logo

Genes within 1Mb (chr6:137330056:G:GT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 1.10e-01 0.226 0.141 0.064 B L1
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 2.63e-01 -0.188 0.167 0.064 B L1
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 1.62e-01 -0.155 0.11 0.064 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 1.45e-01 -0.13 0.089 0.064 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 1.70e-01 0.171 0.124 0.064 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.39e-01 0.208 0.14 0.064 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 9.88e-01 0.00147 0.0964 0.064 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 7.09e-02 0.28 0.154 0.064 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 5.44e-02 0.2 0.103 0.064 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 6.06e-01 0.0503 0.0976 0.064 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00123 0.0744 0.064 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 4.71e-01 0.0886 0.123 0.064 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 8.37e-01 0.0223 0.108 0.064 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 5.56e-01 0.106 0.18 0.064 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 6.53e-01 0.0531 0.118 0.064 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0306 0.091 0.064 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 3.28e-01 -0.094 0.096 0.064 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 2.75e-01 0.146 0.133 0.064 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0104 0.134 0.061 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 9.13e-01 0.0207 0.189 0.061 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0962 0.143 0.061 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 2.64e-01 -0.173 0.155 0.061 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 8.35e-01 -0.031 0.149 0.061 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 2.57e-01 -0.165 0.145 0.061 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 4.25e-01 0.155 0.194 0.061 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 6.51e-02 0.202 0.109 0.064 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 1.60e-01 0.259 0.184 0.064 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 6.57e-01 0.0413 0.093 0.064 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0668 0.163 0.064 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 8.26e-01 0.0239 0.109 0.064 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.84e-01 -0.153 0.115 0.064 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 4.04e-01 -0.11 0.131 0.064 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 3.92e-01 0.104 0.121 0.064 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 8.11e-01 0.0449 0.188 0.064 NK L1
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 5.97e-02 0.222 0.117 0.064 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0912 0.101 0.064 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 9.59e-02 -0.241 0.144 0.064 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.97e-01 -0.185 0.143 0.064 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 5.76e-01 0.0643 0.115 0.064 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0976 0.187 0.064 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0047 0.15 0.064 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0402 0.0714 0.064 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 3.51e-01 -0.129 0.138 0.064 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 3.01e-01 0.147 0.141 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 4.27e-01 -0.144 0.181 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 5.32e-01 0.112 0.179 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0633 0.0924 0.066 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.24e-01 -0.114 0.179 0.066 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 2.55e-01 0.229 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 8.38e-01 0.0321 0.157 0.066 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 2.72e-01 0.187 0.17 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 3.22e-01 -0.176 0.178 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 6.67e-01 -0.07 0.162 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0965 0.127 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 5.82e-01 0.0849 0.154 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 7.18e-01 0.0654 0.181 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 2.79e-02 0.403 0.182 0.065 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 3.05e-01 0.191 0.186 0.065 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 9.25e-03 0.452 0.172 0.065 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 7.74e-01 0.0346 0.12 0.065 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0718 0.164 0.065 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 7.57e-03 0.475 0.176 0.065 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 1.31e-01 0.222 0.147 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 3.17e-01 -0.194 0.194 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 3.41e-01 0.162 0.17 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00427 0.0987 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00518 0.139 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.43e-01 0.226 0.154 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 3.36e-01 0.178 0.184 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 1.97e-02 -0.469 0.199 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 5.08e-01 0.0974 0.147 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 9.22e-01 0.0144 0.147 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 2.29e-01 0.188 0.156 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 4.09e-01 0.157 0.19 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 2.85e-01 -0.182 0.17 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 7.64e-01 0.0566 0.189 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 7.58e-01 0.059 0.191 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0594 0.111 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0166 0.178 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0681 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 5.31e-01 -0.057 0.0908 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 9.03e-02 0.29 0.17 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 2.55e-02 0.315 0.14 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 7.12e-01 0.0367 0.0993 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00403 0.0729 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 3.27e-01 0.126 0.128 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 6.79e-01 0.052 0.126 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 9.02e-01 0.0227 0.185 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 3.67e-01 0.141 0.156 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 3.60e-01 0.0829 0.0904 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 7.45e-01 0.0335 0.103 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 8.59e-02 0.218 0.126 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 1.66e-01 0.195 0.14 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 7.98e-01 0.0467 0.182 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 2.48e-01 0.17 0.147 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 4.51e-01 0.0707 0.0935 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0857 0.145 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 2.80e-01 0.162 0.15 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 8.94e-01 0.0174 0.13 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 6.45e-01 0.0828 0.179 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 4.21e-01 0.139 0.172 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00735 0.11 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0101 0.155 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0512 0.154 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0179 0.129 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 7.77e-02 -0.33 0.186 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 3.27e-02 -0.303 0.141 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.56e-01 0.0596 0.101 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 2.28e-01 -0.144 0.119 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.54e-02 0.36 0.147 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0285 0.172 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 4.20e-02 0.399 0.195 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0688 0.193 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0538 0.093 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 3.11e-01 -0.168 0.166 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 4.94e-01 0.116 0.17 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 1.11e-02 0.41 0.16 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 2.90e-01 0.198 0.187 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 4.03e-01 0.163 0.194 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0205 0.12 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 7.06e-01 -0.07 0.185 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 4.88e-01 -0.124 0.178 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 5.60e-01 0.077 0.132 0.065 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 2.76e-02 -0.393 0.177 0.065 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 9.34e-01 0.0156 0.187 0.065 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0966 0.0886 0.065 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 2.05e-01 -0.196 0.154 0.065 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 4.76e-01 0.117 0.164 0.065 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00987 0.143 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 8.03e-01 0.0465 0.186 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 7.74e-02 0.294 0.166 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 7.84e-01 0.0291 0.106 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0244 0.162 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0209 0.17 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 1.37e-01 0.167 0.112 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 4.39e-01 0.15 0.194 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 9.45e-02 0.227 0.135 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0841 0.106 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 1.84e-01 -0.203 0.152 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.09e-01 -0.254 0.158 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 8.59e-01 0.0287 0.162 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 6.74e-01 0.0863 0.205 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 7.43e-02 0.296 0.165 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0957 0.128 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 2.86e-01 -0.217 0.203 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 9.54e-01 0.0119 0.207 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 2.03e-01 0.151 0.118 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0794 0.186 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 4.89e-01 0.0978 0.141 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 1.41e-01 -0.155 0.105 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 2.06e-01 -0.184 0.145 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0332 0.159 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0608 0.216 0.074 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0914 0.222 0.074 PB L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 4.27e-01 0.11 0.138 0.074 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 2.74e-01 0.184 0.167 0.074 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 4.92e-01 0.132 0.191 0.074 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 9.03e-01 0.0247 0.202 0.074 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 3.60e-01 0.137 0.15 0.065 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 7.53e-01 0.0573 0.182 0.065 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 4.42e-01 0.111 0.145 0.065 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0565 0.0912 0.065 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 8.02e-01 0.0443 0.177 0.065 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 2.12e-01 0.221 0.176 0.065 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 2.32e-01 0.204 0.17 0.064 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00439 0.18 0.064 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 5.54e-02 0.372 0.193 0.064 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0773 0.108 0.064 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 3.65e-01 -0.107 0.117 0.064 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.32e-02 -0.408 0.163 0.064 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 4.39e-01 0.115 0.149 0.061 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 8.68e-01 0.032 0.193 0.061 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 6.39e-02 -0.271 0.145 0.061 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 2.39e-02 -0.385 0.169 0.061 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 7.68e-01 0.0445 0.151 0.061 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0361 0.191 0.061 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 6.87e-01 0.0792 0.196 0.061 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 6.73e-02 0.183 0.0995 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 4.45e-02 0.361 0.179 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0671 0.108 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 3.27e-01 0.152 0.155 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 8.99e-02 0.19 0.112 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 2.79e-01 -0.125 0.115 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 4.57e-01 -0.108 0.144 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 3.10e-01 0.119 0.117 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 2.50e-01 0.216 0.187 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 2.77e-01 -0.113 0.104 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 8.82e-01 0.026 0.175 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 1.00e-01 -0.232 0.14 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 9.35e-02 -0.25 0.148 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 4.21e-01 -0.117 0.145 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 2.04e-01 0.159 0.125 0.067 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 4.58e-01 -0.125 0.169 0.067 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 6.66e-01 0.0468 0.108 0.067 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 5.45e-01 -0.101 0.166 0.067 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 8.86e-01 0.0252 0.176 0.067 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0558 0.161 0.067 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 4.04e-01 0.155 0.185 0.067 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 7.03e-01 0.0557 0.146 0.068 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0809 0.18 0.068 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0327 0.129 0.068 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 8.36e-01 -0.033 0.159 0.068 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 3.79e-01 -0.147 0.167 0.068 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 9.62e-01 0.00763 0.161 0.068 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0304 0.17 0.068 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 3.52e-01 -0.161 0.172 0.065 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 3.67e-01 -0.171 0.189 0.065 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 8.43e-01 0.0318 0.16 0.065 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 2.40e-01 0.156 0.132 0.065 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 7.44e-02 0.377 0.21 0.065 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 2.75e-01 -0.177 0.162 0.065 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 1.38e-02 0.477 0.192 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 6.86e-02 0.272 0.148 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0798 0.172 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 6.59e-02 0.293 0.159 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 8.75e-01 0.0167 0.106 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 4.15e-01 0.114 0.14 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.84e-01 0.237 0.178 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 3.03e-01 0.16 0.155 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 5.51e-02 -0.361 0.187 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 3.43e-01 0.16 0.169 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0435 0.0888 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 4.52e-01 0.098 0.13 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 3.01e-01 0.163 0.158 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 4.54e-02 0.205 0.102 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 5.55e-02 0.352 0.183 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00678 0.095 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 7.86e-01 0.0448 0.165 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 8.16e-01 0.0259 0.111 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 2.23e-01 -0.139 0.113 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 3.54e-01 -0.123 0.132 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 1.39e-01 0.178 0.12 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 4.99e-01 -0.123 0.182 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0522 0.112 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 779237 sc-eQTL 5.45e-01 -0.106 0.176 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 4.13e-01 -0.118 0.144 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00462 0.151 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 546011 sc-eQTL 5.60e-01 0.0998 0.171 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110607 sc-eQTL 2.94e-01 0.121 0.115 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507492 sc-eQTL 7.65e-01 0.058 0.194 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -777363 sc-eQTL 7.47e-02 0.214 0.119 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537158 sc-eQTL 3.15e-01 -0.105 0.104 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537579 sc-eQTL 1.31e-01 -0.213 0.141 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538177 sc-eQTL 1.03e-01 -0.238 0.146 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 407755 5.93e-06 2.45e-06 6.57e-07 2.02e-06 4.25e-07 8.37e-07 2.25e-06 2.73e-07 1.92e-06 7.36e-07 2.01e-06 1.26e-06 3.35e-06 2.79e-07 5.51e-07 1.54e-06 7.7e-07 2.19e-06 1.56e-06 6.16e-07 6.53e-07 3.16e-06 3.17e-06 5.38e-07 3.07e-06 7.59e-07 9.97e-07 8.09e-07 1.74e-06 1.66e-06 9.97e-07 6.58e-08 2.29e-07 1.12e-06 9.05e-07 5.39e-07 1.84e-07 2.38e-07 3.87e-07 7.66e-08 3.02e-07 3.32e-06 5.89e-07 1.52e-07 1.94e-07 3.8e-07 1.37e-07 8.66e-08 8.09e-08
ENSG00000237499 \N -538177 4.68e-06 1.36e-06 8.72e-07 1.56e-06 3.51e-07 8.21e-07 1.3e-06 1.54e-07 1.72e-06 6.69e-07 1.83e-06 7.37e-07 2.67e-06 2.9e-07 4.17e-07 9.79e-07 5.06e-07 1.51e-06 6.58e-07 6.61e-07 8.18e-07 2.17e-06 2.32e-06 5.6e-07 2.34e-06 3.71e-07 9.09e-07 6.23e-07 1.47e-06 1.36e-06 8.43e-07 4.78e-08 9.26e-08 6.13e-07 5.82e-07 4.5e-07 8.35e-08 1.45e-07 1.51e-07 8.8e-09 2.18e-07 2.48e-06 5.1e-07 1.58e-07 9.79e-08 3.36e-07 1.11e-07 3.05e-08 6.14e-08