Genes within 1Mb (chr6:137648638:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0505 0.0816 0.229 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.23e-03 0.177 0.0629 0.229 B L1
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 8.31e-02 -0.167 0.096 0.229 B L1
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0551 0.0638 0.229 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0522 0.0514 0.229 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 1.81e-01 0.0959 0.0715 0.229 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0942 0.0808 0.229 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0352 0.0547 0.229 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 2.01e-01 0.0803 0.0626 0.229 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0204 0.0882 0.229 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 1.56e-01 0.084 0.059 0.229 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 7.11e-01 0.0206 0.0555 0.229 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0349 0.0422 0.229 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0257 0.0699 0.229 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 7.66e-01 0.0186 0.0624 0.229 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00031 0.0668 0.229 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 8.97e-02 -0.176 0.103 0.229 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 2.94e-01 0.0715 0.0679 0.229 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.67e-01 0.00216 0.0526 0.229 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00534 0.0555 0.229 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 4.69e-01 0.0559 0.0771 0.229 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0327 0.0754 0.23 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0144 0.0714 0.23 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 1.42e-01 -0.156 0.106 0.23 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 7.75e-01 0.023 0.0806 0.23 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0616 0.0835 0.23 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0552 0.082 0.23 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 3.97e-01 0.0926 0.109 0.23 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0471 0.0635 0.229 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 2.35e-01 0.0612 0.0514 0.229 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 6.06e-01 0.0553 0.107 0.229 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0407 0.0539 0.229 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0593 0.0628 0.229 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 7.89e-01 0.0179 0.0668 0.229 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 5.22e-01 0.0488 0.0761 0.229 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00207 0.0699 0.23 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 3.52e-01 0.0746 0.0799 0.23 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.62e-01 0.0625 0.108 0.23 NK L1
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 8.97e-01 0.00877 0.0679 0.23 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0528 0.058 0.23 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0427 0.0833 0.23 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0237 0.0824 0.23 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0339 0.065 0.229 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 9.42e-01 0.00499 0.0689 0.229 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 2.26e-01 0.128 0.106 0.229 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 6.01e-01 0.0446 0.085 0.229 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 8.16e-01 -0.00942 0.0405 0.229 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0041 0.0781 0.229 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 6.26e-01 0.0391 0.0803 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0144 0.112 0.222 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 9.50e-01 0.00688 0.11 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 6.83e-01 0.0449 0.11 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.12e-01 -0.021 0.0569 0.222 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0228 0.11 0.222 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00782 0.124 0.222 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0131 0.0964 0.222 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 4.64e-01 0.0709 0.0967 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.47e-02 0.139 0.0719 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0269 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 8.68e-01 0.0154 0.0924 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 5.66e-01 0.0417 0.0724 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00892 0.0876 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0954 0.103 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 1.16e-01 -0.165 0.104 0.228 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 7.21e-01 0.0287 0.08 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 8.03e-02 -0.185 0.105 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0596 0.0997 0.228 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0357 0.0686 0.228 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 2.60e-01 -0.106 0.0935 0.228 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00621 0.102 0.228 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0459 0.0827 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 7.93e-03 0.186 0.0693 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0589 0.109 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.82e-02 0.168 0.0948 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 3.58e-01 -0.051 0.0553 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 3.48e-01 0.0731 0.0777 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 8.10e-02 -0.151 0.0862 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 8.93e-01 -0.014 0.104 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.33e-01 0.0431 0.069 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 6.73e-01 0.048 0.114 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 1.14e-01 0.131 0.0825 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 1.40e-01 0.122 0.0825 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0421 0.0882 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 5.54e-01 0.0634 0.107 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 2.30e-01 0.114 0.0949 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.85e-01 0.048 0.0878 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0321 0.106 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 2.50e-01 0.123 0.107 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 1.00e+00 2.38e-05 0.0625 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0889 0.0995 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0967 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0769 0.0516 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 2.01e-01 0.0781 0.0609 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 1.77e-01 -0.132 0.0975 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 1.56e-01 0.114 0.0804 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 3.77e-01 0.0501 0.0566 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 4.72e-01 -0.03 0.0416 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 9.39e-01 0.00561 0.0734 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00829 0.0721 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 7.31e-01 0.0245 0.0713 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.58e-01 0.0621 0.106 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 6.60e-01 0.0394 0.0895 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0434 0.0519 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0532 0.0591 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 9.86e-01 0.00126 0.0728 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 2.50e-01 0.0949 0.0823 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.63e-02 0.141 0.0736 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 9.73e-01 0.00357 0.107 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0411 0.0863 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00371 0.0548 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0625 0.0846 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0822 0.0877 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 6.27e-01 0.0366 0.0754 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.57e-01 -0.047 0.0799 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0717 0.104 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.65e-01 0.0299 0.0997 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0943 0.0631 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 8.02e-01 0.0225 0.0895 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0611 0.0891 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0989 0.0741 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0121 0.0682 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0687 0.108 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 4.02e-01 0.0687 0.0819 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 3.78e-01 0.0513 0.0581 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 8.32e-01 0.0147 0.069 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 8.75e-01 0.0136 0.0861 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 4.08e-01 0.0809 0.0977 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0439 0.0833 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0553 0.112 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.11e-01 0.0409 0.11 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 5.52e-01 0.0316 0.053 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0526 0.0946 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 2.85e-01 0.104 0.0968 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 1.65e-01 0.132 0.0946 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.81e-02 0.188 0.0989 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 2.56e-01 -0.124 0.109 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.23e-01 0.0404 0.114 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0894 0.0698 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 8.66e-01 0.0183 0.108 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 3.88e-01 0.0899 0.104 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 7.34e-01 -0.026 0.0763 0.227 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 7.02e-01 0.0312 0.0816 0.227 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0381 0.104 0.227 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 2.30e-01 0.13 0.108 0.227 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0141 0.0514 0.227 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 5.26e-01 0.0568 0.0894 0.227 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 1.95e-01 0.123 0.0946 0.227 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 1.45e-01 0.122 0.0834 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 6.71e-01 0.0389 0.0915 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0378 0.109 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 4.65e-02 -0.194 0.097 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0762 0.0622 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 1.67e-01 0.131 0.0945 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0575 0.0995 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 8.77e-01 0.01 0.0646 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 4.82e-01 0.0615 0.0872 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 3.49e-01 0.104 0.111 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.72e-02 -0.138 0.0777 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 6.47e-01 0.0279 0.0608 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 6.18e-01 0.0437 0.0876 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 8.52e-01 0.0171 0.0912 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000466 0.0847 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 3.46e-01 0.0925 0.0979 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 1.62e-01 0.15 0.107 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.87e-01 0.0236 0.0872 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.72e-01 0.00233 0.0671 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 2.26e-01 -0.129 0.106 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 4.38e-01 -0.084 0.108 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 9.53e-01 0.0041 0.0688 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 4.83e-01 0.0617 0.0879 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0745 0.108 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 5.01e-01 0.0552 0.0819 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0464 0.0614 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 1.36e-01 -0.126 0.084 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0567 0.0925 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 4.96e-02 -0.257 0.129 0.241 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 7.37e-02 0.197 0.109 0.241 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.60e-01 0.0788 0.135 0.241 PB L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0129 0.0843 0.241 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0165 0.102 0.241 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0329 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0926 0.122 0.241 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 8.25e-01 0.0189 0.0852 0.23 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0393 0.089 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0405 0.104 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 6.31e-01 0.0396 0.0823 0.23 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0481 0.0518 0.23 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0714 0.1 0.23 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 4.81e-01 -0.071 0.101 0.23 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 6.59e-02 -0.179 0.0967 0.229 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 9.67e-01 0.00296 0.0707 0.229 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.11e-01 0.0678 0.103 0.229 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 2.66e-01 0.124 0.111 0.229 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 5.04e-01 0.0415 0.0619 0.229 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0114 0.0671 0.229 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0261 0.0945 0.229 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0815 0.0827 0.229 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000834 0.073 0.229 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 2.53e-01 -0.123 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.13e-02 0.138 0.0811 0.229 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0724 0.0839 0.229 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 7.95e-01 0.0277 0.106 0.229 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 4.01e-01 0.092 0.109 0.229 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00591 0.0597 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 9.08e-01 0.00683 0.0588 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 2.41e-01 0.126 0.107 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0244 0.0642 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0577 0.0667 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 6.79e-01 0.0284 0.0686 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 6.69e-01 0.0368 0.0859 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 1.99e-01 -0.088 0.0684 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 7.65e-01 0.0191 0.0639 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.75e-01 0.0619 0.11 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.29e-01 0.00542 0.061 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 7.14e-01 0.0304 0.0829 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 2.26e-01 0.106 0.0872 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 4.01e-01 0.0718 0.0853 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0397 0.101 0.206 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000791 0.121 0.206 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 4.02e-02 0.262 0.127 0.206 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0174 0.112 0.206 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 6.76e-02 0.114 0.0617 0.206 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 6.07e-02 -0.247 0.13 0.206 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0394 0.113 0.206 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00153 0.0739 0.222 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0257 0.0737 0.222 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 8.46e-01 0.0194 0.0997 0.222 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 6.86e-01 0.0259 0.0638 0.222 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 2.38e-01 0.122 0.104 0.222 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 6.00e-01 0.0499 0.0951 0.222 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0853 0.11 0.222 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 5.39e-01 0.053 0.0861 0.226 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 6.49e-01 0.0275 0.0604 0.226 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0551 0.107 0.226 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.21e-01 0.00758 0.0763 0.226 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0523 0.099 0.226 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0692 0.0952 0.226 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 3.96e-01 0.0854 0.1 0.226 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0426 0.0967 0.226 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0689 0.0885 0.226 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.80e-01 -0.059 0.106 0.226 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.82e-02 -0.148 0.0889 0.226 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 1.72e-01 -0.163 0.118 0.226 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0827 0.0908 0.226 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 4.07e-01 0.0911 0.11 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0273 0.0845 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.19e-02 0.133 0.068 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 3.59e-02 -0.203 0.0962 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0264 0.0904 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 9.28e-01 0.00536 0.0597 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0449 0.0789 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0552 0.101 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0194 0.0869 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.39e-03 0.178 0.0633 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0586 0.106 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 1.01e-01 0.155 0.0941 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 2.35e-01 -0.059 0.0496 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 5.85e-01 0.0398 0.0729 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0847 0.0884 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0379 0.0599 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 5.20e-01 0.0361 0.0561 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 4.77e-01 0.0765 0.107 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0205 0.0554 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0496 0.0649 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 4.39e-01 0.0514 0.0663 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 5.50e-01 0.0462 0.0773 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0226 0.0708 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 8.17e-01 0.0126 0.0541 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0432 0.107 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 6.19e-01 0.0329 0.0662 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 9.06e-01 0.0101 0.0849 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0151 0.0887 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 864593 sc-eQTL 7.44e-01 0.0329 0.101 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 429189 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0063 0.0659 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 sc-eQTL 3.94e-01 0.0697 0.0816 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 826074 sc-eQTL 5.69e-01 0.0634 0.111 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -458781 sc-eQTL 7.23e-01 0.0244 0.0689 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -218576 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0444 0.06 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0518 0.081 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -219595 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0287 0.084 0.231 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 eQTL 0.000579 0.0732 0.0212 0.0077 0.0 0.282
ENSG00000197442 MAP3K5 856161 eQTL 0.0148 0.0332 0.0136 0.0 0.0 0.282


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -754893 2.67e-07 1.25e-07 3.62e-08 1.86e-07 9.01e-08 1e-07 1.44e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.6e-07 8.59e-08 1.41e-07 6.56e-08 6e-08 7.26e-08 3.88e-08 1.14e-07 5.21e-08 4.42e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.34e-07 3.79e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.36e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.64e-08 3.87e-08 3.3e-08 8.55e-08 8.21e-08 3.93e-08 5.01e-08 9.61e-08 7.2e-08 3.77e-08 4.88e-08 1.35e-07 3.98e-08 1.26e-08 5.59e-08 1.83e-08 1.23e-07 3.92e-09 4.85e-08
ENSG00000220412 \N -58563 5.65e-06 7.64e-06 6.91e-07 3.48e-06 1.64e-06 1.73e-06 8.18e-06 9.79e-07 5.05e-06 2.99e-06 7.6e-06 3.12e-06 9.55e-06 2.13e-06 1.02e-06 3.83e-06 2.16e-06 4.02e-06 1.51e-06 1.37e-06 2.79e-06 4.9e-06 4.69e-06 1.97e-06 8.92e-06 1.91e-06 2.31e-06 1.52e-06 5.8e-06 6.97e-06 2.65e-06 5.25e-07 5.02e-07 2.22e-06 1.96e-06 1.12e-06 1.08e-06 4.58e-07 9.06e-07 5.64e-07 3.61e-07 7.97e-06 3.64e-07 1.57e-07 4.39e-07 1.34e-06 9.89e-07 5.05e-07 3.26e-07
ENSG00000226004 \N -297164 1.13e-06 8.97e-07 1.03e-07 3.04e-07 9.16e-08 3.32e-07 6.87e-07 1.45e-07 6.18e-07 2.8e-07 1.07e-06 5.08e-07 1.07e-06 1.84e-07 3.1e-07 2.45e-07 3.75e-07 4.11e-07 2.57e-07 1.86e-07 2.17e-07 4.66e-07 4.74e-07 2.6e-07 1.39e-06 2.4e-07 3.68e-07 3.18e-07 5.41e-07 7.79e-07 3.93e-07 6.77e-08 5.55e-08 2.22e-07 3.37e-07 1.46e-07 8.43e-08 8.15e-08 7.81e-08 2.26e-08 1.03e-07 9.14e-07 1.21e-08 5.77e-09 1.27e-07 1.46e-08 1.11e-07 1.26e-08 4.71e-08