logo

Genes within 1Mb (chr6:137727290:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 1.05e-01 -0.202 0.124 0.083 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 5.80e-01 0.0543 0.0979 0.083 B L1
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 5.89e-01 0.08 0.148 0.083 B L1
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 2.59e-01 0.11 0.0975 0.083 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 9.37e-01 0.00628 0.0788 0.083 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.49e-01 0.0501 0.11 0.083 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0102 0.124 0.083 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0744 0.0838 0.083 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 9.96e-01 0.000505 0.0962 0.083 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 8.02e-01 0.034 0.135 0.083 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 3.22e-01 0.0898 0.0905 0.083 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 6.14e-02 0.159 0.0843 0.083 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0427 0.0647 0.083 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 5.52e-01 0.0637 0.107 0.083 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0928 0.0959 0.083 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 4.20e-01 0.083 0.103 0.083 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0749 0.16 0.083 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 9.54e-01 0.00608 0.105 0.083 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 9.26e-02 0.136 0.0803 0.083 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0624 0.0853 0.083 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 1.65e-01 0.165 0.118 0.083 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.55e-01 0.0521 0.116 0.086 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 8.34e-02 -0.19 0.109 0.086 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 7.20e-01 0.0588 0.164 0.086 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 3.72e-01 -0.111 0.124 0.086 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00357 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0414 0.129 0.086 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 3.47e-01 -0.141 0.15 0.086 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.64e-01 0.142 0.126 0.086 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 8.86e-01 0.0241 0.168 0.086 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0703 0.0967 0.083 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0605 0.0785 0.083 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 9.97e-03 0.417 0.16 0.083 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 5.71e-01 0.0466 0.0821 0.083 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 6.94e-01 0.0585 0.148 0.083 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 2.82e-01 0.103 0.0956 0.083 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 1.88e-01 -0.203 0.154 0.083 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0474 0.102 0.083 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 4.54e-01 0.087 0.116 0.083 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 8.61e-01 -0.019 0.108 0.084 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 7.63e-01 0.0374 0.124 0.084 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 5.31e-01 -0.105 0.166 0.084 NK L1
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 5.67e-02 0.199 0.104 0.084 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 4.75e-01 0.0643 0.0897 0.084 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 3.62e-01 -0.117 0.128 0.084 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 5.52e-01 0.0759 0.127 0.084 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 1.64e-01 -0.141 0.101 0.083 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 7.64e-01 0.0322 0.107 0.083 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 3.75e-01 -0.146 0.165 0.083 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 6.71e-01 0.0562 0.132 0.083 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 3.78e-02 0.13 0.0623 0.083 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0681 0.121 0.083 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 1.64e-01 0.174 0.124 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0624 0.158 0.092 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 4.79e-02 0.305 0.153 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 6.24e-02 0.288 0.154 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 6.74e-01 0.0338 0.0803 0.092 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0575 0.156 0.092 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.00e-01 0.0915 0.174 0.092 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 3.85e-01 0.118 0.136 0.092 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 1.34e-01 -0.219 0.146 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 2.61e-01 0.123 0.109 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.57e-02 0.305 0.152 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0591 0.14 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 6.92e-01 0.0434 0.11 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 2.65e-01 -0.147 0.132 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.94e-01 0.163 0.155 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 2.88e-01 -0.168 0.158 0.084 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 8.98e-02 0.204 0.12 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 3.63e-01 -0.146 0.16 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 2.06e-02 0.347 0.149 0.084 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 6.74e-01 0.0436 0.104 0.084 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0692 0.141 0.084 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 4.30e-01 0.122 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 4.20e-01 -0.101 0.125 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 7.89e-01 0.0286 0.107 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 8.25e-01 0.0368 0.166 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 9.10e-02 0.244 0.144 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0755 0.0839 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 5.27e-01 0.0748 0.118 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0448 0.132 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0564 0.154 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0677 0.102 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.63e-01 0.124 0.168 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 7.85e-03 0.324 0.121 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0142 0.123 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 1.01e-01 -0.214 0.13 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 4.11e-01 -0.13 0.158 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.76e-01 0.0611 0.146 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 1.01e-01 0.22 0.134 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.55e-01 -0.121 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 5.52e-02 0.313 0.162 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 2.22e-02 0.218 0.0944 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 7.09e-01 -0.057 0.153 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.74e-01 0.163 0.148 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 1.22e-01 -0.122 0.0789 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 9.94e-01 0.000712 0.0936 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00126 0.15 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 8.71e-01 -0.02 0.124 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 3.73e-02 0.18 0.0858 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0331 0.0637 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.09e-01 0.141 0.112 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0929 0.111 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0507 0.109 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0603 0.163 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 2.84e-01 0.147 0.137 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 6.64e-02 0.146 0.0792 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0313 0.0909 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.36e-01 0.132 0.111 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00478 0.125 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 5.52e-01 0.0668 0.112 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 3.65e-01 -0.146 0.161 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0881 0.13 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 9.22e-03 0.214 0.0815 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0995 0.128 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 1.74e-01 -0.18 0.132 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0335 0.115 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 3.62e-01 0.111 0.122 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 6.46e-01 0.0728 0.158 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 3.31e-01 0.148 0.152 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 4.38e-01 0.0751 0.0966 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0101 0.137 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 5.62e-01 0.079 0.136 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 2.06e-02 -0.263 0.113 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 8.96e-01 0.0137 0.105 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.97e-01 -0.112 0.165 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 9.70e-02 -0.208 0.125 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 1.04e-02 0.227 0.0878 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 2.29e-01 -0.127 0.105 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 8.91e-02 0.224 0.131 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 4.49e-01 0.117 0.154 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 5.37e-01 0.0812 0.131 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.78e-01 0.126 0.177 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 8.60e-01 0.0307 0.174 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 4.09e-02 0.17 0.0827 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 2.70e-01 -0.165 0.149 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 5.34e-01 0.0952 0.153 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 8.64e-01 0.025 0.146 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 3.35e-01 0.147 0.153 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0535 0.168 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0743 0.174 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 5.71e-01 0.0609 0.107 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.74e-01 0.07 0.166 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00389 0.159 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0972 0.117 0.08 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 5.14e-01 0.0818 0.125 0.08 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00188 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 1.08e-01 0.266 0.165 0.08 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 3.67e-02 0.164 0.078 0.08 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 4.53e-01 -0.103 0.137 0.08 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.62e-01 0.163 0.145 0.08 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0805 0.129 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 1.43e-01 -0.206 0.14 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 2.54e-01 0.192 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0789 0.15 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 9.93e-01 0.00087 0.096 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0353 0.146 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.19e-02 0.349 0.151 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.22e-01 -0.049 0.0994 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 5.47e-01 0.081 0.134 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 5.27e-01 -0.108 0.171 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 1.03e-01 0.196 0.12 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 4.91e-01 0.0646 0.0936 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0562 0.135 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 8.50e-01 0.0266 0.14 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0799 0.127 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 6.71e-01 0.0627 0.147 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0944 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 4.58e-02 0.261 0.13 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0133 0.101 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0242 0.16 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 7.24e-02 -0.291 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0226 0.104 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 9.87e-01 0.00225 0.133 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.04e-01 -0.137 0.164 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0099 0.124 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 5.65e-01 0.0537 0.0932 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 3.67e-01 -0.115 0.128 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0137 0.141 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 3.06e-01 -0.215 0.209 0.085 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 3.36e-01 -0.17 0.176 0.085 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 2.39e-01 0.254 0.214 0.085 PB L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 6.11e-01 0.0686 0.134 0.085 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00218 0.163 0.085 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 8.51e-02 0.319 0.183 0.085 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 1.04e-01 0.318 0.194 0.085 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0367 0.133 0.08 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 3.92e-01 0.119 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 7.50e-02 -0.287 0.161 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 5.17e-01 0.0834 0.129 0.08 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 1.64e-01 0.113 0.0807 0.08 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.31e-01 0.0756 0.157 0.08 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 3.11e-01 0.159 0.157 0.08 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.25e-01 0.0733 0.15 0.083 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0745 0.109 0.083 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 3.80e-03 0.454 0.155 0.083 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 3.08e-01 0.175 0.171 0.083 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 8.41e-02 0.164 0.0946 0.083 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 7.86e-01 0.028 0.103 0.083 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 1.54e-02 -0.35 0.143 0.083 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0552 0.13 0.08 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 4.82e-02 -0.225 0.113 0.08 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 1.47e-01 0.243 0.167 0.08 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0982 0.128 0.08 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0268 0.148 0.08 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0649 0.132 0.08 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0905 0.163 0.08 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 4.98e-01 -0.113 0.166 0.08 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 9.09e-01 0.0195 0.171 0.08 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0539 0.0892 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 3.63e-01 -0.08 0.0878 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 2.24e-02 0.365 0.159 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 4.07e-01 0.0797 0.096 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0532 0.147 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 1.82e-01 0.133 0.0995 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 1.64e-01 -0.215 0.154 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 7.16e-01 0.0374 0.103 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 6.64e-01 0.0559 0.128 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 1.00e-01 -0.17 0.103 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0922 0.0962 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 8.51e-02 0.285 0.165 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 1.85e-01 0.122 0.0916 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 6.87e-01 0.0608 0.151 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 5.37e-01 0.0773 0.125 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 5.16e-01 -0.108 0.165 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0597 0.132 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 7.74e-01 0.0371 0.129 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 2.03e-01 -0.201 0.157 0.076 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 4.63e-01 -0.138 0.187 0.076 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 1.28e-01 0.303 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 5.12e-01 -0.115 0.174 0.076 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 1.79e-01 0.13 0.0963 0.076 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 3.52e-01 -0.191 0.204 0.076 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 5.78e-01 0.0979 0.175 0.076 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0993 0.11 0.084 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0496 0.11 0.084 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 5.03e-01 -0.1 0.149 0.084 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 3.68e-01 0.0862 0.0954 0.084 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 9.33e-02 0.249 0.148 0.084 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 2.30e-01 0.187 0.155 0.084 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 5.05e-01 0.111 0.167 0.084 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.47e-01 -0.165 0.142 0.084 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 7.14e-01 0.0603 0.164 0.084 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0521 0.133 0.081 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 1.30e-01 0.141 0.0927 0.081 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 3.35e-01 0.159 0.164 0.081 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 8.93e-01 0.0159 0.118 0.081 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0054 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0841 0.153 0.081 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0547 0.167 0.081 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 4.65e-01 -0.108 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 2.06e-01 0.196 0.155 0.081 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 4.16e-02 0.293 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0693 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 9.20e-01 0.0159 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0665 0.134 0.088 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0839 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0348 0.178 0.088 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0975 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 1.73e-01 0.185 0.135 0.088 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 3.56e-01 -0.151 0.163 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 1.22e-01 -0.201 0.129 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 4.82e-02 0.208 0.104 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.38e-01 0.116 0.149 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 7.61e-02 0.246 0.138 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 7.92e-01 0.0242 0.0917 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0992 0.121 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 2.66e-01 0.173 0.155 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0546 0.133 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00992 0.0984 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 8.72e-01 0.0261 0.161 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 1.08e-02 0.366 0.142 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0341 0.0759 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 9.22e-01 0.0109 0.111 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0315 0.135 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0854 0.0901 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0939 0.0842 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 4.62e-03 0.455 0.159 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 3.59e-01 0.0766 0.0833 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0216 0.149 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 1.55e-01 0.139 0.0974 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 1.08e-01 -0.256 0.159 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 8.55e-01 0.0184 0.1 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 7.17e-01 0.0422 0.116 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 3.49e-01 -0.1 0.107 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 9.35e-01 0.00662 0.0815 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 8.74e-01 0.0255 0.161 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 2.79e-01 0.108 0.0995 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -965281 sc-eQTL 1.31e-01 0.218 0.144 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 8.15e-01 0.0299 0.128 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -965258 sc-eQTL 6.79e-01 0.0664 0.16 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0872 0.134 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 943245 sc-eQTL 9.98e-02 0.249 0.151 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 507841 sc-eQTL 9.77e-01 0.00289 0.102 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -676241 sc-eQTL 5.04e-01 0.0845 0.126 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 904726 sc-eQTL 5.25e-01 -0.109 0.172 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -380129 sc-eQTL 5.61e-02 0.203 0.106 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 sc-eQTL 5.52e-01 0.0552 0.0928 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 934813 sc-eQTL 3.78e-01 -0.111 0.125 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -140943 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00871 0.13 0.084 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118503 TNFAIP3 -139924 eQTL 0.043 0.0431 0.0212 0.0 0.0 0.101
ENSG00000182747 SLC35D3 804989 eQTL 0.0122 0.128 0.0508 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000182747 SLC35D3 804989 2.64e-07 1.16e-07 3.62e-08 1.82e-07 9.02e-08 9.87e-08 1.42e-07 5.33e-08 1.4e-07 4.4e-08 1.56e-07 7.78e-08 1.33e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.26e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.32e-07 4.13e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.73e-08 4.1e-08 3.09e-08 8.82e-08 8.93e-08 3.99e-08 4.75e-08 9.55e-08 7.58e-08 3.01e-08 4.57e-08 1.33e-07 3.91e-08 1.2e-08 7.79e-08 1.7e-08 1.22e-07 4.14e-09 4.79e-08
ENSG00000197442 \N 934813 2.61e-07 1.1e-07 3.31e-08 1.79e-07 9.65e-08 9.3e-08 1.41e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.6e-07 8.03e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.44e-08 7.89e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.2e-08 3.88e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.3e-07 4.53e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.1e-07 8.7e-08 9.88e-08 1.09e-07 9.58e-08 3.84e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.24e-08 3.93e-08 4.78e-08 9.44e-08 8.3e-08 3.07e-08 4.27e-08 1.37e-07 3.93e-08 2.03e-08 8.16e-08 1.74e-08 1.26e-07 4.33e-09 4.91e-08
ENSG00000220412 \N 20089 2.2e-05 1.55e-05 3.01e-06 9.48e-06 2.98e-06 8.4e-06 2.18e-05 2.14e-06 1.5e-05 7.65e-06 1.92e-05 7.21e-06 2.82e-05 6.04e-06 4.83e-06 9.23e-06 8.09e-06 1.39e-05 4.31e-06 3.83e-06 8.04e-06 1.67e-05 1.67e-05 5.03e-06 2.59e-05 5.11e-06 7.6e-06 6.41e-06 1.7e-05 1.6e-05 1.04e-05 9.73e-07 1.44e-06 4.13e-06 6.33e-06 3.28e-06 1.71e-06 2.37e-06 2.61e-06 1.89e-06 1.16e-06 2.19e-05 2.48e-06 2.03e-07 1.6e-06 2.34e-06 2.6e-06 6.59e-07 6.16e-07