Genes within 1Mb (chr6:137650721:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 6.01e-01 0.0526 0.1 0.139 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0211 0.0788 0.139 B L1
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 3.40e-01 0.113 0.119 0.139 B L1
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00644 0.0787 0.139 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.60e-01 0.089 0.0631 0.139 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0427 0.0883 0.139 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 1.99e-01 -0.128 0.0993 0.139 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 2.95e-01 0.069 0.0657 0.139 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0525 0.0754 0.139 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 8.04e-01 0.0264 0.106 0.139 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 7.68e-01 -0.021 0.0712 0.139 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 2.16e-01 0.0825 0.0665 0.139 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 6.09e-01 0.026 0.0508 0.139 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0125 0.084 0.139 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 9.91e-01 0.000814 0.075 0.139 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00854 0.0803 0.139 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 5.00e-01 0.0844 0.125 0.139 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 2.32e-01 0.0978 0.0815 0.139 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 6.02e-02 0.118 0.0626 0.139 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 3.01e-01 0.069 0.0665 0.139 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 8.55e-01 0.017 0.0927 0.139 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 5.91e-01 0.0497 0.0923 0.142 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0721 0.0874 0.142 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 9.33e-02 -0.218 0.129 0.142 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0991 0.0985 0.142 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.39e-01 0.0208 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 5.23e-01 0.0644 0.101 0.142 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 2.41e-01 -0.157 0.133 0.142 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 4.90e-01 0.053 0.0766 0.139 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 1.82e-01 -0.083 0.062 0.139 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 4.50e-01 0.0976 0.129 0.139 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.31e-01 0.0982 0.0647 0.139 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 4.60e-01 0.0562 0.0759 0.139 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 7.62e-01 0.0244 0.0806 0.139 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0876 0.0918 0.139 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 4.14e-01 0.0687 0.084 0.139 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0018 0.0963 0.139 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 8.33e-02 -0.224 0.129 0.139 NK L1
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0145 0.0818 0.139 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.62e-03 0.218 0.0684 0.139 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 5.43e-01 0.0611 0.1 0.139 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 2.23e-01 0.121 0.0989 0.139 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 4.27e-01 0.0635 0.0797 0.139 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 1.07e-01 -0.136 0.0841 0.139 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0419 0.13 0.139 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 1.61e-01 0.146 0.104 0.139 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 6.51e-02 0.0914 0.0493 0.139 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 2.56e-01 -0.109 0.0956 0.139 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 8.54e-01 0.0182 0.0986 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0782 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 3.64e-02 0.265 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 1.37e-01 -0.189 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0734 0.0658 0.145 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 3.49e-01 0.12 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 4.57e-01 -0.107 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 5.28e-01 0.0708 0.112 0.145 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0928 0.116 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 5.31e-01 0.0544 0.0868 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 9.07e-01 0.0142 0.121 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0376 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0214 0.0868 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 7.94e-01 0.0275 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 9.88e-01 0.00178 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0124 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0817 0.0962 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 3.52e-01 -0.119 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 4.55e-01 0.0899 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 4.68e-01 0.0601 0.0826 0.14 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0352 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 8.05e-02 0.215 0.122 0.14 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 5.05e-01 0.0665 0.0997 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0342 0.0849 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 5.14e-01 0.086 0.132 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0701 0.115 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.44e-01 0.0976 0.0665 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0433 0.0938 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 4.74e-01 -0.075 0.105 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 3.65e-01 0.0724 0.0798 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 5.75e-01 0.074 0.132 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0322 0.0961 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 7.05e-01 0.0364 0.096 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.57e-01 0.0185 0.102 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 2.10e-01 -0.156 0.124 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 3.25e-01 0.113 0.115 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 2.37e-01 -0.126 0.106 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 4.86e-02 -0.251 0.126 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 6.16e-01 -0.065 0.129 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.25e-02 0.187 0.0743 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 4.92e-01 0.0829 0.12 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0627 0.117 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 3.13e-01 0.0629 0.0623 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0964 0.0733 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 2.48e-01 0.136 0.117 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00463 0.0972 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 2.45e-01 0.0793 0.068 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.84e-01 0.00733 0.0501 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0175 0.0883 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 2.11e-01 0.109 0.087 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.81e-01 0.00211 0.0864 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0359 0.128 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 4.59e-01 0.0803 0.108 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.69e-01 0.0864 0.0626 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 5.84e-01 0.0393 0.0716 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0474 0.0881 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 4.65e-01 0.0723 0.0988 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0915 0.0887 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 3.33e-01 -0.124 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 5.26e-01 0.0656 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.59e-02 0.157 0.0648 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 2.18e-01 0.125 0.101 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 6.96e-01 0.0411 0.105 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 2.85e-01 0.0963 0.0898 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 4.45e-01 0.0729 0.0953 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 1.64e-01 0.172 0.123 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 1.16e-01 0.187 0.118 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.19e-02 0.189 0.0746 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 2.70e-01 0.118 0.107 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 4.59e-02 0.212 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 8.14e-01 -0.021 0.0892 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0231 0.0818 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.129 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 1.07e-01 -0.158 0.0977 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.08e-01 0.112 0.0694 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 6.77e-01 0.0345 0.0827 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0374 0.103 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 2.44e-01 -0.136 0.117 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 2.63e-02 0.22 0.0984 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0173 0.134 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0196 0.132 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 4.69e-02 0.126 0.0628 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 4.42e-01 0.0871 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 2.63e-01 -0.13 0.116 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 2.61e-01 -0.128 0.113 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 3.97e-01 -0.101 0.119 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 6.29e-01 0.0632 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 1.53e-01 0.194 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 6.57e-02 0.154 0.083 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 5.30e-01 0.0814 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 2.87e-01 0.132 0.124 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 8.63e-01 0.0157 0.0903 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0917 0.0964 0.141 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 7.72e-01 0.0355 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 1.50e-01 0.183 0.127 0.141 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 3.42e-02 0.128 0.0601 0.141 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0243 0.106 0.141 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 6.39e-01 0.0529 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 5.32e-01 0.0627 0.1 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.17e-01 0.0114 0.109 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0547 0.13 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 2.80e-01 0.126 0.117 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.86e-01 0.0986 0.0743 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 5.81e-01 0.0626 0.113 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 1.59e-01 0.11 0.0776 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0415 0.105 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 2.97e-02 -0.291 0.133 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0371 0.0944 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.37e-02 0.18 0.0724 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0965 0.106 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 5.75e-01 0.0618 0.11 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 1.82e-01 0.134 0.1 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0946 0.117 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 9.42e-01 0.00938 0.128 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0892 0.104 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.02e-01 0.13 0.0794 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.16e-01 0.0296 0.127 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 6.54e-01 0.0577 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 1.92e-01 0.107 0.0818 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.105 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 2.45e-01 -0.15 0.129 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0432 0.0978 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 5.09e-04 0.252 0.0713 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.27e-02 0.174 0.1 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 3.55e-01 0.102 0.11 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 6.31e-01 0.0748 0.155 0.148 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.46e-01 0.00887 0.131 0.148 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0402 0.16 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 7.49e-01 -0.032 0.0997 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0407 0.121 0.148 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0552 0.138 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0784 0.145 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 1.75e-01 -0.139 0.102 0.137 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 1.00e-01 -0.176 0.107 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 1.41e-01 0.183 0.124 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0691 0.0991 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0113 0.0626 0.137 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.74e-01 0.0192 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 1.19e-01 -0.189 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 6.86e-01 0.0475 0.117 0.139 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0817 0.0851 0.139 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 2.68e-01 0.137 0.124 0.139 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 6.40e-02 -0.248 0.133 0.139 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.43e-02 0.182 0.0736 0.139 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 6.69e-01 0.0346 0.0809 0.139 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 3.90e-01 0.098 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 5.68e-01 0.0609 0.106 0.134 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00655 0.0938 0.134 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 2.66e-01 -0.153 0.137 0.134 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 2.11e-01 -0.131 0.105 0.134 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 4.54e-01 -0.081 0.108 0.134 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00434 0.137 0.134 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0956 0.141 0.134 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 2.49e-01 0.0821 0.0711 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0755 0.0701 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 9.97e-01 0.000466 0.128 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 2.28e-01 0.0926 0.0765 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 9.15e-01 0.0085 0.0798 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 7.49e-01 0.0262 0.082 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0924 0.102 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0359 0.0831 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 7.11e-01 0.0287 0.0774 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 8.27e-02 0.231 0.132 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 5.81e-01 0.0409 0.0738 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.97e-01 0.013 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 7.30e-01 0.0366 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0785 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 8.21e-01 0.0276 0.122 0.139 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 2.26e-01 -0.176 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0762 0.154 0.139 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 7.84e-01 0.037 0.135 0.139 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 1.09e-01 0.12 0.0744 0.139 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.04e-01 0.0395 0.159 0.139 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 7.51e-01 0.0433 0.136 0.139 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 1.71e-02 -0.209 0.0868 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 8.15e-02 -0.153 0.0871 0.14 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 1.34e-01 -0.178 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 5.17e-02 0.147 0.0753 0.14 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 3.54e-03 0.357 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 4.96e-01 0.0772 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0597 0.131 0.14 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 3.56e-01 0.0999 0.108 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 8.95e-01 0.01 0.0759 0.136 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 4.57e-01 0.0998 0.134 0.136 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0178 0.0959 0.136 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.87e-01 0.0178 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0976 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0489 0.126 0.136 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 1.20e-01 0.185 0.118 0.144 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00661 0.109 0.144 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0583 0.131 0.144 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 9.29e-01 0.00991 0.111 0.144 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 2.95e-02 0.318 0.145 0.144 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 6.27e-01 0.0547 0.112 0.144 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 2.64e-01 -0.151 0.135 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0669 0.103 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00937 0.0834 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0443 0.118 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 4.37e-01 0.0856 0.11 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 8.58e-01 0.013 0.0726 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0558 0.096 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 4.75e-01 0.0752 0.105 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0149 0.0781 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 4.00e-01 0.108 0.128 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0504 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 8.69e-02 0.103 0.0598 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 8.32e-01 0.0187 0.0883 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 2.85e-01 -0.115 0.107 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 3.31e-01 0.0702 0.072 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0993 0.0672 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.129 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 2.27e-01 0.0806 0.0665 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 9.39e-01 0.006 0.0783 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 5.54e-01 0.0474 0.08 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0969 0.0929 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0373 0.0854 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0145 0.0652 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0461 0.129 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 4.91e-01 0.055 0.0798 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 4.08e-02 0.209 0.101 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 8.10e-01 0.0257 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 866676 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0924 0.121 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 431272 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.0797 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -752810 sc-eQTL 8.30e-01 0.0213 0.0994 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 828157 sc-eQTL 8.79e-02 -0.23 0.134 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -456698 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0622 0.0838 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -216493 sc-eQTL 7.09e-04 0.244 0.0711 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 858244 sc-eQTL 7.04e-01 0.0376 0.0987 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -217512 sc-eQTL 1.40e-01 0.151 0.102 0.138 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N -456698 2.66e-07 1.1e-07 3.59e-08 1.8e-07 9.65e-08 9.87e-08 1.41e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.24e-08 1.6e-07 7.75e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.44e-08 8.01e-08 4.63e-08 1.1e-07 5.82e-08 4.07e-08 1.05e-07 1.3e-07 1.3e-07 4.13e-08 1.31e-07 1.14e-07 1.12e-07 8.71e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.95e-08 3.26e-08 8.68e-08 8.94e-08 3.96e-08 5.02e-08 9.26e-08 6.78e-08 3e-08 4.6e-08 1.36e-07 5.2e-08 1.53e-08 7.91e-08 1.69e-08 1.26e-07 4.33e-09 5.04e-08