logo

Genes within 1Mb (chr6:137293531:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 2.82e-02 0.201 0.091 0.199 B L1
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0337 0.109 0.199 B L1
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 5.47e-02 -0.138 0.0715 0.199 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0298 0.0581 0.199 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 5.13e-02 0.157 0.0803 0.199 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 2.97e-02 0.198 0.0904 0.199 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0136 0.062 0.199 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 3.33e-01 0.0968 0.0997 0.199 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00155 0.0671 0.199 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 4.64e-01 0.046 0.0628 0.199 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 3.19e-01 0.0477 0.0478 0.199 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 2.57e-02 0.176 0.0782 0.199 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 7.87e-01 -0.019 0.0703 0.199 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 6.21e-01 0.0581 0.117 0.199 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 6.00e-02 -0.144 0.0761 0.199 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 6.34e-01 0.0282 0.0592 0.199 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.80e-01 0.0442 0.0625 0.199 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 9.33e-01 0.00732 0.087 0.199 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 8.71e-01 0.0142 0.0878 0.189 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0778 0.124 0.189 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 6.29e-01 0.0454 0.0938 0.189 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 4.73e-02 -0.201 0.101 0.189 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 3.68e-01 0.0878 0.0972 0.189 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.65e-02 -0.228 0.0943 0.189 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 1.61e-01 -0.178 0.127 0.189 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 6.35e-03 0.189 0.0686 0.199 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.68e-02 0.223 0.117 0.199 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 2.62e-01 0.0664 0.0591 0.199 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 2.92e-01 -0.109 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 5.42e-01 0.0422 0.0691 0.199 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 2.47e-01 -0.085 0.0732 0.199 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0543 0.0837 0.199 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 5.32e-01 0.0501 0.08 0.2 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 6.67e-01 0.0532 0.124 0.2 NK L1
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00169 0.0779 0.2 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 5.48e-01 0.0401 0.0666 0.2 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.39e-01 0.0739 0.0954 0.2 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00388 0.0945 0.2 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 7.59e-01 0.0225 0.0732 0.199 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 7.50e-01 0.0381 0.119 0.199 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 3.73e-01 0.0853 0.0957 0.199 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 4.99e-01 0.0308 0.0456 0.199 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 2.59e-01 0.0992 0.0878 0.199 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0274 0.0905 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 3.69e-01 -0.11 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0582 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0484 0.0621 0.199 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 2.96e-01 -0.126 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0635 0.135 0.199 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.22e-01 0.163 0.105 0.199 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 1.07e-01 0.18 0.111 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 9.67e-01 0.00479 0.117 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 1.54e-01 -0.152 0.106 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 5.97e-01 0.0444 0.0838 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 3.52e-01 0.0943 0.101 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0297 0.119 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 1.30e-01 0.181 0.119 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 4.48e-02 0.242 0.12 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 2.02e-01 0.145 0.113 0.2 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 3.98e-01 0.0662 0.0782 0.2 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0233 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 2.00e-02 0.27 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 9.88e-02 0.154 0.0926 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0668 0.123 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 1.36e-01 -0.16 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 4.17e-01 0.0507 0.0623 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00283 0.0877 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 3.53e-02 0.205 0.0967 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 1.66e-01 0.156 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 1.69e-01 -0.17 0.123 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0301 0.0901 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 2.28e-01 0.108 0.0897 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 1.53e-01 0.137 0.0954 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.95e-01 0.151 0.116 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 4.92e-01 0.074 0.107 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0594 0.119 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 2.29e-01 -0.145 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0427 0.0705 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 5.94e-02 0.212 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 3.62e-01 -0.1 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 6.59e-01 -0.026 0.0588 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.34e-01 0.0692 0.111 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 3.40e-01 0.0875 0.0915 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 2.57e-01 0.0729 0.0641 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 9.90e-01 0.000614 0.0472 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 5.81e-03 0.228 0.0818 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 9.22e-01 0.00807 0.0824 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 7.97e-01 0.0312 0.121 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 2.93e-01 -0.107 0.102 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 3.72e-01 0.0531 0.0593 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 3.16e-01 0.0678 0.0675 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.38e-01 0.123 0.0828 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000775 0.0928 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0563 0.12 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 3.59e-01 0.0891 0.0969 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 7.09e-01 -0.023 0.0616 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 1.50e-01 0.137 0.0947 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 8.64e-01 0.0169 0.0988 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 6.95e-01 0.0334 0.0851 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 3.84e-01 0.102 0.117 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 1.36e-01 -0.168 0.112 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0447 0.0716 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.39e-01 0.0783 0.101 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 2.92e-01 -0.106 0.1 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0184 0.0842 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0812 0.122 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0919 0.0925 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 8.41e-01 0.0132 0.0658 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 2.76e-01 0.085 0.0778 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.17e-01 0.152 0.0968 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0973 0.115 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 7.68e-01 0.0392 0.133 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 1.91e-01 -0.17 0.129 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 8.54e-01 0.0116 0.0627 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0847 0.112 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 3.36e-01 0.11 0.114 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 3.60e-01 0.0957 0.104 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 3.02e-01 0.124 0.12 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 7.28e-01 0.0436 0.125 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 8.84e-01 0.0113 0.0771 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0344 0.119 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 2.54e-01 -0.13 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 5.03e-01 0.0569 0.0849 0.199 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 9.54e-01 0.00666 0.115 0.199 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 2.90e-01 0.127 0.12 0.199 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0428 0.0571 0.199 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 8.31e-01 0.0213 0.0996 0.199 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0649 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0867 0.0936 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.29e-01 0.0771 0.122 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 7.36e-02 0.195 0.109 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 3.96e-01 0.0593 0.0697 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 8.65e-01 0.0181 0.106 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 2.26e-01 -0.135 0.111 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 3.93e-01 0.0624 0.0729 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 3.01e-01 0.13 0.125 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0518 0.0883 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 8.53e-01 0.0128 0.0687 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 3.36e-01 0.0953 0.0987 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0235 0.103 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 9.36e-01 0.00756 0.0942 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.69e-01 0.0682 0.12 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 2.01e-01 0.124 0.0967 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 9.48e-01 0.00491 0.0747 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0713 0.119 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 8.59e-01 0.0213 0.12 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 7.09e-01 0.0284 0.076 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0571 0.119 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0134 0.0906 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 5.64e-01 0.0392 0.0678 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 9.35e-02 0.156 0.0927 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 9.46e-01 0.00695 0.102 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0901 0.141 0.215 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 1.27e-01 -0.22 0.143 0.215 PB L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 1.58e-01 -0.127 0.0895 0.215 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 7.29e-01 0.0381 0.109 0.215 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 6.24e-01 0.0611 0.124 0.215 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.42e-01 -0.193 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 5.74e-01 -0.053 0.0942 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0169 0.114 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 2.27e-01 0.11 0.0907 0.198 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 3.23e-01 0.0568 0.0573 0.198 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.32e-01 0.0875 0.111 0.198 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 5.90e-01 0.06 0.111 0.198 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 2.86e-01 0.119 0.111 0.199 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 2.52e-01 0.134 0.117 0.199 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 2.08e-01 0.16 0.127 0.199 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 7.88e-01 0.019 0.0707 0.199 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0597 0.0765 0.199 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0824 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 3.16e-01 0.0979 0.0975 0.188 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 1.52e-01 -0.181 0.126 0.188 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 9.33e-02 -0.161 0.0956 0.188 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 4.54e-03 -0.317 0.11 0.188 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 9.53e-01 0.00584 0.0992 0.188 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.61e-01 -0.176 0.125 0.188 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 1.51e-01 -0.185 0.128 0.188 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 1.02e-01 0.107 0.0654 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 2.40e-02 0.266 0.117 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 4.86e-01 0.0493 0.0707 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0061 0.102 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 7.71e-02 0.13 0.0731 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0655 0.0755 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0865 0.0945 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 1.68e-02 0.179 0.0744 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 2.36e-01 0.143 0.121 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 1.68e-01 0.0922 0.0667 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 3.45e-01 -0.107 0.113 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.69e-01 -0.066 0.091 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00384 0.0962 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0451 0.0939 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0841 0.12 0.17 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.27e-01 0.0964 0.152 0.17 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 4.30e-01 0.105 0.133 0.17 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 8.48e-01 0.0142 0.0739 0.17 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.78e-01 0.111 0.156 0.17 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 6.73e-01 0.0566 0.134 0.17 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 7.15e-02 0.15 0.0828 0.202 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 8.06e-01 0.0277 0.113 0.202 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 8.18e-02 0.125 0.0716 0.202 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0828 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0817 0.117 0.202 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 1.09e-01 -0.172 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00764 0.124 0.202 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 1.25e-01 0.147 0.0957 0.197 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 9.93e-01 0.000994 0.119 0.197 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 3.68e-01 0.0767 0.085 0.197 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 3.77e-01 0.0931 0.105 0.197 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0634 0.111 0.197 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 7.74e-01 0.0306 0.106 0.197 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 5.33e-01 -0.07 0.112 0.197 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00113 0.115 0.186 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0322 0.126 0.186 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 6.11e-02 0.199 0.105 0.186 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 3.22e-01 0.0875 0.0881 0.186 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 4.08e-02 0.288 0.14 0.186 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 5.47e-02 -0.207 0.107 0.186 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 8.97e-01 0.017 0.13 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 1.76e-01 0.133 0.0975 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 4.12e-01 0.0925 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 6.49e-01 0.0476 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 5.94e-01 0.0368 0.0691 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 5.71e-01 0.0519 0.0914 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 4.82e-01 0.0823 0.117 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 7.51e-02 0.175 0.0981 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0919 0.12 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 8.35e-02 -0.186 0.107 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 6.01e-01 0.0297 0.0566 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 5.05e-01 0.0553 0.0829 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 6.26e-02 0.187 0.0999 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 2.04e-02 0.155 0.0662 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 2.92e-02 0.261 0.119 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 2.90e-01 0.0656 0.0619 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 2.97e-01 -0.112 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 3.49e-01 0.068 0.0725 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0711 0.0742 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0353 0.0865 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 3.07e-02 0.168 0.0774 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 5.84e-01 0.0648 0.118 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 3.09e-01 0.0745 0.073 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 742712 sc-eQTL 6.96e-01 0.0447 0.114 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0935 0.0936 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0359 0.098 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 509486 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0863 0.111 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 sc-eQTL 3.85e-01 0.0653 0.0751 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 470967 sc-eQTL 7.54e-01 0.0398 0.127 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -813888 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0399 0.0786 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -573683 sc-eQTL 7.19e-01 0.0247 0.0685 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 501054 sc-eQTL 2.86e-01 0.0986 0.0923 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -574702 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0065 0.0959 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 74082 eQTL 0.0293 0.0358 0.0164 0.0 0.0 0.233
ENSG00000135525 MAP7 742712 eQTL 0.0245 0.0646 0.0287 0.0 0.0 0.233
ENSG00000182747 SLC35D3 371230 eQTL 3.75e-05 -0.155 0.0375 0.0 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 371230 1.29e-06 8.23e-07 2.62e-07 4.01e-07 1.78e-07 3.22e-07 7.25e-07 2.84e-07 8.66e-07 2.67e-07 1.09e-06 5.5e-07 1.22e-06 2.1e-07 4.15e-07 4.84e-07 7.47e-07 5.31e-07 3.64e-07 3.57e-07 2.89e-07 6.48e-07 5.67e-07 4.09e-07 1.46e-06 2.44e-07 5.43e-07 4.59e-07 7e-07 8.43e-07 4.39e-07 3.85e-08 1.31e-07 2.97e-07 3.22e-07 2.99e-07 2.83e-07 1.36e-07 1.14e-07 1.86e-08 1.98e-07 9.49e-07 7.37e-08 1.22e-08 1.93e-07 4.57e-08 1.9e-07 8.82e-08 5.84e-08