0.094 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 3.44e-01 0.0907 0.0956 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 3.41e-01 0.12 0.126 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 6.12e-02 -0.206 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.72e-01 0.0704 0.0639 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0259 0.0901 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 2.40e-01 0.138 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0773 0.128 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 8.58e-01 0.0168 0.0936 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.27e-01 0.113 0.0932 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 4.61e-01 0.0734 0.0994 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 2.61e-01 0.136 0.121 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 3.67e-01 0.0989 0.109 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0269 0.122 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 5.93e-01 -0.066 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 8.46e-01 -0.014 0.0719 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 4.58e-02 0.228 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 3.24e-01 -0.11 0.112 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0289 0.0602 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 6.79e-01 -0.047 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 3.76e-01 -0.083 0.0936 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.73e-01 0.0721 0.0656 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0154 0.0483 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 2.85e-02 0.186 0.0843 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 5.83e-01 0.0465 0.0846 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0132 0.124 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 1.65e-01 -0.146 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 8.38e-01 0.0125 0.061 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 6.23e-01 0.0342 0.0695 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 8.13e-01 0.0203 0.0855 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0686 0.095 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 8.79e-01 0.0187 0.123 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 6.27e-01 0.0484 0.0995 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0579 0.0631 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 4.27e-02 0.197 0.0967 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0891 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 8.65e-01 0.0148 0.0874 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 5.33e-01 0.075 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 6.95e-03 -0.31 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.95e-01 -0.077 0.0733 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 2.31e-01 0.124 0.103 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 1.54e-01 -0.147 0.103 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 8.21e-01 0.0192 0.085 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 7.28e-01 0.0429 0.123 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 9.20e-01 0.0094 0.0937 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 6.40e-01 0.0312 0.0665 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 2.30e-02 0.178 0.0778 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 4.54e-01 0.0737 0.0982 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0284 0.115 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0495 0.132 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 1.83e-01 -0.172 0.128 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 1.54e-01 0.0887 0.0619 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0642 0.111 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0327 0.114 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 2.95e-01 -0.115 0.11 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0286 0.127 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0163 0.132 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00498 0.0811 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 5.92e-01 0.0672 0.125 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 6.13e-02 -0.224 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 5.70e-01 0.0491 0.0862 0.16 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 3.47e-01 0.11 0.117 0.16 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 6.08e-01 0.0626 0.122 0.16 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0156 0.058 0.16 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 3.94e-01 0.0861 0.101 0.16 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0985 0.107 0.16 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 2.95e-01 -0.103 0.0985 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 9.54e-01 0.00738 0.129 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 3.07e-01 0.118 0.115 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 4.90e-01 0.0508 0.0735 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 5.05e-01 0.0747 0.112 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 2.24e-01 -0.142 0.117 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 5.22e-01 0.0483 0.0753 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 5.44e-01 0.0788 0.13 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 2.72e-02 -0.201 0.0902 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 9.92e-01 0.000724 0.071 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.25e-03 0.272 0.1 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 7.32e-01 0.0365 0.106 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00234 0.0983 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0525 0.125 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 2.92e-01 0.107 0.101 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0333 0.0779 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 6.11e-01 0.063 0.124 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0117 0.126 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0207 0.0791 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0158 0.124 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0359 0.0942 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 4.32e-01 0.0555 0.0705 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 1.41e-02 0.237 0.0956 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0111 0.106 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0526 0.163 0.167 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 9.18e-01 0.0174 0.168 0.167 PB L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 2.77e-02 -0.229 0.103 0.167 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 3.39e-01 -0.122 0.127 0.167 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 4.13e-01 -0.119 0.144 0.167 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.167 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 1.74e-02 -0.238 0.0991 0.157 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 3.80e-01 0.107 0.122 0.157 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0968 0.157 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 3.47e-01 0.0576 0.0611 0.157 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 4.79e-01 0.084 0.118 0.157 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0339 0.119 0.157 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 6.87e-01 0.0461 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 4.20e-01 0.0974 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 7.55e-01 0.0407 0.13 0.16 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 8.03e-01 0.0181 0.0726 0.16 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0276 0.0786 0.16 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0178 0.111 0.16 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 2.85e-01 0.106 0.0985 0.156 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0476 0.128 0.156 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 6.01e-01 -0.051 0.0974 0.156 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0254 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0383 0.1 0.156 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 4.28e-01 -0.101 0.127 0.156 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 2.13e-01 -0.163 0.13 0.156 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 3.76e-01 0.0608 0.0685 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 1.48e-01 0.178 0.123 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.26e-01 0.0894 0.0736 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0794 0.106 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 3.07e-01 0.0785 0.0766 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 9.78e-01 0.0022 0.0789 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0833 0.0986 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 1.24e-01 0.121 0.0783 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 1.09e-01 0.202 0.126 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.77e-02 0.153 0.0691 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 1.10e-01 -0.188 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 4.13e-01 0.0779 0.0949 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 3.66e-01 0.0908 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 8.63e-01 0.0169 0.098 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0538 0.122 0.142 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 9.35e-01 0.0126 0.155 0.142 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 6.36e-01 0.0644 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0245 0.0754 0.142 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 4.50e-02 0.318 0.157 0.142 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 2.00e-01 -0.175 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 1.77e-01 0.115 0.0848 0.162 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 3.90e-01 0.0987 0.115 0.162 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 1.69e-01 0.101 0.0732 0.162 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0331 0.113 0.162 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0595 0.12 0.162 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 2.66e-01 -0.122 0.109 0.162 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 2.21e-01 -0.155 0.126 0.162 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 2.61e-01 0.114 0.101 0.156 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 2.37e-01 0.148 0.125 0.156 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 6.03e-01 0.0465 0.0894 0.156 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 7.61e-01 0.0337 0.111 0.156 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.81e-01 0.0323 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0207 0.112 0.156 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 1.59e-01 -0.166 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 2.47e-01 0.139 0.12 0.147 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 6.74e-01 0.0557 0.132 0.147 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 7.31e-02 0.199 0.11 0.147 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00206 0.0923 0.147 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 9.91e-02 0.243 0.147 0.147 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 1.32e-01 -0.17 0.112 0.147 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 1.83e-01 -0.181 0.135 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0638 0.101 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 5.34e-01 0.0723 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0324 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 3.35e-01 0.0688 0.0711 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 8.79e-01 0.0144 0.0944 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0295 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 1.39e-01 0.149 0.1 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 3.59e-02 -0.23 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.69e-01 0.0639 0.0577 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00942 0.0848 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 2.02e-01 0.131 0.103 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 2.09e-01 0.0871 0.0692 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 4.83e-02 0.245 0.124 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 1.59e-01 0.0903 0.0639 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 1.32e-01 -0.168 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 1.84e-01 0.0999 0.075 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00261 0.077 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 9.96e-01 0.000414 0.0896 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 7.81e-02 0.143 0.081 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 5.89e-02 0.232 0.122 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 2.94e-01 0.0801 0.076 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 797511 sc-eQTL 5.97e-01 0.0629 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00547 0.0978 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0396 0.102 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 564285 sc-eQTL 7.42e-02 -0.207 0.115 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 sc-eQTL 3.32e-01 0.0754 0.0775 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 525766 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00575 0.131 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -759089 sc-eQTL 8.14e-02 -0.141 0.0806 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -518884 sc-eQTL 8.75e-01 0.0111 0.0707 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 555853 sc-eQTL 7.91e-03 0.252 0.094 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -519903 sc-eQTL 6.53e-01 0.0446 0.0989 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 128881 eQTL 0.00728 0.0457 0.017 0.0046 0.0 0.182
ENSG00000135525 MAP7 797511 eQTL 0.0228 0.0679 0.0298 0.0 0.0 0.182
ENSG00000182747 SLC35D3 426029 eQTL 0.000222 -0.145 0.039 0.0 0.0 0.182

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina