logo

Genes within 1Mb (chr6:137323701:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 3.20e-01 0.0967 0.0971 0.145 B L1
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 3.76e-01 0.102 0.115 0.145 B L1
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0203 0.0762 0.145 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 3.46e-01 0.0579 0.0613 0.145 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 2.63e-01 0.0957 0.0853 0.145 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 7.66e-02 0.171 0.0959 0.145 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 8.91e-01 0.00896 0.0654 0.145 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00726 0.105 0.145 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0746 0.0705 0.145 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 5.86e-01 0.0361 0.0662 0.145 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 3.85e-01 0.0439 0.0504 0.145 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 5.88e-02 0.157 0.0827 0.145 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0219 0.074 0.145 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 9.80e-01 0.00312 0.123 0.145 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 1.50e-02 -0.195 0.0795 0.145 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 4.65e-01 0.0455 0.0622 0.145 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 3.26e-02 0.14 0.0651 0.145 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0222 0.0914 0.145 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 4.37e-01 0.0728 0.0936 0.142 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0514 0.132 0.142 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.68e-01 0.111 0.0999 0.142 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 8.83e-01 0.016 0.108 0.142 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 3.64e-01 0.0945 0.104 0.142 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 2.32e-01 -0.122 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 9.49e-02 -0.226 0.135 0.142 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 2.97e-02 0.164 0.0748 0.145 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 1.89e-02 0.297 0.126 0.145 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.23e-01 0.0781 0.064 0.145 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 2.64e-01 -0.126 0.112 0.145 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.34e-01 0.0586 0.0748 0.145 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0182 0.0795 0.145 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 8.57e-01 0.0164 0.0907 0.145 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 6.84e-01 0.0346 0.085 0.146 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0994 0.131 0.146 NK L1
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0999 0.0824 0.146 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00161 0.0708 0.146 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 1.22e-02 0.253 0.0999 0.146 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 6.44e-01 0.0464 0.1 0.146 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0407 0.0782 0.145 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.51e-01 0.146 0.127 0.145 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 7.18e-01 0.0371 0.102 0.145 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 8.94e-01 0.00651 0.0487 0.145 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 7.24e-02 0.169 0.0934 0.145 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 1.56e-01 -0.137 0.0962 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 5.16e-01 0.0855 0.131 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.73e-01 -0.142 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 9.30e-01 0.00588 0.0669 0.14 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.80e-01 -0.14 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 6.18e-02 -0.27 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 5.09e-01 0.0749 0.113 0.14 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 3.90e-01 0.101 0.117 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 8.17e-01 0.0285 0.123 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0748 0.112 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.17e-01 0.109 0.0877 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 5.79e-01 0.0591 0.106 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0796 0.125 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0627 0.128 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.96e-01 0.136 0.13 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0306 0.122 0.147 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.71e-01 0.0924 0.0838 0.147 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0163 0.115 0.147 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 2.55e-01 0.142 0.125 0.147 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 4.64e-01 0.0724 0.0986 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.64e-01 0.145 0.13 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 3.99e-02 -0.233 0.113 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 5.85e-01 0.0361 0.066 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0236 0.0928 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 2.59e-01 0.117 0.103 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 1.52e-01 0.173 0.121 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00433 0.133 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0233 0.0966 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.81e-01 0.104 0.0962 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 3.90e-01 0.0883 0.103 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 1.69e-01 0.171 0.124 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 2.22e-01 0.138 0.113 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.126 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 2.07e-01 -0.161 0.127 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0386 0.0743 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.90e-02 0.233 0.117 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0572 0.116 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0152 0.0621 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 5.01e-01 -0.079 0.117 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 2.42e-01 -0.113 0.0964 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.52e-01 0.0777 0.0677 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 8.38e-01 0.0102 0.0498 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 1.63e-02 0.21 0.0867 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 4.97e-01 0.0592 0.087 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0494 0.128 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 1.85e-01 -0.143 0.108 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 8.82e-01 0.00935 0.0628 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 5.65e-01 0.0412 0.0715 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 6.79e-01 0.0365 0.088 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0369 0.0982 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 9.63e-01 0.00584 0.127 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 7.57e-01 0.0319 0.103 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0804 0.065 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.23e-02 0.204 0.0998 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0476 0.105 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0243 0.0905 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 6.52e-01 0.0562 0.124 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 9.08e-03 -0.31 0.118 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0882 0.0759 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 2.28e-01 0.13 0.107 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.107 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 6.64e-01 0.0384 0.0884 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 3.81e-01 0.112 0.128 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 4.78e-01 0.0692 0.0973 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 7.78e-01 0.0196 0.0692 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 1.17e-02 0.205 0.0807 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 5.06e-01 0.068 0.102 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00802 0.12 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0807 0.138 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 1.43e-01 -0.198 0.134 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 1.99e-01 0.0836 0.0648 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0637 0.116 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 9.03e-01 0.0146 0.119 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0944 0.113 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 5.82e-01 -0.072 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 9.39e-01 0.0104 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0275 0.0838 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 6.74e-01 0.0546 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 2.40e-01 -0.146 0.124 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 7.43e-01 0.0294 0.0897 0.147 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.58e-01 0.138 0.121 0.147 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 6.49e-01 0.0578 0.127 0.147 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0226 0.0603 0.147 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 3.79e-01 0.0925 0.105 0.147 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 3.58e-01 -0.103 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0658 0.103 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 8.91e-01 0.0184 0.134 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 7.87e-01 0.0325 0.12 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 5.94e-01 0.041 0.0766 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 3.81e-01 0.102 0.116 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 2.55e-01 -0.139 0.122 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 7.11e-01 0.0288 0.0778 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00598 0.134 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 5.07e-02 -0.183 0.0934 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00549 0.0733 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 1.55e-02 0.254 0.104 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 4.42e-01 0.0844 0.11 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0254 0.102 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0102 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 6.29e-01 0.051 0.105 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0394 0.0811 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.62e-01 0.0949 0.129 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0111 0.131 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0204 0.082 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 3.71e-01 -0.115 0.129 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0141 0.0977 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 5.48e-01 0.044 0.0732 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.91e-03 0.281 0.0987 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0112 0.11 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00688 0.161 0.148 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0724 0.165 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 8.76e-02 -0.176 0.102 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0402 0.125 0.148 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0709 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 3.08e-01 -0.153 0.15 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 1.39e-02 -0.255 0.103 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 3.61e-01 0.116 0.126 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 4.78e-01 0.0715 0.101 0.141 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 4.72e-01 0.0457 0.0634 0.141 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.88e-01 0.0853 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0314 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 3.15e-01 0.119 0.118 0.145 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 1.61e-01 0.175 0.124 0.145 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 9.38e-01 0.0105 0.135 0.145 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 7.44e-01 0.0246 0.0752 0.145 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0181 0.0815 0.145 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0123 0.115 0.145 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 3.75e-01 0.0916 0.103 0.141 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.55e-01 -0.152 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0516 0.102 0.141 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 9.45e-01 0.00825 0.119 0.141 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0635 0.105 0.141 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 7.92e-01 -0.035 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 9.16e-02 -0.229 0.135 0.141 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 1.45e-01 0.104 0.0708 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 1.74e-01 0.174 0.127 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 1.01e-01 0.125 0.0761 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0399 0.11 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 5.56e-01 0.0469 0.0796 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 7.46e-01 0.0266 0.0818 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0673 0.102 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 1.33e-01 0.122 0.0812 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 1.86e-01 0.173 0.13 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 1.55e-02 0.175 0.0716 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 6.08e-02 -0.228 0.121 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.28e-01 0.0782 0.0985 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 3.26e-01 0.102 0.104 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 5.30e-01 0.0639 0.102 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 4.52e-01 -0.098 0.13 0.127 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 8.72e-01 0.0266 0.165 0.127 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 6.31e-01 0.0693 0.144 0.127 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 7.00e-01 -0.031 0.0801 0.127 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 2.04e-01 0.215 0.169 0.127 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 3.11e-01 -0.147 0.145 0.127 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 2.69e-01 0.0974 0.0879 0.147 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 1.84e-01 0.158 0.118 0.147 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 1.97e-01 0.0981 0.0758 0.147 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 8.57e-01 0.0211 0.117 0.147 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0793 0.124 0.147 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 1.04e-01 -0.184 0.113 0.147 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0961 0.131 0.147 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 9.99e-02 0.173 0.104 0.14 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.34e-01 0.155 0.13 0.14 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 5.26e-01 0.059 0.0929 0.14 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 7.77e-01 0.0326 0.115 0.14 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 4.49e-01 0.0915 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 8.48e-01 0.0223 0.116 0.14 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 3.50e-01 -0.115 0.122 0.14 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 2.58e-01 0.143 0.126 0.136 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 8.80e-01 0.021 0.139 0.136 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 3.82e-02 0.241 0.115 0.136 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 8.74e-01 0.0155 0.097 0.136 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 1.18e-01 0.242 0.154 0.136 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 1.98e-01 -0.153 0.118 0.136 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.142 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00121 0.104 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 7.03e-01 0.0459 0.12 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0435 0.112 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 5.20e-01 0.0474 0.0736 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00757 0.0976 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0345 0.125 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 1.42e-01 0.152 0.103 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 2.08e-01 0.159 0.126 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 2.29e-02 -0.256 0.111 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 4.34e-01 0.0464 0.0592 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 8.11e-01 0.0208 0.0869 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 1.31e-01 0.159 0.105 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 1.03e-01 0.117 0.0715 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 6.37e-02 0.239 0.128 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 9.73e-02 0.11 0.0661 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 1.26e-01 -0.176 0.115 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 3.69e-01 0.0701 0.0778 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 8.78e-01 0.0123 0.0797 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 7.22e-01 0.033 0.0928 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 7.66e-02 0.149 0.0837 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 3.79e-02 0.263 0.126 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 3.08e-01 0.0803 0.0786 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 772882 sc-eQTL 5.35e-01 0.0763 0.123 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 9.30e-01 0.00887 0.101 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0698 0.105 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 539656 sc-eQTL 2.74e-01 -0.131 0.12 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 sc-eQTL 5.02e-01 0.0538 0.08 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 501137 sc-eQTL 4.09e-01 -0.112 0.135 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -783718 sc-eQTL 1.19e-01 -0.13 0.0833 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -543513 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00811 0.073 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 531224 sc-eQTL 8.76e-03 0.257 0.097 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -544532 sc-eQTL 5.51e-01 0.061 0.102 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 104252 eQTL 0.0154 0.0441 0.0182 0.0014 0.0 0.162
ENSG00000182747 SLC35D3 401400 eQTL 8.15e-05 -0.165 0.0417 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 401400 1.13e-06 6.78e-07 1.59e-07 4.34e-07 9.6e-08 3.11e-07 6.23e-07 2.25e-07 7.11e-07 3.1e-07 9.92e-07 5.22e-07 1.05e-06 1.57e-07 3.31e-07 3.68e-07 5.56e-07 4.25e-07 2.87e-07 2.76e-07 2.42e-07 5.34e-07 4.4e-07 3.01e-07 1.16e-06 2.53e-07 4.55e-07 3.24e-07 5.56e-07 7.6e-07 3.77e-07 4.1e-08 4.98e-08 2.15e-07 3.63e-07 1.94e-07 1.43e-07 1.27e-07 7.42e-08 8.29e-09 1.91e-07 6.81e-07 5.09e-08 1.06e-08 1.93e-07 2.64e-08 1.49e-07 3.79e-08 6.23e-08