logo

Genes within 1Mb (chr6:137329977:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 3.20e-01 0.0967 0.0971 0.145 B L1
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 3.76e-01 0.102 0.115 0.145 B L1
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0203 0.0762 0.145 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 3.46e-01 0.0579 0.0613 0.145 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 2.63e-01 0.0957 0.0853 0.145 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 7.66e-02 0.171 0.0959 0.145 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 8.91e-01 0.00896 0.0654 0.145 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00726 0.105 0.145 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0746 0.0705 0.145 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 5.86e-01 0.0361 0.0662 0.145 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 3.85e-01 0.0439 0.0504 0.145 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 5.88e-02 0.157 0.0827 0.145 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0219 0.074 0.145 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 9.80e-01 0.00312 0.123 0.145 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 1.50e-02 -0.195 0.0795 0.145 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 4.65e-01 0.0455 0.0622 0.145 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 3.26e-02 0.14 0.0651 0.145 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0222 0.0914 0.145 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 4.37e-01 0.0728 0.0936 0.142 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0514 0.132 0.142 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.68e-01 0.111 0.0999 0.142 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 8.83e-01 0.016 0.108 0.142 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 3.64e-01 0.0945 0.104 0.142 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 2.32e-01 -0.122 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 9.49e-02 -0.226 0.135 0.142 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 2.97e-02 0.164 0.0748 0.145 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 1.89e-02 0.297 0.126 0.145 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.23e-01 0.0781 0.064 0.145 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 2.64e-01 -0.126 0.112 0.145 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.34e-01 0.0586 0.0748 0.145 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0182 0.0795 0.145 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 8.57e-01 0.0164 0.0907 0.145 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 6.84e-01 0.0346 0.085 0.146 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0994 0.131 0.146 NK L1
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0999 0.0824 0.146 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00161 0.0708 0.146 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 1.22e-02 0.253 0.0999 0.146 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 6.44e-01 0.0464 0.1 0.146 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0407 0.0782 0.145 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.51e-01 0.146 0.127 0.145 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 7.18e-01 0.0371 0.102 0.145 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 8.94e-01 0.00651 0.0487 0.145 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 7.24e-02 0.169 0.0934 0.145 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 1.56e-01 -0.137 0.0962 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 5.16e-01 0.0855 0.131 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.73e-01 -0.142 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 9.30e-01 0.00588 0.0669 0.14 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.80e-01 -0.14 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 6.18e-02 -0.27 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 5.09e-01 0.0749 0.113 0.14 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 3.90e-01 0.101 0.117 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 8.17e-01 0.0285 0.123 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0748 0.112 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.17e-01 0.109 0.0877 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 5.79e-01 0.0591 0.106 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0796 0.125 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0627 0.128 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.96e-01 0.136 0.13 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0306 0.122 0.147 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.71e-01 0.0924 0.0838 0.147 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0163 0.115 0.147 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 2.55e-01 0.142 0.125 0.147 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 4.64e-01 0.0724 0.0986 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.64e-01 0.145 0.13 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 3.99e-02 -0.233 0.113 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 5.85e-01 0.0361 0.066 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0236 0.0928 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 2.59e-01 0.117 0.103 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 1.52e-01 0.173 0.121 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00433 0.133 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0233 0.0966 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.81e-01 0.104 0.0962 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 3.90e-01 0.0883 0.103 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 1.69e-01 0.171 0.124 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 2.22e-01 0.138 0.113 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.126 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 2.07e-01 -0.161 0.127 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0386 0.0743 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.90e-02 0.233 0.117 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0572 0.116 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0152 0.0621 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 5.01e-01 -0.079 0.117 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 2.42e-01 -0.113 0.0964 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.52e-01 0.0777 0.0677 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 8.38e-01 0.0102 0.0498 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 1.63e-02 0.21 0.0867 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 4.97e-01 0.0592 0.087 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0494 0.128 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 1.85e-01 -0.143 0.108 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 8.82e-01 0.00935 0.0628 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 5.65e-01 0.0412 0.0715 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 6.79e-01 0.0365 0.088 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0369 0.0982 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 9.63e-01 0.00584 0.127 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 7.57e-01 0.0319 0.103 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0804 0.065 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.23e-02 0.204 0.0998 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0476 0.105 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0243 0.0905 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 6.52e-01 0.0562 0.124 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 9.08e-03 -0.31 0.118 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0882 0.0759 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 2.28e-01 0.13 0.107 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.107 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 6.64e-01 0.0384 0.0884 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 3.81e-01 0.112 0.128 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 4.78e-01 0.0692 0.0973 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 7.78e-01 0.0196 0.0692 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 1.17e-02 0.205 0.0807 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 5.06e-01 0.068 0.102 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00802 0.12 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0807 0.138 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 1.43e-01 -0.198 0.134 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 1.99e-01 0.0836 0.0648 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0637 0.116 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 9.03e-01 0.0146 0.119 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0944 0.113 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 5.82e-01 -0.072 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 9.39e-01 0.0104 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0275 0.0838 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 6.74e-01 0.0546 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 2.40e-01 -0.146 0.124 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 7.43e-01 0.0294 0.0897 0.147 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.58e-01 0.138 0.121 0.147 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 6.49e-01 0.0578 0.127 0.147 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0226 0.0603 0.147 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 3.79e-01 0.0925 0.105 0.147 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 3.58e-01 -0.103 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0658 0.103 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 8.91e-01 0.0184 0.134 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 7.87e-01 0.0325 0.12 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 5.94e-01 0.041 0.0766 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 3.81e-01 0.102 0.116 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 2.55e-01 -0.139 0.122 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 7.11e-01 0.0288 0.0778 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00598 0.134 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 5.07e-02 -0.183 0.0934 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00549 0.0733 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 1.55e-02 0.254 0.104 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 4.42e-01 0.0844 0.11 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0254 0.102 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0102 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 6.29e-01 0.051 0.105 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0394 0.0811 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.62e-01 0.0949 0.129 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0111 0.131 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0204 0.082 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 3.71e-01 -0.115 0.129 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0141 0.0977 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 5.48e-01 0.044 0.0732 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.91e-03 0.281 0.0987 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0112 0.11 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00688 0.161 0.148 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0724 0.165 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 8.76e-02 -0.176 0.102 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0402 0.125 0.148 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0709 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 3.08e-01 -0.153 0.15 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 1.39e-02 -0.255 0.103 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 3.61e-01 0.116 0.126 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 4.78e-01 0.0715 0.101 0.141 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 4.72e-01 0.0457 0.0634 0.141 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.88e-01 0.0853 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0314 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 3.15e-01 0.119 0.118 0.145 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 1.61e-01 0.175 0.124 0.145 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 9.38e-01 0.0105 0.135 0.145 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 7.44e-01 0.0246 0.0752 0.145 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0181 0.0815 0.145 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0123 0.115 0.145 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 3.75e-01 0.0916 0.103 0.141 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.55e-01 -0.152 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0516 0.102 0.141 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 9.45e-01 0.00825 0.119 0.141 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0635 0.105 0.141 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 7.92e-01 -0.035 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 9.16e-02 -0.229 0.135 0.141 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 1.45e-01 0.104 0.0708 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 1.74e-01 0.174 0.127 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 1.01e-01 0.125 0.0761 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0399 0.11 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 5.56e-01 0.0469 0.0796 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 7.46e-01 0.0266 0.0818 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0673 0.102 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 1.33e-01 0.122 0.0812 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 1.86e-01 0.173 0.13 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 1.55e-02 0.175 0.0716 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 6.08e-02 -0.228 0.121 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.28e-01 0.0782 0.0985 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 3.26e-01 0.102 0.104 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 5.30e-01 0.0639 0.102 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 4.52e-01 -0.098 0.13 0.127 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 8.72e-01 0.0266 0.165 0.127 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 6.31e-01 0.0693 0.144 0.127 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 7.00e-01 -0.031 0.0801 0.127 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 2.04e-01 0.215 0.169 0.127 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 3.11e-01 -0.147 0.145 0.127 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 2.69e-01 0.0974 0.0879 0.147 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 1.84e-01 0.158 0.118 0.147 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 1.97e-01 0.0981 0.0758 0.147 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 8.57e-01 0.0211 0.117 0.147 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0793 0.124 0.147 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 1.04e-01 -0.184 0.113 0.147 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0961 0.131 0.147 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 9.99e-02 0.173 0.104 0.14 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.34e-01 0.155 0.13 0.14 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 5.26e-01 0.059 0.0929 0.14 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 7.77e-01 0.0326 0.115 0.14 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 4.49e-01 0.0915 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 8.48e-01 0.0223 0.116 0.14 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 3.50e-01 -0.115 0.122 0.14 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 2.58e-01 0.143 0.126 0.136 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 8.80e-01 0.021 0.139 0.136 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 3.82e-02 0.241 0.115 0.136 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 8.74e-01 0.0155 0.097 0.136 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 1.18e-01 0.242 0.154 0.136 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 1.98e-01 -0.153 0.118 0.136 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.142 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00121 0.104 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 7.03e-01 0.0459 0.12 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0435 0.112 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 5.20e-01 0.0474 0.0736 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00757 0.0976 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0345 0.125 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 1.42e-01 0.152 0.103 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 2.08e-01 0.159 0.126 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 2.29e-02 -0.256 0.111 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 4.34e-01 0.0464 0.0592 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 8.11e-01 0.0208 0.0869 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 1.31e-01 0.159 0.105 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 1.03e-01 0.117 0.0715 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 6.37e-02 0.239 0.128 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 9.73e-02 0.11 0.0661 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 1.26e-01 -0.176 0.115 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 3.69e-01 0.0701 0.0778 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 8.78e-01 0.0123 0.0797 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 7.22e-01 0.033 0.0928 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 7.66e-02 0.149 0.0837 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 3.79e-02 0.263 0.126 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 3.08e-01 0.0803 0.0786 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 779158 sc-eQTL 5.35e-01 0.0763 0.123 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 9.30e-01 0.00887 0.101 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0698 0.105 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 545932 sc-eQTL 2.74e-01 -0.131 0.12 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 110528 sc-eQTL 5.02e-01 0.0538 0.08 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 507413 sc-eQTL 4.09e-01 -0.112 0.135 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -777442 sc-eQTL 1.19e-01 -0.13 0.0833 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -537237 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00811 0.073 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 537500 sc-eQTL 8.76e-03 0.257 0.097 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -538256 sc-eQTL 5.51e-01 0.061 0.102 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 \N 407676 1.2e-06 1.4e-06 3.44e-07 1.28e-06 2.76e-07 5.98e-07 1.54e-06 3.24e-07 1.66e-06 5.11e-07 1.87e-06 8.59e-07 2.55e-06 3.31e-07 3.31e-07 9.45e-07 9.2e-07 9.58e-07 8.34e-07 6.49e-07 6.51e-07 1.82e-06 9.22e-07 6.4e-07 2.49e-06 4.23e-07 1.03e-06 7.03e-07 1.33e-06 1.25e-06 6.73e-07 2.06e-07 1.95e-07 5.5e-07 5.3e-07 4.49e-07 7.25e-07 1.36e-07 2.94e-07 2.55e-07 2.36e-07 1.62e-06 4.86e-07 1.31e-07 1.6e-07 2.28e-07 2.15e-07 8.81e-08 5.76e-08