Genes within 1Mb (chr6:137292232:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 3.72e-01 0.1 0.112 0.105 B L1
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.08e-01 0.167 0.133 0.105 B L1
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0957 0.0878 0.105 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 4.99e-01 -0.048 0.0708 0.105 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 3.51e-01 0.0921 0.0986 0.105 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0634 0.111 0.105 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0383 0.0753 0.105 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 6.38e-02 0.224 0.12 0.105 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 2.88e-01 0.0866 0.0813 0.105 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0123 0.0764 0.105 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 8.50e-01 -0.011 0.0582 0.105 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 7.38e-01 0.0322 0.0961 0.105 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 5.51e-01 -0.051 0.0854 0.105 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.62e-01 0.0826 0.142 0.105 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 6.35e-01 0.0442 0.0932 0.105 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 4.89e-01 0.0498 0.0719 0.105 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0623 0.0759 0.105 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 3.86e-01 0.0916 0.105 0.105 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 3.16e-02 -0.231 0.107 0.099 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.43e-01 0.0925 0.152 0.099 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 1.45e-02 -0.28 0.113 0.099 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 7.85e-01 0.034 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 7.73e-01 0.0345 0.119 0.099 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 2.53e-01 0.134 0.117 0.099 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 6.71e-01 0.0664 0.156 0.099 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 9.22e-01 0.00843 0.0863 0.105 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.78e-01 0.158 0.145 0.105 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 5.89e-01 0.0395 0.0732 0.105 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0894 0.128 0.105 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 7.27e-01 0.0299 0.0854 0.105 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 1.49e-01 -0.131 0.0903 0.105 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 7.02e-01 0.0397 0.103 0.105 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 9.08e-01 0.0113 0.0975 0.105 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 3.74e-01 0.134 0.15 0.105 NK L1
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0291 0.0948 0.105 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 7.13e-01 0.0299 0.0811 0.105 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 1.69e-01 -0.16 0.116 0.105 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 5.76e-02 0.218 0.114 0.105 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0117 0.0903 0.105 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0878 0.147 0.105 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 4.17e-01 0.096 0.118 0.105 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 8.99e-01 0.00713 0.0562 0.105 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.77e-02 0.179 0.108 0.105 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0652 0.111 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 1.15e-02 -0.363 0.142 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 4.23e-01 -0.114 0.142 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0925 0.0733 0.11 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 2.53e-01 -0.163 0.142 0.11 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 1.32e-01 -0.24 0.159 0.11 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 8.38e-01 0.0255 0.125 0.11 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0623 0.136 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.80e-01 0.0788 0.142 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 1.85e-02 0.304 0.128 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 3.16e-01 -0.102 0.101 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 2.23e-02 0.279 0.121 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 5.61e-02 -0.275 0.143 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0371 0.149 0.106 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 6.17e-01 0.0752 0.15 0.106 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0687 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 1.40e-01 -0.143 0.0967 0.106 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 6.24e-01 0.0651 0.133 0.106 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 4.65e-01 0.106 0.145 0.106 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 5.17e-01 0.0737 0.114 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 1.08e-01 0.24 0.149 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 6.23e-02 0.244 0.13 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0694 0.076 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 3.45e-01 -0.101 0.107 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 9.10e-01 0.0134 0.119 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 3.99e-01 0.12 0.142 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0194 0.155 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00256 0.113 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 8.50e-01 0.0214 0.113 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00922 0.12 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 2.78e-01 -0.158 0.146 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.88e-01 0.0188 0.134 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 6.44e-01 0.0687 0.149 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 3.75e-01 -0.134 0.15 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 2.06e-02 -0.202 0.0867 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0813 0.14 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 9.48e-01 0.00901 0.137 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0602 0.0711 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.02e-01 0.171 0.134 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0509 0.111 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0492 0.0778 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 2.61e-01 0.0642 0.057 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 5.68e-01 0.0576 0.101 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0053 0.0983 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 1.45e-01 0.21 0.144 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 2.23e-01 0.149 0.122 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 4.72e-01 0.051 0.0708 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0693 0.0806 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 3.87e-01 0.0858 0.0991 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 4.53e-01 0.0842 0.112 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0405 0.145 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 5.77e-02 0.222 0.116 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0311 0.0745 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00622 0.115 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 4.59e-01 0.0885 0.119 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 7.98e-01 -0.026 0.101 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.51e-01 0.0832 0.139 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0923 0.134 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0909 0.085 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0668 0.12 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 5.15e-01 0.0781 0.12 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.22e-01 0.0228 0.101 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.97e-01 0.0773 0.146 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0197 0.111 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 8.31e-01 0.0169 0.079 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 2.66e-01 0.104 0.0933 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 6.18e-01 0.0582 0.117 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 3.59e-01 0.129 0.14 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.61e-01 0.0938 0.161 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 1.85e-01 0.209 0.157 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 8.05e-01 0.0188 0.076 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 2.19e-01 0.167 0.135 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 6.22e-01 0.0687 0.139 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 1.35e-01 -0.188 0.125 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.50e-01 0.166 0.144 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 6.10e-01 0.0769 0.15 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 6.96e-01 0.0363 0.0927 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 7.96e-01 0.0371 0.143 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 8.65e-01 0.0234 0.138 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0259 0.106 0.106 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0751 0.144 0.106 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 4.95e-01 0.103 0.15 0.106 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0469 0.0715 0.106 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 3.84e-01 0.109 0.124 0.106 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 3.55e-01 -0.122 0.132 0.106 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0258 0.118 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 1.33e-02 0.377 0.151 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 3.23e-01 0.136 0.137 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0307 0.0876 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.66e-01 0.00575 0.133 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 4.71e-01 0.101 0.14 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 4.30e-01 0.072 0.0909 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 4.01e-01 0.132 0.157 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 4.63e-01 -0.081 0.11 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 9.23e-01 0.00825 0.0858 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 2.59e-01 -0.139 0.123 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 8.50e-02 0.221 0.128 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00716 0.117 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.12e-01 0.185 0.148 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 2.06e-01 -0.152 0.12 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 9.69e-01 0.00363 0.0926 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0634 0.147 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 5.61e-01 0.0869 0.149 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00152 0.0953 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 1.03e-01 -0.243 0.149 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 5.85e-01 -0.062 0.113 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 9.28e-01 0.00768 0.0851 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00374 0.117 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 2.01e-01 0.164 0.128 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0406 0.17 0.115 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 1.79e-01 -0.234 0.173 0.115 PB L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 4.12e-01 0.0892 0.108 0.115 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0598 0.132 0.115 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 3.13e-01 0.151 0.149 0.115 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 4.61e-01 -0.117 0.158 0.115 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 5.56e-01 0.0668 0.113 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 7.22e-01 0.049 0.138 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0138 0.11 0.107 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0692 0.0689 0.107 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.38e-01 0.0104 0.134 0.107 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 4.53e-01 0.101 0.134 0.107 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00631 0.136 0.105 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 8.43e-01 0.0284 0.143 0.105 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 4.59e-03 0.436 0.152 0.105 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0574 0.0861 0.105 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0453 0.0934 0.105 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 2.10e-01 -0.165 0.131 0.105 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 2.36e-02 -0.274 0.12 0.1 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 3.37e-01 -0.152 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 4.29e-02 -0.242 0.119 0.1 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0546 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 6.80e-01 0.0511 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0256 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 8.34e-01 0.0339 0.161 0.1 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0251 0.0803 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 7.55e-02 0.256 0.143 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 6.91e-01 0.0344 0.0864 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0687 0.124 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 5.19e-01 0.058 0.0898 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 2.78e-01 -0.1 0.092 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00187 0.116 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0352 0.0928 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.20e-01 0.183 0.148 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 8.65e-01 -0.014 0.0825 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 9.08e-01 -0.016 0.139 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0457 0.112 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 1.72e-02 -0.281 0.117 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 9.25e-01 0.0109 0.116 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 6.48e-01 0.065 0.142 0.091 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 1.05e-01 -0.292 0.179 0.091 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 1.38e-01 0.233 0.156 0.091 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 2.68e-01 0.097 0.0872 0.091 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0163 0.185 0.091 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 8.46e-01 0.0308 0.159 0.091 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 1.97e-01 0.128 0.0985 0.104 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.74e-01 0.146 0.133 0.104 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0114 0.0854 0.104 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0381 0.131 0.104 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0852 0.139 0.104 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 7.82e-02 0.224 0.126 0.104 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 3.02e-01 0.152 0.146 0.104 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 5.86e-01 -0.065 0.119 0.106 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0945 0.147 0.106 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 3.00e-01 -0.109 0.105 0.106 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 7.00e-01 0.0502 0.13 0.106 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 1.43e-01 0.2 0.136 0.106 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 3.63e-01 -0.12 0.132 0.106 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 3.96e-01 -0.118 0.139 0.106 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0262 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 5.47e-01 -0.102 0.169 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 1.18e-01 -0.222 0.141 0.096 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 5.81e-01 0.0652 0.118 0.096 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 2.03e-02 0.435 0.186 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 6.55e-01 0.0646 0.144 0.096 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 7.94e-01 0.0457 0.174 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 2.36e-01 -0.143 0.12 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 6.55e-01 0.0622 0.139 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 5.95e-01 0.0688 0.129 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00206 0.0853 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 4.53e-02 0.225 0.112 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 1.85e-01 -0.191 0.144 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 2.40e-01 0.141 0.119 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 2.96e-01 0.152 0.145 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 2.95e-02 0.283 0.129 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0399 0.0685 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0625 0.1 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0828 0.122 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0193 0.0814 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 9.93e-02 0.24 0.145 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 3.12e-01 0.076 0.0751 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0894 0.13 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.53e-01 0.00524 0.0882 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 1.26e-01 -0.138 0.0897 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 6.29e-01 0.0508 0.105 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 3.97e-01 0.0815 0.096 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 9.29e-01 0.0129 0.145 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0467 0.0898 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 741413 sc-eQTL 8.11e-01 0.0335 0.14 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00921 0.115 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 2.96e-01 0.126 0.12 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 508187 sc-eQTL 5.25e-01 0.087 0.137 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 72783 sc-eQTL 8.22e-01 0.0209 0.0931 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 469668 sc-eQTL 9.83e-01 0.00326 0.157 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -815187 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0439 0.0974 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -574982 sc-eQTL 7.07e-01 0.0319 0.0848 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 499755 sc-eQTL 2.93e-01 -0.121 0.114 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -576001 sc-eQTL 8.72e-02 0.203 0.118 0.103 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 369931 eQTL 0.0197 -0.124 0.0529 0.0 0.0 0.101


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 \N 741413 3.27e-07 1.59e-07 5.03e-08 2.26e-07 9.82e-08 8.89e-08 1.9e-07 5.82e-08 1.54e-07 6.4e-08 1.63e-07 1.2e-07 2.13e-07 8e-08 6.6e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.16e-08 5.75e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.68e-07 1.21e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.14e-07 4.77e-08 3.74e-08 9.3e-08 5.24e-08 4.86e-08 6.14e-08 7.1e-08 6.49e-08 5.24e-08 4.94e-08 1.59e-07 3.35e-08 1.43e-08 2.64e-08 1.19e-08 1.2e-07 0.0 4.91e-08