logo

Genes within 1Mb (chr6:137345260:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 2.09e-01 0.163 0.129 0.077 B L1
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 4.67e-01 -0.112 0.153 0.077 B L1
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.077 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 4.21e-01 -0.066 0.0818 0.077 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 3.42e-01 0.109 0.114 0.077 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.59e-01 0.181 0.128 0.077 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0339 0.0868 0.077 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 3.43e-02 0.295 0.138 0.077 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 1.72e-02 0.222 0.0926 0.077 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 5.74e-01 0.0495 0.0879 0.077 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0213 0.067 0.077 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 7.66e-01 0.033 0.111 0.077 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000945 0.0993 0.077 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 6.48e-01 0.0756 0.165 0.077 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 6.98e-01 0.0421 0.108 0.077 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.97e-01 0.0108 0.0836 0.077 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 2.39e-01 -0.104 0.088 0.077 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 5.34e-01 0.0763 0.123 0.077 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 8.68e-01 0.02 0.121 0.072 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 5.00e-01 0.114 0.17 0.072 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 2.49e-01 -0.148 0.128 0.072 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 1.59e-01 -0.196 0.139 0.072 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 8.31e-01 0.0286 0.134 0.072 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 3.93e-02 -0.269 0.13 0.072 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 3.83e-01 0.152 0.174 0.072 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 1.67e-01 0.137 0.0988 0.077 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 1.71e-01 0.228 0.166 0.077 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.94e-01 0.0113 0.0842 0.077 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0803 0.147 0.077 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 4.34e-01 0.0769 0.0981 0.077 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.59e-01 -0.147 0.104 0.077 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 6.33e-02 -0.22 0.118 0.077 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 3.30e-01 0.106 0.109 0.077 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 2.15e-01 0.208 0.167 0.077 NK L1
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 8.94e-02 0.179 0.105 0.077 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0155 0.0906 0.077 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 2.83e-01 -0.139 0.129 0.077 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.98e-01 -0.165 0.128 0.077 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 4.69e-01 0.0751 0.103 0.077 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 5.10e-01 -0.111 0.169 0.077 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 4.91e-01 0.0933 0.135 0.077 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 9.04e-01 0.0078 0.0645 0.077 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00364 0.125 0.077 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 3.78e-01 0.113 0.128 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 3.92e-01 -0.145 0.169 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 9.22e-01 0.0164 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0605 0.0861 0.079 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 3.63e-01 -0.152 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 7.58e-01 0.0579 0.187 0.079 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 3.08e-01 0.149 0.146 0.079 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0981 0.158 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 9.44e-01 0.0117 0.166 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 3.99e-01 -0.128 0.151 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0868 0.119 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 5.21e-01 0.092 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 7.06e-01 0.0636 0.168 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 6.95e-02 0.306 0.168 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 3.16e-01 0.171 0.17 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 2.14e-03 0.488 0.157 0.078 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 9.15e-01 0.0118 0.11 0.078 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 9.35e-01 0.0123 0.151 0.078 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 2.44e-02 0.368 0.162 0.078 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 1.49e-01 0.198 0.137 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 2.68e-01 -0.201 0.181 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 1.79e-01 0.213 0.158 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 3.18e-01 0.0919 0.0917 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0146 0.129 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 9.91e-02 0.237 0.143 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 5.09e-01 0.113 0.171 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 3.75e-03 -0.537 0.183 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 2.53e-01 0.155 0.136 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 7.52e-01 0.043 0.136 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 4.18e-01 0.117 0.145 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 6.41e-01 0.0821 0.176 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 2.15e-01 -0.194 0.156 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0205 0.174 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 1.25e-01 0.27 0.175 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00407 0.103 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 8.08e-01 0.04 0.164 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 3.11e-01 -0.162 0.16 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0848 0.0817 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 2.78e-02 0.339 0.153 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 9.03e-03 0.331 0.126 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 7.58e-01 0.0276 0.0895 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0407 0.0657 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 5.93e-01 0.0621 0.116 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 8.93e-01 0.0152 0.113 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 5.35e-01 0.103 0.165 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 3.22e-01 0.139 0.14 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 4.02e-01 0.068 0.0811 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 8.17e-01 0.0214 0.0925 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 2.05e-01 0.144 0.113 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 4.83e-01 0.09 0.128 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 6.86e-01 0.0669 0.165 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 1.61e-01 0.188 0.133 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 2.99e-01 0.0884 0.0849 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0689 0.131 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 6.44e-01 0.0632 0.136 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 4.29e-01 0.0933 0.118 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 3.71e-01 0.145 0.162 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 4.92e-01 0.107 0.156 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.94e-01 0.0132 0.0991 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 9.27e-01 0.0128 0.14 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0745 0.139 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0356 0.117 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 3.05e-02 -0.364 0.167 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 6.49e-03 -0.347 0.126 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 3.81e-01 0.0798 0.091 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 2.64e-01 -0.121 0.108 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 2.80e-02 0.295 0.133 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0375 0.155 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 1.79e-02 0.42 0.176 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 8.70e-01 0.0285 0.175 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0177 0.0841 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 4.39e-01 -0.116 0.15 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 8.25e-01 0.0341 0.154 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 6.11e-02 0.284 0.151 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 1.70e-01 0.24 0.174 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 5.61e-01 0.106 0.182 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 7.60e-01 0.0343 0.112 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0361 0.174 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 6.79e-02 -0.303 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 2.82e-01 0.129 0.12 0.076 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 1.27e-02 -0.404 0.161 0.076 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 7.09e-01 0.0636 0.17 0.076 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 4.22e-01 -0.065 0.0808 0.076 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 3.83e-01 -0.123 0.141 0.076 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 7.61e-01 0.0456 0.15 0.076 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0589 0.128 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 8.58e-01 0.0297 0.166 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 9.11e-03 0.386 0.147 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 6.08e-01 0.0487 0.095 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 8.57e-01 -0.026 0.145 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0377 0.151 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 6.55e-02 0.185 0.0998 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 1.19e-01 0.27 0.172 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 2.61e-01 0.137 0.121 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0459 0.0947 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0673 0.136 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 7.79e-02 -0.249 0.141 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 5.87e-01 0.0751 0.138 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00979 0.176 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 2.46e-02 0.319 0.141 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0463 0.11 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 2.62e-01 -0.196 0.174 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 8.89e-01 0.0246 0.177 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 2.25e-01 0.129 0.106 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 5.22e-01 0.107 0.166 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 5.90e-01 0.0681 0.126 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0899 0.0945 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 1.86e-01 -0.172 0.13 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0262 0.143 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0413 0.193 0.089 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 6.09e-01 0.102 0.198 0.089 PB L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 9.51e-01 0.00759 0.124 0.089 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.54e-01 0.0278 0.15 0.089 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 5.10e-01 0.113 0.171 0.089 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 8.65e-01 0.0308 0.181 0.089 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 3.84e-01 0.117 0.134 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 6.47e-01 0.0747 0.163 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 2.68e-01 0.143 0.129 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0135 0.0817 0.078 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 7.16e-01 0.0575 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 2.47e-01 0.183 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 8.95e-01 0.0204 0.154 0.077 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 4.81e-01 -0.115 0.163 0.077 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 6.13e-02 0.328 0.175 0.077 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0702 0.0978 0.077 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 3.91e-01 -0.091 0.106 0.077 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.70e-02 -0.355 0.147 0.077 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 4.09e-01 0.112 0.135 0.073 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 2.85e-01 0.187 0.175 0.073 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 8.34e-02 -0.231 0.132 0.073 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 3.92e-02 -0.321 0.154 0.073 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 5.28e-01 0.0867 0.137 0.073 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 2.71e-01 -0.191 0.173 0.073 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 3.58e-01 0.165 0.179 0.073 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 4.11e-01 0.0746 0.0906 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 7.23e-02 0.293 0.162 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 1.89e-01 -0.128 0.0973 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 8.98e-01 0.018 0.141 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 3.30e-02 0.216 0.1 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.29e-01 -0.158 0.104 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 2.60e-01 -0.147 0.13 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 2.42e-01 0.123 0.105 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 6.83e-02 0.308 0.168 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 2.11e-01 -0.117 0.0935 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 6.14e-01 0.0798 0.158 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 1.77e-01 -0.172 0.127 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.18e-01 -0.211 0.134 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 1.77e-01 -0.177 0.131 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 6.53e-01 0.0862 0.192 0.058 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 4.39e-01 0.188 0.242 0.058 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 3.61e-01 0.194 0.212 0.058 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 5.43e-01 0.0718 0.118 0.058 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0158 0.249 0.058 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.48e-01 0.308 0.212 0.058 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 1.13e-01 0.179 0.112 0.08 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 2.89e-01 -0.161 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 6.01e-01 0.0511 0.0974 0.08 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 3.41e-01 -0.143 0.149 0.08 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 6.56e-01 0.0708 0.159 0.08 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 8.63e-01 0.025 0.145 0.08 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 8.66e-01 0.0283 0.168 0.08 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0126 0.131 0.081 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0261 0.162 0.081 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0641 0.116 0.081 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0341 0.143 0.081 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 2.04e-01 -0.192 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0735 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 3.24e-01 -0.151 0.153 0.081 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0835 0.161 0.073 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 4.09e-01 -0.147 0.177 0.073 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0583 0.15 0.073 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 7.34e-01 0.0422 0.124 0.073 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 4.21e-02 0.402 0.196 0.073 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 6.66e-02 -0.277 0.15 0.073 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 2.56e-02 0.406 0.18 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 4.27e-01 0.112 0.141 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 8.99e-01 0.0208 0.163 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 7.19e-02 0.271 0.15 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 5.56e-01 0.0588 0.0998 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 3.11e-01 0.134 0.132 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.64e-01 0.234 0.168 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 3.79e-01 0.128 0.145 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 2.54e-02 -0.393 0.174 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 2.21e-01 0.193 0.157 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 7.80e-01 0.0232 0.083 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 9.58e-01 0.00649 0.122 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 3.61e-01 0.135 0.148 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 1.78e-01 0.125 0.0928 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 4.47e-02 0.335 0.166 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0458 0.0862 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 9.05e-01 0.0178 0.15 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 3.97e-01 0.0857 0.101 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.41e-01 -0.152 0.103 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 1.49e-01 -0.173 0.12 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 1.05e-01 0.176 0.108 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 6.06e-01 -0.085 0.165 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 6.10e-01 -0.052 0.102 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 794441 sc-eQTL 5.25e-01 -0.101 0.159 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0999 0.131 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 8.47e-01 0.0263 0.137 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 561215 sc-eQTL 6.02e-01 -0.081 0.155 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 sc-eQTL 1.50e-01 0.148 0.102 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 522696 sc-eQTL 2.03e-01 0.22 0.173 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -762159 sc-eQTL 1.84e-01 0.142 0.107 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0373 0.0935 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 552783 sc-eQTL 3.36e-01 -0.122 0.126 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -522973 sc-eQTL 1.41e-01 -0.192 0.13 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 125811 pQTL 0.0167 0.0682 0.0284 0.0 0.0 0.0766
ENSG00000118503 TNFAIP3 -521954 eQTL 0.0166 0.0559 0.0233 0.00137 0.0 0.079
ENSG00000220412 AL356234.1 -361941 eQTL 0.0348 0.091 0.0431 0.00124 0.0 0.079
ENSG00000237499 AL357060.1 -522973 eQTL 0.0132 0.0554 0.0223 0.00136 0.0 0.079

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 \N 794441 3.07e-07 1.56e-07 7.45e-08 2.24e-07 1.01e-07 9.05e-08 2.1e-07 5.43e-08 1.44e-07 6.75e-08 1.59e-07 1.22e-07 1.87e-07 8e-08 5.69e-08 7.98e-08 4.18e-08 1.72e-07 7.29e-08 4.92e-08 1.22e-07 1.31e-07 1.64e-07 3.07e-08 2.02e-07 1.22e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.31e-07 1.29e-07 1.06e-07 3.54e-08 3.51e-08 8.11e-08 3.46e-08 2.85e-08 5.74e-08 8.61e-08 6.58e-08 3.75e-08 5.37e-08 1.59e-07 3.08e-08 1.1e-08 4.06e-08 1.8e-08 1.15e-07 2.05e-09 4.83e-08
ENSG00000182747 \N 422959 1.26e-06 9.39e-07 3.18e-07 5.11e-07 9.6e-08 3.12e-07 1.02e-06 2e-07 1.09e-06 3.13e-07 1.16e-06 5.6e-07 1.46e-06 2.68e-07 4.53e-07 5.7e-07 7.43e-07 5.65e-07 4.95e-07 3.34e-07 2.8e-07 7.06e-07 7.63e-07 4.79e-07 1.86e-06 2.4e-07 6.38e-07 4.75e-07 8.24e-07 1.07e-06 4.71e-07 3.72e-08 9.46e-08 1.9e-07 3.16e-07 3.59e-07 2.59e-07 1.18e-07 1.6e-07 9.61e-09 1.18e-07 1.3e-06 8.31e-08 2.64e-08 1.86e-07 4.53e-08 1.41e-07 8.66e-08 9.42e-08
ENSG00000237499 AL357060.1 -522973 9.39e-07 6.78e-07 2.62e-07 4.32e-07 1.1e-07 1.77e-07 5.8e-07 8.17e-08 4.61e-07 2.37e-07 6.39e-07 4.21e-07 7.71e-07 1.6e-07 2.77e-07 2.45e-07 3.13e-07 4.2e-07 2.65e-07 1.3e-07 2.01e-07 3.76e-07 4.12e-07 1.73e-07 9.15e-07 2.4e-07 3.04e-07 2.54e-07 3.86e-07 7.06e-07 3.13e-07 6.06e-08 5.68e-08 1.27e-07 3e-07 1.44e-07 1.18e-07 7.75e-08 4.55e-08 3.05e-08 3.6e-08 6.11e-07 6.44e-08 1.06e-08 2e-07 1.61e-08 7.89e-08 2.35e-08 6.03e-08