logo

Genes within 1Mb (chr6:137359323:TATAG:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.09e-02 0.331 0.142 0.056 B L1
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0821 0.171 0.056 B L1
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0307 0.113 0.056 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 1.75e-01 -0.123 0.0906 0.056 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 5.18e-01 0.0819 0.127 0.056 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 4.06e-01 0.119 0.143 0.056 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 5.55e-01 0.0576 0.0975 0.056 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 1.37e-02 0.385 0.155 0.056 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.91e-02 0.246 0.104 0.056 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 7.57e-01 0.0306 0.0988 0.056 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.40e-01 0.0719 0.0752 0.056 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.89e-01 0.132 0.124 0.056 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 4.95e-01 0.0744 0.109 0.056 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 3.45e-01 0.172 0.181 0.056 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 6.08e-01 0.061 0.119 0.056 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00872 0.0916 0.056 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 6.32e-01 0.0464 0.0967 0.056 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 1.70e-01 0.184 0.134 0.056 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0796 0.135 0.052 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0504 0.19 0.052 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 2.48e-01 -0.166 0.144 0.052 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 8.73e-01 -0.025 0.156 0.052 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 4.33e-01 0.118 0.15 0.052 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0308 0.147 0.052 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 7.58e-01 0.0602 0.195 0.052 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 8.42e-02 0.19 0.11 0.056 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 4.65e-01 0.136 0.186 0.056 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0221 0.0937 0.056 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00204 0.164 0.056 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.52e-01 0.102 0.109 0.056 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.95e-01 -0.122 0.116 0.056 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 3.14e-01 -0.134 0.132 0.056 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 3.26e-01 0.121 0.123 0.056 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.17e-01 0.124 0.191 0.056 NK L1
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 9.02e-02 0.203 0.119 0.056 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0874 0.103 0.056 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 1.61e-01 -0.206 0.147 0.056 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.81e-01 -0.157 0.145 0.056 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.29e-01 0.177 0.116 0.056 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 1.57e-01 -0.27 0.19 0.056 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0338 0.153 0.056 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0527 0.0728 0.056 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 8.99e-01 0.0179 0.141 0.056 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 4.80e-01 0.102 0.144 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0936 0.184 0.059 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 3.66e-01 0.163 0.18 0.059 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 6.36e-01 0.0444 0.0935 0.059 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 3.87e-01 0.157 0.181 0.059 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 5.98e-01 0.107 0.203 0.059 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 4.81e-01 -0.112 0.158 0.059 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 4.56e-01 0.127 0.17 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 7.36e-01 -0.06 0.178 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0408 0.162 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 3.88e-01 -0.11 0.127 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 9.18e-01 0.0159 0.154 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 8.47e-01 0.0348 0.18 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 3.35e-02 0.389 0.182 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 2.07e-01 0.234 0.185 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 9.66e-03 0.448 0.172 0.056 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0562 0.12 0.056 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 2.09e-01 -0.206 0.163 0.056 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 1.01e-02 0.456 0.176 0.056 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 7.98e-02 0.257 0.146 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.35e-01 -0.121 0.194 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 5.67e-02 0.323 0.168 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0538 0.0985 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 4.50e-01 -0.105 0.138 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 3.45e-01 0.146 0.154 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 7.47e-02 0.329 0.184 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 3.83e-01 -0.177 0.202 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 2.31e-01 0.176 0.147 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0373 0.147 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 7.32e-01 0.0537 0.157 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 5.63e-01 0.11 0.19 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.73e-01 -0.187 0.171 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.19e-01 0.122 0.189 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0464 0.192 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0653 0.112 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 6.03e-01 0.0932 0.179 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 3.91e-01 0.15 0.174 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0148 0.092 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 3.38e-02 0.367 0.172 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 7.73e-03 0.379 0.141 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 9.05e-01 0.012 0.101 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 4.22e-01 0.0593 0.0737 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.40e-01 0.153 0.13 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.34e-01 0.152 0.127 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 2.52e-01 0.215 0.187 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.71e-01 0.217 0.158 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 4.22e-01 0.074 0.092 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.73e-01 0.0936 0.105 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 5.47e-02 0.247 0.128 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.28e-01 0.216 0.142 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0151 0.184 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.86e-01 0.197 0.149 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 6.70e-01 0.0403 0.0947 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0488 0.146 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 1.60e-01 0.213 0.151 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 8.68e-01 0.0224 0.134 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 1.42e-01 0.271 0.184 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 5.44e-01 0.108 0.178 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 9.15e-01 0.0121 0.113 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 2.70e-01 0.176 0.159 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 9.32e-01 0.0136 0.159 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 9.80e-01 0.00328 0.131 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 9.41e-02 -0.316 0.188 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.43e-01 -0.21 0.143 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 6.59e-01 0.0451 0.102 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 8.25e-01 0.0269 0.121 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 3.19e-02 0.323 0.149 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 7.67e-01 0.0511 0.172 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 6.53e-02 0.363 0.196 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 4.34e-01 0.151 0.193 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0669 0.0933 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 5.38e-01 -0.103 0.167 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 1.63e-01 0.238 0.17 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.79e-02 0.39 0.163 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 3.20e-01 0.19 0.19 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 4.00e-01 0.167 0.198 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 8.91e-01 0.0168 0.122 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 8.25e-01 0.0418 0.189 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 1.05e-01 -0.293 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.83e-01 0.177 0.132 0.056 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 2.86e-02 -0.392 0.178 0.056 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 6.47e-01 0.0861 0.188 0.056 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 2.34e-01 -0.106 0.0891 0.056 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 9.91e-01 0.00169 0.156 0.056 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.59e-01 0.186 0.165 0.056 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 5.55e-01 0.0859 0.145 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 6.46e-01 0.087 0.189 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 4.00e-01 0.143 0.169 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 9.72e-01 0.00384 0.108 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0854 0.165 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0819 0.172 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.05e-01 0.185 0.113 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 3.13e-01 0.198 0.196 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.98e-01 0.178 0.138 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0854 0.107 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 1.64e-01 -0.215 0.154 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.50e-01 -0.185 0.16 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.01e-01 0.153 0.119 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0469 0.188 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 6.50e-01 0.0648 0.142 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 9.54e-02 -0.178 0.106 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0636 0.147 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 8.07e-01 0.0395 0.161 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0961 0.228 0.067 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 8.72e-01 0.0378 0.235 0.067 PB L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 5.56e-01 0.0864 0.146 0.067 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 1.93e-01 0.231 0.176 0.067 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.44e-01 0.191 0.202 0.067 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00294 0.213 0.067 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 3.71e-01 0.136 0.152 0.057 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.42e-01 -0.112 0.184 0.057 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0586 0.147 0.057 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0486 0.0925 0.057 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 7.77e-01 0.0508 0.179 0.057 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 3.11e-01 0.182 0.179 0.057 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.89e-01 0.231 0.175 0.056 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.90e-01 0.1 0.186 0.056 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.86e-01 0.265 0.2 0.056 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0973 0.112 0.056 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0173 0.121 0.056 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 1.85e-02 -0.399 0.168 0.056 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0346 0.15 0.051 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.21e-01 0.124 0.194 0.051 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 6.16e-02 -0.275 0.146 0.051 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0959 0.172 0.051 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.53e-01 0.141 0.152 0.051 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 6.10e-01 0.0983 0.192 0.051 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0794 0.198 0.051 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.25e-01 0.156 0.101 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 9.43e-02 0.305 0.182 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 3.43e-01 -0.104 0.109 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 3.10e-01 0.16 0.157 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 2.11e-02 0.261 0.112 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 3.09e-01 -0.119 0.117 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 4.85e-01 -0.102 0.146 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.13e-01 0.188 0.118 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 7.06e-01 0.0718 0.19 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 2.79e-01 -0.114 0.105 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 3.80e-01 0.156 0.177 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.17e-01 -0.143 0.143 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 3.23e-01 -0.15 0.151 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 2.20e-01 -0.181 0.147 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.35e-01 0.15 0.126 0.058 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 9.81e-01 0.00401 0.17 0.058 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0172 0.109 0.058 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 3.70e-01 -0.15 0.167 0.058 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 7.57e-01 0.0548 0.177 0.058 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 8.94e-01 0.0217 0.162 0.058 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 2.28e-01 0.226 0.187 0.058 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.66e-01 0.168 0.151 0.057 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.47e-01 -0.113 0.187 0.057 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0514 0.134 0.057 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 4.95e-01 0.113 0.165 0.057 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0878 0.174 0.057 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 9.27e-01 0.0153 0.167 0.057 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0764 0.176 0.057 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 3.03e-01 -0.174 0.169 0.059 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 2.08e-01 -0.234 0.185 0.059 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 4.16e-01 -0.128 0.156 0.059 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 4.51e-01 0.098 0.13 0.059 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.17e-02 0.444 0.205 0.059 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 6.71e-02 -0.29 0.157 0.059 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 1.90e-02 0.447 0.188 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 1.37e-01 0.221 0.148 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 6.35e-01 0.0813 0.171 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.98e-02 0.369 0.157 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0333 0.105 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 9.03e-01 0.0169 0.139 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.16e-01 0.22 0.177 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 6.80e-02 0.284 0.155 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 2.10e-01 -0.237 0.189 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 5.00e-02 0.331 0.168 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0573 0.0891 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 9.32e-01 0.0111 0.131 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 5.32e-01 0.0993 0.159 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 5.94e-02 0.195 0.103 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 3.25e-01 0.183 0.186 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 6.84e-01 -0.039 0.0958 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 6.38e-01 0.0783 0.166 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 3.39e-01 -0.11 0.115 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 2.29e-01 -0.161 0.133 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.66e-01 0.137 0.123 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 4.54e-01 -0.139 0.186 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 3.11e-01 -0.117 0.115 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 808504 sc-eQTL 6.21e-01 -0.089 0.18 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0974 0.147 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 7.49e-01 0.0494 0.154 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 575278 sc-eQTL 5.19e-01 0.113 0.175 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 sc-eQTL 2.69e-01 0.129 0.116 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 536759 sc-eQTL 5.13e-01 0.129 0.196 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -748096 sc-eQTL 1.11e-01 0.194 0.121 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -507891 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0956 0.106 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 566846 sc-eQTL 2.05e-01 -0.182 0.143 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -508910 sc-eQTL 2.23e-01 -0.181 0.148 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 139874 pQTL 0.00082 0.119 0.0355 0.00344 0.00166 0.0513

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina