logo

Genes within 1Mb (chr6:137681500:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 3.52e-01 -0.108 0.116 0.098 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0753 0.0909 0.098 B L1
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 6.36e-01 0.0652 0.137 0.098 B L1
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00493 0.0909 0.098 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.11e-01 0.0915 0.073 0.098 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0215 0.102 0.098 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 1.72e-02 -0.273 0.114 0.098 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 2.81e-01 0.0837 0.0773 0.098 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.83e-01 -0.118 0.0886 0.098 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0881 0.125 0.098 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 1.94e-01 -0.109 0.0835 0.098 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 3.67e-01 0.0709 0.0784 0.098 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0348 0.0598 0.098 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 9.31e-02 -0.166 0.0983 0.098 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 7.55e-01 0.028 0.0896 0.098 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 2.58e-01 -0.109 0.0956 0.098 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 8.43e-01 0.0296 0.149 0.098 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 6.28e-01 0.0474 0.0976 0.098 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.09e-01 0.0947 0.0751 0.098 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0195 0.0797 0.098 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 1.90e-01 -0.145 0.11 0.098 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 3.21e-01 0.105 0.106 0.101 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 4.00e-02 -0.206 0.0995 0.101 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.89e-01 -0.196 0.149 0.101 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0387 0.113 0.101 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 3.32e-01 -0.114 0.117 0.101 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 8.47e-01 0.0223 0.116 0.101 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0279 0.154 0.101 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 6.27e-01 0.0431 0.0887 0.098 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.15e-01 -0.113 0.0716 0.098 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 7.39e-02 0.266 0.148 0.098 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.57e-01 0.107 0.0749 0.098 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0278 0.0878 0.098 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 8.89e-01 0.013 0.0933 0.098 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0157 0.106 0.098 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 1.97e-01 0.128 0.0986 0.099 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 3.53e-01 -0.105 0.113 0.099 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.97e-01 -0.197 0.152 0.099 NK L1
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 8.12e-01 -0.023 0.0962 0.099 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.39e-02 0.185 0.0814 0.099 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 5.57e-01 0.0694 0.118 0.099 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0148 0.117 0.099 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 2.98e-01 0.0955 0.0916 0.098 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 7.51e-02 -0.173 0.0966 0.098 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 3.24e-01 -0.148 0.149 0.098 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 5.34e-01 0.0747 0.12 0.098 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 3.37e-02 0.121 0.0565 0.098 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 1.20e-01 -0.171 0.11 0.098 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.60e-01 0.0662 0.113 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0617 0.156 0.102 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.14e-02 0.385 0.151 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 7.39e-02 -0.274 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0523 0.0796 0.102 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 9.25e-01 0.0145 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0408 0.173 0.102 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0827 0.135 0.102 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 1.26e-01 -0.207 0.135 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00737 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 6.19e-01 0.0706 0.142 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0122 0.129 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 6.50e-01 0.0462 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0283 0.123 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 8.63e-01 -0.025 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 7.92e-01 0.0388 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 8.58e-01 0.0201 0.112 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 2.37e-01 -0.175 0.148 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 4.66e-01 0.102 0.139 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 7.81e-02 0.169 0.0953 0.099 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 3.91e-01 -0.113 0.131 0.099 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 2.27e-01 0.173 0.142 0.099 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 3.66e-01 -0.105 0.115 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0891 0.0983 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 8.19e-01 0.0349 0.153 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0818 0.133 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 5.09e-01 0.0512 0.0774 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0347 0.109 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 2.72e-01 -0.133 0.121 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 9.36e-01 0.0115 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 9.34e-01 0.00784 0.0944 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 8.46e-01 0.0302 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0141 0.113 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 5.07e-01 0.0752 0.113 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.27e-01 0.0264 0.121 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 2.78e-02 -0.321 0.145 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 8.12e-01 0.0321 0.135 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 2.46e-01 -0.144 0.124 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 5.91e-02 -0.282 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 4.25e-01 -0.121 0.151 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 5.46e-03 0.244 0.0868 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 6.51e-01 0.064 0.141 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0483 0.138 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 5.02e-01 0.0498 0.074 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 8.04e-02 -0.152 0.0868 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 9.49e-01 0.00894 0.14 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 1.01e-01 -0.189 0.115 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 4.07e-01 0.0672 0.0809 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0616 0.0593 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 2.03e-01 -0.133 0.105 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 8.42e-02 0.176 0.101 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0847 0.101 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.43e-01 -0.219 0.149 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0289 0.127 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.97e-01 0.0768 0.0734 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 4.51e-01 0.0632 0.0837 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 1.13e-02 -0.26 0.102 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 7.02e-01 0.0442 0.115 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.71e-01 -0.142 0.103 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0041 0.149 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0692 0.121 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.47e-02 0.186 0.0756 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 1.71e-01 0.162 0.118 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 4.45e-02 -0.246 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 1.02e-01 0.171 0.104 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 8.07e-01 0.0271 0.111 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.77e-01 0.194 0.143 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 1.22e-01 0.213 0.137 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.74e-02 0.193 0.0869 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 9.70e-01 0.0047 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 2.37e-01 0.146 0.123 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 8.82e-02 -0.179 0.104 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0895 0.0962 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 7.80e-02 -0.268 0.151 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 2.15e-01 -0.143 0.115 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.11e-01 0.131 0.0818 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0783 0.0973 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0856 0.121 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.136 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.90e-01 0.152 0.115 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 9.36e-01 0.0126 0.156 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 8.19e-01 -0.035 0.153 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 5.55e-02 0.141 0.0731 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 6.87e-01 0.0532 0.132 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 2.89e-02 -0.294 0.133 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0801 0.135 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 2.34e-01 -0.169 0.141 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 4.08e-01 0.129 0.155 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 2.57e-01 0.184 0.161 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.35e-01 0.149 0.0992 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 6.65e-01 -0.067 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0843 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 4.50e-01 0.0793 0.105 0.1 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 3.15e-01 -0.113 0.112 0.1 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0355 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 2.69e-01 0.164 0.148 0.1 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.66e-03 0.22 0.0689 0.1 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.122 0.1 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 3.91e-01 0.112 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 6.95e-02 0.21 0.115 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0592 0.127 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0173 0.151 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 5.37e-01 -0.084 0.136 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 7.70e-01 0.0254 0.0865 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 1.84e-01 0.175 0.131 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 4.72e-02 0.273 0.137 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 5.86e-02 0.174 0.0914 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 3.26e-01 -0.156 0.158 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0313 0.112 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 5.21e-02 0.168 0.086 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 3.94e-01 -0.107 0.125 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 9.04e-01 0.0156 0.13 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 9.14e-02 0.197 0.116 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0785 0.135 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 4.64e-01 -0.109 0.148 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0445 0.12 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 9.75e-02 0.153 0.0919 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 6.86e-01 0.0595 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0993 0.149 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 3.98e-02 0.195 0.0944 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0079 0.122 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.93e-01 -0.195 0.149 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 4.93e-01 0.0779 0.113 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.37e-03 0.269 0.0831 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 5.73e-01 0.0661 0.117 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 9.01e-01 0.0159 0.128 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 9.10e-01 0.0206 0.182 0.111 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0558 0.153 0.111 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0888 0.187 0.111 PB L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0745 0.116 0.111 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 4.41e-01 -0.109 0.141 0.111 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.71e-01 0.0261 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0292 0.17 0.111 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 5.41e-01 -0.074 0.121 0.093 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 9.47e-02 -0.211 0.126 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 3.88e-01 0.127 0.147 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0839 0.117 0.093 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0332 0.0737 0.093 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 6.02e-01 0.0745 0.143 0.093 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 9.02e-02 -0.242 0.142 0.093 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 5.52e-01 0.0815 0.137 0.098 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.13e-01 -0.157 0.0988 0.098 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 3.33e-01 0.14 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 2.55e-01 -0.178 0.156 0.098 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.52e-02 0.21 0.0859 0.098 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0296 0.0943 0.098 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 9.85e-01 0.00242 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 6.65e-01 0.0526 0.121 0.1 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 2.87e-01 -0.114 0.107 0.1 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 5.07e-01 -0.104 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0426 0.12 0.1 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0709 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0949 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 7.44e-01 0.0524 0.16 0.1 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 5.29e-01 0.0522 0.0828 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 2.10e-01 -0.102 0.0813 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 6.46e-01 0.0684 0.149 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.69e-01 0.0987 0.0889 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0915 0.0925 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.16e-01 0.0619 0.0951 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 5.86e-01 -0.065 0.119 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0349 0.0959 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0398 0.0893 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.74e-02 0.364 0.152 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 8.86e-01 0.0122 0.0852 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.59e-01 0.0206 0.116 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0462 0.122 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 6.06e-01 0.0617 0.119 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 3.80e-01 0.12 0.136 0.1 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 8.23e-02 -0.281 0.161 0.1 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 2.10e-01 -0.216 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00549 0.151 0.1 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.71e-01 0.115 0.0833 0.1 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0547 0.177 0.1 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 9.22e-01 0.0149 0.152 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 3.18e-02 -0.217 0.1 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.52e-02 -0.244 0.0998 0.1 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 2.51e-01 -0.157 0.137 0.1 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.01e-01 0.144 0.0872 0.1 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 3.24e-02 0.304 0.141 0.1 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.75e-01 0.0734 0.131 0.1 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 7.24e-01 0.0533 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 1.49e-01 0.174 0.12 0.1 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0879 0.0845 0.1 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.43e-01 0.219 0.149 0.1 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0286 0.107 0.1 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0205 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 2.76e-01 -0.146 0.133 0.1 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 2.11e-01 -0.176 0.14 0.1 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 1.79e-01 0.178 0.132 0.107 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0812 0.121 0.107 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0862 0.146 0.107 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 5.01e-01 0.0828 0.123 0.107 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 5.47e-01 0.0985 0.163 0.107 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 3.14e-01 0.126 0.124 0.107 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 1.28e-01 -0.228 0.149 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 2.79e-01 -0.131 0.121 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0101 0.0982 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 3.19e-01 -0.139 0.139 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 4.02e-01 0.108 0.129 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.87e-01 0.112 0.085 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 2.57e-01 -0.128 0.113 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 9.28e-01 0.0131 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0931 0.122 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0847 0.0907 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 7.26e-01 0.0524 0.149 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0329 0.133 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.88e-01 0.0745 0.0699 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.73e-01 0.0164 0.103 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 6.01e-02 -0.234 0.124 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 6.79e-01 0.0347 0.0837 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 1.00e-01 -0.129 0.0778 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.50e-01 0.216 0.149 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 2.86e-01 0.0826 0.0772 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0792 0.0905 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 5.51e-01 0.0554 0.0927 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0322 0.108 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00983 0.0986 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 4.08e-02 -0.153 0.0745 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 6.27e-01 0.0723 0.149 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 4.33e-01 0.0723 0.092 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 5.05e-01 0.0789 0.118 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 7.30e-01 0.0427 0.123 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 897455 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0915 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 sc-eQTL 7.77e-02 0.165 0.0928 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0946 0.116 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 858936 sc-eQTL 1.54e-01 -0.225 0.157 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -425919 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0543 0.0978 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -185714 sc-eQTL 1.15e-02 0.214 0.0839 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 889023 sc-eQTL 8.04e-01 0.0287 0.115 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -186733 sc-eQTL 7.76e-01 -0.034 0.119 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 462051 pQTL 0.0427 -0.0631 0.0311 0.0 0.0 0.0639
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 eQTL 0.0281 -0.0851 0.0387 0.0 0.0 0.0608

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -722031 2.95e-07 1.36e-07 5.14e-08 2.27e-07 9.79e-08 8.89e-08 1.67e-07 5.48e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.63e-07 9.19e-08 1.71e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.53e-08 4.01e-08 1.44e-07 6.07e-08 4.31e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.72e-07 1.14e-07 1.18e-07 9.74e-08 1.2e-07 1.05e-07 1.07e-07 2.99e-08 3.96e-08 9.3e-08 3.51e-08 3.62e-08 5.45e-08 8.37e-08 6.71e-08 3.6e-08 4.94e-08 1.46e-07 5.27e-08 7.21e-09 4.25e-08 1.19e-08 1.22e-07 1.9e-09 4.8e-08
ENSG00000220412 \N -25701 2.34e-05 2.32e-05 3.83e-06 1.17e-05 3.42e-06 9.27e-06 2.83e-05 3.33e-06 1.87e-05 9.96e-06 2.55e-05 9.14e-06 3.35e-05 8.78e-06 5.45e-06 1.11e-05 1.05e-05 1.69e-05 5.56e-06 4.38e-06 9.57e-06 2.09e-05 1.98e-05 5.39e-06 3.08e-05 5.36e-06 8.36e-06 8.17e-06 2.12e-05 1.68e-05 1.34e-05 1.26e-06 1.66e-06 4.75e-06 7.8e-06 4.06e-06 1.87e-06 2.72e-06 3.25e-06 2.62e-06 1.28e-06 2.65e-05 2.76e-06 2.22e-07 1.93e-06 2.68e-06 3.24e-06 1.3e-06 1.15e-06